FuNGI

A0A4Y9ZCW4

Protein Details

Accession

A0A4Y9ZCW4

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
484-523	TVARPRNESKEEKKVRKQAVKAERQTRRVEKKATKEQFSA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
489-516	RNESKEEKKVRKQAVKAERQTRRVEKKA

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 4, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPKKSIFRQPGVQHFQLVHRSQRDPLIHDPEASQHVLKPFIRENDKKGKSRAELEKILSPSDLAHDTQRPNVGEASLYGIYYDDTDYDYMQHLRPVGDQEEGVDSVLVEAPTQKKSKGKGKEGLTLRDLPPEALPSTSELPRNYENQEAIPSSIAGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFMEEDADDDFFGELVGGGEREKDEGVYFEFAEEGVGEEEEAGEEGEGDDELPEDAGWEARFAAFKKAQKDQDGATDVDGYSEGGDTVGRMPEFSVIGGKKRRKGTSDASGYSMSSSSMFRNEGLRMVDERFDQIEKEYASDEEEIEDVEDDDDTEPQLITTREDFDSMMDDFLDNYEIFGGKMKPALHGTGAEKLETLRTAMGQDQRVKEKDSDESSDNDDADIYAYLEKEDKRDRWDVETVLTAHTNLENHPRLIRARESKPVPQIRLDPKTGLPIVLNGEELKPRRKPVKQPTLEEEEIEGPVHVTVARPRNESKEEKKVRKQAVKAERQTRRVEKKATKEQFSAAIKQQTQVMASKDVKTRKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.55
3	0.55
4	0.51
5	0.49
6	0.46
7	0.47
8	0.47
9	0.53
10	0.51
11	0.47
12	0.52
13	0.52
14	0.47
15	0.46
16	0.44
17	0.4
18	0.4
19	0.37
20	0.29
21	0.24
22	0.25
23	0.31
24	0.31
25	0.32
26	0.34
27	0.41
28	0.49
29	0.51
30	0.56
31	0.61
32	0.68
33	0.69
34	0.69
35	0.69
36	0.65
37	0.69
38	0.71
39	0.68
40	0.66
41	0.64
42	0.64
43	0.57
44	0.53
45	0.43
46	0.33
47	0.26
48	0.23
49	0.21
50	0.16
51	0.19
52	0.24
53	0.26
54	0.3
55	0.35
56	0.32
57	0.32
58	0.31
59	0.27
60	0.21
61	0.2
62	0.21
63	0.16
64	0.15
65	0.13
66	0.12
67	0.12
68	0.12
69	0.12
70	0.07
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.1
75	0.12
76	0.14
77	0.15
78	0.16
79	0.16
80	0.17
81	0.18
82	0.21
83	0.2
84	0.19
85	0.18
86	0.17
87	0.18
88	0.18
89	0.16
90	0.11
91	0.09
92	0.09
93	0.11
94	0.09
95	0.07
96	0.1
97	0.13
98	0.18
99	0.2
100	0.23
101	0.26
102	0.34
103	0.43
104	0.49
105	0.55
106	0.59
107	0.62
108	0.67
109	0.68
110	0.66
111	0.61
112	0.56
113	0.48
114	0.45
115	0.4
116	0.32
117	0.27
118	0.25
119	0.21
120	0.16
121	0.16
122	0.14
123	0.17
124	0.19
125	0.22
126	0.2
127	0.24
128	0.26
129	0.29
130	0.29
131	0.29
132	0.27
133	0.24
134	0.26
135	0.23
136	0.21
137	0.18
138	0.15
139	0.12
140	0.14
141	0.13
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.11
146	0.11
147	0.13
148	0.12
149	0.13
150	0.13
151	0.17
152	0.17
153	0.15
154	0.16
155	0.14
156	0.13
157	0.13
158	0.13
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.08
163	0.07
164	0.05
165	0.05
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.03
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.05
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.07
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.08
193	0.07
194	0.07
195	0.06
196	0.05
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.03
205	0.02
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.04
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.07
224	0.08
225	0.13
226	0.17
227	0.21
228	0.25
229	0.31
230	0.34
231	0.36
232	0.37
233	0.32
234	0.33
235	0.32
236	0.28
237	0.22
238	0.19
239	0.16
240	0.14
241	0.13
242	0.08
243	0.05
244	0.05
245	0.04
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.04
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.07
256	0.06
257	0.09
258	0.09
259	0.14
260	0.22
261	0.25
262	0.3
263	0.36
264	0.39
265	0.38
266	0.43
267	0.45
268	0.47
269	0.5
270	0.45
271	0.42
272	0.39
273	0.36
274	0.31
275	0.24
276	0.15
277	0.1
278	0.09
279	0.07
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.12
284	0.12
285	0.13
286	0.13
287	0.14
288	0.14
289	0.14
290	0.15
291	0.13
292	0.14
293	0.12
294	0.12
295	0.11
296	0.1
297	0.12
298	0.11
299	0.11
300	0.11
301	0.1
302	0.11
303	0.12
304	0.11
305	0.08
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.07
321	0.07
322	0.08
323	0.09
324	0.12
325	0.12
326	0.13
327	0.13
328	0.11
329	0.13
330	0.12
331	0.11
332	0.08
333	0.08
334	0.07
335	0.07
336	0.09
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.12
346	0.12
347	0.14
348	0.15
349	0.17
350	0.15
351	0.17
352	0.19
353	0.22
354	0.22
355	0.2
356	0.18
357	0.17
358	0.17
359	0.15
360	0.14
361	0.07
362	0.07
363	0.09
364	0.13
365	0.17
366	0.21
367	0.27
368	0.3
369	0.36
370	0.37
371	0.39
372	0.37
373	0.34
374	0.35
375	0.34
376	0.34
377	0.3
378	0.3
379	0.31
380	0.31
381	0.29
382	0.23
383	0.18
384	0.14
385	0.13
386	0.11
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.11
392	0.11
393	0.16
394	0.23
395	0.25
396	0.3
397	0.36
398	0.37
399	0.39
400	0.43
401	0.39
402	0.34
403	0.35
404	0.3
405	0.26
406	0.24
407	0.19
408	0.15
409	0.16
410	0.15
411	0.12
412	0.2
413	0.21
414	0.22
415	0.23
416	0.26
417	0.27
418	0.31
419	0.38
420	0.37
421	0.39
422	0.47
423	0.5
424	0.54
425	0.61
426	0.65
427	0.59
428	0.55
429	0.6
430	0.6
431	0.61
432	0.57
433	0.5
434	0.44
435	0.47
436	0.43
437	0.35
438	0.26
439	0.22
440	0.23
441	0.21
442	0.2
443	0.15
444	0.16
445	0.21
446	0.24
447	0.28
448	0.29
449	0.36
450	0.45
451	0.52
452	0.61
453	0.66
454	0.74
455	0.76
456	0.79
457	0.78
458	0.78
459	0.71
460	0.61
461	0.53
462	0.43
463	0.35
464	0.28
465	0.21
466	0.12
467	0.11
468	0.11
469	0.08
470	0.08
471	0.15
472	0.23
473	0.27
474	0.31
475	0.34
476	0.41
477	0.49
478	0.56
479	0.57
480	0.6
481	0.67
482	0.73
483	0.8
484	0.82
485	0.85
486	0.85
487	0.84
488	0.83
489	0.83
490	0.84
491	0.84
492	0.85
493	0.83
494	0.81
495	0.83
496	0.84
497	0.83
498	0.8
499	0.81
500	0.8
501	0.81
502	0.86
503	0.85
504	0.81
505	0.74
506	0.68
507	0.67
508	0.63
509	0.58
510	0.54
511	0.54
512	0.48
513	0.47
514	0.47
515	0.4
516	0.38
517	0.36
518	0.32
519	0.32
520	0.34
521	0.39
522	0.43

A0A4Y9ZCW4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer