Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZF42

Protein Details
Accession A0A4Y9ZF42    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MSSRHDYRRRDRTPEKDERDRDRDREBasic
31-68RDRYRGGRGRSRSRSPPRRGGDRRPERRDDRRDDRRDYBasic
191-212GTANVKKERTWRQYMNRRGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-121RRDRTPEKDERDRDRDRERDRDRDRYRGGRGRSRSRSPPRRGGDRRPERRDDRRDDRRDYGRDRKDDRRRDDRDGRDYDRDDRRDRDRERDRDRRDDPKGRERPRERDGRSDE
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSSRHDYRRRDRTPEKDERDRDRDRERDRDRDRYRGGRGRSRSRSPPRRGGDRRPERRDDRRDDRRDYGRDRKDDRRRDDRDGRDYDRDDRRDRDRERDRDRRDDPKGRERPRERDGRSDERANPRDSEMKRSGGPSDAGPSSTADATPEPGEEVEAMDATNDDDAAMMAMMGLTGFGSTKGKHVDGNQEGTANVKKERTWRQYMNRRGGFNRPLDKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.85
3 0.84
4 0.86
5 0.85
6 0.84
7 0.81
8 0.78
9 0.76
10 0.77
11 0.74
12 0.76
13 0.74
14 0.76
15 0.76
16 0.79
17 0.75
18 0.75
19 0.76
20 0.73
21 0.75
22 0.72
23 0.73
24 0.71
25 0.74
26 0.75
27 0.76
28 0.75
29 0.76
30 0.79
31 0.83
32 0.81
33 0.83
34 0.79
35 0.82
36 0.82
37 0.82
38 0.82
39 0.83
40 0.85
41 0.82
42 0.84
43 0.82
44 0.84
45 0.83
46 0.81
47 0.81
48 0.81
49 0.81
50 0.78
51 0.77
52 0.75
53 0.73
54 0.72
55 0.71
56 0.69
57 0.69
58 0.69
59 0.72
60 0.74
61 0.77
62 0.77
63 0.77
64 0.74
65 0.75
66 0.78
67 0.75
68 0.74
69 0.7
70 0.67
71 0.62
72 0.58
73 0.57
74 0.55
75 0.53
76 0.48
77 0.46
78 0.49
79 0.52
80 0.52
81 0.55
82 0.57
83 0.62
84 0.67
85 0.73
86 0.72
87 0.71
88 0.74
89 0.72
90 0.7
91 0.69
92 0.66
93 0.67
94 0.71
95 0.68
96 0.73
97 0.7
98 0.7
99 0.68
100 0.71
101 0.63
102 0.62
103 0.63
104 0.61
105 0.59
106 0.57
107 0.56
108 0.56
109 0.57
110 0.5
111 0.44
112 0.39
113 0.42
114 0.38
115 0.4
116 0.33
117 0.32
118 0.31
119 0.31
120 0.3
121 0.24
122 0.24
123 0.17
124 0.17
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.09
133 0.08
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.03
164 0.04
165 0.06
166 0.07
167 0.11
168 0.14
169 0.16
170 0.18
171 0.22
172 0.31
173 0.33
174 0.38
175 0.36
176 0.33
177 0.32
178 0.33
179 0.34
180 0.26
181 0.24
182 0.21
183 0.23
184 0.32
185 0.42
186 0.47
187 0.52
188 0.59
189 0.67
190 0.76
191 0.83
192 0.85
193 0.81
194 0.79
195 0.73
196 0.73
197 0.7
198 0.68
199 0.66