FuNGI

A0A4Y9ZCA1

Protein Details

Accession

A0A4Y9ZCA1

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
102-121	GNLIKNMKFKRKPKMADGEV	Hydrophilic
219-243	KADRTPSPKPLRKGKARTNVRRIDS	Hydrophilic
338-357	EEPDKRPKPPTRKAQPFPLA	Hydrophilic
692-712	QQQVAKPRPRMIRKRHMDEGS	Hydrophilic
820-839	APPAEAKSDRPRPRPVNRST	Hydrophilic
847-870	DNTEATPRPRRTRPSSRDKSDNES	Hydrophilic
890-914	TTIPDQPDTRKRSQWRKNLGNSYTM	Hydrophilic
923-945	IEARSSPPSRMTKRKGKDSWLLS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
173-196	RPLKKKEAPIKPVVPPRRARQPQE
201-239	LSPPGRLPSPDPKGKGKAKADRTPSPKPLRKGKARTNVR
313-317	RSKKA
724-730	GKIKRKK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MEQMNSSQLSRGVSMHSDTNLRLAKRPTASSSTQNNIIFHDMGTTQYQKGPKPTHNPRTYGAKKGRTARVSTGPDDIDFLSQESRDAEKPTPPEVSKYETHGNLIKNMKFKRKPKMADGEVEDANSNSQRSETPSSSTASSSKAHVGHSALENLSGNENKLHSNPVSSRVASRPLKKKEAPIKPVVPPRRARQPQEFPLSLSPPGRLPSPDPKGKGKAKADRTPSPKPLRKGKARTNVRRIDSEDPSPPTKRNTSRAPRSSQDDRDSSSDSDIEVVEEAEEDMQLRKNRVASRRKLEAETEEDDTPRNHSVRRSKKAKPAAPFPEIEPLSGAADSDDEEPDKRPKPPTRKAQPFPLADSPLARPSTPPHNGKGKQKAEENYPMPSPLAKKASKTSFPTMSPLSSPVHGNPKMGSPVKMSRSMGSLYEDREDILLSNDDSLLIDSTVDPSTLCPYCDEPLPPSPTPHLQSLLAAAKRKSYPEPRPGNPRGLKAPLPTFITICQRHQFEALEMPKAKKRGWPTSIDFSKLRSRGREESMFWNHVVKEVQAMGSRAVVGVKGQFDSFSKTQPGYYGELGSMVIHQTIYNLFPPSSFDADSISPLTPTEFIQRVLVPEAALALIMEDMGFDRDHAAITMRESAAYGVAMFPDSGDGDGLGHGAGVGEDIVRERARARRKELEVEERVEEKMLKEAQQQVAKPRPRMIRKRHMDEGSATETDSTADGKGKIKRKKLSSESDEAAGGSTPRRGAVNPAVTVEPKTKTSTALGKGKPPMSVNSRATRRSASVQMHTDEDSDTLVPTTGKEKAKASVVSDDDEVQIVAPPAEAKSDRPRPRPVNRSTISLIDDDDNTEATPRPRRTRPSSRDKSDNESTTSKAAFCPLQAARNRQGSTTIPDQPDTRKRSQWRKNLGNSYTMGPGSSSDEIEARSSPPSRMTKRKGKDSWLLSDSLSSSP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.23
3	0.23
4	0.24
5	0.23
6	0.3
7	0.32
8	0.32
9	0.35
10	0.37
11	0.42
12	0.44
13	0.48
14	0.47
15	0.48
16	0.5
17	0.53
18	0.56
19	0.54
20	0.56
21	0.55
22	0.49
23	0.45
24	0.45
25	0.37
26	0.29
27	0.26
28	0.19
29	0.18
30	0.22
31	0.22
32	0.2
33	0.24
34	0.29
35	0.3
36	0.39
37	0.44
38	0.49
39	0.57
40	0.66
41	0.72
42	0.75
43	0.76
44	0.71
45	0.75
46	0.71
47	0.71
48	0.69
49	0.67
50	0.67
51	0.72
52	0.76
53	0.71
54	0.71
55	0.67
56	0.68
57	0.64
58	0.6
59	0.55
60	0.47
61	0.41
62	0.38
63	0.32
64	0.24
65	0.19
66	0.18
67	0.15
68	0.13
69	0.14
70	0.15
71	0.17
72	0.18
73	0.22
74	0.23
75	0.27
76	0.31
77	0.34
78	0.39
79	0.36
80	0.39
81	0.38
82	0.41
83	0.38
84	0.4
85	0.43
86	0.37
87	0.4
88	0.4
89	0.38
90	0.4
91	0.45
92	0.43
93	0.44
94	0.5
95	0.57
96	0.61
97	0.67
98	0.7
99	0.73
100	0.76
101	0.77
102	0.81
103	0.76
104	0.74
105	0.72
106	0.66
107	0.56
108	0.51
109	0.41
110	0.31
111	0.28
112	0.21
113	0.16
114	0.11
115	0.12
116	0.12
117	0.18
118	0.25
119	0.24
120	0.27
121	0.29
122	0.31
123	0.31
124	0.32
125	0.27
126	0.24
127	0.23
128	0.21
129	0.24
130	0.24
131	0.24
132	0.24
133	0.24
134	0.25
135	0.26
136	0.27
137	0.22
138	0.21
139	0.21
140	0.19
141	0.21
142	0.18
143	0.16
144	0.15
145	0.16
146	0.17
147	0.17
148	0.21
149	0.18
150	0.23
151	0.24
152	0.28
153	0.31
154	0.3
155	0.33
156	0.32
157	0.4
158	0.41
159	0.49
160	0.53
161	0.56
162	0.64
163	0.64
164	0.71
165	0.72
166	0.76
167	0.73
168	0.72
169	0.7
170	0.69
171	0.76
172	0.74
173	0.71
174	0.68
175	0.67
176	0.69
177	0.71
178	0.7
179	0.71
180	0.73
181	0.73
182	0.75
183	0.69
184	0.61
185	0.58
186	0.54
187	0.46
188	0.37
189	0.3
190	0.24
191	0.24
192	0.23
193	0.2
194	0.23
195	0.3
196	0.37
197	0.42
198	0.44
199	0.49
200	0.56
201	0.61
202	0.64
203	0.64
204	0.65
205	0.68
206	0.71
207	0.72
208	0.73
209	0.74
210	0.73
211	0.73
212	0.75
213	0.73
214	0.72
215	0.75
216	0.76
217	0.79
218	0.8
219	0.8
220	0.8
221	0.84
222	0.88
223	0.87
224	0.86
225	0.79
226	0.74
227	0.69
228	0.65
229	0.58
230	0.52
231	0.47
232	0.43
233	0.44
234	0.42
235	0.4
236	0.38
237	0.43
238	0.44
239	0.46
240	0.52
241	0.58
242	0.66
243	0.71
244	0.72
245	0.68
246	0.69
247	0.7
248	0.67
249	0.62
250	0.54
251	0.5
252	0.47
253	0.46
254	0.4
255	0.33
256	0.26
257	0.2
258	0.18
259	0.15
260	0.12
261	0.08
262	0.07
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.06
270	0.11
271	0.13
272	0.15
273	0.17
274	0.22
275	0.28
276	0.37
277	0.46
278	0.49
279	0.55
280	0.62
281	0.63
282	0.6
283	0.57
284	0.52
285	0.47
286	0.41
287	0.37
288	0.29
289	0.26
290	0.25
291	0.23
292	0.22
293	0.2
294	0.18
295	0.17
296	0.24
297	0.34
298	0.43
299	0.52
300	0.57
301	0.61
302	0.69
303	0.77
304	0.76
305	0.72
306	0.71
307	0.69
308	0.64
309	0.58
310	0.5
311	0.48
312	0.42
313	0.36
314	0.27
315	0.21
316	0.18
317	0.17
318	0.15
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.11
327	0.16
328	0.19
329	0.21
330	0.29
331	0.38
332	0.47
333	0.56
334	0.64
335	0.7
336	0.78
337	0.79
338	0.8
339	0.79
340	0.71
341	0.67
342	0.61
343	0.52
344	0.42
345	0.4
346	0.31
347	0.28
348	0.26
349	0.21
350	0.17
351	0.18
352	0.26
353	0.31
354	0.32
355	0.32
356	0.41
357	0.46
358	0.54
359	0.61
360	0.58
361	0.55
362	0.58
363	0.56
364	0.52
365	0.56
366	0.49
367	0.41
368	0.36
369	0.32
370	0.27
371	0.26
372	0.22
373	0.19
374	0.24
375	0.22
376	0.24
377	0.3
378	0.36
379	0.39
380	0.42
381	0.42
382	0.4
383	0.39
384	0.4
385	0.35
386	0.3
387	0.25
388	0.23
389	0.19
390	0.16
391	0.16
392	0.15
393	0.22
394	0.22
395	0.22
396	0.2
397	0.21
398	0.25
399	0.26
400	0.24
401	0.2
402	0.25
403	0.27
404	0.31
405	0.3
406	0.25
407	0.26
408	0.25
409	0.22
410	0.19
411	0.18
412	0.15
413	0.15
414	0.14
415	0.13
416	0.12
417	0.11
418	0.08
419	0.08
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.05
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.09
437	0.1
438	0.1
439	0.09
440	0.11
441	0.12
442	0.13
443	0.14
444	0.13
445	0.18
446	0.24
447	0.23
448	0.23
449	0.24
450	0.26
451	0.27
452	0.26
453	0.22
454	0.17
455	0.16
456	0.18
457	0.2
458	0.19
459	0.19
460	0.18
461	0.19
462	0.2
463	0.22
464	0.24
465	0.28
466	0.34
467	0.42
468	0.49
469	0.49
470	0.58
471	0.59
472	0.63
473	0.57
474	0.53
475	0.46
476	0.42
477	0.4
478	0.34
479	0.33
480	0.26
481	0.26
482	0.23
483	0.2
484	0.19
485	0.25
486	0.24
487	0.24
488	0.26
489	0.24
490	0.24
491	0.25
492	0.23
493	0.17
494	0.22
495	0.21
496	0.22
497	0.22
498	0.23
499	0.25
500	0.26
501	0.26
502	0.23
503	0.29
504	0.33
505	0.36
506	0.41
507	0.43
508	0.5
509	0.51
510	0.5
511	0.44
512	0.38
513	0.41
514	0.39
515	0.36
516	0.3
517	0.34
518	0.36
519	0.41
520	0.41
521	0.37
522	0.41
523	0.43
524	0.42
525	0.36
526	0.34
527	0.28
528	0.27
529	0.24
530	0.16
531	0.12
532	0.11
533	0.12
534	0.11
535	0.12
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.08
540	0.08
541	0.06
542	0.05
543	0.06
544	0.07
545	0.07
546	0.07
547	0.08
548	0.08
549	0.14
550	0.15
551	0.15
552	0.17
553	0.16
554	0.17
555	0.18
556	0.2
557	0.17
558	0.18
559	0.16
560	0.14
561	0.14
562	0.14
563	0.12
564	0.09
565	0.06
566	0.05
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.06
571	0.07
572	0.08
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.12
577	0.14
578	0.16
579	0.15
580	0.13
581	0.14
582	0.15
583	0.16
584	0.15
585	0.12
586	0.1
587	0.1
588	0.1
589	0.09
590	0.09
591	0.13
592	0.12
593	0.13
594	0.15
595	0.15
596	0.16
597	0.17
598	0.16
599	0.11
600	0.1
601	0.09
602	0.08
603	0.07
604	0.05
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.02
610	0.03
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.08
619	0.07
620	0.09
621	0.12
622	0.11
623	0.11
624	0.11
625	0.11
626	0.1
627	0.09
628	0.08
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.04
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.04
639	0.04
640	0.05
641	0.05
642	0.04
643	0.03
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.03
649	0.02
650	0.03
651	0.04
652	0.06
653	0.06
654	0.07
655	0.1
656	0.17
657	0.27
658	0.33
659	0.4
660	0.47
661	0.51
662	0.59
663	0.63
664	0.65
665	0.6
666	0.57
667	0.52
668	0.44
669	0.4
670	0.33
671	0.27
672	0.18
673	0.19
674	0.18
675	0.17
676	0.2
677	0.27
678	0.32
679	0.36
680	0.37
681	0.4
682	0.47
683	0.51
684	0.5
685	0.51
686	0.54
687	0.6
688	0.68
689	0.7
690	0.72
691	0.76
692	0.81
693	0.82
694	0.75
695	0.68
696	0.6
697	0.56
698	0.49
699	0.4
700	0.32
701	0.24
702	0.21
703	0.18
704	0.16
705	0.11
706	0.07
707	0.09
708	0.11
709	0.17
710	0.24
711	0.32
712	0.4
713	0.48
714	0.55
715	0.6
716	0.68
717	0.71
718	0.75
719	0.73
720	0.72
721	0.65
722	0.58
723	0.51
724	0.41
725	0.33
726	0.23
727	0.16
728	0.11
729	0.1
730	0.09
731	0.1
732	0.11
733	0.11
734	0.17
735	0.24
736	0.29
737	0.28
738	0.3
739	0.3
740	0.3
741	0.32
742	0.29
743	0.24
744	0.2
745	0.23
746	0.22
747	0.23
748	0.26
749	0.32
750	0.36
751	0.42
752	0.42
753	0.45
754	0.51
755	0.5
756	0.49
757	0.44
758	0.42
759	0.39
760	0.46
761	0.45
762	0.48
763	0.52
764	0.52
765	0.53
766	0.49
767	0.47
768	0.43
769	0.45
770	0.42
771	0.42
772	0.44
773	0.43
774	0.42
775	0.39
776	0.35
777	0.27
778	0.22
779	0.17
780	0.13
781	0.11
782	0.09
783	0.09
784	0.09
785	0.09
786	0.12
787	0.18
788	0.2
789	0.23
790	0.24
791	0.27
792	0.33
793	0.35
794	0.35
795	0.35
796	0.34
797	0.33
798	0.32
799	0.3
800	0.24
801	0.22
802	0.19
803	0.12
804	0.11
805	0.1
806	0.08
807	0.08
808	0.08
809	0.08
810	0.12
811	0.13
812	0.16
813	0.26
814	0.36
815	0.45
816	0.51
817	0.61
818	0.66
819	0.76
820	0.81
821	0.78
822	0.79
823	0.72
824	0.72
825	0.65
826	0.59
827	0.51
828	0.42
829	0.36
830	0.27
831	0.25
832	0.21
833	0.18
834	0.15
835	0.12
836	0.13
837	0.14
838	0.17
839	0.26
840	0.33
841	0.4
842	0.48
843	0.57
844	0.65
845	0.74
846	0.79
847	0.81
848	0.84
849	0.84
850	0.86
851	0.82
852	0.8
853	0.78
854	0.72
855	0.66
856	0.59
857	0.52
858	0.47
859	0.43
860	0.36
861	0.27
862	0.27
863	0.22
864	0.2
865	0.25
866	0.24
867	0.3
868	0.36
869	0.42
870	0.46
871	0.53
872	0.54
873	0.47
874	0.48
875	0.44
876	0.44
877	0.44
878	0.44
879	0.38
880	0.39
881	0.42
882	0.47
883	0.53
884	0.54
885	0.54
886	0.55
887	0.63
888	0.71
889	0.79
890	0.8
891	0.82
892	0.84
893	0.88
894	0.89
895	0.82
896	0.76
897	0.68
898	0.6
899	0.54
900	0.43
901	0.33
902	0.23
903	0.22
904	0.22
905	0.21
906	0.19
907	0.16
908	0.17
909	0.18
910	0.2
911	0.2
912	0.16
913	0.2
914	0.21
915	0.22
916	0.29
917	0.37
918	0.44
919	0.54
920	0.62
921	0.67
922	0.75
923	0.84
924	0.82
925	0.81
926	0.82
927	0.78
928	0.77
929	0.7
930	0.62
931	0.51
932	0.47

A0A4Y9ZCA1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer