Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R3R6

Protein Details
Accession C4R3R6    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MSDTIRRKRLRNQKPANGSTAAHydrophilic
122-150ASPRDGRHVQKIKKSPRKQRAKAFPPAQFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-144SPKSTNRTIQPPRTPSKKSAASPRDGRHVQKIKKSPRKQRAKA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ppa:PAS_chr3_0174  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15535  PHD1_Rco1  
cd15534  PHD2_PHF12_Rco1  
Amino Acid Sequences MSDTIRRKRLRNQKPANGSTAATTEMSHGRPAGPGSLKLFATTQQEESQQLATEADYKLKLVTNESESLTKPSLERTRNLRPTPKSGAPNYQIKLKLTGPRSPKSTNRTIQPPRTPSKKSAASPRDGRHVQKIKKSPRKQRAKAFPPAQFGAILPSASASPSSSSSLSALNSTNPLSGNTDSEPNLNSISVAAPNGSSTSPEPDNDDFCSGCGGPGTFICCEGCPRSFHFICCDPPLHEEDLSDDAWFCTECKAQRHPPPKHRGGFFAALLDQAVVRNPRSFLLPKKIRETFVDVATTRLGSYSDGSSKVDQFSRASDKGNNASSQASQDVKFCYRCKESDLRKPIIACEYCPLVWHLDCLDPPLAAPKLLGVRWKCPNHTDDLYNHRRRLKNQPQIEVAMVRGFKNNGDVEIINDQNENDQDFVQLPTPPYFDNISTTEGIASLQKPAFKIVQIDNITYRIPENGVILDFIETAKIKKLNEIEQLKKENESILTRVDKSKREVLGGLIALKQSPIEQKLSNSANLSNEVDFRQLVEIAEAQLGCDQHITVPPLETETRDLVYIKQLIQLKGRDAMIKFLES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.86
3 0.81
4 0.73
5 0.62
6 0.53
7 0.44
8 0.35
9 0.25
10 0.21
11 0.19
12 0.21
13 0.21
14 0.2
15 0.2
16 0.18
17 0.2
18 0.21
19 0.25
20 0.23
21 0.25
22 0.27
23 0.31
24 0.3
25 0.29
26 0.29
27 0.26
28 0.29
29 0.29
30 0.29
31 0.27
32 0.3
33 0.3
34 0.31
35 0.29
36 0.22
37 0.2
38 0.17
39 0.15
40 0.16
41 0.16
42 0.17
43 0.16
44 0.16
45 0.17
46 0.19
47 0.2
48 0.2
49 0.24
50 0.25
51 0.28
52 0.29
53 0.3
54 0.29
55 0.32
56 0.3
57 0.26
58 0.22
59 0.28
60 0.34
61 0.36
62 0.41
63 0.44
64 0.54
65 0.62
66 0.68
67 0.69
68 0.66
69 0.7
70 0.72
71 0.72
72 0.68
73 0.64
74 0.66
75 0.62
76 0.65
77 0.59
78 0.58
79 0.54
80 0.48
81 0.48
82 0.43
83 0.45
84 0.41
85 0.46
86 0.46
87 0.48
88 0.52
89 0.54
90 0.57
91 0.57
92 0.62
93 0.61
94 0.61
95 0.66
96 0.7
97 0.73
98 0.75
99 0.75
100 0.74
101 0.76
102 0.73
103 0.68
104 0.68
105 0.66
106 0.62
107 0.65
108 0.64
109 0.64
110 0.68
111 0.66
112 0.66
113 0.62
114 0.61
115 0.6
116 0.63
117 0.62
118 0.62
119 0.69
120 0.71
121 0.77
122 0.84
123 0.84
124 0.85
125 0.9
126 0.89
127 0.9
128 0.9
129 0.87
130 0.87
131 0.84
132 0.79
133 0.74
134 0.67
135 0.57
136 0.46
137 0.38
138 0.31
139 0.24
140 0.17
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.06
147 0.07
148 0.09
149 0.11
150 0.11
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.13
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.16
166 0.15
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.17
171 0.15
172 0.14
173 0.12
174 0.11
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.12
187 0.13
188 0.13
189 0.18
190 0.18
191 0.2
192 0.2
193 0.21
194 0.17
195 0.16
196 0.17
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.1
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.13
210 0.15
211 0.14
212 0.18
213 0.25
214 0.26
215 0.26
216 0.28
217 0.29
218 0.3
219 0.31
220 0.29
221 0.22
222 0.23
223 0.26
224 0.23
225 0.2
226 0.17
227 0.16
228 0.17
229 0.16
230 0.14
231 0.11
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.07
236 0.06
237 0.09
238 0.12
239 0.17
240 0.23
241 0.31
242 0.4
243 0.5
244 0.57
245 0.64
246 0.71
247 0.75
248 0.74
249 0.68
250 0.62
251 0.57
252 0.5
253 0.4
254 0.32
255 0.23
256 0.18
257 0.16
258 0.12
259 0.08
260 0.05
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.13
268 0.15
269 0.18
270 0.28
271 0.34
272 0.36
273 0.42
274 0.44
275 0.42
276 0.42
277 0.44
278 0.36
279 0.31
280 0.3
281 0.24
282 0.23
283 0.21
284 0.19
285 0.11
286 0.09
287 0.08
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.12
295 0.13
296 0.14
297 0.14
298 0.14
299 0.13
300 0.15
301 0.2
302 0.2
303 0.21
304 0.21
305 0.23
306 0.26
307 0.28
308 0.25
309 0.2
310 0.2
311 0.18
312 0.17
313 0.17
314 0.14
315 0.13
316 0.14
317 0.16
318 0.18
319 0.21
320 0.21
321 0.24
322 0.26
323 0.26
324 0.3
325 0.37
326 0.41
327 0.48
328 0.54
329 0.52
330 0.5
331 0.5
332 0.46
333 0.44
334 0.37
335 0.28
336 0.23
337 0.21
338 0.19
339 0.2
340 0.19
341 0.14
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.13
349 0.1
350 0.1
351 0.14
352 0.13
353 0.11
354 0.11
355 0.1
356 0.13
357 0.14
358 0.2
359 0.17
360 0.23
361 0.32
362 0.35
363 0.35
364 0.37
365 0.38
366 0.39
367 0.4
368 0.37
369 0.33
370 0.4
371 0.48
372 0.51
373 0.54
374 0.55
375 0.56
376 0.57
377 0.64
378 0.65
379 0.65
380 0.65
381 0.66
382 0.62
383 0.6
384 0.56
385 0.45
386 0.35
387 0.29
388 0.23
389 0.17
390 0.16
391 0.15
392 0.13
393 0.17
394 0.16
395 0.14
396 0.16
397 0.15
398 0.16
399 0.2
400 0.2
401 0.16
402 0.16
403 0.15
404 0.14
405 0.15
406 0.13
407 0.1
408 0.09
409 0.1
410 0.1
411 0.12
412 0.11
413 0.12
414 0.13
415 0.14
416 0.15
417 0.15
418 0.16
419 0.17
420 0.16
421 0.18
422 0.18
423 0.2
424 0.19
425 0.19
426 0.17
427 0.15
428 0.14
429 0.13
430 0.12
431 0.13
432 0.14
433 0.15
434 0.15
435 0.18
436 0.19
437 0.18
438 0.22
439 0.2
440 0.28
441 0.28
442 0.3
443 0.29
444 0.29
445 0.28
446 0.24
447 0.22
448 0.14
449 0.13
450 0.12
451 0.12
452 0.11
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.14
463 0.17
464 0.16
465 0.22
466 0.27
467 0.31
468 0.41
469 0.48
470 0.5
471 0.55
472 0.6
473 0.56
474 0.53
475 0.47
476 0.41
477 0.37
478 0.33
479 0.27
480 0.27
481 0.3
482 0.31
483 0.38
484 0.41
485 0.42
486 0.44
487 0.5
488 0.46
489 0.44
490 0.42
491 0.37
492 0.37
493 0.33
494 0.29
495 0.23
496 0.21
497 0.19
498 0.17
499 0.15
500 0.13
501 0.17
502 0.18
503 0.21
504 0.23
505 0.25
506 0.33
507 0.36
508 0.36
509 0.33
510 0.32
511 0.31
512 0.32
513 0.32
514 0.25
515 0.24
516 0.23
517 0.22
518 0.19
519 0.18
520 0.16
521 0.15
522 0.14
523 0.14
524 0.14
525 0.13
526 0.15
527 0.14
528 0.13
529 0.14
530 0.14
531 0.12
532 0.12
533 0.11
534 0.11
535 0.16
536 0.18
537 0.17
538 0.19
539 0.19
540 0.22
541 0.23
542 0.23
543 0.23
544 0.22
545 0.22
546 0.22
547 0.22
548 0.2
549 0.25
550 0.27
551 0.24
552 0.27
553 0.32
554 0.34
555 0.39
556 0.41
557 0.38
558 0.4
559 0.41
560 0.4
561 0.35
562 0.39