Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZAP4

Protein Details
Accession A0A4Y9ZAP4    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-70EKETKRIQDRIAKVRNKRELNHydrophilic
85-111TDDTLKWIKKAKKREKELAKKRQAEIDHydrophilic
263-289QKGDVGFKKPKTKKKRPSRRVAADSDVBasic
660-686PQPLSKGKTEKTKGKKKDQNKSAAQTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-106IKKAKKREKELAKKR
271-283KKPKTKKKRPSRR
330-339RRAKIKSKRL
588-614SHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEEKKK
668-677KTEKTKGKKK
769-773PPKRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 11, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MEESISLEETNKIRISLGLKPLTDDSSPADDKDKQAEQNYANQREREAEEKETKRIQDRIAKVRNKRELNASLKGSTLGDADADTDDTLKWIKKAKKREKELAKKRQAEIDGMDKVFQDEYTEKDLEGIKVSHDFDELEDGEARILTLKDSXILDNEEDELQNVEMAEQERTKERNDLKIKSRGYTGYDDDEFVDGREGMKRAVLSKYDEFLEGPKETGFRLGASSPSTSKAARQELEQAAAAVNKSLLSIDYAKNIETQDYLQKGDVGFKKPKTKKKRPSRRVAADSDVAPVDEVPMEVDEKPIVPRVRDLDANFVDDDELQAALARTRRAKIKSKRLSPEEVARKIAEERARTEQPNGAETINDDGDEQDGDSSGLVFDDTSEFVRAITYNPVAVKKEAPSSTPAPEKQEPTAVKDEPMEVVEELEAGEVNVKEEEDEEAMINAIESAIKATEAEEKASTTNDDMGTSSEQTFSTGMASTLNILRQQGILATPSSDQTDREQVQLQRDLWLAEQRRRVAEREMERLKSRGSNKDQAQREYENRLREQQEARANLEAFKNYKPDVNIVYYDEFGRSLTPKEAWKALSHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEEKKKEAMASGDTPLSMSRAFQMRQEKTGQAHFVLSVGNRGAVPQAAEFLDPQPLSKGKTEKTKGKKKDQNKSAAQTLDNGYITLPAPQVSHNAGISASPAPNSETNSPAPRPGFSRITSAIVSEAPSGTGTPVSGDRTKVAFGFGTKRKAGEEASGTPPPKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.28
4 0.36
5 0.37
6 0.36
7 0.39
8 0.4
9 0.4
10 0.36
11 0.3
12 0.26
13 0.28
14 0.29
15 0.27
16 0.3
17 0.3
18 0.32
19 0.38
20 0.39
21 0.37
22 0.4
23 0.46
24 0.43
25 0.5
26 0.57
27 0.59
28 0.59
29 0.54
30 0.52
31 0.5
32 0.51
33 0.47
34 0.42
35 0.41
36 0.45
37 0.48
38 0.53
39 0.54
40 0.55
41 0.56
42 0.57
43 0.56
44 0.56
45 0.61
46 0.65
47 0.69
48 0.73
49 0.75
50 0.8
51 0.83
52 0.79
53 0.74
54 0.72
55 0.71
56 0.69
57 0.68
58 0.62
59 0.53
60 0.47
61 0.45
62 0.36
63 0.28
64 0.21
65 0.14
66 0.1
67 0.09
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.12
76 0.13
77 0.15
78 0.23
79 0.32
80 0.39
81 0.51
82 0.61
83 0.69
84 0.76
85 0.84
86 0.86
87 0.89
88 0.92
89 0.92
90 0.92
91 0.89
92 0.82
93 0.79
94 0.7
95 0.62
96 0.55
97 0.51
98 0.46
99 0.39
100 0.37
101 0.29
102 0.28
103 0.24
104 0.2
105 0.17
106 0.13
107 0.16
108 0.21
109 0.21
110 0.2
111 0.22
112 0.24
113 0.21
114 0.23
115 0.2
116 0.16
117 0.19
118 0.21
119 0.18
120 0.17
121 0.16
122 0.14
123 0.18
124 0.17
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.12
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.13
156 0.17
157 0.19
158 0.21
159 0.27
160 0.3
161 0.38
162 0.45
163 0.5
164 0.53
165 0.6
166 0.61
167 0.55
168 0.54
169 0.46
170 0.43
171 0.41
172 0.36
173 0.32
174 0.31
175 0.3
176 0.27
177 0.25
178 0.21
179 0.16
180 0.15
181 0.09
182 0.09
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.18
190 0.19
191 0.21
192 0.23
193 0.25
194 0.24
195 0.24
196 0.21
197 0.2
198 0.21
199 0.16
200 0.15
201 0.14
202 0.13
203 0.13
204 0.15
205 0.14
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.14
211 0.16
212 0.14
213 0.16
214 0.18
215 0.16
216 0.19
217 0.24
218 0.28
219 0.26
220 0.27
221 0.32
222 0.32
223 0.34
224 0.3
225 0.23
226 0.19
227 0.19
228 0.17
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.07
236 0.1
237 0.11
238 0.14
239 0.15
240 0.15
241 0.17
242 0.17
243 0.15
244 0.13
245 0.14
246 0.16
247 0.17
248 0.18
249 0.16
250 0.17
251 0.17
252 0.23
253 0.26
254 0.26
255 0.3
256 0.34
257 0.45
258 0.52
259 0.62
260 0.66
261 0.73
262 0.78
263 0.83
264 0.9
265 0.89
266 0.93
267 0.93
268 0.92
269 0.88
270 0.82
271 0.75
272 0.66
273 0.56
274 0.46
275 0.36
276 0.25
277 0.18
278 0.13
279 0.09
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.13
291 0.14
292 0.13
293 0.16
294 0.18
295 0.21
296 0.23
297 0.23
298 0.25
299 0.25
300 0.26
301 0.23
302 0.2
303 0.18
304 0.14
305 0.14
306 0.07
307 0.06
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.08
313 0.1
314 0.12
315 0.14
316 0.2
317 0.25
318 0.36
319 0.44
320 0.53
321 0.6
322 0.67
323 0.73
324 0.72
325 0.72
326 0.65
327 0.65
328 0.62
329 0.55
330 0.48
331 0.4
332 0.36
333 0.32
334 0.33
335 0.27
336 0.21
337 0.22
338 0.26
339 0.29
340 0.29
341 0.3
342 0.28
343 0.25
344 0.24
345 0.22
346 0.16
347 0.13
348 0.12
349 0.13
350 0.1
351 0.09
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.09
377 0.08
378 0.09
379 0.1
380 0.12
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.13
385 0.18
386 0.17
387 0.17
388 0.19
389 0.21
390 0.23
391 0.26
392 0.26
393 0.28
394 0.3
395 0.31
396 0.28
397 0.32
398 0.29
399 0.29
400 0.33
401 0.27
402 0.25
403 0.23
404 0.23
405 0.17
406 0.16
407 0.12
408 0.08
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.03
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.05
425 0.06
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.04
440 0.1
441 0.11
442 0.12
443 0.12
444 0.13
445 0.13
446 0.14
447 0.14
448 0.09
449 0.11
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.11
454 0.11
455 0.12
456 0.12
457 0.1
458 0.1
459 0.11
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.07
479 0.08
480 0.08
481 0.09
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.13
486 0.2
487 0.2
488 0.22
489 0.26
490 0.27
491 0.31
492 0.35
493 0.33
494 0.28
495 0.27
496 0.26
497 0.22
498 0.26
499 0.25
500 0.26
501 0.31
502 0.31
503 0.34
504 0.36
505 0.37
506 0.35
507 0.39
508 0.39
509 0.43
510 0.46
511 0.45
512 0.45
513 0.44
514 0.41
515 0.4
516 0.4
517 0.4
518 0.43
519 0.48
520 0.52
521 0.6
522 0.63
523 0.6
524 0.6
525 0.56
526 0.52
527 0.53
528 0.51
529 0.48
530 0.45
531 0.48
532 0.45
533 0.45
534 0.44
535 0.42
536 0.45
537 0.42
538 0.42
539 0.39
540 0.37
541 0.34
542 0.33
543 0.29
544 0.24
545 0.23
546 0.24
547 0.21
548 0.24
549 0.22
550 0.23
551 0.24
552 0.24
553 0.24
554 0.24
555 0.24
556 0.22
557 0.21
558 0.18
559 0.15
560 0.12
561 0.13
562 0.11
563 0.12
564 0.14
565 0.16
566 0.18
567 0.21
568 0.25
569 0.24
570 0.28
571 0.32
572 0.36
573 0.42
574 0.43
575 0.48
576 0.48
577 0.48
578 0.53
579 0.5
580 0.51
581 0.5
582 0.54
583 0.51
584 0.56
585 0.59
586 0.6
587 0.67
588 0.67
589 0.66
590 0.68
591 0.66
592 0.68
593 0.73
594 0.74
595 0.75
596 0.75
597 0.74
598 0.72
599 0.71
600 0.61
601 0.53
602 0.45
603 0.38
604 0.33
605 0.29
606 0.22
607 0.2
608 0.2
609 0.18
610 0.17
611 0.12
612 0.1
613 0.11
614 0.16
615 0.17
616 0.23
617 0.33
618 0.34
619 0.38
620 0.41
621 0.41
622 0.39
623 0.44
624 0.41
625 0.32
626 0.3
627 0.26
628 0.22
629 0.2
630 0.17
631 0.15
632 0.13
633 0.12
634 0.11
635 0.12
636 0.12
637 0.11
638 0.12
639 0.09
640 0.11
641 0.1
642 0.11
643 0.12
644 0.12
645 0.17
646 0.16
647 0.16
648 0.18
649 0.2
650 0.22
651 0.27
652 0.32
653 0.32
654 0.43
655 0.5
656 0.56
657 0.65
658 0.73
659 0.76
660 0.81
661 0.86
662 0.86
663 0.89
664 0.88
665 0.88
666 0.86
667 0.83
668 0.79
669 0.73
670 0.64
671 0.57
672 0.51
673 0.45
674 0.36
675 0.3
676 0.22
677 0.2
678 0.2
679 0.18
680 0.15
681 0.11
682 0.12
683 0.13
684 0.16
685 0.17
686 0.2
687 0.17
688 0.17
689 0.16
690 0.16
691 0.17
692 0.16
693 0.14
694 0.12
695 0.13
696 0.16
697 0.18
698 0.23
699 0.24
700 0.24
701 0.29
702 0.35
703 0.36
704 0.38
705 0.38
706 0.36
707 0.37
708 0.4
709 0.4
710 0.36
711 0.41
712 0.37
713 0.39
714 0.37
715 0.34
716 0.29
717 0.24
718 0.23
719 0.18
720 0.16
721 0.12
722 0.12
723 0.12
724 0.11
725 0.11
726 0.09
727 0.1
728 0.13
729 0.18
730 0.2
731 0.21
732 0.23
733 0.25
734 0.27
735 0.25
736 0.24
737 0.21
738 0.22
739 0.3
740 0.34
741 0.39
742 0.39
743 0.4
744 0.39
745 0.41
746 0.39
747 0.37
748 0.36
749 0.34
750 0.39
751 0.45
752 0.45