Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9YCT6

Protein Details
Accession A0A4Y9YCT6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-38DPHRHPPAPLHIRLRRHRPGKRLSQVHPSLHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-29IRLRRHRPGKR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 7.5, cyto_nucl 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006896  Sec23/24_trunk_dom  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
IPR006895  Znf_Sec23_Sec24  
IPR036174  Znf_Sec23_Sec24_sf  
Gene Ontology GO:0030127  C:COPII vesicle coat  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006888  P:endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04811  Sec23_trunk  
PF04810  zf-Sec23_Sec24  
Amino Acid Sequences MGLRAVHDPHRHPPAPLHIRLRRHRPGKRLSQVHPSLHLGLPHSSRLANELDIPLFVVLQPFAELDPRDEPVPVVNFGPDGPPRCDQCKGYVNPWCTWIAEGWRWMCNLCGHASEVGANYYSPLDPHLLRVDQPNRLELQKGTVDFVVSDASEYWEVQPPTRLAPSYILPPAPPLLPSSSPSPPTSPPRSSTSAPSTPMTPSGFMALQTAPPPDTRKPTPMPHLFALDVSQTSVVSGFFRSSCDAILLSLYGGIDQDGNTIAPSLPEGCSVGILTFDNSLHFYDLSPHLESARVLIVSDIDEPFIPLRTGLFVDPHESRSVLEQLLQSLPARHEGTLVSQTCLGSVLSVTLAALTRLGGHLIVFQATRPTLGPGALLESPSLTSSSDPDHPITIHDPDAAWENAGEDSQKPASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.58
3 0.61
4 0.64
5 0.61
6 0.7
7 0.77
8 0.81
9 0.8
10 0.81
11 0.81
12 0.81
13 0.84
14 0.85
15 0.86
16 0.85
17 0.8
18 0.81
19 0.8
20 0.74
21 0.69
22 0.62
23 0.55
24 0.48
25 0.44
26 0.36
27 0.33
28 0.32
29 0.29
30 0.27
31 0.23
32 0.22
33 0.22
34 0.22
35 0.18
36 0.18
37 0.19
38 0.18
39 0.17
40 0.17
41 0.14
42 0.12
43 0.11
44 0.09
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.11
51 0.11
52 0.13
53 0.16
54 0.17
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.18
59 0.2
60 0.18
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.19
66 0.18
67 0.19
68 0.22
69 0.26
70 0.3
71 0.33
72 0.37
73 0.35
74 0.38
75 0.44
76 0.43
77 0.47
78 0.5
79 0.5
80 0.47
81 0.48
82 0.42
83 0.33
84 0.3
85 0.24
86 0.22
87 0.21
88 0.25
89 0.24
90 0.24
91 0.24
92 0.24
93 0.24
94 0.2
95 0.19
96 0.16
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.1
112 0.1
113 0.13
114 0.16
115 0.15
116 0.17
117 0.25
118 0.28
119 0.31
120 0.31
121 0.31
122 0.29
123 0.29
124 0.3
125 0.22
126 0.22
127 0.2
128 0.2
129 0.19
130 0.17
131 0.16
132 0.14
133 0.15
134 0.11
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.17
146 0.16
147 0.18
148 0.19
149 0.18
150 0.14
151 0.16
152 0.17
153 0.17
154 0.18
155 0.16
156 0.14
157 0.15
158 0.15
159 0.13
160 0.12
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.14
165 0.17
166 0.19
167 0.21
168 0.22
169 0.23
170 0.24
171 0.3
172 0.35
173 0.33
174 0.34
175 0.37
176 0.4
177 0.39
178 0.4
179 0.39
180 0.36
181 0.36
182 0.33
183 0.29
184 0.25
185 0.26
186 0.22
187 0.16
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.13
200 0.14
201 0.19
202 0.21
203 0.26
204 0.3
205 0.34
206 0.41
207 0.43
208 0.45
209 0.4
210 0.4
211 0.35
212 0.3
213 0.26
214 0.18
215 0.13
216 0.09
217 0.08
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.12
271 0.14
272 0.17
273 0.17
274 0.16
275 0.16
276 0.17
277 0.16
278 0.14
279 0.13
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.11
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.09
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.15
301 0.17
302 0.19
303 0.18
304 0.17
305 0.17
306 0.18
307 0.2
308 0.16
309 0.18
310 0.16
311 0.17
312 0.18
313 0.19
314 0.16
315 0.16
316 0.17
317 0.2
318 0.2
319 0.18
320 0.18
321 0.17
322 0.21
323 0.26
324 0.26
325 0.22
326 0.22
327 0.22
328 0.21
329 0.21
330 0.17
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.09
351 0.1
352 0.13
353 0.13
354 0.14
355 0.13
356 0.16
357 0.15
358 0.15
359 0.15
360 0.12
361 0.16
362 0.16
363 0.15
364 0.13
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.09
370 0.09
371 0.11
372 0.15
373 0.19
374 0.22
375 0.23
376 0.24
377 0.24
378 0.27
379 0.29
380 0.28
381 0.25
382 0.23
383 0.21
384 0.2
385 0.25
386 0.21
387 0.18
388 0.15
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.1
394 0.15