Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9Z3A9

Protein Details
Accession A0A4Y9Z3A9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-103EECPHSSKVERRRHVRRLDTFRADIHydrophilic
480-504ASRACWTRSARTRHGRRVRSILRLCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
464-467ARRP
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 8.5, cyto_mito 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006974  P:DNA damage response  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
Amino Acid Sequences MGVLGLTPFLQKTCPEVIRKLPNRLKDLTGKTIVMHVLGWYRLIRELRDDNVKAICVFDGKERNLAKAEEVRLHSSNLEECPHSSKVERRRHVRRLDTFRADIESKRLQRLTRVTELLQASQRLDAADRQRATDSLKAIMAGQTPPAAPPVPLYIAGDLSSVDTMTAAPSPSPPPNAEVPTTYGYPDEFDEDDLREILADAAGLPSGVDLVAPPPPSDVEHEHFQSPDDLSFDQLSLDSYNLVRRDIDDQTSSDSTWALPSTKLGDLPSLLSALYLNYRQSIPELDVLPALPSSVAVSPAVPTQDFQADAMSKTQQQLTQAEGAFWTALAQGTDATAPTALATRSSLLVQSYARRSNAPTPETYTESHAVLRAMGVPCIETTGPYEAEGLASALVLHGLADYVATEDTDVLAYGAPMLRNITSRKDALLLLAPHTLQTALSLHPRAFSRLPAPARHGLHRADPARRPAPRAAASCRRMGASRACWTRSARTRHGRRVRSILRLCGGRGTCFTQYHPCRSGRCWLVEIGTTGALGRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.34
3 0.39
4 0.48
5 0.57
6 0.64
7 0.69
8 0.68
9 0.7
10 0.71
11 0.69
12 0.66
13 0.64
14 0.64
15 0.61
16 0.58
17 0.5
18 0.45
19 0.45
20 0.39
21 0.3
22 0.24
23 0.18
24 0.17
25 0.16
26 0.18
27 0.15
28 0.15
29 0.2
30 0.22
31 0.22
32 0.25
33 0.3
34 0.33
35 0.41
36 0.41
37 0.39
38 0.39
39 0.39
40 0.32
41 0.29
42 0.24
43 0.16
44 0.16
45 0.21
46 0.27
47 0.27
48 0.34
49 0.34
50 0.37
51 0.38
52 0.37
53 0.35
54 0.34
55 0.36
56 0.35
57 0.37
58 0.4
59 0.38
60 0.39
61 0.35
62 0.3
63 0.29
64 0.25
65 0.24
66 0.2
67 0.2
68 0.25
69 0.26
70 0.26
71 0.27
72 0.32
73 0.4
74 0.49
75 0.56
76 0.61
77 0.69
78 0.77
79 0.83
80 0.85
81 0.85
82 0.84
83 0.85
84 0.82
85 0.73
86 0.65
87 0.6
88 0.52
89 0.43
90 0.4
91 0.39
92 0.36
93 0.4
94 0.43
95 0.38
96 0.44
97 0.5
98 0.51
99 0.48
100 0.48
101 0.42
102 0.45
103 0.46
104 0.42
105 0.38
106 0.32
107 0.26
108 0.24
109 0.23
110 0.17
111 0.17
112 0.19
113 0.21
114 0.27
115 0.27
116 0.28
117 0.29
118 0.29
119 0.32
120 0.3
121 0.26
122 0.2
123 0.2
124 0.19
125 0.18
126 0.19
127 0.17
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.11
135 0.09
136 0.1
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.11
158 0.13
159 0.16
160 0.16
161 0.18
162 0.22
163 0.24
164 0.24
165 0.22
166 0.23
167 0.23
168 0.23
169 0.2
170 0.16
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.12
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.08
183 0.08
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.02
196 0.02
197 0.03
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.13
205 0.16
206 0.17
207 0.2
208 0.22
209 0.22
210 0.22
211 0.21
212 0.2
213 0.16
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.1
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.14
236 0.14
237 0.18
238 0.18
239 0.17
240 0.14
241 0.12
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.11
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.09
277 0.08
278 0.05
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.14
302 0.13
303 0.15
304 0.15
305 0.16
306 0.19
307 0.18
308 0.17
309 0.15
310 0.14
311 0.12
312 0.1
313 0.08
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.08
335 0.1
336 0.1
337 0.15
338 0.19
339 0.22
340 0.23
341 0.23
342 0.26
343 0.32
344 0.38
345 0.35
346 0.32
347 0.34
348 0.37
349 0.39
350 0.36
351 0.33
352 0.27
353 0.26
354 0.24
355 0.2
356 0.17
357 0.14
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.12
366 0.12
367 0.07
368 0.09
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.1
374 0.11
375 0.1
376 0.08
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.03
383 0.03
384 0.02
385 0.03
386 0.02
387 0.03
388 0.03
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.09
406 0.13
407 0.15
408 0.2
409 0.22
410 0.23
411 0.24
412 0.24
413 0.24
414 0.22
415 0.26
416 0.22
417 0.2
418 0.21
419 0.2
420 0.18
421 0.18
422 0.16
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.15
428 0.17
429 0.17
430 0.21
431 0.22
432 0.25
433 0.25
434 0.27
435 0.26
436 0.32
437 0.36
438 0.37
439 0.42
440 0.45
441 0.47
442 0.48
443 0.49
444 0.43
445 0.44
446 0.49
447 0.49
448 0.48
449 0.51
450 0.54
451 0.58
452 0.58
453 0.58
454 0.54
455 0.58
456 0.57
457 0.57
458 0.57
459 0.59
460 0.59
461 0.59
462 0.55
463 0.48
464 0.43
465 0.42
466 0.41
467 0.38
468 0.45
469 0.47
470 0.47
471 0.5
472 0.52
473 0.58
474 0.58
475 0.6
476 0.6
477 0.65
478 0.73
479 0.8
480 0.86
481 0.84
482 0.83
483 0.85
484 0.82
485 0.82
486 0.78
487 0.74
488 0.7
489 0.64
490 0.58
491 0.55
492 0.49
493 0.41
494 0.39
495 0.37
496 0.36
497 0.35
498 0.38
499 0.41
500 0.46
501 0.51
502 0.54
503 0.54
504 0.53
505 0.55
506 0.61
507 0.57
508 0.55
509 0.49
510 0.45
511 0.43
512 0.41
513 0.4
514 0.32
515 0.25
516 0.2