Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZSD3

Protein Details
Accession A0A4Y9ZSD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
564-586GPEWEKTKAKSKLPKPKVDDTVLHydrophilic
647-673EAEAKGPRTGKKRKADDSGQDKRRSKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
653-676AKGPRTGKKRKADDSGQDKRRSKR
Subcellular Location(s) cyto 15, nucl 8, cyto_pero 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002938  FAD-bd  
IPR036188  FAD/NAD-bd_sf  
IPR015353  Rubisco_LSMT_subst-bd  
IPR036464  Rubisco_LSMT_subst-bd_sf  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071949  F:FAD binding  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0016705  F:oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen  
GO:0032259  P:methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01494  FAD_binding_3  
PF09273  Rubis-subs-bind  
PF00856  SET  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
Amino Acid Sequences MVKDPELKWFVDNPQMNVFVGPRRHVVMYKIRSTVYNVVMAHPDDGSTESWTAQGDIAKAREEFSDFAPCVRKVLDLVPSLMNWKLMARDPLSKWVHDDGKVALLGDACHPMLPYRAQGAAMAVEDAAVLGVLFGHLSIHSEIGPXLXACQDIRYPRASKTQQDGGGDASREGFRICRQLWKSELVAGQETRGGTFDESALMFTEIEGHGRGALALRDLPEGHALFTIPRDLTLSTRTSSLPRILGFSEWKKFGLDSGWAGLMLCMMWEEAQGASSKWSGYIESLPKRFDTPMFWSEGELEELKGTSVVDKIGKDQAENDYREKVLPALQNRPDLFPPDLLEKHYSLHAYHLMGSRILSRSFQVEKWEQEQDEKTNEPSSSHQNPDSMNVDEEVPPSSNAAQSDEAEAKLDELLDDDSDDENEDSSDVAMVPMADMLNARYESENAKLFYEERDLRMVTTKAIFSGEQIWNTYGDPPNSDLLRRYGHVDLVPIPQGGLGNPADIXEVRADLAVAAVSSTRPGESSEPYAERVDWWLEEGGDDVFVLETNHQLPDELVSFMRLLILTGPEWEKTKAKSKLPKPKVDDTVLSITADMLNRRLSEYSTTLEEDEKILADPDLKLNRRHAVIVRLGEKRIIQGTVQAVKKILEEAEAKGPRTGKKRKADDSGQDKRRSKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.38
4 0.35
5 0.33
6 0.3
7 0.31
8 0.3
9 0.27
10 0.29
11 0.31
12 0.32
13 0.37
14 0.4
15 0.44
16 0.48
17 0.48
18 0.46
19 0.45
20 0.49
21 0.49
22 0.41
23 0.39
24 0.33
25 0.32
26 0.34
27 0.34
28 0.29
29 0.21
30 0.19
31 0.14
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.14
36 0.13
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.15
42 0.14
43 0.18
44 0.19
45 0.21
46 0.21
47 0.21
48 0.21
49 0.21
50 0.21
51 0.19
52 0.26
53 0.23
54 0.27
55 0.31
56 0.3
57 0.29
58 0.28
59 0.26
60 0.2
61 0.24
62 0.27
63 0.24
64 0.26
65 0.26
66 0.25
67 0.27
68 0.25
69 0.22
70 0.15
71 0.14
72 0.15
73 0.17
74 0.22
75 0.23
76 0.3
77 0.32
78 0.41
79 0.43
80 0.4
81 0.41
82 0.42
83 0.44
84 0.38
85 0.38
86 0.29
87 0.3
88 0.29
89 0.25
90 0.19
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.15
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.14
100 0.15
101 0.15
102 0.15
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.15
108 0.13
109 0.11
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.04
115 0.03
116 0.02
117 0.02
118 0.02
119 0.02
120 0.02
121 0.02
122 0.03
123 0.03
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.17
138 0.2
139 0.24
140 0.26
141 0.28
142 0.38
143 0.42
144 0.45
145 0.45
146 0.49
147 0.48
148 0.48
149 0.45
150 0.39
151 0.38
152 0.32
153 0.25
154 0.2
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.13
159 0.12
160 0.19
161 0.2
162 0.27
163 0.29
164 0.34
165 0.36
166 0.39
167 0.37
168 0.35
169 0.36
170 0.28
171 0.29
172 0.25
173 0.22
174 0.2
175 0.19
176 0.15
177 0.14
178 0.12
179 0.09
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.12
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.11
218 0.14
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.16
223 0.17
224 0.19
225 0.2
226 0.19
227 0.17
228 0.18
229 0.18
230 0.19
231 0.22
232 0.24
233 0.25
234 0.24
235 0.24
236 0.22
237 0.22
238 0.2
239 0.17
240 0.14
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.07
248 0.05
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.13
267 0.18
268 0.23
269 0.26
270 0.26
271 0.26
272 0.27
273 0.27
274 0.24
275 0.21
276 0.21
277 0.21
278 0.24
279 0.23
280 0.22
281 0.22
282 0.21
283 0.19
284 0.13
285 0.11
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.08
295 0.08
296 0.1
297 0.13
298 0.14
299 0.13
300 0.14
301 0.19
302 0.23
303 0.25
304 0.25
305 0.23
306 0.23
307 0.23
308 0.22
309 0.16
310 0.15
311 0.17
312 0.19
313 0.24
314 0.27
315 0.31
316 0.32
317 0.33
318 0.29
319 0.28
320 0.26
321 0.19
322 0.18
323 0.17
324 0.17
325 0.17
326 0.18
327 0.16
328 0.15
329 0.16
330 0.15
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.11
335 0.13
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.14
343 0.12
344 0.1
345 0.13
346 0.15
347 0.16
348 0.19
349 0.2
350 0.22
351 0.25
352 0.27
353 0.24
354 0.25
355 0.26
356 0.24
357 0.23
358 0.22
359 0.2
360 0.2
361 0.2
362 0.18
363 0.18
364 0.24
365 0.25
366 0.27
367 0.27
368 0.26
369 0.26
370 0.28
371 0.29
372 0.22
373 0.18
374 0.15
375 0.16
376 0.14
377 0.14
378 0.12
379 0.1
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.1
384 0.09
385 0.12
386 0.11
387 0.11
388 0.14
389 0.14
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.1
394 0.09
395 0.08
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.11
428 0.14
429 0.17
430 0.15
431 0.16
432 0.16
433 0.16
434 0.16
435 0.22
436 0.2
437 0.19
438 0.21
439 0.2
440 0.2
441 0.24
442 0.23
443 0.18
444 0.18
445 0.16
446 0.14
447 0.15
448 0.15
449 0.11
450 0.18
451 0.19
452 0.18
453 0.19
454 0.19
455 0.18
456 0.19
457 0.22
458 0.18
459 0.17
460 0.17
461 0.18
462 0.21
463 0.21
464 0.22
465 0.19
466 0.19
467 0.21
468 0.2
469 0.22
470 0.2
471 0.21
472 0.21
473 0.21
474 0.2
475 0.2
476 0.21
477 0.17
478 0.15
479 0.13
480 0.13
481 0.11
482 0.12
483 0.1
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.06
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.08
506 0.11
507 0.14
508 0.19
509 0.23
510 0.24
511 0.26
512 0.27
513 0.25
514 0.23
515 0.23
516 0.2
517 0.15
518 0.15
519 0.14
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.1
524 0.08
525 0.07
526 0.06
527 0.05
528 0.05
529 0.06
530 0.05
531 0.07
532 0.08
533 0.09
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.11
538 0.12
539 0.12
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.11
544 0.12
545 0.09
546 0.08
547 0.08
548 0.09
549 0.08
550 0.11
551 0.13
552 0.14
553 0.16
554 0.19
555 0.22
556 0.25
557 0.35
558 0.39
559 0.47
560 0.55
561 0.63
562 0.72
563 0.77
564 0.83
565 0.8
566 0.82
567 0.8
568 0.75
569 0.68
570 0.62
571 0.58
572 0.49
573 0.42
574 0.33
575 0.26
576 0.23
577 0.23
578 0.18
579 0.14
580 0.16
581 0.16
582 0.18
583 0.19
584 0.18
585 0.21
586 0.23
587 0.23
588 0.24
589 0.25
590 0.24
591 0.24
592 0.23
593 0.19
594 0.17
595 0.15
596 0.12
597 0.12
598 0.11
599 0.11
600 0.12
601 0.18
602 0.27
603 0.29
604 0.33
605 0.38
606 0.43
607 0.43
608 0.47
609 0.44
610 0.42
611 0.46
612 0.49
613 0.5
614 0.49
615 0.48
616 0.46
617 0.42
618 0.39
619 0.35
620 0.29
621 0.22
622 0.24
623 0.29
624 0.35
625 0.36
626 0.33
627 0.32
628 0.31
629 0.32
630 0.29
631 0.22
632 0.19
633 0.19
634 0.21
635 0.3
636 0.33
637 0.34
638 0.35
639 0.39
640 0.41
641 0.49
642 0.56
643 0.56
644 0.62
645 0.71
646 0.76
647 0.81
648 0.83
649 0.84
650 0.84
651 0.85
652 0.84
653 0.84