FuNGI

A0A4Z0A9P5

Protein Details

Accession

A0A4Z0A9P5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-26	LDEPDRRTYLKRFRRPNLENIQRMT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 11, nucl 9, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR035698 RNAP_III_Rpc1_C IPR035697 RNAP_III_RPC1_N IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02736 RNAP_III_Rpc1_C cd02583 RNAP_III_RPC1_N

Amino Acid Sequences

MLDEPDRRTYLKRFRRPNLENIQRMTLIKAVNTSARKTVYCQYCTSTNGAVKKAGALKIIHDKFRAKKTADELEKWKKTFTAAVEGQKELGMYINKAAQEDLNPLKVLDLFRRISDEDCELLGLRPEFNRPEEYLWQYISVPPVCIRPSVAQDGASNEDDLTVKLTEIVFTNALIRQGLTKGAPTPQFMEQWEFLQLSVAMYINSELPGVPSQMGQKPIRGFCQRLKGKQGRFRGNLSGKRVDFSGRTVISPDPNLRIDEVAVPERVAKILTYPERVTTFNIEKLQKAVRNGCDVHPGANYVTAGSSGFKKYLKFGNRTAIADGLRYGDVVERHIIDGDIVLFNRQPSLHKLSIMCHRVKVRPWRSFRLNECVCNPYNADFDGDEMNLHVPQTEEARTEALQLMSVKLNMVTPRNGEPVIAAIQDFITASYLLSRRDQFFDRCQFTQICSYFADADLQIDVPPPTIWKPVRLWTGKQIFNVLMRPNKSYNIFVNVESKCNTQHKPDPKCYSSRMNPVADMSPNDGWLVIVNSEIMCGVMDKATVGAGKKKSVFGVIMRDYGPDEAAAAMNRLAKLCARYLANFGFSLGINDVIPGPVLSSKKDSLVEKAYAACQDLIALAKKGKLENKAGCNQEQTLEAMISSVLSKVRDEVGEICMKELSHHNAPLIMATCGSKGSIINVSQMVACVGQQIIAGHRVPDGFQDRSLPHFPKKSRSPPSKGFVRNSFYSGLSPTEFLFHAISGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKALEDLTTQYDLSVRTGTGGLVQFRYGDDGLDPACLEGDAQPLEFVRAWKHAAXIAARELSLKKFASECTPAYISIVRTFVREHVAEHLAKMRKSRGMFEALEREEEWDADTDLSMGASDADKAIVDNKAKVTEDQLLSFLSICWIKYVKAKIEPGSTVGAVGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINAAKAISTPIISCRLVTADSEPSARIVKGRLEKTHLGDIASVLEEAWAPEYTYVGIIVDMEGIQRLQLEMTIDDIKWAIVNTRKLKVKQESITIIPRKNRLRIYIDGQDNYYRLRELKRLLPEVVVKGVPTIARAVINVKDKDDDRGKKGDKELLVEGYGLQKCMTTEGIVGEHTTSNHVIEVAQVLGIEAARKTIIDEIQFTMGSHGMSIDPRHVMLLGDTMSYKGEVLGITRFGVAKMKDSVLMLASFEKTTDHLFDAAAYGKTDSIAGVSESIIMGNPAANCGTSMPALISPSPHIRKPRPLLFEGAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.84
3	0.84
4	0.85
5	0.85
6	0.84
7	0.82
8	0.75
9	0.71
10	0.62
11	0.58
12	0.5
13	0.43
14	0.34
15	0.28
16	0.26
17	0.24
18	0.28
19	0.31
20	0.32
21	0.33
22	0.35
23	0.35
24	0.37
25	0.44
26	0.45
27	0.45
28	0.45
29	0.44
30	0.45
31	0.47
32	0.46
33	0.43
34	0.4
35	0.42
36	0.41
37	0.39
38	0.34
39	0.37
40	0.39
41	0.35
42	0.34
43	0.29
44	0.32
45	0.41
46	0.46
47	0.44
48	0.43
49	0.48
50	0.51
51	0.6
52	0.63
53	0.54
54	0.56
55	0.59
56	0.66
57	0.65
58	0.64
59	0.65
60	0.67
61	0.73
62	0.67
63	0.61
64	0.52
65	0.47
66	0.46
67	0.39
68	0.38
69	0.37
70	0.44
71	0.46
72	0.45
73	0.43
74	0.38
75	0.34
76	0.24
77	0.23
78	0.17
79	0.14
80	0.16
81	0.19
82	0.19
83	0.2
84	0.21
85	0.17
86	0.17
87	0.23
88	0.24
89	0.24
90	0.24
91	0.23
92	0.23
93	0.25
94	0.25
95	0.24
96	0.27
97	0.26
98	0.26
99	0.31
100	0.31
101	0.3
102	0.31
103	0.29
104	0.23
105	0.22
106	0.22
107	0.18
108	0.18
109	0.2
110	0.18
111	0.17
112	0.17
113	0.21
114	0.24
115	0.26
116	0.29
117	0.27
118	0.32
119	0.36
120	0.4
121	0.38
122	0.36
123	0.34
124	0.31
125	0.31
126	0.31
127	0.26
128	0.22
129	0.2
130	0.24
131	0.24
132	0.24
133	0.25
134	0.23
135	0.27
136	0.31
137	0.32
138	0.29
139	0.29
140	0.31
141	0.33
142	0.3
143	0.25
144	0.18
145	0.18
146	0.17
147	0.16
148	0.15
149	0.11
150	0.1
151	0.11
152	0.11
153	0.11
154	0.12
155	0.14
156	0.12
157	0.12
158	0.14
159	0.14
160	0.15
161	0.14
162	0.13
163	0.12
164	0.13
165	0.15
166	0.13
167	0.14
168	0.15
169	0.21
170	0.24
171	0.24
172	0.26
173	0.27
174	0.29
175	0.29
176	0.32
177	0.27
178	0.26
179	0.27
180	0.23
181	0.2
182	0.19
183	0.17
184	0.12
185	0.12
186	0.11
187	0.08
188	0.08
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.07
193	0.06
194	0.08
195	0.1
196	0.11
197	0.1
198	0.11
199	0.16
200	0.2
201	0.27
202	0.26
203	0.3
204	0.35
205	0.37
206	0.44
207	0.45
208	0.45
209	0.45
210	0.55
211	0.57
212	0.57
213	0.64
214	0.66
215	0.69
216	0.73
217	0.77
218	0.76
219	0.72
220	0.7
221	0.7
222	0.7
223	0.68
224	0.66
225	0.65
226	0.55
227	0.53
228	0.49
229	0.42
230	0.34
231	0.3
232	0.31
233	0.24
234	0.24
235	0.25
236	0.26
237	0.26
238	0.29
239	0.29
240	0.25
241	0.25
242	0.26
243	0.25
244	0.23
245	0.21
246	0.2
247	0.21
248	0.19
249	0.18
250	0.17
251	0.17
252	0.17
253	0.16
254	0.13
255	0.09
256	0.09
257	0.17
258	0.2
259	0.24
260	0.24
261	0.27
262	0.29
263	0.31
264	0.31
265	0.3
266	0.3
267	0.3
268	0.36
269	0.34
270	0.33
271	0.35
272	0.39
273	0.36
274	0.38
275	0.4
276	0.36
277	0.41
278	0.42
279	0.4
280	0.41
281	0.38
282	0.34
283	0.28
284	0.26
285	0.21
286	0.2
287	0.19
288	0.11
289	0.11
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.11
294	0.11
295	0.13
296	0.15
297	0.15
298	0.19
299	0.27
300	0.33
301	0.35
302	0.38
303	0.45
304	0.48
305	0.48
306	0.46
307	0.41
308	0.34
309	0.29
310	0.25
311	0.18
312	0.14
313	0.12
314	0.11
315	0.1
316	0.11
317	0.12
318	0.13
319	0.12
320	0.12
321	0.13
322	0.12
323	0.09
324	0.09
325	0.09
326	0.08
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.1
332	0.1
333	0.11
334	0.16
335	0.24
336	0.24
337	0.27
338	0.28
339	0.31
340	0.39
341	0.43
342	0.39
343	0.36
344	0.39
345	0.4
346	0.46
347	0.53
348	0.54
349	0.57
350	0.62
351	0.66
352	0.69
353	0.73
354	0.7
355	0.7
356	0.64
357	0.59
358	0.55
359	0.52
360	0.45
361	0.39
362	0.35
363	0.27
364	0.25
365	0.21
366	0.19
367	0.14
368	0.15
369	0.14
370	0.13
371	0.1
372	0.09
373	0.1
374	0.08
375	0.08
376	0.07
377	0.06
378	0.07
379	0.1
380	0.1
381	0.1
382	0.11
383	0.13
384	0.12
385	0.14
386	0.15
387	0.12
388	0.13
389	0.12
390	0.13
391	0.12
392	0.12
393	0.11
394	0.09
395	0.12
396	0.12
397	0.14
398	0.14
399	0.15
400	0.18
401	0.21
402	0.2
403	0.18
404	0.16
405	0.15
406	0.15
407	0.13
408	0.1
409	0.07
410	0.07
411	0.08
412	0.07
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.08
418	0.1
419	0.11
420	0.14
421	0.17
422	0.18
423	0.21
424	0.25
425	0.26
426	0.32
427	0.39
428	0.41
429	0.39
430	0.41
431	0.38
432	0.36
433	0.4
434	0.33
435	0.27
436	0.22
437	0.23
438	0.2
439	0.19
440	0.19
441	0.11
442	0.1
443	0.09
444	0.09
445	0.07
446	0.08
447	0.08
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.09
452	0.15
453	0.16
454	0.19
455	0.22
456	0.27
457	0.35
458	0.37
459	0.38
460	0.4
461	0.47
462	0.46
463	0.44
464	0.4
465	0.33
466	0.32
467	0.34
468	0.29
469	0.26
470	0.25
471	0.27
472	0.27
473	0.29
474	0.29
475	0.28
476	0.26
477	0.27
478	0.27
479	0.24
480	0.3
481	0.27
482	0.28
483	0.26
484	0.25
485	0.23
486	0.26
487	0.27
488	0.26
489	0.34
490	0.41
491	0.48
492	0.56
493	0.59
494	0.57
495	0.6
496	0.58
497	0.59
498	0.55
499	0.56
500	0.52
501	0.46
502	0.43
503	0.4
504	0.38
505	0.31
506	0.26
507	0.21
508	0.15
509	0.15
510	0.14
511	0.12
512	0.1
513	0.09
514	0.08
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.04
519	0.05
520	0.04
521	0.04
522	0.03
523	0.03
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.05
531	0.06
532	0.12
533	0.13
534	0.16
535	0.17
536	0.18
537	0.18
538	0.18
539	0.19
540	0.15
541	0.21
542	0.2
543	0.2
544	0.2
545	0.19
546	0.19
547	0.17
548	0.15
549	0.08
550	0.07
551	0.05
552	0.06
553	0.05
554	0.05
555	0.06
556	0.07
557	0.08
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.1
562	0.1
563	0.12
564	0.12
565	0.12
566	0.16
567	0.16
568	0.17
569	0.15
570	0.14
571	0.13
572	0.11
573	0.11
574	0.08
575	0.08
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.05
580	0.05
581	0.04
582	0.04
583	0.07
584	0.07
585	0.08
586	0.11
587	0.12
588	0.14
589	0.17
590	0.17
591	0.18
592	0.21
593	0.21
594	0.18
595	0.19
596	0.18
597	0.16
598	0.16
599	0.12
600	0.08
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.09
608	0.1
609	0.12
610	0.16
611	0.18
612	0.24
613	0.28
614	0.33
615	0.38
616	0.39
617	0.38
618	0.35
619	0.32
620	0.26
621	0.22
622	0.17
623	0.12
624	0.09
625	0.08
626	0.07
627	0.06
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.06
635	0.07
636	0.07
637	0.08
638	0.09
639	0.11
640	0.13
641	0.13
642	0.13
643	0.12
644	0.12
645	0.12
646	0.14
647	0.16
648	0.15
649	0.16
650	0.16
651	0.16
652	0.16
653	0.16
654	0.14
655	0.09
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.06
660	0.07
661	0.06
662	0.05
663	0.06
664	0.09
665	0.09
666	0.1
667	0.1
668	0.11
669	0.1
670	0.1
671	0.09
672	0.06
673	0.05
674	0.05
675	0.04
676	0.04
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.08
681	0.08
682	0.08
683	0.08
684	0.08
685	0.08
686	0.11
687	0.15
688	0.13
689	0.13
690	0.16
691	0.17
692	0.21
693	0.26
694	0.25
695	0.25
696	0.32
697	0.33
698	0.39
699	0.46
700	0.51
701	0.57
702	0.63
703	0.66
704	0.66
705	0.7
706	0.71
707	0.69
708	0.64
709	0.6
710	0.56
711	0.5
712	0.45
713	0.41
714	0.32
715	0.27
716	0.23
717	0.18
718	0.14
719	0.13
720	0.11
721	0.11
722	0.1
723	0.11
724	0.1
725	0.08
726	0.09
727	0.08
728	0.08
729	0.07
730	0.07
731	0.06
732	0.06
733	0.06
734	0.05
735	0.05
736	0.06
737	0.06
738	0.06
739	0.05
740	0.06
741	0.06
742	0.06
743	0.07
744	0.09
745	0.12
746	0.18
747	0.19
748	0.22
749	0.22
750	0.23
751	0.23
752	0.21
753	0.2
754	0.17
755	0.17
756	0.15
757	0.15
758	0.15
759	0.15
760	0.13
761	0.11
762	0.1
763	0.09
764	0.1
765	0.1
766	0.08
767	0.08
768	0.08
769	0.08
770	0.1
771	0.11
772	0.11
773	0.11
774	0.11
775	0.11
776	0.1
777	0.13
778	0.1
779	0.08
780	0.07
781	0.08
782	0.08
783	0.08
784	0.08
785	0.05
786	0.05
787	0.05
788	0.05
789	0.05
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.07
794	0.07
795	0.09
796	0.09
797	0.09
798	0.09
799	0.11
800	0.13
801	0.13
802	0.14
803	0.14
804	0.17
805	0.18
806	0.18
807	0.17
808	0.16
809	0.18
810	0.18
811	0.17
812	0.18
813	0.16
814	0.14
815	0.15
816	0.15
817	0.18
818	0.21
819	0.21
820	0.21
821	0.22
822	0.21
823	0.21
824	0.23
825	0.19
826	0.17
827	0.19
828	0.15
829	0.15
830	0.16
831	0.16
832	0.17
833	0.16
834	0.15
835	0.17
836	0.21
837	0.2
838	0.2
839	0.26
840	0.26
841	0.27
842	0.29
843	0.28
844	0.29
845	0.3
846	0.33
847	0.29
848	0.31
849	0.31
850	0.32
851	0.37
852	0.32
853	0.32
854	0.29
855	0.27
856	0.22
857	0.21
858	0.18
859	0.11
860	0.1
861	0.09
862	0.08
863	0.07
864	0.06
865	0.06
866	0.05
867	0.04
868	0.04
869	0.04
870	0.04
871	0.04
872	0.04
873	0.04
874	0.05
875	0.07
876	0.1
877	0.11
878	0.13
879	0.14
880	0.17
881	0.18
882	0.18
883	0.19
884	0.22
885	0.22
886	0.21
887	0.2
888	0.18
889	0.18
890	0.17
891	0.14
892	0.1
893	0.09
894	0.09
895	0.1
896	0.1
897	0.11
898	0.17
899	0.22
900	0.25
901	0.3
902	0.34
903	0.36
904	0.38
905	0.38
906	0.34
907	0.32
908	0.26
909	0.2
910	0.16
911	0.13
912	0.09
913	0.09
914	0.06
915	0.04
916	0.04
917	0.04
918	0.04
919	0.04
920	0.04
921	0.04
922	0.06
923	0.06
924	0.07
925	0.08
926	0.11
927	0.11
928	0.13
929	0.13
930	0.12
931	0.12
932	0.12
933	0.12
934	0.1
935	0.1
936	0.09
937	0.08
938	0.08
939	0.07
940	0.07
941	0.06
942	0.06
943	0.08
944	0.07
945	0.08
946	0.1
947	0.1
948	0.11
949	0.16
950	0.22
951	0.22
952	0.23
953	0.22
954	0.21
955	0.21
956	0.21
957	0.17
958	0.1
959	0.09
960	0.11
961	0.15
962	0.15
963	0.15
964	0.14
965	0.15
966	0.15
967	0.16
968	0.16
969	0.15
970	0.17
971	0.18
972	0.17
973	0.17
974	0.18
975	0.17
976	0.16
977	0.14
978	0.2
979	0.27
980	0.33
981	0.35
982	0.39
983	0.44
984	0.46
985	0.5
986	0.44
987	0.37
988	0.31
989	0.28
990	0.23
991	0.19
992	0.15
993	0.08
