Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZPY6

Protein Details
Accession A0A4Y9ZPY6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-166DEGGDDKPKKKRKPLPKMDETRLLGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-158KPKKKRKPLPK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MSLDDIWDLPAENASDIPLKPIEIDDSDDEAPVGPRKAKRPLFLPSDSDEDQASASKPASRTNQTSKSSRPEIDALFEDLDNPEADLAPALDLEALRREADARNAKAAEKEFALPDSSSKHGADKGKGEGKGGKDVLLDDDDEGGDDKPKKKRKPLPKMDETRLLGKDGFPQLVKDTKYFKPKGKGYEAADLDRVLQIYQFWTHRMYPKTKFRDTVERVEKLCHSRRVQVALSVWRDESKGLVNGRKIPDGEDEVIDLTDGEASDDDDDKPPRKTKSAKDTSPAPIDLDSDAEGLLPQHISVPPSSSSPTSAPEDDFDLDALLAQEEARLNADPPVTRTNPSVGASYRAPDVTDEDEAMWDALDMDLDSAPPPPPASRPAVPPPMVDEDEDMWDVVREMEQEQQTSASTNAAASHLPRNDQVPTSQAAAVAKETPPRATNDEGWDDMYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.14
4 0.18
5 0.16
6 0.16
7 0.16
8 0.17
9 0.19
10 0.16
11 0.2
12 0.2
13 0.24
14 0.24
15 0.23
16 0.22
17 0.19
18 0.2
19 0.2
20 0.2
21 0.22
22 0.27
23 0.34
24 0.44
25 0.49
26 0.52
27 0.54
28 0.59
29 0.61
30 0.6
31 0.58
32 0.51
33 0.51
34 0.48
35 0.43
36 0.35
37 0.28
38 0.24
39 0.21
40 0.18
41 0.14
42 0.13
43 0.16
44 0.17
45 0.23
46 0.3
47 0.35
48 0.41
49 0.49
50 0.57
51 0.58
52 0.63
53 0.63
54 0.64
55 0.64
56 0.58
57 0.53
58 0.49
59 0.44
60 0.43
61 0.38
62 0.33
63 0.28
64 0.25
65 0.22
66 0.18
67 0.17
68 0.13
69 0.11
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.12
86 0.13
87 0.22
88 0.29
89 0.28
90 0.33
91 0.34
92 0.34
93 0.37
94 0.37
95 0.3
96 0.24
97 0.23
98 0.19
99 0.19
100 0.2
101 0.16
102 0.16
103 0.17
104 0.17
105 0.18
106 0.18
107 0.19
108 0.22
109 0.27
110 0.29
111 0.29
112 0.34
113 0.38
114 0.38
115 0.38
116 0.36
117 0.34
118 0.37
119 0.34
120 0.28
121 0.22
122 0.22
123 0.22
124 0.18
125 0.16
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.07
132 0.11
133 0.15
134 0.2
135 0.28
136 0.38
137 0.45
138 0.54
139 0.64
140 0.71
141 0.78
142 0.84
143 0.85
144 0.87
145 0.88
146 0.83
147 0.81
148 0.72
149 0.67
150 0.56
151 0.48
152 0.37
153 0.3
154 0.3
155 0.24
156 0.23
157 0.17
158 0.17
159 0.18
160 0.22
161 0.23
162 0.2
163 0.23
164 0.27
165 0.36
166 0.4
167 0.43
168 0.47
169 0.51
170 0.55
171 0.56
172 0.57
173 0.51
174 0.54
175 0.5
176 0.43
177 0.39
178 0.32
179 0.26
180 0.21
181 0.17
182 0.09
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.12
190 0.14
191 0.2
192 0.24
193 0.29
194 0.34
195 0.43
196 0.5
197 0.5
198 0.52
199 0.49
200 0.56
201 0.55
202 0.57
203 0.53
204 0.5
205 0.47
206 0.46
207 0.45
208 0.41
209 0.42
210 0.39
211 0.35
212 0.36
213 0.38
214 0.41
215 0.38
216 0.34
217 0.31
218 0.3
219 0.3
220 0.25
221 0.23
222 0.19
223 0.19
224 0.16
225 0.14
226 0.1
227 0.12
228 0.14
229 0.17
230 0.19
231 0.24
232 0.26
233 0.26
234 0.25
235 0.22
236 0.22
237 0.22
238 0.21
239 0.16
240 0.14
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.08
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.04
251 0.05
252 0.06
253 0.07
254 0.1
255 0.13
256 0.15
257 0.19
258 0.24
259 0.25
260 0.31
261 0.37
262 0.42
263 0.51
264 0.59
265 0.58
266 0.57
267 0.61
268 0.59
269 0.56
270 0.48
271 0.38
272 0.28
273 0.26
274 0.22
275 0.17
276 0.12
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.04
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.11
290 0.11
291 0.13
292 0.15
293 0.13
294 0.15
295 0.16
296 0.19
297 0.2
298 0.2
299 0.19
300 0.18
301 0.2
302 0.19
303 0.18
304 0.14
305 0.11
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.11
319 0.13
320 0.12
321 0.15
322 0.22
323 0.22
324 0.24
325 0.25
326 0.25
327 0.27
328 0.28
329 0.27
330 0.22
331 0.24
332 0.23
333 0.23
334 0.22
335 0.18
336 0.17
337 0.15
338 0.17
339 0.16
340 0.16
341 0.16
342 0.14
343 0.14
344 0.14
345 0.13
346 0.1
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.07
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.14
362 0.18
363 0.24
364 0.26
365 0.32
366 0.39
367 0.46
368 0.46
369 0.44
370 0.44
371 0.44
372 0.42
373 0.36
374 0.3
375 0.24
376 0.25
377 0.25
378 0.2
379 0.14
380 0.13
381 0.12
382 0.1
383 0.09
384 0.08
385 0.09
386 0.16
387 0.18
388 0.18
389 0.19
390 0.19
391 0.19
392 0.19
393 0.19
394 0.13
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.21
402 0.22
403 0.24
404 0.25
405 0.27
406 0.29
407 0.3
408 0.29
409 0.25
410 0.25
411 0.26
412 0.25
413 0.24
414 0.22
415 0.21
416 0.21
417 0.21
418 0.21
419 0.23
420 0.24
421 0.26
422 0.28
423 0.31
424 0.35
425 0.37
426 0.41
427 0.42
428 0.45
429 0.42