Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZWD8

Protein Details
Accession A0A4Y9ZWD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
509-528LASRGNRPKMWSPARPKSLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
487-496RRRNTHGRAR
511-518SRGNRPKM
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 3.5, cyto_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011603  2oxoglutarate_DH_E1  
IPR031717  KGD_C  
IPR042179  KGD_C_sf  
IPR029061  THDP-binding  
IPR005475  Transketolase-like_Pyr-bd  
Gene Ontology GO:0004591  F:oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) activity  
GO:0030976  F:thiamine pyrophosphate binding  
GO:0006099  P:tricarboxylic acid cycle  
Pfam View protein in Pfam  
PF16870  OxoGdeHyase_C  
PF02779  Transket_pyr  
Amino Acid Sequences EIHSRLQRHVKHRLQGVKAGKGLDWATAEAMAFGSLMLEGCDVRISGQDVGRGTFSQRHAMLVDQKSEAVVVPLNAELQSKGRLELANSSLSEMAVMGFEFGVSWERPNMLPIWEAQFGDFFNGAQVIIDTFISSAETKWLKQSGIVLLLPHGLDGAGPEHSSSRMERMLQLSDDPYVPNESGALANVNMHVVFPTTPAQYFHLLRRQIKRNFRKPLIVAAPKGLLRLPAASSPIAGFEPSLKFKPVLDDPAGNQQTAERVVLVSGKVYYDLAKERQARGLEKRVALVRVEELSPFPFGELERVLEAYANGTEIRWVQEEPRNQGAYGHVAPRLGWVLRKLGRDASAVKYVGRCEAPMPAPGVGKAHRACPARSIDPSAVAPLDMTTKTQTSHSSFFPRIGFRSASKGAPAPPPPQQPPDDDDDWFTPYNGPYEVPTDMQHPHPGDRDSWGAGLHSAMQNEDVLPGPEYEQRDGGQGQGEGRGGSIRRRNTHGRARAASTVPPAPLSRLASRGNRPKMWSPARPKSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.72
3 0.72
4 0.68
5 0.63
6 0.56
7 0.48
8 0.43
9 0.39
10 0.33
11 0.27
12 0.2
13 0.18
14 0.17
15 0.17
16 0.12
17 0.12
18 0.09
19 0.07
20 0.06
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.06
28 0.07
29 0.06
30 0.07
31 0.09
32 0.11
33 0.15
34 0.16
35 0.2
36 0.2
37 0.21
38 0.23
39 0.21
40 0.22
41 0.24
42 0.25
43 0.29
44 0.28
45 0.29
46 0.28
47 0.31
48 0.37
49 0.35
50 0.35
51 0.29
52 0.29
53 0.27
54 0.26
55 0.22
56 0.15
57 0.12
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.17
70 0.18
71 0.19
72 0.24
73 0.24
74 0.24
75 0.23
76 0.24
77 0.21
78 0.2
79 0.18
80 0.13
81 0.1
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.05
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.12
94 0.12
95 0.14
96 0.15
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.17
104 0.17
105 0.15
106 0.17
107 0.15
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.05
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.06
123 0.12
124 0.13
125 0.14
126 0.18
127 0.2
128 0.19
129 0.2
130 0.23
131 0.19
132 0.22
133 0.22
134 0.18
135 0.16
136 0.17
137 0.16
138 0.13
139 0.1
140 0.06
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.08
149 0.1
150 0.1
151 0.12
152 0.14
153 0.15
154 0.17
155 0.19
156 0.21
157 0.2
158 0.2
159 0.18
160 0.17
161 0.16
162 0.14
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.07
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.12
186 0.14
187 0.17
188 0.19
189 0.22
190 0.26
191 0.31
192 0.36
193 0.43
194 0.51
195 0.55
196 0.64
197 0.7
198 0.73
199 0.77
200 0.74
201 0.72
202 0.64
203 0.64
204 0.62
205 0.56
206 0.47
207 0.39
208 0.37
209 0.31
210 0.3
211 0.22
212 0.15
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.09
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.1
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.17
233 0.17
234 0.19
235 0.18
236 0.18
237 0.18
238 0.28
239 0.28
240 0.24
241 0.22
242 0.18
243 0.18
244 0.17
245 0.16
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.07
258 0.09
259 0.11
260 0.17
261 0.2
262 0.21
263 0.25
264 0.27
265 0.29
266 0.31
267 0.37
268 0.35
269 0.32
270 0.34
271 0.31
272 0.3
273 0.27
274 0.22
275 0.16
276 0.13
277 0.13
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.12
305 0.17
306 0.22
307 0.26
308 0.31
309 0.3
310 0.29
311 0.29
312 0.27
313 0.26
314 0.24
315 0.21
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.17
325 0.22
326 0.24
327 0.24
328 0.24
329 0.26
330 0.27
331 0.28
332 0.25
333 0.26
334 0.24
335 0.24
336 0.23
337 0.22
338 0.23
339 0.2
340 0.17
341 0.12
342 0.17
343 0.17
344 0.18
345 0.19
346 0.17
347 0.17
348 0.17
349 0.19
350 0.15
351 0.21
352 0.2
353 0.21
354 0.26
355 0.28
356 0.28
357 0.31
358 0.36
359 0.33
360 0.34
361 0.36
362 0.3
363 0.3
364 0.3
365 0.26
366 0.2
367 0.16
368 0.14
369 0.1
370 0.11
371 0.09
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.14
377 0.18
378 0.2
379 0.23
380 0.26
381 0.31
382 0.31
383 0.33
384 0.35
385 0.34
386 0.31
387 0.32
388 0.31
389 0.26
390 0.32
391 0.31
392 0.29
393 0.28
394 0.28
395 0.28
396 0.32
397 0.35
398 0.32
399 0.36
400 0.43
401 0.45
402 0.47
403 0.46
404 0.43
405 0.42
406 0.45
407 0.4
408 0.34
409 0.33
410 0.29
411 0.31
412 0.27
413 0.24
414 0.2
415 0.18
416 0.19
417 0.16
418 0.15
419 0.13
420 0.16
421 0.17
422 0.16
423 0.16
424 0.17
425 0.19
426 0.21
427 0.26
428 0.25
429 0.27
430 0.3
431 0.31
432 0.29
433 0.3
434 0.31
435 0.26
436 0.24
437 0.21
438 0.17
439 0.16
440 0.15
441 0.15
442 0.14
443 0.13
444 0.13
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.13
449 0.11
450 0.1
451 0.11
452 0.11
453 0.12
454 0.17
455 0.19
456 0.2
457 0.21
458 0.2
459 0.23
460 0.23
461 0.22
462 0.2
463 0.19
464 0.18
465 0.19
466 0.19
467 0.15
468 0.15
469 0.18
470 0.16
471 0.23
472 0.3
473 0.35
474 0.4
475 0.47
476 0.55
477 0.6
478 0.7
479 0.7
480 0.72
481 0.69
482 0.69
483 0.69
484 0.63
485 0.57
486 0.52
487 0.46
488 0.38
489 0.36
490 0.32
491 0.28
492 0.31
493 0.33
494 0.31
495 0.33
496 0.38
497 0.44
498 0.53
499 0.6
500 0.63
501 0.63
502 0.66
503 0.69
504 0.73
505 0.74
506 0.74
507 0.74
508 0.76