Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZTX4

Protein Details
Accession A0A4Y9ZTX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSVRQPKPTRKGPNSNDSAPSHydrophilic
465-484GAAHPRPPRPRTTSRSRRRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
468-486AAHPRPPRPRTTSRSRRRR
Subcellular Location(s) mito_nucl 10.166, nucl 10, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MSVRQPKPTRKGPNSNDSAPSRRAPAWTGARASPTFSPAPSNARLPNAPAAANPTPNAPPAFPPLPAAAPRSDADKVLQALTGLTGTTITLNTKTSQRYEGVIASTTGEGDTIGVSLRDVKEISLPGAPLKDQIFIASTNIDTWTSGPADAKAPNGDSFKTDTDISHKPHRTGSERELQAWADSPLPPGIGMSPPLLPVPAHHTDDXTFGXGASQNSQWDQFAANERLFGVKTAFDEDLYTTKLDRNAKDYKERERRAQVLAAEIMGTTANNSHIAEERVMNNLEGTGDGENEEDKYGAVVRGQNAYVPPGARKGTGKAPDIPKVAVNAPDGTAVDAAAGNGNGNSGGSKAPSPAPGGASKPPADALPAFREFVTNEKQRLAQKRSVLMKNDRDKRMAELVKFSQSFKVHHLVIRTVTLLTPRQLNKPIPDDLVTILAKDEDKQKQIREKSSADAASAQARAIAAAGAAHPRPPRPRTTSRSRRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.81
3 0.78
4 0.73
5 0.69
6 0.63
7 0.57
8 0.51
9 0.46
10 0.44
11 0.39
12 0.42
13 0.44
14 0.45
15 0.47
16 0.44
17 0.47
18 0.45
19 0.45
20 0.37
21 0.34
22 0.3
23 0.26
24 0.29
25 0.26
26 0.32
27 0.32
28 0.36
29 0.34
30 0.37
31 0.38
32 0.37
33 0.4
34 0.36
35 0.33
36 0.28
37 0.32
38 0.3
39 0.31
40 0.28
41 0.25
42 0.24
43 0.27
44 0.28
45 0.22
46 0.21
47 0.26
48 0.28
49 0.25
50 0.26
51 0.25
52 0.27
53 0.28
54 0.28
55 0.22
56 0.23
57 0.23
58 0.26
59 0.24
60 0.22
61 0.21
62 0.23
63 0.23
64 0.21
65 0.2
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.08
77 0.09
78 0.11
79 0.13
80 0.18
81 0.21
82 0.23
83 0.26
84 0.26
85 0.27
86 0.28
87 0.28
88 0.25
89 0.22
90 0.2
91 0.18
92 0.16
93 0.14
94 0.11
95 0.09
96 0.07
97 0.06
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.09
104 0.09
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.14
109 0.15
110 0.16
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.13
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.08
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.13
140 0.14
141 0.17
142 0.18
143 0.17
144 0.17
145 0.19
146 0.19
147 0.19
148 0.18
149 0.16
150 0.19
151 0.25
152 0.27
153 0.34
154 0.35
155 0.35
156 0.38
157 0.43
158 0.43
159 0.43
160 0.44
161 0.44
162 0.42
163 0.42
164 0.4
165 0.35
166 0.3
167 0.25
168 0.21
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.13
187 0.16
188 0.18
189 0.18
190 0.18
191 0.18
192 0.19
193 0.2
194 0.13
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.14
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.1
226 0.08
227 0.1
228 0.14
229 0.18
230 0.18
231 0.22
232 0.28
233 0.3
234 0.39
235 0.41
236 0.47
237 0.53
238 0.56
239 0.56
240 0.56
241 0.56
242 0.49
243 0.49
244 0.39
245 0.31
246 0.28
247 0.21
248 0.15
249 0.12
250 0.1
251 0.06
252 0.06
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.07
271 0.08
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.14
292 0.14
293 0.12
294 0.12
295 0.14
296 0.15
297 0.15
298 0.16
299 0.18
300 0.24
301 0.29
302 0.31
303 0.34
304 0.37
305 0.42
306 0.42
307 0.4
308 0.33
309 0.3
310 0.29
311 0.25
312 0.22
313 0.17
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.13
318 0.11
319 0.08
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.09
336 0.1
337 0.12
338 0.15
339 0.15
340 0.17
341 0.18
342 0.21
343 0.23
344 0.25
345 0.24
346 0.23
347 0.22
348 0.19
349 0.2
350 0.18
351 0.18
352 0.2
353 0.21
354 0.21
355 0.21
356 0.22
357 0.2
358 0.23
359 0.28
360 0.27
361 0.27
362 0.29
363 0.33
364 0.4
365 0.49
366 0.5
367 0.48
368 0.48
369 0.54
370 0.61
371 0.63
372 0.63
373 0.62
374 0.66
375 0.7
376 0.74
377 0.7
378 0.64
379 0.59
380 0.56
381 0.57
382 0.53
383 0.45
384 0.43
385 0.42
386 0.47
387 0.47
388 0.43
389 0.4
390 0.37
391 0.37
392 0.35
393 0.37
394 0.32
395 0.33
396 0.35
397 0.31
398 0.31
399 0.3
400 0.26
401 0.21
402 0.2
403 0.22
404 0.21
405 0.2
406 0.26
407 0.27
408 0.32
409 0.39
410 0.43
411 0.45
412 0.47
413 0.48
414 0.44
415 0.43
416 0.38
417 0.32
418 0.33
419 0.27
420 0.22
421 0.19
422 0.17
423 0.16
424 0.17
425 0.24
426 0.24
427 0.31
428 0.36
429 0.43
430 0.52
431 0.59
432 0.65
433 0.64
434 0.61
435 0.59
436 0.62
437 0.56
438 0.47
439 0.41
440 0.35
441 0.32
442 0.3
443 0.24
444 0.17
445 0.16
446 0.14
447 0.12
448 0.1
449 0.06
450 0.06
451 0.08
452 0.11
453 0.12
454 0.17
455 0.2
456 0.27
457 0.35
458 0.4
459 0.48
460 0.52
461 0.62
462 0.66
463 0.74
464 0.78