FuNGI

A0A4Y9YSZ2

Protein Details

Accession

A0A4Y9YSZ2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
54-78	WPGLSMMYHKMRRKRHRHALIEVSV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 20, nucl 3, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010998 Integrase_recombinase_N IPR044730 RNase_H-like_dom_plant IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding
CDD	cd06222 RNase_H_like

Amino Acid Sequences

MSVTLSDERRDALVSAIRDFAGCLMKKHVRRPLHQFQSLTGWIQWALNVYPLLWPGLSMMYHKMRRKRHRHALIEVSVALRRELHWLADHVEHSSRMFMLRSLSWQVKDADLVIFTDTCFDGMGFWSPQQSLGFQSHLLPVAGTIFFWECLAVLSAIHWAASNVDTPIPQRLVVYCDNTNTVNLFSSLHAQPQYNPLLCSAVDVLLRSNIDLRVLHIPGEINRVADALSRWDIEPPAQCTGGTAAINFPSCSTRQPVRERWSRERLLHERAVALGFALKDSSLLSYSSALQSYLAFCETHQLPVEPTEETLSFYVVYTCHYICPSSIHNYLSGICQQLEAFFPQVRTVRHSKLVSQTLAGCFRTHAHPTTCKSPLTRAQLAETIVSYQQSSSLDDLLFCVLLAMAFHGLLRLGELVLNDNPRLRDCRTVIERASLKLLLNGYRFLLPSSKTDRVFHGAEIIIAGVTSDDDPLALFTCYLRIRDQLFPFHPHLWLCRSGQDPTRLSRLVRDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.23
3	0.23
4	0.22
5	0.21
6	0.2
7	0.19
8	0.22
9	0.21
10	0.21
11	0.28
12	0.37
13	0.42
14	0.51
15	0.57
16	0.58
17	0.64
18	0.72
19	0.75
20	0.76
21	0.77
22	0.7
23	0.63
24	0.62
25	0.56
26	0.49
27	0.38
28	0.3
29	0.24
30	0.23
31	0.21
32	0.16
33	0.14
34	0.14
35	0.14
36	0.13
37	0.14
38	0.14
39	0.15
40	0.12
41	0.11
42	0.09
43	0.12
44	0.12
45	0.12
46	0.17
47	0.25
48	0.33
49	0.4
50	0.47
51	0.56
52	0.66
53	0.75
54	0.8
55	0.83
56	0.86
57	0.87
58	0.87
59	0.86
60	0.79
61	0.71
62	0.61
63	0.51
64	0.43
65	0.35
66	0.27
67	0.18
68	0.15
69	0.17
70	0.17
71	0.17
72	0.18
73	0.19
74	0.22
75	0.24
76	0.24
77	0.21
78	0.22
79	0.21
80	0.19
81	0.18
82	0.15
83	0.14
84	0.14
85	0.12
86	0.14
87	0.14
88	0.17
89	0.21
90	0.25
91	0.24
92	0.27
93	0.27
94	0.24
95	0.24
96	0.21
97	0.17
98	0.13
99	0.13
100	0.11
101	0.1
102	0.09
103	0.1
104	0.09
105	0.08
106	0.08
107	0.07
108	0.06
109	0.07
110	0.11
111	0.1
112	0.1
113	0.12
114	0.12
115	0.14
116	0.14
117	0.14
118	0.14
119	0.15
120	0.16
121	0.15
122	0.16
123	0.16
124	0.16
125	0.15
126	0.12
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.08
131	0.08
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.05
137	0.06
138	0.07
139	0.06
140	0.05
141	0.05
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.06
146	0.05
147	0.06
148	0.07
149	0.08
150	0.07
151	0.08
152	0.08
153	0.09
154	0.13
155	0.13
156	0.12
157	0.12
158	0.12
159	0.16
160	0.18
161	0.22
162	0.19
163	0.19
164	0.21
165	0.21
166	0.2
167	0.16
168	0.14
169	0.11
170	0.1
171	0.1
172	0.09
173	0.13
174	0.13
175	0.15
176	0.16
177	0.16
178	0.16
179	0.21
180	0.25
181	0.21
182	0.21
183	0.19
184	0.18
185	0.18
186	0.18
187	0.13
188	0.1
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.08
195	0.09
196	0.08
197	0.09
198	0.09
199	0.11
200	0.13
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.13
205	0.12
206	0.17
207	0.15
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.08
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.1
219	0.11
220	0.12
221	0.14
222	0.14
223	0.15
224	0.15
225	0.14
226	0.14
227	0.15
228	0.15
229	0.12
230	0.09
231	0.08
232	0.09
233	0.1
234	0.09
235	0.09
236	0.08
237	0.09
238	0.1
239	0.14
240	0.17
241	0.24
242	0.3
243	0.37
244	0.44
245	0.51
246	0.57
247	0.6
248	0.64
249	0.62
250	0.58
251	0.59
252	0.57
253	0.55
254	0.5
255	0.42
256	0.34
257	0.31
258	0.27
259	0.19
260	0.13
261	0.09
262	0.06
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.05
270	0.05
271	0.06
272	0.07
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.08
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.07
281	0.08
282	0.07
283	0.06
284	0.11
285	0.12
286	0.13
287	0.13
288	0.13
289	0.12
290	0.14
291	0.16
292	0.11
293	0.11
294	0.11
295	0.1
296	0.11
297	0.11
298	0.09
299	0.08
300	0.08
301	0.09
302	0.07
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.1
308	0.11
309	0.1
310	0.13
311	0.15
312	0.18
313	0.2
314	0.2
315	0.2
316	0.2
317	0.21
318	0.19
319	0.18
320	0.14
321	0.12
322	0.12
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.11
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.14
331	0.18
332	0.18
333	0.22
334	0.27
335	0.28
336	0.34
337	0.35
338	0.36
339	0.41
340	0.45
341	0.4
342	0.36
343	0.35
344	0.31
345	0.34
346	0.31
347	0.23
348	0.18
349	0.2
350	0.22
351	0.23
352	0.24
353	0.25
354	0.31
355	0.35
356	0.42
357	0.43
358	0.41
359	0.39
360	0.41
361	0.45
362	0.46
363	0.47
364	0.41
365	0.4
366	0.41
367	0.4
368	0.34
369	0.26
370	0.2
371	0.16
372	0.15
373	0.12
374	0.09
375	0.11
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.13
380	0.13
381	0.12
382	0.13
383	0.11
384	0.1
385	0.08
386	0.07
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.06
401	0.07
402	0.1
403	0.12
404	0.15
405	0.15
406	0.18
407	0.19
408	0.2
409	0.25
410	0.24
411	0.29
412	0.29
413	0.38
414	0.41
415	0.46
416	0.45
417	0.49
418	0.49
419	0.42
420	0.44
421	0.36
422	0.31
423	0.28
424	0.29
425	0.26
426	0.25
427	0.25
428	0.23
429	0.23
430	0.23
431	0.21
432	0.22
433	0.19
434	0.24
435	0.31
436	0.36
437	0.37
438	0.38
439	0.42
440	0.43
441	0.43
442	0.37
443	0.34
444	0.27
445	0.24
446	0.22
447	0.18
448	0.12
449	0.1
450	0.09
451	0.04
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.06
459	0.08
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.13
464	0.15
465	0.18
466	0.19
467	0.22
468	0.27
469	0.35
470	0.39
471	0.42
472	0.45
473	0.49
474	0.52
475	0.49
476	0.48
477	0.42
478	0.42
479	0.38
480	0.39
481	0.35
482	0.36
483	0.37
484	0.39
485	0.44
486	0.48
487	0.48
488	0.47
489	0.53
490	0.5
491	0.47

A0A4Y9YSZ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer