Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9YNV8

Protein Details
Accession A0A4Y9YNV8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-156LEQPARHRRCRHIERRARQRRCRFTRGRRETAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-151ARHRRCRHIERRARQRRCRFTRGR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MNMKTESDSTPAASQTPSLPQTQTPQPQTTQPQQQQQQQQQQPTTSYATAQWATSRMIYLLMPSIHSTQARPITNRTNTIRRPRMATTNPISPSSSLTASHARTHPAINTKYDRSNFHHQRHRLEQPARHRRCRHIERRARQRRCRFTRGRRETAALLRPAPDVPPLRRPLAQTACLAQNFETRFLGPTMRKIGTRHRVTKVPEDSVNYVALALRARLSDLITGMIAASTHRTSTQFDREPSLYEDGTPMWGVNVRQDVAKQLAALEKGEREEEMRVRRERKELAAAQAAALATHAAGAAGLGWGSCCRRLPASAYALRAMEAASARLRGGRSAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.24
4 0.23
5 0.23
6 0.24
7 0.25
8 0.31
9 0.39
10 0.45
11 0.44
12 0.46
13 0.46
14 0.51
15 0.56
16 0.59
17 0.61
18 0.59
19 0.62
20 0.65
21 0.71
22 0.74
23 0.76
24 0.78
25 0.74
26 0.75
27 0.7
28 0.65
29 0.6
30 0.53
31 0.47
32 0.37
33 0.31
34 0.25
35 0.26
36 0.24
37 0.22
38 0.2
39 0.19
40 0.19
41 0.19
42 0.18
43 0.13
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.14
51 0.16
52 0.18
53 0.19
54 0.18
55 0.21
56 0.28
57 0.31
58 0.31
59 0.35
60 0.41
61 0.45
62 0.52
63 0.51
64 0.53
65 0.57
66 0.66
67 0.68
68 0.61
69 0.62
70 0.59
71 0.62
72 0.57
73 0.58
74 0.52
75 0.51
76 0.51
77 0.47
78 0.44
79 0.35
80 0.33
81 0.27
82 0.24
83 0.17
84 0.18
85 0.21
86 0.22
87 0.26
88 0.25
89 0.25
90 0.25
91 0.26
92 0.27
93 0.29
94 0.29
95 0.3
96 0.34
97 0.35
98 0.4
99 0.42
100 0.43
101 0.42
102 0.51
103 0.54
104 0.58
105 0.63
106 0.62
107 0.66
108 0.68
109 0.68
110 0.66
111 0.63
112 0.61
113 0.63
114 0.7
115 0.69
116 0.71
117 0.7
118 0.69
119 0.73
120 0.77
121 0.77
122 0.77
123 0.8
124 0.8
125 0.87
126 0.9
127 0.9
128 0.89
129 0.89
130 0.89
131 0.87
132 0.88
133 0.87
134 0.86
135 0.88
136 0.87
137 0.83
138 0.74
139 0.68
140 0.61
141 0.56
142 0.51
143 0.41
144 0.32
145 0.27
146 0.25
147 0.23
148 0.19
149 0.18
150 0.16
151 0.17
152 0.23
153 0.25
154 0.26
155 0.28
156 0.29
157 0.32
158 0.33
159 0.33
160 0.27
161 0.26
162 0.27
163 0.26
164 0.25
165 0.17
166 0.18
167 0.16
168 0.17
169 0.15
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.17
174 0.13
175 0.16
176 0.2
177 0.21
178 0.22
179 0.23
180 0.32
181 0.38
182 0.45
183 0.48
184 0.47
185 0.51
186 0.53
187 0.6
188 0.54
189 0.48
190 0.43
191 0.4
192 0.38
193 0.34
194 0.31
195 0.21
196 0.17
197 0.13
198 0.12
199 0.09
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.1
220 0.13
221 0.19
222 0.27
223 0.3
224 0.31
225 0.36
226 0.35
227 0.37
228 0.37
229 0.35
230 0.26
231 0.21
232 0.21
233 0.16
234 0.17
235 0.14
236 0.1
237 0.07
238 0.1
239 0.1
240 0.12
241 0.15
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.18
246 0.19
247 0.19
248 0.15
249 0.14
250 0.17
251 0.17
252 0.18
253 0.16
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.15
258 0.14
259 0.17
260 0.23
261 0.29
262 0.34
263 0.41
264 0.45
265 0.49
266 0.55
267 0.54
268 0.53
269 0.55
270 0.52
271 0.51
272 0.52
273 0.48
274 0.41
275 0.38
276 0.33
277 0.23
278 0.19
279 0.13
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.04
291 0.07
292 0.09
293 0.12
294 0.14
295 0.16
296 0.19
297 0.22
298 0.27
299 0.32
300 0.39
301 0.41
302 0.42
303 0.42
304 0.4
305 0.37
306 0.32
307 0.25
308 0.19
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.15
313 0.15
314 0.18
315 0.19