Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9XXS5

Protein Details
Accession A0A4Y9XXS5    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-104TDDGASKKRLKQDKSPKKKKEKKDNAAESAKVKVKKDKKKAKAEVLEPSEBasic
147-166SISKSGKTPKVRTKTPKFVPHydrophilic
442-465LDETKLKFAKRKLRVQRCKTLPGGHydrophilic
475-499KAAPPAKGDKEKRPQQKRPAVPIVVHydrophilic
525-545DADRVARRLAKKKARNALGRAHydrophilic
566-596AGERKGGAPKKEQKKSRVRSERNAEKRNVKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-96KKRKKTGTDDGASKKRLKQDKSPKKKKEKKDNAAESAKVKVKKDKKKAK
452-598AKRKLRVQRCKTLPGGKLPSVKISGKAAPPAKGDKEKRPQQKRPAVPIVVPKGNPLLGEKLAHLPKEQRKEAKAADADRVARRLAKKKARNALGRAGVKEQQGAGAKRDRERVRKSAGERKGGAPKKEQKKSRVRSERNAEKRNVKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSLSSFLLGGTPKPIDNDLDALFRSTTVAKSLVSITEPTPGPSSEVEKKRKKTGTDDGASKKRLKQDKSPKKKKEKKDNAAESAKVKVKKDKKKAKAEVLEPSEDEDNADIEDAYLTKTQTIQPEPVENASDSSGDEGDPSQLVHESISKSGKTPKVRTKTPKFVPPEETKEQRDARTIFVGNVPIDVAKNKSLLKQXKKHILTHVPHAKIESVRFRSVAFQTPTTKLTGAADEGARKPPLTFTPTTESEGRQHDRERAASWRSSXGGEEKEPVKRQTPQEKKRIAFIKQELHDQVDAVHAYVVFAYPAPRAANLPALEVLAPHDAAALAVEKCDGTVFLERTLRVDLVARPAADAKSVGGGGGAGGRPEEDTTLISAEKGPRGQEDADDREEDEEPEEEDTEDKPKTWVTRVRIIRDRDTQLGKGFAYVQFADRECVDELLALDETKLKFAKRKLRVQRCKTLPGGKLPSVKISGKAAPPAKGDKEKRPQQKRPAVPIVVPKGNPLLGEKLAHLPKEQRKEAKAADADRVARRLAKKKARNALGRAGVKEQQGAGAKRDRERVRKSAGERKGGAPKKEQKKSRVRSERNAEKRNVKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.22
4 0.25
5 0.22
6 0.24
7 0.23
8 0.23
9 0.21
10 0.19
11 0.18
12 0.16
13 0.15
14 0.15
15 0.16
16 0.14
17 0.16
18 0.18
19 0.17
20 0.18
21 0.19
22 0.17
23 0.22
24 0.22
25 0.22
26 0.23
27 0.22
28 0.22
29 0.22
30 0.29
31 0.32
32 0.41
33 0.49
34 0.56
35 0.62
36 0.7
37 0.74
38 0.72
39 0.72
40 0.73
41 0.73
42 0.71
43 0.74
44 0.74
45 0.75
46 0.74
47 0.7
48 0.65
49 0.64
50 0.65
51 0.62
52 0.64
53 0.67
54 0.74
55 0.8
56 0.86
57 0.88
58 0.91
59 0.95
60 0.95
61 0.95
62 0.95
63 0.94
64 0.94
65 0.93
66 0.91
67 0.87
68 0.79
69 0.7
70 0.66
71 0.62
72 0.55
73 0.49
74 0.49
75 0.54
76 0.6
77 0.7
78 0.73
79 0.77
80 0.83
81 0.89
82 0.9
83 0.88
84 0.83
85 0.82
86 0.76
87 0.68
88 0.57
89 0.51
90 0.41
91 0.32
92 0.27
93 0.18
94 0.13
95 0.1
96 0.1
97 0.07
98 0.06
99 0.07
100 0.06
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.11
106 0.14
107 0.2
108 0.23
109 0.25
110 0.26
111 0.3
112 0.31
113 0.31
114 0.3
115 0.24
116 0.22
117 0.19
118 0.17
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.11
133 0.11
134 0.15
135 0.18
136 0.18
137 0.19
138 0.27
139 0.33
140 0.38
141 0.46
142 0.52
143 0.57
144 0.66
145 0.75
146 0.77
147 0.8
148 0.79
149 0.79
150 0.75
151 0.72
152 0.71
153 0.68
154 0.66
155 0.62
156 0.62
157 0.56
158 0.57
159 0.56
160 0.5
161 0.49
162 0.42
163 0.38
164 0.37
165 0.34
166 0.28
167 0.26
168 0.27
169 0.2
170 0.19
171 0.16
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.1
177 0.13
178 0.14
179 0.2
180 0.29
181 0.37
182 0.43
183 0.49
184 0.55
185 0.61
186 0.63
187 0.62
188 0.61
189 0.56
190 0.6
191 0.59
192 0.54
193 0.46
194 0.44
195 0.41
196 0.34
197 0.35
198 0.33
199 0.3
200 0.29
201 0.29
202 0.29
203 0.31
204 0.31
205 0.34
206 0.28
207 0.27
208 0.29
209 0.31
210 0.32
211 0.29
212 0.27
213 0.19
214 0.18
215 0.15
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.13
220 0.14
221 0.16
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.15
226 0.17
227 0.2
228 0.19
229 0.2
230 0.26
231 0.28
232 0.31
233 0.3
234 0.28
235 0.27
236 0.32
237 0.31
238 0.28
239 0.28
240 0.3
241 0.31
242 0.31
243 0.29
244 0.28
245 0.28
246 0.27
247 0.26
248 0.23
249 0.22
250 0.22
251 0.23
252 0.2
253 0.2
254 0.21
255 0.23
256 0.27
257 0.3
258 0.3
259 0.31
260 0.34
261 0.38
262 0.47
263 0.55
264 0.57
265 0.62
266 0.67
267 0.65
268 0.66
269 0.65
270 0.58
271 0.54
272 0.51
273 0.49
274 0.43
275 0.47
276 0.4
277 0.36
278 0.32
279 0.25
280 0.2
281 0.14
282 0.12
283 0.08
284 0.08
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.03
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.07
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.09
323 0.1
324 0.12
325 0.14
326 0.14
327 0.16
328 0.17
329 0.15
330 0.11
331 0.13
332 0.11
333 0.15
334 0.16
335 0.15
336 0.14
337 0.16
338 0.15
339 0.14
340 0.13
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.06
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.09
363 0.11
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.16
369 0.16
370 0.17
371 0.21
372 0.23
373 0.24
374 0.24
375 0.23
376 0.22
377 0.22
378 0.2
379 0.15
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.13
392 0.15
393 0.21
394 0.28
395 0.29
396 0.38
397 0.44
398 0.51
399 0.57
400 0.59
401 0.59
402 0.59
403 0.58
404 0.54
405 0.52
406 0.46
407 0.4
408 0.38
409 0.31
410 0.25
411 0.23
412 0.18
413 0.18
414 0.16
415 0.15
416 0.16
417 0.17
418 0.17
419 0.15
420 0.17
421 0.14
422 0.14
423 0.12
424 0.1
425 0.1
426 0.11
427 0.11
428 0.08
429 0.08
430 0.11
431 0.12
432 0.13
433 0.15
434 0.15
435 0.2
436 0.28
437 0.38
438 0.43
439 0.54
440 0.62
441 0.72
442 0.82
443 0.84
444 0.87
445 0.83
446 0.82
447 0.78
448 0.75
449 0.68
450 0.66
451 0.65
452 0.59
453 0.59
454 0.53
455 0.5
456 0.47
457 0.44
458 0.37
459 0.34
460 0.34
461 0.3
462 0.37
463 0.36
464 0.35
465 0.37
466 0.41
467 0.43
468 0.48
469 0.51
470 0.54
471 0.61
472 0.67
473 0.74
474 0.79
475 0.82
476 0.84
477 0.88
478 0.87
479 0.86
480 0.86
481 0.78
482 0.71
483 0.71
484 0.67
485 0.62
486 0.53
487 0.45
488 0.39
489 0.36
490 0.33
491 0.26
492 0.23
493 0.2
494 0.21
495 0.21
496 0.26
497 0.29
498 0.29
499 0.29
500 0.34
501 0.4
502 0.48
503 0.54
504 0.54
505 0.54
506 0.6
507 0.61
508 0.61
509 0.59
510 0.52
511 0.5
512 0.48
513 0.5
514 0.46
515 0.45
516 0.38
517 0.37
518 0.42
519 0.45
520 0.51
521 0.56
522 0.61
523 0.69
524 0.78
525 0.81
526 0.82
527 0.79
528 0.78
529 0.77
530 0.73
531 0.66
532 0.61
533 0.56
534 0.49
535 0.44
536 0.35
537 0.31
538 0.34
539 0.33
540 0.33
541 0.37
542 0.41
543 0.44
544 0.53
545 0.56
546 0.59
547 0.65
548 0.68
549 0.68
550 0.72
551 0.75
552 0.76
553 0.75
554 0.74
555 0.69
556 0.68
557 0.7
558 0.69
559 0.66
560 0.66
561 0.68
562 0.7
563 0.77
564 0.79
565 0.78
566 0.82
567 0.87
568 0.88
569 0.89
570 0.87
571 0.88
572 0.91
573 0.91
574 0.91
575 0.9
576 0.87