Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9Y5W2

Protein Details
Accession A0A4Y9Y5W2    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-219SPPPLPPHRPRPQHPHRRPSPPSHBasic
246-272RTLHTRLKRTLQRHNRRRRARAAHPGPBasic
279-313QRQPQRPRPRAGARHRRRRRRRRAAPRQHGHRGPRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-214RPRPXQHPHRR
258-332RLKRTLQRHNRRRRARAAHPGPGPKAGTQRQPQRPRPRAGARHRRRRRRRRAAPRQHGHRGPRPRARAGARRRXA
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 6, cyto 4, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009327  Cupin_DUF985  
IPR014710  RmlC-like_jellyroll  
IPR011051  RmlC_Cupin_sf  
IPR039935  YML079W-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF06172  Cupin_5  
CDD cd06121  cupin_YML079wp  
Amino Acid Sequences MELIRDLSLLKHPEGGFFAETDRQDATVPSPFADNQLRSLATSIFYLLTYDEPNGVIHMNKSVTYHVLHHGRAEYTLVTPGNPPRIEHVVLGTNVAAGERRQLIVGTGVWKMSKIPKADLISAKTAEEKARTGCLITEVVTPGFHWEDHQFLTKTGLQELFQGVPGGESKMLELLPAALALPARLASTLLPFPSLSPPPLPPHRPRPXQHPHRRPSPPSHXXPVPXAKNSHLLALVAPLSDSPAXLPDRXXIRTLHTRLKRTLQRHNRRRRARAAHPGPGPKAGTQRQPQRPRPRAGARHRRRRRRRRAAPRQHGHRGPRPRARAGARRRXALALVRLARARAVLSLLPGSRACTAPVVLPIFALLHHPAGTSHRPCACLIVPPLHASSHQCLVQRPAPAGPCGPRHSALDSVMCCVLVGGRHGHQHCRARACRRKTASASATASSGSVRSFCRALARRVDAARAKQERMRTSSSRPCFPALNTAIMLWTLAGALSYTFPNVCSPSFPCHFLQPAPSRLRSPRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.25
4 0.22
5 0.24
6 0.23
7 0.23
8 0.23
9 0.21
10 0.19
11 0.19
12 0.19
13 0.2
14 0.21
15 0.21
16 0.2
17 0.22
18 0.21
19 0.27
20 0.33
21 0.3
22 0.26
23 0.3
24 0.3
25 0.28
26 0.29
27 0.24
28 0.18
29 0.17
30 0.16
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.11
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.12
44 0.11
45 0.15
46 0.15
47 0.15
48 0.17
49 0.17
50 0.19
51 0.19
52 0.21
53 0.25
54 0.3
55 0.29
56 0.31
57 0.32
58 0.3
59 0.29
60 0.27
61 0.2
62 0.16
63 0.2
64 0.17
65 0.15
66 0.18
67 0.22
68 0.29
69 0.28
70 0.28
71 0.29
72 0.33
73 0.34
74 0.31
75 0.3
76 0.27
77 0.26
78 0.26
79 0.21
80 0.16
81 0.14
82 0.14
83 0.11
84 0.07
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.15
99 0.2
100 0.23
101 0.23
102 0.25
103 0.32
104 0.35
105 0.41
106 0.44
107 0.4
108 0.39
109 0.37
110 0.35
111 0.3
112 0.29
113 0.25
114 0.22
115 0.21
116 0.19
117 0.2
118 0.2
119 0.19
120 0.17
121 0.17
122 0.15
123 0.14
124 0.15
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.13
135 0.15
136 0.21
137 0.18
138 0.18
139 0.22
140 0.23
141 0.22
142 0.23
143 0.22
144 0.17
145 0.18
146 0.2
147 0.16
148 0.14
149 0.13
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.07
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.14
181 0.15
182 0.14
183 0.15
184 0.17
185 0.22
186 0.29
187 0.34
188 0.36
189 0.45
190 0.53
191 0.58
192 0.62
