Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9XTG1

Protein Details
Accession A0A4Y9XTG1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
794-820DAPLAVRRPRRAPKPPVPWWKVTRPSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
843-850RPRRAPKP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025314  DUF4219  
IPR025724  GAG-pre-integrase_dom  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF13961  DUF4219  
PF13976  gag_pre-integrs  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MSDTNPKFKXAHLNGTNYRQWSEEMAAYLRTKRLWLIVNGSSLKPSPTPDNDAAVSDWAERASQAAGLIFLYLDPSQRIHVQSMQDDPVLMWTTLASVHVQKRPGTRFNAXDDFFSIRLQDXESLQSLMNRIDEGMRTIQNLRPDPYVLKDLDNELVCMAMVRSLPPEYSTFTSSLLLLDKLDRTSLQDAFRNEEINRLRRGGELGPSALKAAAPASAAAAKAPPRPKSNLKCDYCKRSGHTAEQCYKKAFDSLHPSQKANAVVPAAASGSSSSAPVPTEFAGSASLRSSSSPSLNDPPADESWNADTGATSHMTSHRHWFHSYSPFVTPIRLADNSVIYSAGIGSVQFVPLMRGKEQRAVLFSRVLHVPELRNNLLSVLYLTRHKSFSVLIQGNSVQFSLQGEVLFTARVDSSNTAFLEGRTVCSAQFAGLSSTLPLDLSLWHRRLGHHYHAGIQRLLREDLVTGLELKPGAPXPICEPCLAGKMHADPFPSSETRASAPLELIHTDLHGPLAVRSHSGYRYWISFIDDYSRFRVIYPLRTKGAAFDAFKAFKAYAENHFDASIKGLRDDKGGEYMSNAFLAFTTAAGIVRQHTVRNRPQQNGVAERANRTMDEGVTTLLAEARLPKSFWAECLGAFVHVWNRVGTSSVSDAVPYTLWHSRKPDVSRLRVWGCTAYVHVQKDKRRSLDPHMEKCLFIGYPEGYKGWRFYNPRTKKILICERATFDERDFPGLSLSGIRSQPTLTPPASLDRXLTPLLAPLDQDKEDSSQPTSPVLGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXEPSPLPEPVAASPAPSGVDDDAPLAVRRPRRAPKPPVPWWKVTRPSASPAPSTPLRAPSSLAPVPVDSPSMTEPRVKTGMLRHPGAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.68
3 0.65
4 0.57
5 0.5
6 0.42
7 0.39
8 0.33
9 0.3
10 0.25
11 0.24
12 0.27
13 0.28
14 0.3
15 0.29
16 0.26
17 0.25
18 0.24
19 0.28
20 0.3
21 0.31
22 0.34
23 0.36
24 0.42
25 0.43
26 0.42
27 0.39
28 0.34
29 0.32
30 0.27
31 0.27
32 0.28
33 0.3
34 0.38
35 0.38
36 0.41
37 0.4
38 0.4
39 0.37
40 0.31
41 0.27
42 0.2
43 0.18
44 0.14
45 0.13
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.09
55 0.07
56 0.06
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.14
63 0.18
64 0.21
65 0.22
66 0.26
67 0.29
68 0.31
69 0.35
70 0.34
71 0.3
72 0.28
73 0.25
74 0.24
75 0.22
76 0.19
77 0.14
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.13
82 0.11
83 0.14
84 0.21
85 0.25
86 0.29
87 0.33
88 0.41
89 0.47
90 0.52
91 0.52
92 0.51
93 0.52
94 0.55
95 0.55
96 0.48
97 0.43
98 0.38
99 0.34
100 0.29
101 0.25
102 0.2
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.16
109 0.16
110 0.15
111 0.18
112 0.17
113 0.15
114 0.14
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.19
122 0.22
123 0.24
124 0.3
125 0.33
126 0.32
127 0.3
128 0.31
129 0.31
130 0.32
131 0.35
132 0.28
133 0.26
134 0.25
135 0.25
136 0.28
137 0.26
138 0.23
139 0.17
140 0.16
141 0.14
142 0.12
143 0.1
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.13
151 0.14
152 0.16
153 0.19
154 0.21
155 0.19
156 0.2
157 0.2
158 0.18
159 0.18
160 0.16
161 0.13
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.15
169 0.18
170 0.22
171 0.23
172 0.27
173 0.28
174 0.32
175 0.33
176 0.32
177 0.28
178 0.32
179 0.35
180 0.35
181 0.37
182 0.33
183 0.33
184 0.3
185 0.34
186 0.28
187 0.26
188 0.23
189 0.22
190 0.22
191 0.21
192 0.21
193 0.17
194 0.15
195 0.1
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.11
205 0.12
206 0.18
207 0.24
208 0.28
209 0.31
210 0.38
211 0.48
212 0.54
213 0.62
214 0.66
215 0.66
216 0.71
217 0.75
218 0.77
219 0.73
220 0.69
221 0.63
222 0.62
223 0.62
224 0.61
225 0.61
226 0.61
227 0.63
228 0.65
229 0.63
230 0.55
231 0.52
232 0.43
233 0.38
234 0.31
235 0.29
236 0.32
237 0.37
238 0.45
239 0.46
240 0.46
241 0.44
242 0.46
243 0.42
244 0.33
245 0.28
246 0.19
247 0.16
248 0.15
249 0.14
250 0.1
251 0.08
252 0.07
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.11
267 0.1
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.1
273 0.12
274 0.11
275 0.14
276 0.14
277 0.17
278 0.22
279 0.23
280 0.23
281 0.22
282 0.23
283 0.22
284 0.23
285 0.19
286 0.16
287 0.17
288 0.17
289 0.16
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.12
294 0.11
295 0.09
296 0.08
297 0.12
298 0.14
299 0.16
300 0.23
301 0.26
302 0.28
303 0.29
304 0.3
305 0.33
306 0.38
307 0.39
308 0.33
309 0.3
310 0.3
311 0.29
312 0.27
313 0.22
314 0.16
315 0.17
316 0.15
317 0.15
318 0.13
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.05
327 0.04
328 0.03
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.07
335 0.1
336 0.12
337 0.13
338 0.17
339 0.18
340 0.24
341 0.26
342 0.25
343 0.25
344 0.26
345 0.25
346 0.24
347 0.23
348 0.2
349 0.19
350 0.18
351 0.16
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.22
356 0.2
357 0.2
358 0.19
359 0.18
360 0.16
361 0.15
362 0.11
363 0.07
364 0.08
365 0.1
366 0.12
367 0.14
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.15
373 0.22
374 0.22
375 0.2
376 0.21
377 0.21
378 0.21
379 0.21
380 0.18
381 0.09
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.07
397 0.07
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.11
403 0.14
404 0.13
405 0.13
406 0.11
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.05
421 0.04
422 0.04
423 0.05
424 0.1
425 0.15
426 0.16
427 0.18
428 0.19
429 0.2
430 0.25
431 0.29
432 0.3
433 0.3
434 0.29
435 0.34
436 0.36
437 0.37
438 0.33
439 0.28
440 0.25
441 0.22
442 0.22
443 0.15
444 0.12
445 0.1
446 0.1
447 0.1
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.08
459 0.11
460 0.14
461 0.14
462 0.14
463 0.13
464 0.17
465 0.16
466 0.16
467 0.14
468 0.15
469 0.17
470 0.18
471 0.18
472 0.15
473 0.16
474 0.19
475 0.18
476 0.17
477 0.15
478 0.14
479 0.14
480 0.16
481 0.15
482 0.12
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.11
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.07
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.09
500 0.11
501 0.12
502 0.13
503 0.14
504 0.14
505 0.15
506 0.15
507 0.15
508 0.16
509 0.15
510 0.15
511 0.19
512 0.19
513 0.19
514 0.21
515 0.22
516 0.19
517 0.18
518 0.24
519 0.21
520 0.29
521 0.32
522 0.34
523 0.34
524 0.35
525 0.35
526 0.31
527 0.33
528 0.28
529 0.23
530 0.22
531 0.25
532 0.25
533 0.25
534 0.25
535 0.2
536 0.16
537 0.18
538 0.17
539 0.19
540 0.25
541 0.26
542 0.25
543 0.25
544 0.25
545 0.22
546 0.22
547 0.19
548 0.13
549 0.14
550 0.15
551 0.15
552 0.17
553 0.18
554 0.16
555 0.17
556 0.18
557 0.16
558 0.15
559 0.16
560 0.15
561 0.14
562 0.13
563 0.08
564 0.07
565 0.09
566 0.07
567 0.05
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.07
573 0.07
574 0.1
575 0.11
576 0.13
577 0.18
578 0.26
579 0.34
580 0.44
581 0.5
582 0.5
583 0.55
584 0.58
585 0.58
586 0.55
587 0.51
588 0.47
589 0.42
590 0.4
591 0.38
592 0.32
593 0.26
594 0.24
595 0.21
596 0.15
597 0.15
598 0.13
599 0.11
600 0.1
601 0.1
602 0.08
603 0.07
604 0.07
605 0.06
606 0.09
607 0.1
608 0.11
609 0.12
610 0.12
611 0.17
612 0.17
613 0.18
614 0.19
615 0.18
616 0.17
617 0.19
618 0.19
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.12
623 0.14
624 0.15
625 0.12
626 0.13
627 0.12
628 0.14
629 0.13
630 0.13
631 0.12
632 0.13
633 0.13
634 0.12
635 0.12
636 0.11
637 0.11
638 0.09
639 0.11
640 0.16
641 0.18
642 0.22
643 0.26
644 0.3
645 0.37
646 0.41
647 0.47
648 0.5
649 0.55
650 0.56
651 0.59
652 0.59
653 0.53
654 0.5
655 0.42
656 0.34
657 0.28
658 0.26
659 0.24
660 0.26
661 0.27
662 0.32
663 0.37
664 0.43
665 0.51
666 0.56
667 0.55
668 0.56
669 0.58
670 0.61
671 0.66
672 0.69
673 0.68
674 0.69
675 0.65
676 0.58
677 0.53
678 0.46
679 0.35
680 0.25
681 0.21
682 0.14
683 0.15
684 0.17
685 0.17
686 0.15
687 0.17
688 0.19
689 0.19
690 0.25
691 0.28
692 0.36
693 0.47
694 0.54
695 0.6
696 0.65
697 0.66
698 0.63
699 0.68
700 0.69
701 0.65
702 0.62
703 0.59
704 0.55
705 0.57
706 0.56
707 0.47
708 0.38
709 0.39
710 0.34
711 0.34
712 0.31
713 0.26
714 0.24
715 0.22
716 0.21
717 0.15
718 0.16
719 0.17
720 0.17
721 0.18
722 0.17
723 0.18
724 0.21
725 0.22
726 0.26
727 0.21
728 0.22
729 0.23
730 0.27
731 0.29
732 0.26
733 0.23
734 0.22
735 0.24
736 0.22
737 0.21
738 0.17
739 0.16
740 0.16
741 0.17
742 0.16
743 0.18
744 0.18
745 0.19
746 0.19
747 0.2
748 0.22
749 0.23
750 0.23
751 0.22
752 0.23
753 0.24
754 0.23
755 0.2
756 0.19
757 0.17
758 0.16
759 0.13
760 0.15
761 0.14
762 0.16
763 0.17
764 0.16
765 0.16
766 0.14
767 0.16
768 0.14
769 0.17
770 0.15
771 0.15
772 0.15
773 0.15
774 0.15
775 0.13
776 0.14
777 0.11
778 0.13
779 0.12
780 0.12
781 0.12
782 0.13
783 0.13
784 0.14
785 0.18
786 0.23
787 0.29
788 0.38
789 0.47
790 0.56
791 0.66
792 0.73
793 0.79
794 0.83
795 0.88
796 0.89
797 0.86
798 0.85
799 0.82
800 0.82
801 0.8
802 0.77
803 0.74
804 0.67
805 0.67
806 0.66
807 0.63
808 0.57
809 0.5
810 0.5
811 0.45
812 0.46
813 0.43
814 0.43
815 0.42
816 0.39
817 0.39
818 0.36
819 0.41
820 0.37
821 0.35
822 0.29
823 0.27
824 0.28
825 0.27
826 0.25
827 0.16
828 0.17
829 0.19
830 0.22
831 0.22
832 0.27
833 0.27
834 0.31
835 0.34
836 0.31
837 0.32
838 0.38
839 0.46
840 0.47