FuNGI

A0A4Y9ZXS5

Protein Details

Accession

A0A4Y9ZXS5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-43	RSLPHFPKKSRSPPSKGFVRNS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cysk 11, cyto 8, cyto_nucl 6.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR035698 RNAP_III_Rpc1_C IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02736 RNAP_III_Rpc1_C

Amino Acid Sequences

MVACVGQQIIAGHRVPDGFQDRSLPHFPKKSRSPPSKGFVRNSFYSGLSPTEFLFHAISGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKALEDLTTQYDLSVRTGTGGLVQFRYGDDGLDPACLEGDAQPLEFVRAWRHAASIADRTSRGLLPYEILEITARELSLKKFASECTPAYISIVRTFIKEHVAEHLAKMRKSRGMFEALEREEEWDADTDLSMGASDADKAIVDNKAKVTKDQLLSFLSICWIKYVKAKIEPGSTVGAVGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINAAKAISTPIISCRLVTADSEPSARIVKGRLEKTHLGDIASVLEEAWAPEYTYIGIIVDMEGIQRLQLEMTIDDIKWAIVNTRKLKVKQESITIIPRKNRLRIYIDGQDNYYRLRELKRLLPEVVVKGVPTIARAVINVKDKDDDRGKKGDKELLVEGYGLQKCMTTEGIVGEHTTSNHVIEVAQVLGIEAARKTIIDEIQFTMGSHGMSIDPRHVMLLGDTMSYKGEVLGITRFGVAKMKDSVLMLASFEKTTDHLFDAAAYGKTDSIAGVSESIIMGNPAANCGTSM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.17
3	0.23
4	0.26
5	0.24
6	0.25
7	0.3
8	0.3
9	0.36
10	0.43
11	0.41
12	0.43
13	0.5
14	0.54
15	0.58
16	0.67
17	0.71
18	0.74
19	0.79
20	0.8
21	0.8
22	0.84
23	0.84
24	0.82
25	0.79
26	0.77
27	0.73
28	0.67
29	0.61
30	0.56
31	0.47
32	0.4
33	0.34
34	0.29
35	0.23
36	0.21
37	0.18
38	0.18
39	0.17
40	0.17
41	0.16
42	0.13
43	0.14
44	0.14
45	0.14
46	0.13
47	0.12
48	0.11
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.1
53	0.1
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.1
60	0.11
61	0.15
62	0.19
63	0.26
64	0.28
65	0.32
66	0.33
67	0.33
68	0.33
69	0.31
70	0.3
71	0.26
72	0.26
73	0.23
74	0.24
75	0.24
76	0.23
77	0.21
78	0.17
79	0.15
80	0.14
81	0.14
82	0.14
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.11
87	0.14
88	0.16
89	0.16
90	0.16
91	0.16
92	0.15
93	0.15
94	0.19
95	0.14
96	0.12
97	0.1
98	0.11
99	0.11
100	0.11
101	0.11
102	0.07
103	0.07
104	0.07
105	0.07
106	0.06
107	0.09
108	0.09
109	0.09
110	0.09
111	0.09
112	0.12
113	0.13
114	0.13
115	0.13
116	0.16
117	0.19
118	0.19
119	0.2
120	0.19
121	0.21
122	0.24
123	0.26
124	0.25
125	0.26
126	0.25
127	0.26
128	0.27
129	0.25
130	0.22
131	0.18
132	0.16
133	0.14
134	0.15
135	0.15
136	0.12
137	0.12
138	0.11
139	0.09
140	0.1
141	0.1
142	0.09
143	0.08
144	0.1
145	0.11
146	0.17
147	0.18
148	0.17
149	0.18
150	0.19
151	0.23
152	0.26
153	0.26
154	0.24
155	0.24
156	0.23
157	0.24
158	0.25
159	0.21
160	0.19
161	0.21
162	0.16
163	0.16
164	0.18
165	0.17
166	0.2
167	0.19
168	0.17
169	0.19
170	0.21
171	0.21
172	0.21
173	0.27
174	0.26
175	0.27
176	0.29
177	0.28
178	0.31
179	0.31
180	0.34
181	0.3
182	0.31
183	0.31
184	0.32
185	0.36
186	0.32
187	0.32
188	0.29
189	0.27
190	0.21
191	0.2
192	0.17
193	0.1
194	0.1
195	0.08
196	0.08
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.05
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.06
210	0.09
211	0.1
212	0.12
213	0.14
214	0.2
215	0.2
216	0.21
217	0.24
218	0.27
219	0.29
220	0.29
221	0.28
222	0.25
223	0.25
224	0.24
225	0.2
226	0.15
227	0.13
228	0.11
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.14
233	0.18
234	0.2
235	0.25
236	0.28
237	0.29
238	0.31
239	0.3
240	0.27
241	0.25
242	0.21
243	0.16
244	0.12
245	0.1
246	0.07
247	0.07
248	0.05
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.04
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.08
261	0.08
262	0.1
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.07
281	0.07
282	0.08
283	0.1
284	0.14
285	0.15
286	0.15
287	0.15
288	0.14
289	0.14
290	0.14
291	0.12
292	0.07
293	0.06
294	0.07
295	0.11
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.11
300	0.11
301	0.11
302	0.12
303	0.1
304	0.11
305	0.12
306	0.11
307	0.12
308	0.12
309	0.12
310	0.1
311	0.1
312	0.14
313	0.21
314	0.24
315	0.25
316	0.3
317	0.33
318	0.35
319	0.38
320	0.33
321	0.26
322	0.23
323	0.21
324	0.16
325	0.14
326	0.1
327	0.06
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.03
345	0.03
346	0.04
347	0.03
348	0.03
349	0.04
350	0.04
351	0.03
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.13
365	0.21
366	0.24
367	0.31
368	0.37
369	0.39
370	0.47
371	0.51
372	0.54
373	0.49
374	0.51
375	0.48
376	0.46
377	0.53
378	0.5
379	0.48
380	0.44
381	0.48
382	0.48
383	0.5
384	0.5
385	0.47
386	0.47
387	0.47
388	0.49
389	0.5
390	0.5
391	0.44
392	0.42
393	0.38
394	0.33
395	0.3
396	0.25
397	0.17
398	0.15
399	0.17
400	0.21
401	0.23
402	0.29
403	0.34
404	0.37
405	0.37
406	0.38
407	0.37
408	0.34
409	0.33
410	0.26
411	0.19
412	0.16
413	0.16
414	0.14
415	0.11
416	0.11
417	0.09
418	0.09
419	0.1
420	0.12
421	0.16
422	0.23
423	0.23
424	0.24
425	0.26
426	0.26
427	0.33
428	0.39
429	0.4
430	0.37
431	0.46
432	0.48
433	0.5
434	0.54
435	0.53
436	0.45
437	0.44
438	0.42
439	0.35
440	0.31
441	0.26
442	0.23
443	0.23
444	0.22
445	0.18
446	0.15
447	0.14
448	0.13
449	0.15
450	0.16
451	0.09
452	0.1
453	0.11
454	0.12
455	0.11
456	0.12
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.13
461	0.12
462	0.12
463	0.11
464	0.11
465	0.1
466	0.09
467	0.1
468	0.08
469	0.07
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.11
481	0.14
482	0.14
483	0.17
484	0.18
485	0.21
486	0.21
487	0.2
488	0.18
489	0.16
490	0.14
491	0.11
492	0.1
493	0.09
494	0.11
495	0.12
496	0.13
497	0.13
498	0.13
499	0.14
500	0.14
501	0.13
502	0.11
503	0.13
504	0.11
505	0.11
506	0.11
507	0.11
508	0.11
509	0.11
510	0.11
511	0.07
512	0.08
513	0.07
514	0.09
515	0.11
516	0.12
517	0.12
518	0.13
519	0.14
520	0.13
521	0.19
522	0.18
523	0.2
524	0.22
525	0.23
526	0.23
527	0.24
528	0.24
529	0.2
530	0.2
531	0.16
532	0.15
533	0.16
534	0.14
535	0.14
536	0.13
537	0.13
538	0.15
539	0.17
540	0.16
541	0.15
542	0.15
543	0.16
544	0.17
545	0.19
546	0.17
547	0.15
548	0.14
549	0.13
550	0.13
551	0.13
552	0.11
553	0.09
554	0.09
555	0.08
556	0.08
557	0.08
558	0.09
559	0.09
560	0.09
561	0.08
562	0.07
563	0.07
564	0.09
565	0.09
566	0.1
567	0.1

A0A4Y9ZXS5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer