Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9XXT3

Protein Details
Accession A0A4Y9XXT3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-84VEDDEPGRKTKKPKKKKKKESGAGTPASPBasic
111-139QASPPGPSKKERKALKKQKAKEKKSGVDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-78GRKTKKPKKKKKKESGA
115-134PGPSKKERKALKKQKAKEKK
Subcellular Location(s) mito 9.5, cyto_mito 9.333, cyto_nucl 8.833, nucl 8.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MAPRLSKRQQRELEELSALSGTPELELEPSSEDDVDDTHLAVPGKGGFAALMSDEVEDDEPGRKTKKPKKKKKKESGAGTPASPAPHPIIKVVEGKPTPVGVPSPPQAQAQASPPGPSKKERKALKKQKAKEKKSGVDEIEKALQELSTKYPDLQRVTANPSPGTSQESRSLSSDLASLLAVSLTHLDPEVEFRKFFGKKVVEAERSSSAGPSTPTGAXGRRTQRSNLTRPKREWGPAQMREGLSVRALSEDELAHKMEVNGWEPLEERWWTVEYSKRYRGATKAFMETVYSGNPDGLFAIYRRMPWHADTLMQLAEVQSHREDHSQAADLIERALFAYERAFVGSFNFTSGSNRLDFDHAENRPFFLAIHRQIINLERRRVMRTTFEFARLLYGLEPWTDPHGALLWLDFLAIKAGMNQWLLDMYALFESHASEKEEGGPLKGRVSVLALPGWAYAKALALRARGGAGSAKESTEALKQAIMAFPSAVPLLADKADISLSGEVRGHSAFRIFVPSWTSSEPES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.53
3 0.44
4 0.35
5 0.28
6 0.19
7 0.14
8 0.09
9 0.07
10 0.08
11 0.07
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.11
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.12
21 0.12
22 0.14
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.12
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.08
35 0.07
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.12
47 0.14
48 0.18
49 0.21
50 0.25
51 0.35
52 0.46
53 0.56
54 0.63
55 0.73
56 0.81
57 0.9
58 0.96
59 0.96
60 0.97
61 0.96
62 0.95
63 0.95
64 0.93
65 0.84
66 0.73
67 0.64
68 0.55
69 0.46
70 0.36
71 0.27
72 0.21
73 0.21
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.23
78 0.3
79 0.29
80 0.33
81 0.31
82 0.31
83 0.31
84 0.29
85 0.26
86 0.21
87 0.21
88 0.14
89 0.19
90 0.2
91 0.23
92 0.24
93 0.24
94 0.24
95 0.24
96 0.24
97 0.23
98 0.27
99 0.24
100 0.25
101 0.29
102 0.32
103 0.34
104 0.39
105 0.43
106 0.46
107 0.54
108 0.61
109 0.67
110 0.73
111 0.81
112 0.85
113 0.87
114 0.87
115 0.89
116 0.91
117 0.88
118 0.87
119 0.85
120 0.82
121 0.79
122 0.77
123 0.7
124 0.65
125 0.59
126 0.52
127 0.46
128 0.38
129 0.32
130 0.24
131 0.2
132 0.15
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.15
137 0.16
138 0.2
139 0.25
140 0.27
141 0.28
142 0.28
143 0.28
144 0.35
145 0.36
146 0.34
147 0.29
148 0.26
149 0.25
150 0.23
151 0.26
152 0.2
153 0.21
154 0.25
155 0.26
156 0.27
157 0.27
158 0.27
159 0.22
160 0.2
161 0.18
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.07
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.1
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.21
182 0.22
183 0.23
184 0.27
185 0.26
186 0.27
187 0.33
188 0.4
189 0.37
190 0.37
191 0.4
192 0.33
193 0.32
194 0.3
195 0.23
196 0.16
197 0.13
198 0.13
199 0.1
200 0.11
201 0.1
202 0.12
203 0.13
204 0.15
205 0.18
206 0.23
207 0.29
208 0.3
209 0.33
210 0.4
211 0.44
212 0.53
213 0.59
214 0.62
215 0.63
216 0.62
217 0.65
218 0.61
219 0.58
220 0.53
221 0.52
222 0.52
223 0.49
224 0.5
225 0.48
226 0.43
227 0.41
228 0.37
229 0.28
230 0.19
231 0.15
232 0.12
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.17
260 0.2
261 0.26
262 0.31
263 0.33
264 0.33
265 0.36
266 0.38
267 0.38
268 0.39
269 0.36
270 0.33
271 0.3
272 0.29
273 0.27
274 0.23
275 0.19
276 0.13
277 0.11
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.13
291 0.14
292 0.15
293 0.19
294 0.16
295 0.17
296 0.17
297 0.17
298 0.15
299 0.14
300 0.12
301 0.08
302 0.1
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.11
308 0.13
309 0.14
310 0.12
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.11
317 0.11
318 0.1
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.12
337 0.13
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.15
343 0.16
344 0.18
345 0.24
346 0.23
347 0.26
348 0.26
349 0.25
350 0.24
351 0.23
352 0.19
353 0.16
354 0.22
355 0.22
356 0.27
357 0.26
358 0.26
359 0.27
360 0.33
361 0.38
362 0.37
363 0.37
364 0.37
365 0.39
366 0.42
367 0.43
368 0.4
369 0.39
370 0.38
371 0.41
372 0.39
373 0.4
374 0.37
375 0.35
376 0.35
377 0.26
378 0.22
379 0.15
380 0.14
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.1
385 0.13
386 0.12
387 0.12
388 0.11
389 0.12
390 0.11
391 0.11
392 0.1
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.08
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.09
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.06
416 0.08
417 0.1
418 0.12
419 0.14
420 0.14
421 0.15
422 0.18
423 0.23
424 0.22
425 0.23
426 0.25
427 0.23
428 0.24
429 0.26
430 0.23
431 0.18
432 0.22
433 0.21
434 0.18
435 0.18
436 0.17
437 0.15
438 0.16
439 0.16
440 0.12
441 0.1
442 0.09
443 0.11
444 0.12
445 0.15
446 0.17
447 0.18
448 0.19
449 0.19
450 0.2
451 0.16
452 0.16
453 0.17
454 0.15
455 0.18
456 0.18
457 0.17
458 0.17
459 0.18
460 0.18
461 0.18
462 0.19
463 0.16
464 0.16
465 0.16
466 0.17
467 0.19
468 0.18
469 0.15
470 0.14
471 0.13
472 0.13
473 0.13
474 0.11
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.09
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.11
485 0.13
486 0.13
487 0.15
488 0.16
489 0.15
490 0.18
491 0.18
492 0.17
493 0.15
494 0.16
495 0.15
496 0.15
497 0.22
498 0.2
499 0.22
500 0.26
501 0.27
502 0.29
503 0.3