Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9YIK0

Protein Details
Accession A0A4Y9YIK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1007-1026DPESEPKRKRISSQNFQRLAHydrophilic
1073-1099VQSEGDKDKEQRKKDKKDKKKRKSTLVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1083-1098KEQRKKDKKDKKKRKS
Subcellular Location(s) plas 21, nucl 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR011527  ABC1_TM_dom  
IPR036640  ABC1_TM_sf  
IPR003439  ABC_transporter-like_ATP-bd  
IPR017871  ABC_transporter-like_CS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034158  SF3B4_RRM1  
IPR039421  Type_1_exporter  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140359  F:ABC-type transporter activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00664  ABC_membrane  
PF00005  ABC_tran  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50929  ABC_TM1F  
PS00211  ABC_TRANSPORTER_1  
PS50893  ABC_TRANSPORTER_2  
PS50102  RRM  
CDD cd18583  ABC_6TM_HMT1  
cd12334  RRM1_SF3B4  
Amino Acid Sequences MSRPQDDRNQEATVYLGNLDERCTDALVWELMLQAGPVVNVHLPKDRISMAHQGYGFCEFLTEEDAEYACKIMNQIKLWGKPIRVNKASSDKKQLDVGANLFIGNLDENVDERLLYDTFSAFGVMATTAKIARDPHAPPRSCTFSPYPRCAHLLPRWTDFVVFAVVTKTWPQNTGIEVNTLVGLVGFAGLAALGVWKDIHGVPVWFLRRLKAAVTASLVLDIAQVVLAGVYLPTAPTHGRYRLPVPLEPLLHLVFPTFRVLVLVLLFFALISPRAAYTPVASADGLEAAPTTSLLQPPLASTGLNAPADSSKYGTFRSTGSAPNTASGPTTRAHTPDPLAPATAQAELEGQGHQPRPVLGGDLGAPASHHTVPLAVEEPRAAAARDAVHPPAHRWPLHQLRGARRACEGDRDIREGRRSLAVAVPARYSDREMSQLSFNHLLNLSFAFHTHRKTGEVLRILDRGAAINHTFELILFSVVPTFVDIIVALVVFTIRLDWTLAAVIFFVMFAYISASVILTRWRTKLRRQMNERDVVTRGIHTDCLLNYETVKYFNGEEHEGDRYREAIREYQALEYRVMLSLNLLNLIQNFIISVGLLVGSFIVASRVTSGQLEPSEFVFFITYLAQLYGPLNSLGYIYRSMNQSLVDTERLLKLLSEPTEINDKPNAPDLIVSEGEISFENVNFSYDGRSTALKGVSFTVPKGSSVALVGESGAGKSTILRLLYRFYDLKEGEGRITIDGQDIRDVTQTSLRKAIGVVPQDSVLFNASIEYNIGYGKFGASHEEIEEAAKAAQMHDKIANFPDGYATKVGERGIRLSGGEKQRVAIARTLLKNPPVLLLDEATSALDTSTERDIQKALQNLMHGRSSLSIAHRLSTIASADLILVLKDGQIVEQGSHKELLDQNGIFASMWADQVSATEEPVSGYQIEQDTAAPDTEETPEVVESADIIPAAVQVAEEANEDPAPVAEPDLVPVSAPEXPXPAPAPSVSSPGVTFVPEVSTPPRTGTPDPESEPKRKRISSQNFQRLARRISISGRRQSSVASVAASFVPGLKREGSSSKKDDTPQGTASPNPSVQSEGDKDKEQRKKDKKDKKKRKSTLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.17
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.15
7 0.14
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.14
12 0.13
13 0.15
14 0.14
15 0.13
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.1
20 0.09
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.1
27 0.12
28 0.15
29 0.21
30 0.22
31 0.24
32 0.28
33 0.27
34 0.27
35 0.3
36 0.37
37 0.34
38 0.38
39 0.37
40 0.34
41 0.34
42 0.35
43 0.31
44 0.21
45 0.18
46 0.13
47 0.12
48 0.15
49 0.14
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.12
56 0.09
57 0.09
58 0.11
59 0.15
60 0.21
61 0.22
62 0.31
63 0.38
64 0.41
65 0.47
66 0.5
67 0.48
68 0.5
69 0.57
70 0.59
71 0.56
72 0.55
73 0.56
74 0.62
75 0.67
76 0.67
77 0.68
78 0.6
79 0.58
80 0.6
81 0.57
82 0.51
83 0.46
84 0.41
85 0.34
86 0.31
87 0.28
88 0.23
89 0.19
90 0.15
91 0.1
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.09
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.11
118 0.12
119 0.15
120 0.21
121 0.25
122 0.34
123 0.44
124 0.45
125 0.46
126 0.51
127 0.57
128 0.5
129 0.52
130 0.5
131 0.5
132 0.56
133 0.6
134 0.57
135 0.52
136 0.56
137 0.52
138 0.53
139 0.5
140 0.52
141 0.49
142 0.49
143 0.49
144 0.45
145 0.43
146 0.35
147 0.29
148 0.21
149 0.16
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.15
155 0.17
156 0.16
157 0.18
158 0.2
159 0.21
160 0.24
161 0.27
162 0.24
163 0.22
164 0.21
165 0.2
166 0.18
167 0.15
168 0.11
169 0.07
170 0.06
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.02
175 0.02
176 0.02
177 0.02
178 0.02
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.06
185 0.06
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.18
191 0.2
192 0.23
193 0.23
194 0.24
195 0.26
196 0.27
197 0.26
198 0.27
199 0.27
200 0.24
201 0.26
202 0.25
203 0.22
204 0.21
205 0.2
206 0.12
207 0.11
208 0.08
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.06
222 0.06
223 0.1
224 0.16
225 0.2
226 0.22
227 0.26
228 0.29
229 0.34
230 0.37
231 0.35
232 0.36
233 0.37
234 0.35
235 0.33
236 0.32
237 0.26
238 0.22
239 0.2
240 0.16
241 0.11
242 0.11
243 0.13
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.11
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.09
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.12
286 0.11
287 0.09
288 0.09
289 0.12
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.14
294 0.15
295 0.16
296 0.16
297 0.14
298 0.12
299 0.13
300 0.15
301 0.15
302 0.15
303 0.14
304 0.18
305 0.18
306 0.21
307 0.22
308 0.25
309 0.24
310 0.24
311 0.24
312 0.21
313 0.19
314 0.15
315 0.14
316 0.11
317 0.13
318 0.14
319 0.16
320 0.17
321 0.19
322 0.2
323 0.22
324 0.25
325 0.22
326 0.22
327 0.19
328 0.19
329 0.18
330 0.16
331 0.12
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.09
337 0.08
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.14
344 0.13
345 0.14
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.1
355 0.09
356 0.08
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.11
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.08
369 0.07
370 0.08
371 0.1
372 0.12
373 0.13
374 0.14
375 0.16
376 0.17
377 0.19
378 0.25
379 0.28
380 0.27
381 0.27
382 0.35
383 0.42
384 0.47
385 0.49
386 0.47
387 0.49
388 0.59
389 0.58
390 0.49
391 0.42
392 0.41
393 0.36
394 0.37
395 0.32
396 0.3
397 0.31
398 0.35
399 0.36
400 0.35
401 0.37
402 0.32
403 0.31
404 0.26
405 0.24
406 0.2
407 0.19
408 0.21
409 0.2
410 0.2
411 0.19
412 0.17
413 0.18
414 0.17
415 0.17
416 0.14
417 0.13
418 0.15
419 0.16
420 0.17
421 0.19
422 0.2
423 0.21
424 0.23
425 0.22
426 0.2
427 0.19
428 0.17
429 0.14
430 0.14
431 0.12
432 0.08
433 0.09
434 0.12
435 0.14
436 0.16
437 0.17
438 0.17
439 0.18
440 0.2
441 0.23
442 0.25
443 0.27
444 0.27
445 0.28
446 0.27
447 0.26
448 0.23
449 0.2
450 0.15
451 0.1
452 0.1
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.07
457 0.07
458 0.06
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.03
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.02
477 0.02
478 0.02
479 0.02
480 0.02
481 0.02
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.04
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.02
495 0.02
496 0.02
497 0.03
498 0.03
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.06
505 0.08
506 0.1
507 0.12
508 0.19
509 0.22
510 0.29
511 0.39
512 0.47
513 0.54
514 0.6
515 0.68
516 0.68
517 0.72
518 0.65
519 0.58
520 0.5
521 0.42
522 0.34
523 0.25
524 0.2
525 0.13
526 0.12
527 0.1
528 0.1
529 0.08
530 0.11
531 0.11
532 0.1
533 0.09
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.09
539 0.08
540 0.09
541 0.11
542 0.11
543 0.11
544 0.12
545 0.15
546 0.14
547 0.15
548 0.14
549 0.13
550 0.12
551 0.14
552 0.13
553 0.13
554 0.14
555 0.16
556 0.17
557 0.18
558 0.2
559 0.2
560 0.18
561 0.16
562 0.15
563 0.13
564 0.12
565 0.09
566 0.07
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.05
572 0.06
573 0.07
574 0.06
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.03
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.02
586 0.02
587 0.02
588 0.02
589 0.03
590 0.03
591 0.03
592 0.04
593 0.05
594 0.06
595 0.06
596 0.07
597 0.08
598 0.09
599 0.1
600 0.09
601 0.1
602 0.1
603 0.09
604 0.09
605 0.07
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.06
610 0.05
611 0.06
612 0.05
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.05
619 0.05
620 0.06
621 0.05
622 0.07
623 0.08
624 0.08
625 0.11
626 0.12
627 0.13
628 0.13
629 0.13
630 0.12
631 0.12
632 0.14
633 0.12
634 0.11
635 0.12
636 0.11
637 0.11
638 0.11
639 0.09
640 0.09
641 0.12
642 0.12
643 0.13
644 0.13
645 0.14
646 0.21
647 0.21
648 0.21
649 0.2
650 0.2
651 0.19
652 0.23
653 0.22
654 0.15
655 0.16
656 0.15
657 0.16
658 0.15
659 0.14
660 0.1
661 0.1
662 0.1
663 0.1
664 0.1
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.07
669 0.08
670 0.07
671 0.07
672 0.08
673 0.08
674 0.1
675 0.1
676 0.11
677 0.11
678 0.14
679 0.15
680 0.14
681 0.14
682 0.15
683 0.16
684 0.17
685 0.16
686 0.17
687 0.16
688 0.16
689 0.16
690 0.14
691 0.11
692 0.11
693 0.11
694 0.07
695 0.07
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.05
700 0.05
701 0.05
702 0.04
703 0.05
704 0.06
705 0.08
706 0.09
707 0.09
708 0.1
709 0.13
710 0.14
711 0.18
712 0.17
713 0.16
714 0.22
715 0.21
716 0.23
717 0.24
718 0.24
719 0.21
720 0.21
721 0.21
722 0.14
723 0.15
724 0.13
725 0.12
726 0.12
727 0.12
728 0.12
729 0.12
730 0.12
731 0.13
732 0.13
733 0.12
734 0.17
735 0.19
736 0.19
737 0.22
738 0.22
739 0.2
740 0.2
741 0.24
742 0.22
743 0.24
744 0.24
745 0.2
746 0.21
747 0.21
748 0.21
749 0.16
750 0.12
751 0.09
752 0.07
753 0.07
754 0.07
755 0.06
756 0.07
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.06
766 0.1
767 0.11
768 0.11
769 0.12
770 0.12
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.09
775 0.08
776 0.08
777 0.08
778 0.08
779 0.12
780 0.12
781 0.13
782 0.16
783 0.16
784 0.17
785 0.19
786 0.21
787 0.17
788 0.16
789 0.19
790 0.16
791 0.17
792 0.17
793 0.16
794 0.13
795 0.15
796 0.17
797 0.15
798 0.15
799 0.15
800 0.16
801 0.16
802 0.15
803 0.16
804 0.22
805 0.26
806 0.28
807 0.26
808 0.25
809 0.29
810 0.31
811 0.31
812 0.27
813 0.25
814 0.28
815 0.31
816 0.35
817 0.34
818 0.33
819 0.33
820 0.3
821 0.28
822 0.23
823 0.21
824 0.18
825 0.16
826 0.14
827 0.13
828 0.13
829 0.1
830 0.09
831 0.08
832 0.06
833 0.06
834 0.05
835 0.07
836 0.1
837 0.14
838 0.14
839 0.15
840 0.16
841 0.19
842 0.23
843 0.25
844 0.25
845 0.23
846 0.26
847 0.28
848 0.3
849 0.28
850 0.23
851 0.19
852 0.18
853 0.18
854 0.18
855 0.18
856 0.22
857 0.21
858 0.22
859 0.21
860 0.21
861 0.19
862 0.18
863 0.16
864 0.1
865 0.1
866 0.09
867 0.08
868 0.09
869 0.08
870 0.06
871 0.06
872 0.05
873 0.05
874 0.06
875 0.06
876 0.05
877 0.07
878 0.08
879 0.09
880 0.13
881 0.15
882 0.16
883 0.17
884 0.17
885 0.19
886 0.21
887 0.24
888 0.25
889 0.23
890 0.22
891 0.21
892 0.22
893 0.17
894 0.15
895 0.12
896 0.08
897 0.08
898 0.08
899 0.08
900 0.07
901 0.08
902 0.11
903 0.1
904 0.09
905 0.09
906 0.09
907 0.1
908 0.11
909 0.12
910 0.09
911 0.08
912 0.11
913 0.12
914 0.12
915 0.11
916 0.11
917 0.11
918 0.12
919 0.12
920 0.1
921 0.09
922 0.1
923 0.11
924 0.12
925 0.11
926 0.11
927 0.1
928 0.1
929 0.1
930 0.08
931 0.08
932 0.07
933 0.08
934 0.06
935 0.06
936 0.06
937 0.06
938 0.06
939 0.05
940 0.04
941 0.04
942 0.05
943 0.06
944 0.07
945 0.07
946 0.08
947 0.08
948 0.09
949 0.08
950 0.08
951 0.09
952 0.08
953 0.09
954 0.09
955 0.09
956 0.1
957 0.12
958 0.12
959 0.1
960 0.1
961 0.11
962 0.12
963 0.13
964 0.12
965 0.13
966 0.14
967 0.17
968 0.18
969 0.17
970 0.18
971 0.19
972 0.23
973 0.21
974 0.22
975 0.19
976 0.2
977 0.2
978 0.18
979 0.16
980 0.12
981 0.14
982 0.13
983 0.15
984 0.17
985 0.2
986 0.2
987 0.23
988 0.26
989 0.29
990 0.31
991 0.37
992 0.38
993 0.41
994 0.45
995 0.51
996 0.53
997 0.58
998 0.63
999 0.64
1000 0.67
1001 0.64
1002 0.67
1003 0.69
1004 0.74
1005 0.75
1006 0.79
1007 0.8
1008 0.79
1009 0.79
1010 0.79
1011 0.75
1012 0.69
1013 0.64
1014 0.57
1015 0.49
1016 0.51
1017 0.58
1018 0.59
1019 0.6
1020 0.61
1021 0.56
1022 0.52
1023 0.5
1024 0.45
1025 0.39
1026 0.32
1027 0.24
1028 0.19
1029 0.19
1030 0.19
1031 0.18
1032 0.14
1033 0.12
1034 0.13
1035 0.13
1036 0.16
1037 0.16
1038 0.17
1039 0.21
1040 0.3
1041 0.34
1042 0.4
1043 0.44
1044 0.48
1045 0.51
1046 0.54
1047 0.59
1048 0.56
1049 0.55
1050 0.51
1051 0.5
1052 0.47
1053 0.44
1054 0.44
1055 0.41
1056 0.37
1057 0.32
1058 0.29
1059 0.28
1060 0.26
1061 0.3
1062 0.31
1063 0.33
1064 0.35
1065 0.4
1066 0.46
1067 0.53
1068 0.6
1069 0.63
1070 0.69
1071 0.72
1072 0.8
1073 0.85
1074 0.89
1075 0.91
1076 0.94
1077 0.96
1078 0.96
1079 0.97