994	0.08
995	0.07
996	0.07
997	0.08
998	0.07
999	0.07
1000	0.07
1001	0.07
1002	0.07
1003	0.08
1004	0.08
1005	0.06
1006	0.05
1007	0.05
1008	0.05
1009	0.05
1010	0.05
1011	0.05
1012	0.05
1013	0.05
1014	0.05
1015	0.05
1016	0.05
1017	0.05
1018	0.06
1019	0.07
1020	0.07
1021	0.1
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.12
1025	0.12
1026	0.11
1027	0.11
1028	0.11
1029	0.12
1030	0.16
1031	0.25
1032	0.3
1033	0.37
1034	0.44
1035	0.47
1036	0.56
1037	0.6
1038	0.62
1039	0.59
1040	0.61
1041	0.58
1042	0.56
1043	0.62
1044	0.59
1045	0.57
1046	0.53
1047	0.57
1048	0.56
1049	0.59
1050	0.59
1051	0.56
1052	0.55
1053	0.55
1054	0.57
1055	0.58
1056	0.57
1057	0.52
1058	0.49
1059	0.45
1060	0.4
1061	0.36
1062	0.3
1063	0.23
1064	0.2
1065	0.23
1066	0.26
1067	0.28
1068	0.35
1069	0.41
1070	0.44
1071	0.44
1072	0.44
1073	0.44
1074	0.41
1075	0.4
1076	0.33
1077	0.24
1078	0.21
1079	0.21
1080	0.17
1081	0.14
1082	0.13
1083	0.11
1084	0.12
1085	0.12
1086	0.15
1087	0.19
1088	0.27
1089	0.27
1090	0.27
1091	0.3
1092	0.3
1093	0.37
1094	0.44
1095	0.45
1096	0.42
1097	0.51
1098	0.54
1099	0.55
1100	0.6
1101	0.59
1102	0.51
1103	0.49
1104	0.47
1105	0.4
1106	0.37
1107	0.3
1108	0.26
1109	0.27
1110	0.25
1111	0.21
1112	0.17
1113	0.15
1114	0.15
1115	0.17
1116	0.17
1117	0.11
1118	0.11
1119	0.13
1120	0.14
1121	0.13
1122	0.14
1123	0.13
1124	0.13
1125	0.13
1126	0.15
1127	0.14
1128	0.13
1129	0.13
1130	0.13
1131	0.11
1132	0.11
1133	0.12
1134	0.09
1135	0.08
1136	0.07
1137	0.07
1138	0.07
1139	0.08
1140	0.08
1141	0.06
1142	0.07
1143	0.07
1144	0.07
1145	0.08
1146	0.12
1147	0.15
1148	0.16
1149	0.19
1150	0.2
1151	0.23
1152	0.23
1153	0.22
1154	0.19
1155	0.17
1156	0.15
1157	0.12
1158	0.11
1159	0.1
1160	0.12
1161	0.13
1162	0.14
1163	0.15
1164	0.15
1165	0.16
1166	0.15
1167	0.14
1168	0.13
1169	0.15
1170	0.12
1171	0.12
1172	0.12
1173	0.12
1174	0.12
1175	0.12
1176	0.11
1177	0.08
1178	0.09
1179	0.08
1180	0.1
1181	0.12
1182	0.12
1183	0.13
1184	0.14
1185	0.14
1186	0.14
1187	0.2
1188	0.19
1189	0.21
1190	0.23
1191	0.24
1192	0.24
1193	0.24
1194	0.25
1195	0.21
1196	0.2
1197	0.17
1198	0.16
1199	0.16
1200	0.15
1201	0.14
1202	0.14
1203	0.13
1204	0.16
1205	0.17
1206	0.16
1207	0.16
1208	0.16
1209	0.16
1210	0.17
1211	0.19
1212	0.17
1213	0.15
1214	0.14
1215	0.13
1216	0.14
1217	0.13
1218	0.11
1219	0.09
1220	0.09
1221	0.08
1222	0.08
1223	0.08
1224	0.09
1225	0.09
1226	0.09
1227	0.08
1228	0.07
1229	0.07
1230	0.09
1231	0.09
1232	0.1
1233	0.1
1234	0.1
1235	0.1
1236	0.11
1237	0.13
1238	0.11
1239	0.11
1240	0.11
1241	0.12
1242	0.15
1243	0.15
1244	0.16
1245	0.19
1246	0.29
1247	0.33
1248	0.38
1249	0.46
1250	0.5
1251	0.6
1252	0.68
1253	0.72
1254	0.69
1255	0.68

A0A4Z0A9P5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer