Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZTL8

Protein Details
Accession A0A4Y9ZTL8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-44GEMISKQELKRREKQRDKEARKAKAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-50LKRREKQRDKEARKAKAAAALPEKP
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004364  Aa-tRNA-synt_II  
IPR006195  aa-tRNA-synth_II  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR008594  DcpS/DCS2  
IPR019808  Histidine_triad_CS  
IPR036265  HIT-like_sf  
IPR044136  Lys-tRNA-ligase_II_N  
IPR018149  Lys-tRNA-synth_II_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR004365  NA-bd_OB_tRNA  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0004824  F:lysine-tRNA ligase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
GO:0006430  P:lysyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05652  DcpS  
PF11969  DcpS_C  
PF00152  tRNA-synt_2  
PF01336  tRNA_anti-codon  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50862  AA_TRNA_LIGASE_II  
PS00892  HIT_1  
CDD cd04322  LysRS_N  
Amino Acid Sequences MASEQPATAGTHKDPITGEMISKQELKRREKQRDKEARKAKAAAALPEKPAAAPKAAVSNENDLNPNQYFELRSRQIQKLRETQDPNPYPHKFDVSISITEFIDKHGKEGVLTDGQRLDGTTVSLAGRIHNMRQYGKLRFYDLHGEGKKLQIMATVQDAANPDTFTVTHDIFRRGDVVGVVGTPSRTQKGELSILPSEMVLLAPNLHQLPSGHFGLKDQETRYRKRYLDLMLSDDTRRIFLTRSRIINYVRRFLDTLGFLEVETPMTSMIAGGATAKPFVTHHNDLDLDLYLRVAPELYLKQLVVGGLDRVYEIGRVFRNEGIDLTHNPEFTICEFYMAYADMYDVMDLTEALVEGMVKHLTGGETTLKYHPDGKDGKEYELNFQRPWKRYDMIETLEEKLGVKFPPGETLHTEEANVFLRDLAKKHDVDCSEPRTNARLLDKLVGEFIEPLCISPAFIVGHPQYSWGLAWLKRSEEGADIKVSVICPATEVHIRKVSHAHSNSWPRIQSEDGYKYSAQKIHLVHETPEMYACIVKPYIDAFPPSRTQWVEDILDGRSEFDSVLFRSSSDAPFGFLILPDMKWDGITTSALYLLAITLFKGIRTLRDLTREHIGMLKEIRQRARQIVKERYGLESTEFRCYVHYQPSYYHFHVHIVNTNYVGLPGMSVGQAHLLDDIISLLELDPPGAPSILQRMTLSYGLGDQHGLFVPLKAAQTELTKEDDGDGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.28
4 0.25
5 0.24
6 0.22
7 0.24
8 0.24
9 0.29
10 0.3
11 0.33
12 0.41
13 0.48
14 0.53
15 0.62
16 0.7
17 0.75
18 0.82
19 0.87
20 0.89
21 0.9
22 0.91
23 0.9
24 0.88
25 0.84
26 0.79
27 0.7
28 0.67
29 0.62
30 0.59
31 0.57
32 0.52
33 0.46
34 0.44
35 0.41
36 0.33
37 0.34
38 0.29
39 0.23
40 0.2
41 0.19
42 0.25
43 0.26
44 0.28
45 0.27
46 0.31
47 0.32
48 0.33
49 0.34
50 0.26
51 0.3
52 0.28
53 0.26
54 0.21
55 0.2
56 0.2
57 0.21
58 0.31
59 0.29
60 0.36
61 0.42
62 0.49
63 0.54
64 0.58
65 0.63
66 0.63
67 0.65
68 0.67
69 0.66
70 0.63
71 0.67
72 0.66
73 0.64
74 0.63
75 0.6
76 0.56
77 0.53
78 0.52
79 0.42
80 0.38
81 0.41
82 0.37
83 0.36
84 0.32
85 0.31
86 0.26
87 0.26
88 0.24
89 0.19
90 0.23
91 0.2
92 0.2
93 0.23
94 0.23
95 0.22
96 0.23
97 0.25
98 0.24
99 0.24
100 0.25
101 0.22
102 0.22
103 0.22
104 0.21
105 0.17
106 0.1
107 0.11
108 0.09
109 0.1
110 0.09
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.16
115 0.17
116 0.2
117 0.22
118 0.26
119 0.26
120 0.33
121 0.39
122 0.4
123 0.44
124 0.43
125 0.43
126 0.41
127 0.42
128 0.43
129 0.4
130 0.43
131 0.37
132 0.39
133 0.36
134 0.38
135 0.36
136 0.28
137 0.25
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.18
142 0.18
143 0.16
144 0.17
145 0.19
146 0.17
147 0.17
148 0.16
149 0.13
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.14
154 0.13
155 0.16
156 0.19
157 0.22
158 0.22
159 0.22
160 0.22
161 0.18
162 0.18
163 0.15
164 0.13
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.14
175 0.16
176 0.21
177 0.24
178 0.24
179 0.27
180 0.26
181 0.25
182 0.24
183 0.21
184 0.16
185 0.12
186 0.1
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.12
197 0.16
198 0.18
199 0.17
200 0.16
201 0.17
202 0.21
203 0.24
204 0.24
205 0.22
206 0.3
207 0.35
208 0.41
209 0.45
210 0.47
211 0.45
212 0.44
213 0.47
214 0.43
215 0.45
216 0.41
217 0.41
218 0.35
219 0.36
220 0.34
221 0.3
222 0.25
223 0.17
224 0.16
225 0.13
226 0.12
227 0.15
228 0.23
229 0.28
230 0.31
231 0.33
232 0.37
233 0.4
234 0.46
235 0.45
236 0.44
237 0.38
238 0.37
239 0.35
240 0.31
241 0.31
242 0.24
243 0.21
244 0.16
245 0.15
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.11
267 0.17
268 0.19
269 0.2
270 0.22
271 0.23
272 0.23
273 0.23
274 0.2
275 0.13
276 0.1
277 0.1
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.08
302 0.09
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.14
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.16
313 0.16
314 0.15
315 0.14
316 0.14
317 0.13
318 0.12
319 0.16
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.02
339 0.02
340 0.02
341 0.02
342 0.02
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.07
352 0.07
353 0.09
354 0.11
355 0.11
356 0.12
357 0.17
358 0.16
359 0.2
360 0.22
361 0.23
362 0.3
363 0.3
364 0.32
365 0.31
366 0.31
367 0.31
368 0.35
369 0.35
370 0.27
371 0.32
372 0.38
373 0.37
374 0.39
375 0.37
376 0.32
377 0.31
378 0.36
379 0.35
380 0.3
381 0.31
382 0.29
383 0.27
384 0.25
385 0.24
386 0.19
387 0.14
388 0.14
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.16
394 0.16
395 0.18
396 0.18
397 0.23
398 0.24
399 0.22
400 0.23
401 0.15
402 0.16
403 0.16
404 0.14
405 0.09
406 0.08
407 0.1
408 0.11
409 0.12
410 0.15
411 0.18
412 0.18
413 0.19
414 0.24
415 0.23
416 0.27
417 0.32
418 0.35
419 0.34
420 0.34
421 0.34
422 0.32
423 0.32
424 0.3
425 0.27
426 0.22
427 0.21
428 0.23
429 0.22
430 0.19
431 0.19
432 0.15
433 0.13
434 0.11
435 0.09
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.12
447 0.11
448 0.13
449 0.12
450 0.14
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.1
455 0.14
456 0.13
457 0.18
458 0.18
459 0.19
460 0.19
461 0.2
462 0.18
463 0.18
464 0.19
465 0.17
466 0.16
467 0.15
468 0.15
469 0.15
470 0.14
471 0.11
472 0.09
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.1
477 0.15
478 0.17
479 0.2
480 0.26
481 0.26
482 0.27
483 0.32
484 0.32
485 0.35
486 0.36
487 0.36
488 0.38
489 0.47
490 0.48
491 0.48
492 0.46
493 0.38
494 0.39
495 0.36
496 0.31
497 0.29
498 0.32
499 0.29
500 0.31
501 0.31
502 0.31
503 0.33
504 0.34
505 0.28
506 0.27
507 0.27
508 0.28
509 0.33
510 0.31
511 0.29
512 0.3
513 0.3
514 0.24
515 0.24
516 0.19
517 0.15
518 0.14
519 0.13
520 0.11
521 0.1
522 0.1
523 0.1
524 0.11
525 0.13
526 0.13
527 0.17
528 0.16
529 0.2
530 0.23
531 0.24
532 0.27
533 0.25
534 0.26
535 0.25
536 0.27
537 0.24
538 0.22
539 0.23
540 0.19
541 0.2
542 0.17
543 0.16
544 0.12
545 0.11
546 0.1
547 0.09
548 0.11
549 0.1
550 0.13
551 0.11
552 0.11
553 0.14
554 0.17
555 0.17
556 0.17
557 0.17
558 0.16
559 0.16
560 0.16
561 0.14
562 0.11
563 0.13
564 0.11
565 0.11
566 0.11
567 0.12
568 0.11
569 0.11
570 0.11
571 0.09
572 0.09
573 0.1
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.09
578 0.09
579 0.08
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.05
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.11
588 0.12
589 0.14
590 0.19
591 0.23
592 0.24
593 0.32
594 0.34
595 0.34
596 0.4
597 0.37
598 0.33
599 0.33
600 0.3
601 0.26
602 0.27
603 0.31
604 0.3
605 0.36
606 0.4
607 0.41
608 0.45
609 0.5
610 0.57
611 0.58
612 0.62
613 0.66
614 0.67
615 0.67
616 0.65
617 0.6
618 0.52
619 0.45
620 0.4
621 0.37
622 0.33
623 0.35
624 0.33
625 0.28
626 0.29
627 0.32
628 0.33
629 0.35
630 0.37
631 0.31
632 0.35
633 0.41
634 0.46
635 0.45
636 0.44
637 0.36
638 0.36
639 0.38
640 0.37
641 0.38
642 0.35
643 0.34
644 0.3
645 0.3
646 0.27
647 0.23
648 0.2
649 0.13
650 0.08
651 0.07
652 0.07
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.09
657 0.09
658 0.09
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.05
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.07
669 0.07
670 0.08
671 0.08
672 0.09
673 0.1
674 0.1
675 0.1
676 0.09
677 0.17
678 0.18
679 0.2
680 0.19
681 0.2
682 0.24
683 0.24
684 0.23
685 0.16
686 0.17
687 0.16
688 0.16
689 0.15
690 0.12
691 0.13
692 0.13
693 0.15
694 0.13
695 0.13
696 0.14
697 0.15
698 0.16
699 0.14
700 0.15
701 0.15
702 0.19
703 0.22
704 0.23
705 0.25
706 0.25
707 0.25