Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZGD7

Protein Details
Accession A0A4Y9ZGD7    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-122HSSDTLRTRRSHRSHSRDRRDRRRERDHDDRRRRSRSPDRSVRDRHSRSRERSHRDRDRDVDRERRHRERGESRHSHRDRDDRDRDHRRRKRDEDDHGSERBasic
203-224EEERPRRARRTPPPPIKRPSPTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-132TRRSHRSHSRDRRDRRRERDHDDRRRRSRSPDRSVRDRHSRSRERSHRDRDRDVDRERRHRERGESRHSHRDRDDRDRDHRRRKRDEDXDHGSERDERAKRKRD
150-163PPPPPPLRDSPRRS
170-175RERDHR
177-185ADRPARPPR
196-221RYGRGKSGEEERPRRARRTPPPPIKR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, cyto 4, mito 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR029123  RBM39_linker  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF15519  RBM39linker  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12284  RRM2_RBM23_RBM39  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MSENGKVADLLPDQRSARSRDHSSDTLRTRRSHRSHSRDRRDRRRERDHDDRRRRSRSPDRSVRDRHSRSRERSHRDRDRDVDRERRHRERGESRHSHRDRDDRDRDHRRRKRDEDXDHGSERDERAKRKRDDDGGDERLPPPPPSAGLPPPPPPLRDSPRRSSETGHSRERDHRYADRPARPPRDPRDEFDDLPRYGRGKSGEEERPRRARRTPPPPIKRPSPTYEVAAADDLMDDEPKEDDSEARSVFVSQLAARLTARDLGYFFEDKLGEGTVLDARIVTDRLSRRSKGIGYVEFRAIDLVEKAIALSGTVVMGLPIMVQLTESERNRLHPGDGNLNLPPGVSAPHGAMQLYVGSLHFNLTESDIKQVFEPFGELEFVDLHRDPTTGRSKGYAFVQYKRPEDARMALEQMEGFELAGRTLRVNTVHEKGSMKYTPQDSLDEAGGGNLNAASRQALMQKLARIEPTTKAEPIMRPNIPQSMESRSVLLTNMFDPEEETERDWDKDLADDVKIECQGKFGPVERIKVEKESQGEIYVKFDTVETARKAVQGLHGRWFGGKQVSATFISDAIMQAHQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.38
3 0.38
4 0.42
5 0.44
6 0.49
7 0.49
8 0.56
9 0.57
10 0.59
11 0.63
12 0.64
13 0.66
14 0.65
15 0.64
16 0.64
17 0.68
18 0.69
19 0.71
20 0.73
21 0.75
22 0.81
23 0.86
24 0.91
25 0.91
26 0.94
27 0.94
28 0.95
29 0.95
30 0.94
31 0.94
32 0.92
33 0.91
34 0.91
35 0.91
36 0.91
37 0.92
38 0.92
39 0.91
40 0.9
41 0.86
42 0.85
43 0.85
44 0.84
45 0.84
46 0.84
47 0.82
48 0.84
49 0.87
50 0.86
51 0.86
52 0.83
53 0.82
54 0.82
55 0.84
56 0.82
57 0.85
58 0.86
59 0.85
60 0.87
61 0.88
62 0.88
63 0.86
64 0.86
65 0.83
66 0.81
67 0.8
68 0.78
69 0.77
70 0.76
71 0.78
72 0.78
73 0.79
74 0.78
75 0.76
76 0.78
77 0.78
78 0.79
79 0.79
80 0.81
81 0.79
82 0.82
83 0.78
84 0.75
85 0.72
86 0.72
87 0.69
88 0.69
89 0.73
90 0.7
91 0.77
92 0.81
93 0.84
94 0.86
95 0.86
96 0.86
97 0.87
98 0.87
99 0.88
100 0.86
101 0.86
102 0.85
103 0.85
104 0.8
105 0.71
106 0.64
107 0.55
108 0.47
109 0.45
110 0.41
111 0.41
112 0.46
113 0.54
114 0.57
115 0.61
116 0.68
117 0.67
118 0.67
119 0.66
120 0.65
121 0.62
122 0.58
123 0.54
124 0.47
125 0.42
126 0.38
127 0.32
128 0.25
129 0.19
130 0.18
131 0.19
132 0.24
133 0.25
134 0.29
135 0.32
136 0.35
137 0.41
138 0.42
139 0.4
140 0.38
141 0.42
142 0.44
143 0.5
144 0.53
145 0.54
146 0.6
147 0.63
148 0.61
149 0.57
150 0.58
151 0.58
152 0.57
153 0.57
154 0.51
155 0.51
156 0.58
157 0.61
158 0.57
159 0.52
160 0.52
161 0.5
162 0.58
163 0.62
164 0.61
165 0.62
166 0.67
167 0.69
168 0.68
169 0.71
170 0.69
171 0.71
172 0.66
173 0.62
174 0.61
175 0.58
176 0.54
177 0.52
178 0.5
179 0.4
180 0.39
181 0.37
182 0.29
183 0.25
184 0.27
185 0.23
186 0.19
187 0.21
188 0.27
189 0.34
190 0.42
191 0.47
192 0.52
193 0.59
194 0.6
195 0.62
196 0.61
197 0.63
198 0.64
199 0.69
200 0.72
201 0.73
202 0.79
203 0.83
204 0.83
205 0.8
206 0.76
207 0.72
208 0.66
209 0.6
210 0.53
211 0.47
212 0.43
213 0.36
214 0.3
215 0.25
216 0.19
217 0.14
218 0.12
219 0.09
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.08
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.07
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.07
259 0.06
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.1
270 0.12
271 0.19
272 0.23
273 0.23
274 0.24
275 0.27
276 0.27
277 0.27
278 0.29
279 0.28
280 0.27
281 0.28
282 0.28
283 0.25
284 0.24
285 0.19
286 0.15
287 0.1
288 0.08
289 0.06
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.02
302 0.03
303 0.02
304 0.02
305 0.02
306 0.02
307 0.02
308 0.02
309 0.03
310 0.06
311 0.12
312 0.12
313 0.16
314 0.16
315 0.19
316 0.22
317 0.22
318 0.21
319 0.2
320 0.22
321 0.25
322 0.26
323 0.25
324 0.23
325 0.22
326 0.2
327 0.16
328 0.13
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.04
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.11
351 0.11
352 0.15
353 0.15
354 0.15
355 0.15
356 0.16
357 0.14
358 0.11
359 0.12
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.11
372 0.1
373 0.16
374 0.24
375 0.22
376 0.23
377 0.24
378 0.25
379 0.27
380 0.3
381 0.33
382 0.28
383 0.31
384 0.39
385 0.42
386 0.43
387 0.44
388 0.42
389 0.35
390 0.35
391 0.35
392 0.3
393 0.26
394 0.26
395 0.22
396 0.21
397 0.19
398 0.16
399 0.12
400 0.09
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.1
410 0.11
411 0.14
412 0.19
413 0.21
414 0.22
415 0.25
416 0.26
417 0.25
418 0.3
419 0.28
420 0.26
421 0.28
422 0.29
423 0.29
424 0.29
425 0.3
426 0.25
427 0.25
428 0.23
429 0.18
430 0.15
431 0.13
432 0.11
433 0.09
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.11
443 0.12
444 0.15
445 0.18
446 0.21
447 0.23
448 0.25
449 0.26
450 0.25
451 0.26
452 0.28
453 0.31
454 0.32
455 0.29
456 0.3
457 0.32
458 0.33
459 0.38
460 0.41
461 0.36
462 0.35
463 0.38
464 0.41
465 0.38
466 0.36
467 0.32
468 0.31
469 0.33
470 0.31
471 0.29
472 0.24
473 0.24
474 0.23
475 0.21
476 0.15
477 0.12
478 0.14
479 0.13
480 0.12
481 0.13
482 0.15
483 0.18
484 0.18
485 0.19
486 0.2
487 0.23
488 0.24
489 0.25
490 0.23
491 0.19
492 0.2
493 0.21
494 0.19
495 0.17
496 0.18
497 0.17
498 0.2
499 0.23
500 0.23
501 0.19
502 0.2
503 0.2
504 0.21
505 0.24
506 0.23
507 0.3
508 0.33
509 0.38
510 0.38
511 0.43
512 0.42
513 0.45
514 0.45
515 0.4
516 0.39
517 0.38
518 0.36
519 0.36
520 0.36
521 0.31
522 0.31
523 0.27
524 0.24
525 0.2
526 0.18
527 0.17
528 0.17
529 0.24
530 0.23
531 0.25
532 0.26
533 0.27
534 0.27
535 0.26
536 0.32
537 0.35
538 0.35
539 0.4
540 0.41
541 0.4
542 0.41
543 0.39
544 0.35
545 0.32
546 0.3
547 0.25
548 0.25
549 0.28
550 0.29
551 0.29
552 0.25
553 0.19
554 0.18
555 0.17
556 0.15