193 0.68
194 0.72
195 0.77
196 0.81
197 0.81
198 0.79
199 0.82
200 0.81
201 0.79
202 0.78
203 0.75
204 0.7
205 0.66
206 0.65
207 0.59
208 0.59
209 0.56
210 0.5
211 0.44
212 0.4
213 0.34
214 0.29
215 0.24
216 0.19
217 0.14
218 0.1
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.08
227 0.1
228 0.11
229 0.12
230 0.13
231 0.14
232 0.16
233 0.18
234 0.21
235 0.26
236 0.32
237 0.38
238 0.39
239 0.45
240 0.5
241 0.53
242 0.58
243 0.62
244 0.67
245 0.72
246 0.8
247 0.82
248 0.84
249 0.85
250 0.85
251 0.82
252 0.79
253 0.8
254 0.75
255 0.72
256 0.68
257 0.65
258 0.56
259 0.5
260 0.43
261 0.33
262 0.34
263 0.3
264 0.32
265 0.35
266 0.44
267 0.51
268 0.6
269 0.68
270 0.72
271 0.77
272 0.74
273 0.76
274 0.75
275 0.75
276 0.77
277 0.78
278 0.78
279 0.81
280 0.87
281 0.89
282 0.91
283 0.93
284 0.93
285 0.93
286 0.94
287 0.94
288 0.96
289 0.96
290 0.96
291 0.94
292 0.92
293 0.89
294 0.84
295 0.8
296 0.76
297 0.75
298 0.73
299 0.72
300 0.68
301 0.63
302 0.63
303 0.63
304 0.65
305 0.64
306 0.65
307 0.59
308 0.56
309 0.54
310 0.5
311 0.44
312 0.38
313 0.35
314 0.29
315 0.29
316 0.28
317 0.27
318 0.24
319 0.23
320 0.2
321 0.13
322 0.11
323 0.08
324 0.09
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.11
334 0.12
335 0.11
336 0.15
337 0.15
338 0.13
339 0.12
340 0.12
341 0.11
342 0.1
343 0.11
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.14
350 0.21
351 0.21
352 0.26
353 0.27
354 0.29
355 0.29
356 0.32
357 0.28
358 0.27
359 0.27
360 0.26
361 0.25
362 0.25
363 0.26
364 0.23
365 0.23
366 0.21
367 0.22
368 0.21
369 0.23
370 0.23
371 0.23
372 0.28
373 0.31
374 0.3
375 0.28
376 0.28
377 0.27
378 0.27
379 0.29
380 0.28
381 0.3
382 0.31
383 0.33
384 0.31
385 0.32
386 0.33
387 0.32
388 0.3
389 0.29
390 0.26
391 0.24
392 0.23
393 0.2
394 0.17
395 0.14
396 0.13
397 0.08
398 0.1
399 0.11
400 0.13
401 0.2
402 0.22
403 0.28
404 0.36
405 0.43
406 0.47
407 0.54
408 0.59
409 0.63
410 0.72
411 0.74
412 0.76
413 0.74
414 0.77
415 0.73
416 0.75
417 0.69
418 0.67
419 0.62
420 0.53
421 0.47
422 0.38
423 0.33
424 0.23
425 0.19
426 0.12
427 0.11
428 0.12
429 0.14
430 0.14
431 0.15
432 0.25
433 0.29
434 0.34
435 0.41
436 0.44
437 0.48
438 0.49
439 0.56
440 0.52
441 0.53
442 0.57
443 0.54
444 0.52
445 0.5
446 0.57
447 0.56
448 0.56
449 0.57
450 0.52
451 0.56
452 0.62
453 0.65
454 0.64
455 0.6
456 0.57
457 0.53
458 0.49
459 0.5
460 0.43
461 0.41
462 0.34
463 0.31
464 0.28
465 0.25
466 0.23
467 0.13
468 0.1
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.06
475 0.07
476 0.08
477 0.08
478 0.1
479 0.13
480 0.15
481 0.15
482 0.18
483 0.21
484 0.27
485 0.31
486 0.34
487 0.33
488 0.36
489 0.39
490 0.37
491 0.44
492 0.44
493 0.49
494 0.53
495 0.54
496 0.55