FuNGI

A0A4Y9YW01

Protein Details

Accession

A0A4Y9YW01

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-41	TLLSARTHPRPPQRPPARPHPNTPAF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1249-1255	KRGSTRR

Subcellular Location(s)

mito 23, nucl 2, cyto 2, cyto_nucl 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MIPLTRRTARKNLETTLLSARTHPRPPQRPPARPHPNTPAFLAGAPKDASDAAEHDGAGAGGMHDFLRTPAPYTLLPTPLPNDCTSAENELFFMDSPTQDLLSVVDACLHNLYDVRRAKQIFDDLRVRKPGDPKFDTRLYNSILRAYMDMADILEPSRRAIWMDDAWLLFQVIESGEENVQPNAGSYALALLMWSKFSREGSPQYITDSADLTSHTPTSLLRNIIDRQIPITAVVSDRAFTSSKDVEQVIQLLSKAAVELDLPSVLQELGQAEALGALDALQTPELPEVVPVRTPAKITTNGVKDPISEPGNEENEVPFKIENLRRHLAQFTLARRVLPEDAAARQKLLEESVYDDAVERLRVQAEKLDELGLNNSELKQTDLQHWMWDWHTKLTARLKKDIIQLVKQEELSPPKASVYRLGPFLSLLKPEKLSLLTILELMRLHGSGGVSEGMKTARGLLAVGKAVELEYKAFVCRKNKISVPMTSARGPGQGSYFSRFSYNDLHARRLTAFKYMEDAEEWTSDWTQNTKVKVGSFLVDRLIDCATVTRTAVSKVTGEEVSEEHPAFFHSYEYMRGHKLGVIKLNPIIAQRMAKDGLRETLHPRHMPMLTKPKPWVSHDNGGYMYNKAPVMRFKESKEQLAYIKQACGEGNIELVLAGLDVLGATPWKINRRIFDVVLEVWNSGERMGKLPPAMYDLPEPPRPEGADTDPQARSVYLQRHRAWLQERANNHSDRCSVNYKIEIARAFIDDTIYMPHNLDFRGRAYPIPPHLNHIGDDLSRGLLLFADKKPLGVRGLRWLKIHLANLYGYDKATFDERVAFVEQHLDDIFDSAENPLSGRRWWGKADDPWQCLATCMELKAALESPDPLAYECALPVHQDGTCNGLQHYAALGGDSQGAKQVNLDVAERPSDVYTYVANMVEDAINEDIGKDKYAALLAGKISRKVVKQTVMTTVYGVTFIGAREQIHKQLRDRGDISEEEQYIASIYLAKKVLQCIGDLFKGAQAIQDYLTSCARLIAKSVPGTRLTEAMKVERKKSGKTASRLRKEQMTSVVWTTPLGLPIVQPYRKVKRRQIETGLQSVYISDPNVQSEVNTQKQASAFPPNFIHSLDATHMLLTALECQTQGLTFASVHDSYWTHPCDIDQMSEIIRNTFISLHSSDVLGRLDAEFRERYAGYKVPVVSLRTESLMRSLGLTENDTLVTTSEEEAAALESADVSSVVVEGETAPVAENGVVTISREQVKAELNKKRGSTRRAKAAAGAEDGAGAEGDVPANFQTKFVNLTDMLPRLPKKGEFDASVSAGAPSA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.57
3	0.55
4	0.51
5	0.42
6	0.4
7	0.44
8	0.43
9	0.49
10	0.53
11	0.56
12	0.62
13	0.7
14	0.76
15	0.8
16	0.82
17	0.82
18	0.85
19	0.86
20	0.82
21	0.81
22	0.81
23	0.78
24	0.71
25	0.66
26	0.59
27	0.49
28	0.46
29	0.42
30	0.32
31	0.28
32	0.26
33	0.23
34	0.2
35	0.18
36	0.18
37	0.15
38	0.16
39	0.15
40	0.16
41	0.15
42	0.14
43	0.14
44	0.13
45	0.11
46	0.09
47	0.06
48	0.05
49	0.06
50	0.06
51	0.05
52	0.06
53	0.07
54	0.12
55	0.12
56	0.16
57	0.17
58	0.2
59	0.21
60	0.26
61	0.29
62	0.28
63	0.28
64	0.27
65	0.29
66	0.31
67	0.33
68	0.29
69	0.28
70	0.26
71	0.27
72	0.28
73	0.31
74	0.28
75	0.24
76	0.24
77	0.2
78	0.2
79	0.17
80	0.17
81	0.12
82	0.11
83	0.12
84	0.13
85	0.13
86	0.13
87	0.13
88	0.11
89	0.12
90	0.13
91	0.1
92	0.14
93	0.14
94	0.14
95	0.15
96	0.15
97	0.13
98	0.15
99	0.17
100	0.21
101	0.27
102	0.29
103	0.35
104	0.36
105	0.38
106	0.41
107	0.48
108	0.44
109	0.46
110	0.53
111	0.5
112	0.56
113	0.6
114	0.57
115	0.52
116	0.56
117	0.57
118	0.57
119	0.59
120	0.58
121	0.59
122	0.63
123	0.62
124	0.57
125	0.55
126	0.49
127	0.48
128	0.43
129	0.4
130	0.34
131	0.32
132	0.28
133	0.24
134	0.21
135	0.16
136	0.15
137	0.11
138	0.1
139	0.1
140	0.1
141	0.11
142	0.1
143	0.11
144	0.12
145	0.12
146	0.13
147	0.15
148	0.2
149	0.18
150	0.21
151	0.23
152	0.22
153	0.21
154	0.21
155	0.19
156	0.13
157	0.11
158	0.09
159	0.06
160	0.08
161	0.08
162	0.09
163	0.1
164	0.12
165	0.14
166	0.13
167	0.13
168	0.11
169	0.11
170	0.1
171	0.1
172	0.08
173	0.06
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.06
179	0.07
180	0.09
181	0.09
182	0.09
183	0.12
184	0.14
185	0.17
186	0.21
187	0.27
188	0.31
189	0.35
190	0.34
191	0.36
192	0.36
193	0.33
194	0.28
195	0.23
196	0.18
197	0.14
198	0.15
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.11
203	0.1
204	0.11
205	0.16
206	0.2
207	0.21
208	0.2
209	0.24
210	0.27
211	0.32
212	0.33
213	0.28
214	0.25
215	0.24
216	0.23
217	0.19
218	0.18
219	0.14
220	0.12
221	0.14
222	0.13
223	0.12
224	0.12
225	0.14
226	0.13
227	0.12
228	0.18
229	0.18
230	0.18
231	0.21
232	0.21
233	0.19
234	0.2
235	0.21
236	0.16
237	0.15
238	0.14
239	0.12
240	0.11
241	0.1
242	0.09
243	0.07
244	0.06
245	0.05
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.06
254	0.07
255	0.06
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.04
264	0.03
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.05
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.07
275	0.09
276	0.1
277	0.11
278	0.12
279	0.14
280	0.15
281	0.16
282	0.17
283	0.2
284	0.23
285	0.26
286	0.32
287	0.35
288	0.35
289	0.36
290	0.34
291	0.31
292	0.28
293	0.3
294	0.24
295	0.19
296	0.21
297	0.25
298	0.27
299	0.26
300	0.25
301	0.21
302	0.21
303	0.21
304	0.19
305	0.13
306	0.12
307	0.19
308	0.25
309	0.29
310	0.35
311	0.38
312	0.38
313	0.4
314	0.41
315	0.34
316	0.33
317	0.33
318	0.29
319	0.34
320	0.33
321	0.31
322	0.31
323	0.33
324	0.28
325	0.23
326	0.21
327	0.15
328	0.19
329	0.23
330	0.23
331	0.2
332	0.19
333	0.19
334	0.18
335	0.17
336	0.13
337	0.09
338	0.13
339	0.14
340	0.14
341	0.13
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.12
346	0.09
347	0.08
348	0.1
349	0.11
350	0.11
351	0.14
352	0.16
353	0.16
354	0.17
355	0.17
356	0.15
357	0.15
358	0.17
359	0.13
360	0.12
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.11
365	0.12
366	0.14
367	0.15
368	0.18
369	0.23
370	0.23
371	0.23
372	0.23
373	0.23
374	0.22
375	0.25
376	0.22
377	0.19
378	0.22
379	0.21
380	0.27
381	0.35
382	0.39
383	0.39
384	0.43
385	0.43
386	0.45
387	0.51
388	0.51
389	0.45
390	0.44
391	0.44
392	0.41
393	0.41
394	0.36
395	0.31
396	0.28
397	0.28
398	0.26
399	0.24
400	0.21
401	0.21
402	0.22
403	0.22
404	0.23
405	0.23
406	0.22
407	0.24
408	0.24
409	0.22
410	0.21
411	0.23
412	0.19
413	0.19
414	0.19
415	0.18
416	0.19
417	0.19
418	0.19
419	0.18
420	0.17
421	0.14
422	0.13
423	0.11
424	0.12
425	0.11
426	0.11
427	0.1
428	0.1
429	0.09
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.08
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.06
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.09
449	0.09
450	0.09
451	0.08
452	0.08
453	0.07
454	0.08
455	0.07
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.08
460	0.11
461	0.15
462	0.19
463	0.25
464	0.29
465	0.34
466	0.36
467	0.42
468	0.44
469	0.43
470	0.45
471	0.43
472	0.42
473	0.38
474	0.36
475	0.29
476	0.27
477	0.24
478	0.18
479	0.15
480	0.15
481	0.16
482	0.18
483	0.19
484	0.17
485	0.19
486	0.18
487	0.19
488	0.21
489	0.23
490	0.26
491	0.27
492	0.31
493	0.29
494	0.31
495	0.3
496	0.28
497	0.25
498	0.23
499	0.22
500	0.19
501	0.21
502	0.2
503	0.19
504	0.17
505	0.18
506	0.13
507	0.12
508	0.12
509	0.1
510	0.1
511	0.1
512	0.1
513	0.1
514	0.13
515	0.17
516	0.18
517	0.19
518	0.2
519	0.2
520	0.21
521	0.21
522	0.18
523	0.16
524	0.15
525	0.14
526	0.14
527	0.13
528	0.12
529	0.11
530	0.09
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.09
539	0.1
540	0.1
541	0.09
542	0.09
543	0.11
544	0.11
545	0.1
546	0.1
547	0.1
548	0.11
549	0.12
550	0.12
551	0.09
552	0.09
553	0.1
554	0.1
555	0.1
556	0.08
557	0.07
558	0.08
559	0.12
560	0.14
561	0.15
562	0.15
563	0.15
564	0.15
565	0.16
566	0.19
567	0.17
568	0.2
569	0.19
570	0.19
571	0.2
572	0.2
573	0.19
574	0.16
575	0.15
576	0.12
577	0.12
578	0.11
579	0.13
580	0.13
581	0.13
582	0.14
583	0.13
584	0.15
585	0.15
586	0.16
587	0.2
588	0.25
589	0.29
590	0.28
591	0.28
592	0.28
593	0.29
594	0.29
595	0.3
596	0.34
597	0.33
598	0.36
599	0.37
600	0.38
601	0.39
602	0.42
603	0.44
604	0.39
605	0.43
606	0.41
607	0.41
608	0.37
609	0.35
610	0.32
611	0.25
612	0.19
613	0.13
614	0.12
615	0.11
616	0.11
617	0.14
618	0.19
619	0.24
620	0.26
621	0.27
622	0.36
623	0.37
624	0.4
625	0.37
626	0.33
627	0.29
628	0.29
629	0.3
630	0.21
631	0.2
632	0.17
633	0.17
634	0.15
635	0.14
636	0.12
637	0.08
638	0.08
639	0.07
640	0.06
641	0.05
642	0.05
643	0.04
644	0.03
645	0.02
646	0.02
647	0.02
648	0.02
649	0.02
650	0.02
651	0.02
652	0.02
653	0.03
654	0.05
655	0.09
656	0.14
657	0.17
658	0.18
659	0.25
660	0.27
661	0.27
662	0.26
663	0.24
664	0.2
665	0.19
666	0.18
667	0.12
668	0.09
669	0.09
670	0.08
671	0.06
672	0.07
673	0.07
674	0.08
675	0.09
676	0.1
677	0.1
678	0.1
679	0.1
680	0.13
681	0.13
682	0.12
683	0.14
684	0.16
685	0.19
686	0.22
687	0.23
688	0.19
689	0.2
690	0.2
691	0.19
692	0.18
693	0.19
694	0.21
695	0.22
696	0.25
697	0.24
698	0.24
699	0.23
700	0.21
701	0.18
702	0.17
703	0.24
704	0.25
705	0.33
706	0.33
707	0.38
708	0.39
709	0.43
710	0.41
711	0.42
712	0.42
713	0.39
714	0.4
715	0.41
716	0.45
717	0.41
718	0.38
719	0.32
720	0.28
721	0.25
722	0.27
723	0.25
724	0.22
725	0.23
726	0.24
727	0.23
728	0.22
729	0.24
730	0.2
731	0.17
732	0.16
733	0.15
734	0.14
735	0.12
736	0.11
737	0.08
738	0.08
739	0.09
740	0.08
741	0.08
742	0.08
743	0.09
744	0.1
745	0.1
746	0.11
747	0.1
748	0.11
749	0.14
750	0.14
751	0.14
752	0.14
753	0.18
754	0.22
755	0.28
756	0.26
757	0.28
758	0.3
759	0.3
760	0.28
761	0.26
762	0.22
763	0.15
764	0.15
765	0.12
766	0.09
767	0.08
768	0.07
769	0.06
770	0.05
771	0.06
772	0.08
773	0.08
774	0.13
775	0.13
776	0.14
777	0.15
778	0.17
779	0.18
780	0.17
781	0.18
782	0.23
783	0.3
784	0.32
785	0.32
786	0.32
787	0.33
788	0.35
789	0.36
790	0.26
791	0.21
792	0.19
793	0.2
794	0.2
795	0.16
796	0.13
797	0.11
798	0.1
799	0.09
800	0.1
801	0.09
802	0.08
803	0.11
804	0.11
805	0.13
806	0.14
807	0.13
808	0.12
809	0.16
810	0.15
811	0.13
812	0.13
813	0.11
814	0.09
815	0.1
816	0.1
817	0.06
818	0.06
819	0.05
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.07
824	0.08
825	0.08
826	0.13
827	0.16
828	0.18
829	0.2
830	0.23
831	0.28
832	0.32
833	0.4
834	0.43
835	0.41
836	0.4
837	0.4
838	0.36
839	0.31
840	0.26
841	0.2
842	0.14
843	0.12
844	0.11
845	0.1
846	0.1
847	0.11
848	0.12
849	0.1
850	0.09
851	0.09
852	0.1
853	0.1
854	0.11
855	0.1
856	0.09
857	0.09
858	0.08
859	0.08
860	0.08
861	0.07
862	0.07
863	0.08
864	0.08
865	0.08
866	0.09
867	0.09
868	0.13
869	0.14
870	0.14
871	0.14
872	0.13
873	0.13
874	0.12
875	0.12
876	0.08
877	0.07
878	0.06
879	0.06
880	0.05
881	0.08
882	0.07
883	0.07
884	0.1
885	0.1
886	0.1
887	0.1
888	0.11
889	0.11
890	0.12
891	0.13
892	0.11
893	0.12
894	0.14
895	0.13
896	0.13
897	0.12
898	0.11
899	0.1
900	0.09
901	0.08
902	0.09
903	0.1
904	0.1
905	0.09
906	0.09
907	0.09
908	0.08
909	0.08
910	0.08
911	0.07
912	0.07
913	0.07
914	0.07
915	0.09
916	0.09
917	0.1
918	0.09
919	0.08
920	0.09
921	0.1
922	0.1
923	0.08
924	0.1
925	0.1
926	0.16
927	0.17
928	0.17
929	0.19
930	0.23
931	0.24
932	0.28
933	0.32
934	0.32
935	0.34
936	0.36
937	0.4
938	0.39
939	0.37
940	0.32
941	0.27
942	0.21
943	0.18
944	0.15
945	0.08
946	0.06
947	0.06
948	0.08
949	0.08
950	0.09
951	0.12
952	0.15
953	0.23
954	0.29
955	0.33
956	0.35
957	0.42
958	0.45
959	0.47
960	0.46
961	0.4
962	0.37
963	0.35
964	0.34
965	0.31
966	0.28
967	0.23
968	0.21
969	0.19
970	0.15
971	0.14
972	0.11
973	0.1
974	0.1
975	0.13
976	0.14
977	0.16
978	0.17
979	0.19
980	0.23
981	0.19
982	0.2
983	0.18
984	0.21
985	0.2
986	0.19
987	0.17
988	0.15
989	0.15
990	0.14
991	0.13
992	0.11
993	0.11
994	0.11
995	0.13
996	0.12
997	0.14
998	0.15
999	0.13
1000	0.12
1001	0.15
1002	0.15
1003	0.13
1004	0.15
1005	0.16
1006	0.2
1007	0.25
1008	0.28
1009	0.27
1010	0.28
1011	0.31
1012	0.29
1013	0.3
1014	0.27
1015	0.26
1016	0.25
1017	0.29
1018	0.35
1019	0.36
1020	0.39
1021	0.42
1022	0.44
1023	0.44
1024	0.5
1025	0.53
1026	0.54
1027	0.59
1028	0.67
1029	0.69
1030	0.76
1031	0.78
1032	0.73
1033	0.71
1034	0.65
1035	0.61
1036	0.57
1037	0.5
1038	0.43
1039	0.4
1040	0.37
1041	0.29
1042	0.26
1043	0.24
1044	0.18
1045	0.16
1046	0.13
1047	0.11
1048	0.1
1049	0.17
1050	0.25
1051	0.23
1052	0.27
1053	0.34
1054	0.44
1055	0.52
1056	0.61
1057	0.64
1058	0.66
1059	0.73
1060	0.78
1061	0.78
1062	0.77
1063	0.74
1064	0.72
1065	0.63
1066	0.53
1067	0.45
1068	0.36
1069	0.29
1070	0.21
1071	0.16
1072	0.12
1073	0.12
1074	0.13
1075	0.15
1076	0.14
1077	0.13
1078	0.18
1079	0.25
1080	0.27
1081	0.28
1082	0.27
1083	0.29
1084	0.3
1085	0.32
1086	0.29
1087	0.31
1088	0.28
1089	0.3
1090	0.32
1091	0.31
1092	0.32
1093	0.3
1094	0.29
1095	0.19
1096	0.2
1097	0.18
1098	0.19
1099	0.16
1100	0.15
1101	0.14
1102	0.12
1103	0.12
1104	0.1
1105	0.12
1106	0.1
1107	0.1
1108	0.1
1109	0.1
1110	0.11
1111	0.1
1112	0.11
1113	0.08
1114	0.09
1115	0.08
1116	0.1
1117	0.14
1118	0.13
1119	0.14
1120	0.15
1121	0.15
1122	0.16
1123	0.23
1124	0.24
1125	0.21
1126	0.21
1127	0.21
1128	0.24
1129	0.25
1130	0.24
1131	0.19
1132	0.18
1133	0.19
1134	0.22
1135	0.22
1136	0.18
1137	0.17
1138	0.15
1139	0.15
1140	0.14
1141	0.14
1142	0.14
1143	0.15
1144	0.17
1145	0.17
1146	0.17
1147	0.16
1148	0.18
1149	0.18
1150	0.13
1151	0.13
1152	0.11
1153	0.13
1154	0.13
1155	0.17
1156	0.15
1157	0.15
1158	0.19
1159	0.19
1160	0.2
1161	0.22
1162	0.26
1163	0.23
1164	0.28
1165	0.28
1166	0.28
1167	0.32
1168	0.32
1169	0.3
1170	0.29
1171	0.29
1172	0.26
1173	0.27
1174	0.23
1175	0.22
1176	0.22
1177	0.19
1178	0.17
1179	0.17
1180	0.17
1181	0.18
1182	0.2
1183	0.17
1184	0.16
1185	0.16
1186	0.16
1187	0.15
1188	0.12
1189	0.12
1190	0.11
1191	0.11
1192	0.11
1193	0.1
1194	0.1
1195	0.1
1196	0.1
1197	0.09
1198	0.08
1199	0.07
1200	0.06
1201	0.06
1202	0.06
1203	0.05
1204	0.04
1205	0.04
1206	0.04
1207	0.04
1208	0.04
1209	0.04
1210	0.04
1211	0.05
1212	0.06
1213	0.06
1214	0.06
1215	0.06
1216	0.07
1217	0.07
1218	0.07
1219	0.06
1220	0.07
1221	0.07
1222	0.08
1223	0.1
1224	0.13
1225	0.16
1226	0.17
1227	0.18
1228	0.2
1229	0.27
1230	0.34
1231	0.42
1232	0.47
1233	0.5
1234	0.56
1235	0.59
1236	0.66
1237	0.67
1238	0.68
1239	0.7
1240	0.7
1241	0.75
1242	0.73
1243	0.71
1244	0.67
1245	0.65
1246	0.6
1247	0.52
1248	0.44
1249	0.33
1250	0.28
1251	0.27
1252	0.21
1253	0.13
1254	0.09
1255	0.05
1256	0.05
1257	0.06
1258	0.05
1259	0.06
1260	0.07
1261	0.1
1262	0.11
1263	0.11
1264	0.13
1265	0.14
1266	0.18
1267	0.18
1268	0.21
1269	0.19
1270	0.23
1271	0.28
1272	0.29
1273	0.29
1274	0.32
1275	0.33
1276	0.33
1277	0.37
1278	0.37
1279	0.38
1280	0.44
1281	0.48
1282	0.44
1283	0.46
1284	0.47
1285	0.44
1286	0.4
1287	0.34

A0A4Y9YW01

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer