Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZH77

Protein Details
Accession A0A4Y9ZH77    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-107GVAPRAKMNQQRSRRFRTAKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-114SRRFRTAKEAREVREK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR004859  Xrn1_N  
Gene Ontology GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03159  XRN_N  
Amino Acid Sequences MGIPKFFRYISERYPLTSQIIEENKIPEFDNLYLDFNGIIHSCSHPNDNDAHFRLSEEQIFTSIFAYVDHLFGKIKPKKLFFMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRTAKEAREVREKALRNGEKLPDEKKLQFDLNESARLFSAPVANTISAWPAHQVEIARKLKKTEKSLPPFGWDTEPVMGSEEVIEEAFIDVFCDLVYGGGWMDIEREEEVDRECNWALVEYKSLPLAKSTVTPGGSDPRTSSIVFLFEEFVPLEYRQQLSATLKSRPRMLSLFSPNKNKQWKQATTLNGHPYVVGHVPKSPSYREVEFERLLRGNAGSTKIISFDQTGGVKTATQVQVQPNAPSASTDKRNLAPRAPQPSTSLYLSPSREPPLQARSPSPSTPTGKKSRFRLPVPLSTTNSRTSGLSPSEYENVDFETRLASYSDEELNLGNGSARGLSKAEKRQSRDDAWVDILVANHSRRMGGQDAEMRRAGGRPLKGGISDPELASQEVAQALAAVRGHLPDDDDGEDDDIEPMNVPSGAASQISTTQENSTLEETHTETHTDADEEDDVMERTTSQRKRLGYFDLHPERRPPRSIEEDPRALLSRKSDGSMDLAYNHRAAPSDSMDGDFEPATPSPGLDIPDYRLSSGLRKEDMSSKKESMTLPGLMDTPSESGSPNVSPTTKAALSPPGPGRTAALIEMYREKERQATASRIPVAQKPLP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.44
3 0.42
4 0.36
5 0.31
6 0.31
7 0.34
8 0.33
9 0.32
10 0.32
11 0.29
12 0.29
13 0.29
14 0.23
15 0.22
16 0.22
17 0.24
18 0.23
19 0.25
20 0.23
21 0.22
22 0.2
23 0.16
24 0.17
25 0.13
26 0.12
27 0.1
28 0.13
29 0.16
30 0.18
31 0.23
32 0.22
33 0.24
34 0.29
35 0.32
36 0.38
37 0.38
38 0.39
39 0.34
40 0.35
41 0.37
42 0.34
43 0.34
44 0.27
45 0.25
46 0.23
47 0.23
48 0.22
49 0.18
50 0.16
51 0.11
52 0.09
53 0.12
54 0.11
55 0.12
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.15
60 0.26
61 0.29
62 0.37
63 0.42
64 0.46
65 0.5
66 0.54
67 0.59
68 0.49
69 0.51
70 0.45
71 0.39
72 0.36
73 0.31
74 0.28
75 0.21
76 0.2
77 0.12
78 0.14
79 0.19
80 0.26
81 0.36
82 0.45
83 0.54
84 0.65
85 0.74
86 0.79
87 0.83
88 0.82
89 0.78
90 0.79
91 0.79
92 0.77
93 0.79
94 0.76
95 0.71
96 0.74
97 0.7
98 0.64
99 0.62
100 0.56
101 0.52
102 0.56
103 0.55
104 0.48
105 0.52
106 0.53
107 0.5
108 0.51
109 0.48
110 0.44
111 0.46
112 0.46
113 0.44
114 0.43
115 0.41
116 0.38
117 0.38
118 0.38
119 0.36
120 0.38
121 0.34
122 0.3
123 0.27
124 0.26
125 0.22
126 0.17
127 0.18
128 0.13
129 0.15
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.17
134 0.17
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.15
142 0.18
143 0.28
144 0.34
145 0.36
146 0.36
147 0.41
148 0.46
149 0.52
150 0.56
151 0.56
152 0.6
153 0.64
154 0.71
155 0.67
156 0.65
157 0.6
158 0.53
159 0.46
160 0.36
161 0.31
162 0.24
163 0.23
164 0.18
165 0.18
166 0.16
167 0.13
168 0.12
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.14
201 0.14
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.12
207 0.14
208 0.11
209 0.12
210 0.14
211 0.15
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.11
216 0.13
217 0.14
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.23
223 0.23
224 0.21
225 0.2
226 0.19
227 0.21
228 0.2
229 0.2
230 0.14
231 0.15
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.14
247 0.15
248 0.21
249 0.22
250 0.27
251 0.3
252 0.31
253 0.36
254 0.33
255 0.34
256 0.29
257 0.3
258 0.31
259 0.37
260 0.44
261 0.44
262 0.52
263 0.51
264 0.57
265 0.63
266 0.57
267 0.56
268 0.57
269 0.56
270 0.53
271 0.57
272 0.55
273 0.51
274 0.55
275 0.5
276 0.41
277 0.38
278 0.31
279 0.25
280 0.22
281 0.2
282 0.15
283 0.11
284 0.13
285 0.15
286 0.17
287 0.19
288 0.18
289 0.19
290 0.21
291 0.22
292 0.23
293 0.25
294 0.27
295 0.26
296 0.26
297 0.25
298 0.22
299 0.21
300 0.19
301 0.15
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.14
321 0.13
322 0.13
323 0.15
324 0.16
325 0.22
326 0.23
327 0.23
328 0.2
329 0.19
330 0.18
331 0.16
332 0.17
333 0.16
334 0.19
335 0.2
336 0.2
337 0.23
338 0.3
339 0.31
340 0.31
341 0.33
342 0.35
343 0.41
344 0.4
345 0.38
346 0.34
347 0.35
348 0.35
349 0.3
350 0.25
351 0.18
352 0.22
353 0.22
354 0.21
355 0.2
356 0.21
357 0.21
358 0.22
359 0.23
360 0.25
361 0.27
362 0.27
363 0.27
364 0.29
365 0.31
366 0.31
367 0.31
368 0.3
369 0.3
370 0.34
371 0.38
372 0.42
373 0.45
374 0.5
375 0.52
376 0.56
377 0.59
378 0.56
379 0.6
380 0.56
381 0.57
382 0.58
383 0.58
384 0.52
385 0.47
386 0.48
387 0.4
388 0.36
389 0.29
390 0.23
391 0.19
392 0.19
393 0.18
394 0.17
395 0.16
396 0.17
397 0.18
398 0.18
399 0.17
400 0.13
401 0.14
402 0.13
403 0.12
404 0.1
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.07
410 0.07
411 0.09
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.07
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.07
426 0.1
427 0.16
428 0.24
429 0.32
430 0.37
431 0.41
432 0.48
433 0.53
434 0.53
435 0.53
436 0.48
437 0.42
438 0.38
439 0.34
440 0.27
441 0.22
442 0.18
443 0.13
444 0.13
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.1
450 0.13
451 0.15
452 0.13
453 0.16
454 0.22
455 0.24
456 0.27
457 0.27
458 0.24
459 0.21
460 0.21
461 0.21
462 0.19
463 0.19
464 0.18
465 0.2
466 0.2
467 0.2
468 0.21
469 0.19
470 0.18
471 0.18
472 0.16
473 0.16
474 0.17
475 0.16
476 0.15
477 0.13
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.06
482 0.05
483 0.05
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.08
490 0.07
491 0.08
492 0.07
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.1
500 0.1
501 0.08
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.07
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.1
515 0.13
516 0.13
517 0.14
518 0.14
519 0.17
520 0.17
521 0.19
522 0.17
523 0.16
524 0.16
525 0.16
526 0.17
527 0.16
528 0.16
529 0.15
530 0.13
531 0.13
532 0.14
533 0.12
534 0.11
535 0.11
536 0.11
537 0.1
538 0.1
539 0.1
540 0.09
541 0.09
542 0.09
543 0.07
544 0.1
545 0.19
546 0.23
547 0.28
548 0.33
549 0.36
550 0.4
551 0.43
552 0.47
553 0.44
554 0.45
555 0.5
556 0.55
557 0.55
558 0.53
559 0.58
560 0.57
561 0.56
562 0.56
563 0.49
564 0.47
565 0.52
566 0.59
567 0.6
568 0.62
569 0.6
570 0.56
571 0.55
572 0.51
573 0.43
574 0.37
575 0.31
576 0.29
577 0.26
578 0.27
579 0.25
580 0.23
581 0.25
582 0.25
583 0.22
584 0.2
585 0.21
586 0.21
587 0.21
588 0.2
589 0.17
590 0.16
591 0.16
592 0.17
593 0.18
594 0.2
595 0.19
596 0.2
597 0.21
598 0.2
599 0.2
600 0.16
601 0.13
602 0.12
603 0.12
604 0.13
605 0.12
606 0.12
607 0.12
608 0.14
609 0.16
610 0.15
611 0.17
612 0.19
613 0.26
614 0.27
615 0.25
616 0.25
617 0.24
618 0.29
619 0.33
620 0.34
621 0.3
622 0.3
623 0.33
624 0.4
625 0.46
626 0.44
627 0.44
628 0.42
629 0.41
630 0.44
631 0.42
632 0.39
633 0.36
634 0.34
635 0.29
636 0.27
637 0.26
638 0.22
639 0.22
640 0.17
641 0.14
642 0.12
643 0.12
644 0.11
645 0.12
646 0.14
647 0.15
648 0.16
649 0.18
650 0.18
651 0.19
652 0.21
653 0.26
654 0.24
655 0.24
656 0.25
657 0.3
658 0.3
659 0.37
660 0.41
661 0.38
662 0.38
663 0.37
664 0.37
665 0.31
666 0.31
667 0.24
668 0.22
669 0.19
670 0.21
671 0.27
672 0.29
673 0.3
674 0.3
675 0.3
676 0.31
677 0.33
678 0.37
679 0.37
680 0.41
681 0.43
682 0.5
683 0.52
684 0.5
685 0.51
686 0.49