Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9YMC8

Protein Details
Accession A0A4Y9YMC8    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-34VVVKKDGKDAKKRFEVKKWNAVAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017901  C-CAP_CF_C-like  
IPR016098  CAP/MinC_C  
IPR027684  TBCC  
IPR031925  TBCC_N  
IPR038397  TBCC_N_sf  
IPR012945  Tubulin-bd_cofactor_C_dom  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR024766  Znf_RING_H2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0015631  F:tubulin binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0007023  P:post-chaperonin tubulin folding pathway  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF07986  TBCC  
PF16752  TBCC_N  
PF12678  zf-rbx1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51329  C_CAP_COFACTOR_C  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16485  mRING-H2-C3H2C2D_RBX1  
Amino Acid Sequences MADMDVDPPAGVVVKKDGKDAKKRFEVKKWNAVALWAWDIVVDNCAICRNHIMDLCIDCQANQVSATSEECNAAWGICNHAFHFHCISRWLKTRNVCPLDNREWELQKLGMADTVSSRRASRSALAASLEAAKGNTHPDIGELSIQAAKLRKLLVDATHILPSYDQRQCEAQMTALEGVLEDLRSSTVAKPKFSFKRKAPSSSTPPKDVVFAPIKPQPTTAGPAYVPPQTSISPSTFLTLKDQSNSHISLQALPLASEASALSNPDLTISNLKRCIVDLCTPVEGSTLTSPFSTLHIRDIQDTILILPIISGSVMLHNLTRCVLAVGCHQFRMHHSTAVDVYLTIPSNPIIEHCSRIRFAHYPPSLLQFSRAPSAGFPRDVSTHIPGMTDLKIELLAQKQDFAVQDFSHIRPTQSPNWSLIEHQSLLQDWSELRTQSPTSLDDILHRLLELAST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.31
4 0.39
5 0.46
6 0.57
7 0.64
8 0.66
9 0.69
10 0.78
11 0.8
12 0.82
13 0.85
14 0.83
15 0.84
16 0.79
17 0.73
18 0.64
19 0.58
20 0.5
21 0.42
22 0.36
23 0.26
24 0.21
25 0.16
26 0.17
27 0.16
28 0.14
29 0.1
30 0.07
31 0.08
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.16
36 0.17
37 0.22
38 0.24
39 0.25
40 0.24
41 0.27
42 0.27
43 0.26
44 0.24
45 0.19
46 0.21
47 0.2
48 0.17
49 0.15
50 0.14
51 0.13
52 0.14
53 0.17
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.11
63 0.16
64 0.18
65 0.19
66 0.18
67 0.25
68 0.25
69 0.26
70 0.32
71 0.27
72 0.26
73 0.3
74 0.32
75 0.32
76 0.4
77 0.4
78 0.41
79 0.46
80 0.52
81 0.58
82 0.61
83 0.57
84 0.55
85 0.59
86 0.6
87 0.58
88 0.54
89 0.49
90 0.46
91 0.44
92 0.4
93 0.32
94 0.26
95 0.22
96 0.18
97 0.15
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.15
102 0.15
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.17
107 0.19
108 0.18
109 0.2
110 0.2
111 0.21
112 0.21
113 0.19
114 0.19
115 0.18
116 0.16
117 0.11
118 0.1
119 0.08
120 0.08
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.15
141 0.14
142 0.17
143 0.19
144 0.19
145 0.2
146 0.2
147 0.18
148 0.17
149 0.17
150 0.19
151 0.2
152 0.18
153 0.18
154 0.2
155 0.21
156 0.23
157 0.22
158 0.16
159 0.14
160 0.15
161 0.14
162 0.12
163 0.1
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.06
173 0.08
174 0.15
175 0.17
176 0.19
177 0.21
178 0.29
179 0.38
180 0.44
181 0.49
182 0.48
183 0.57
184 0.6
185 0.65
186 0.63
187 0.62
188 0.64
189 0.66
190 0.64
191 0.57
192 0.53
193 0.47
194 0.42
195 0.35
196 0.31
197 0.25
198 0.22
199 0.22
200 0.24
201 0.25
202 0.23
203 0.23
204 0.2
205 0.17
206 0.2
207 0.17
208 0.15
209 0.14
210 0.15
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.12
215 0.14
216 0.12
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.15
226 0.17
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.2
232 0.21
233 0.18
234 0.17
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.13
240 0.11
241 0.11
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.14
256 0.15
257 0.19
258 0.21
259 0.22
260 0.21
261 0.21
262 0.22
263 0.19
264 0.21
265 0.19
266 0.2
267 0.2
268 0.2
269 0.19
270 0.18
271 0.14
272 0.11
273 0.11
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.12
280 0.13
281 0.12
282 0.15
283 0.19
284 0.2
285 0.21
286 0.21
287 0.19
288 0.16
289 0.16
290 0.12
291 0.09
292 0.08
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.03
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.14
313 0.21
314 0.21
315 0.22
316 0.23
317 0.23
318 0.26
319 0.33
320 0.28
321 0.25
322 0.24
323 0.25
324 0.25
325 0.25
326 0.22
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.12
338 0.13
339 0.18
340 0.2
341 0.23
342 0.25
343 0.26
344 0.3
345 0.29
346 0.31
347 0.37
348 0.36
349 0.35
350 0.35
351 0.4
352 0.37
353 0.33
354 0.33
355 0.26
356 0.27
357 0.27
358 0.26
359 0.21
360 0.2
361 0.28
362 0.28
363 0.27
364 0.26
365 0.25
366 0.26
367 0.28
368 0.3
369 0.27
370 0.25
371 0.24
372 0.23
373 0.21
374 0.22
375 0.21
376 0.17
377 0.13
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.14
382 0.15
383 0.19
384 0.19
385 0.2
386 0.19
387 0.22
388 0.23
389 0.22
390 0.22
391 0.17
392 0.22
393 0.25
394 0.26
395 0.31
396 0.31
397 0.3
398 0.33
399 0.4
400 0.42
401 0.46
402 0.48
403 0.43
404 0.46
405 0.45
406 0.41
407 0.4
408 0.37
409 0.3
410 0.29
411 0.27
412 0.25
413 0.25
414 0.23
415 0.19
416 0.14
417 0.16
418 0.19
419 0.18
420 0.18
421 0.21
422 0.22
423 0.24
424 0.26
425 0.25
426 0.24
427 0.26
428 0.26
429 0.25
430 0.28
431 0.27
432 0.24
433 0.22
434 0.19