FuNGI

A0A4Y9ZY34

Protein Details

Accession

A0A4Y9ZY34

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
79-116	GSGKPKVYCKFCKAKGHTRDECRKLKEKEKNNKSSSSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 15, cyto 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MRRIGHTLTALGNKLXDKLIXVAIILSLPPSYDTLKTILTSAASLDIDNVVXQVLQEEQRXRESAXTSAFXVXSSGXKTPSKGSPSGSGKPKVYCKFCKAKGHTRDECRKLKEKEKNNKSSSSSKAPVGDAXAKVAMVCEPDDSXIXVFKASAXALAKRPDLTTRWLVDSGASRIMSCVRDWFTTYQAFDTPRKVWLGDNSSIXAYGVGXIPVLMQAKGEWHKVXLSXALYVXDLHGNLISVSQITRXGAXVQFLESSCEIXDQQGTLTCEGXLEXNLYXINARSXXPEAXHITIAEPGTDPTXLTAFVARTKVARADLQTWHXRLGHINTDSVLXMVKKSMVTGMDIVLRSDGGGEYVSREVRQFLRDKGIKHETTTADSPEFNGVSERFNRTVMEMARPMLEDSGLPKPFWFDAVEYATYIHNVVPTRSLATNITPHEAWTGNKPDVSLIRTFGCRAFVHIPDSRRRKLDPKSLICTFIGYAKHRKAYRLVHRPTGRIIESRDVIFEETSNHEHLERVQIEVDPESDTSGGEEIAAPVAPESADSEAEVTELLDADEHPAVSHTAPPAAPQLRRSTRNAHAPVADDDARYRITSYDKKTLPQPAGAPPAEEHVNSARADPNGDPLTYKEAMSRPDAAEWLAACNEELHSFKQMGVYEEVDRPRDRKVVNSKWVFRIKRGPNGEVEKYKARLVAKGFTQVEGIDFDETFAPVVKFTSLRTLLALAAKEDLEVHQMDVKTAYLHGELEEEIYLQPPAGFGVPEGKVWKLIKSVYGLKQAGRVWYLRIKSEFEKLGYTRIDSDHSFFTKWAREDGTILYAAIYVDDIILVSNSMDALLEAKEALKRLFNMSDLGEVHWVLGLEVIRDRNARTIALSQRRYVEEILERAGYSDARPIATPALANEHMAKVDAPEVDVLTYQSGIGSLMYAMLGTRPDLAYTVGVLSQHTAKPGEAHQRALVRAFKYLRGTADYQLVFDGKKPWELTGYVDADWAGDVNDRRSISGYTFLLAGGAVSWSSKKQNTTALSSTEAEYIAAAHAAKEATWLRTFLGEIGRPCKTATLLLMDNQSAMAIARNPAFHARTKHIDVRYHFLREKVEAGAINLQYVPTGDQVADVLTKGLVKAKHDKFSEAMGMRHAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.22
3	0.17
4	0.15
5	0.14
6	0.14
7	0.11
8	0.12
9	0.11
10	0.12
11	0.12
12	0.1
13	0.09
14	0.09
15	0.11
16	0.13
17	0.14
18	0.15
19	0.17
20	0.19
21	0.19
22	0.19
23	0.18
24	0.16
25	0.15
26	0.14
27	0.15
28	0.13
29	0.13
30	0.12
31	0.12
32	0.11
33	0.1
34	0.1
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.08
39	0.12
40	0.17
41	0.2
42	0.21
43	0.26
44	0.28
45	0.29
46	0.29
47	0.26
48	0.25
49	0.25
50	0.25
51	0.22
52	0.2
53	0.22
54	0.22
55	0.26
56	0.25
57	0.25
58	0.26
59	0.3
60	0.36
61	0.37
62	0.38
63	0.42
64	0.46
65	0.53
66	0.59
67	0.6
68	0.57
69	0.6
70	0.66
71	0.65
72	0.67
73	0.67
74	0.67
75	0.71
76	0.75
77	0.8
78	0.79
79	0.81
80	0.82
81	0.84
82	0.84
83	0.85
84	0.87
85	0.85
86	0.86
87	0.83
88	0.82
89	0.8
90	0.81
91	0.81
92	0.81
93	0.83
94	0.85
95	0.88
96	0.84
97	0.83
98	0.78
99	0.76
100	0.72
101	0.7
102	0.63
103	0.56
104	0.54
105	0.47
106	0.47
107	0.42
108	0.37
109	0.28
110	0.25
111	0.23
112	0.19
113	0.18
114	0.14
115	0.13
116	0.11
117	0.11
118	0.11
119	0.1
120	0.11
121	0.12
122	0.11
123	0.12
124	0.12
125	0.11
126	0.11
127	0.12
128	0.15
129	0.16
130	0.19
131	0.21
132	0.23
133	0.26
134	0.27
135	0.29
136	0.28
137	0.32
138	0.34
139	0.34
140	0.35
141	0.33
142	0.32
143	0.31
144	0.32
145	0.29
146	0.27
147	0.24
148	0.2
149	0.2
150	0.24
151	0.22
152	0.19
153	0.22
154	0.2
155	0.21
156	0.25
157	0.26
158	0.26
159	0.29
160	0.3
161	0.26
162	0.27
163	0.29
164	0.29
165	0.32
166	0.29
167	0.28
168	0.29
169	0.28
170	0.27
171	0.31
172	0.35
173	0.32
174	0.33
175	0.31
176	0.29
177	0.29
178	0.25
179	0.17
180	0.11
181	0.08
182	0.06
183	0.04
184	0.04
185	0.06
186	0.08
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.13
191	0.16
192	0.19
193	0.17
194	0.17
195	0.18
196	0.18
197	0.19
198	0.14
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.07
215	0.07
216	0.1
217	0.1
218	0.11
219	0.11
220	0.12
221	0.13
222	0.12
223	0.15
224	0.13
225	0.15
226	0.14
227	0.15
228	0.14
229	0.13
230	0.13
231	0.1
232	0.12
233	0.11
234	0.11
235	0.1
236	0.1
237	0.09
238	0.1
239	0.09
240	0.08
241	0.07
242	0.07
243	0.09
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.12
250	0.15
251	0.14
252	0.15
253	0.14
254	0.14
255	0.17
256	0.16
257	0.14
258	0.11
259	0.1
260	0.11
261	0.1
262	0.09
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.09
269	0.11
270	0.12
271	0.12
272	0.13
273	0.16
274	0.17
275	0.19
276	0.2
277	0.23
278	0.29
279	0.34
280	0.37
281	0.35
282	0.33
283	0.32
284	0.32
285	0.27
286	0.29
287	0.27
288	0.23
289	0.23
290	0.23
291	0.22
292	0.19
293	0.2
294	0.11
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.08
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.1
304	0.13
305	0.13
306	0.13
307	0.12
308	0.11
309	0.09
310	0.09
311	0.08
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.07
316	0.09
317	0.1
318	0.1
319	0.1
320	0.13
321	0.15
322	0.2
323	0.21
324	0.22
325	0.31
326	0.34
327	0.35
328	0.41
329	0.47
330	0.43
331	0.42
332	0.45
333	0.37
334	0.38
335	0.39
336	0.33
337	0.25
338	0.24
339	0.23
340	0.2
341	0.18
342	0.14
343	0.14
344	0.12
345	0.14
346	0.17
347	0.2
348	0.19
349	0.2
350	0.2
351	0.18
352	0.23
353	0.21
354	0.23
355	0.2
356	0.19
357	0.19
358	0.19
359	0.18
360	0.13
361	0.12
362	0.08
363	0.1
364	0.16
365	0.16
366	0.16
367	0.16
368	0.17
369	0.17
370	0.18
371	0.16
372	0.1
373	0.13
374	0.16
375	0.16
376	0.14
377	0.15
378	0.14
379	0.13
380	0.13
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.13
388	0.13
389	0.14
390	0.13
391	0.14
392	0.19
393	0.18
394	0.2
395	0.18
396	0.18
397	0.18
398	0.18
399	0.17
400	0.18
401	0.22
402	0.2
403	0.2
404	0.2
405	0.19
406	0.21
407	0.22
408	0.18
409	0.15
410	0.15
411	0.16
412	0.17
413	0.16
414	0.17
415	0.15
416	0.18
417	0.2
418	0.19
419	0.24
420	0.27
421	0.3
422	0.35
423	0.42
424	0.41
425	0.4
426	0.42
427	0.46
428	0.5
429	0.56
430	0.57
431	0.56
432	0.59
433	0.58
434	0.57
435	0.49
436	0.42
437	0.32
438	0.26
439	0.24
440	0.2
441	0.26
442	0.27
443	0.33
444	0.33
445	0.35
446	0.37
447	0.43
448	0.5
449	0.54
450	0.54
451	0.57
452	0.59
453	0.59
454	0.54
455	0.5
456	0.41
457	0.33
458	0.32
459	0.26
460	0.25
461	0.23
462	0.21
463	0.17
464	0.16
465	0.14
466	0.11
467	0.09
468	0.11
469	0.12
470	0.13
471	0.12
472	0.12
473	0.12
474	0.12
475	0.17
476	0.15
477	0.14
478	0.14
479	0.14
480	0.14
481	0.15
482	0.14
483	0.08
484	0.08
485	0.08
486	0.07
487	0.06
488	0.06
489	0.06
490	0.05
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.03
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.03
501	0.04
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.04
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.03
514	0.03
515	0.04
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.07
523	0.06
524	0.07
525	0.07
526	0.08
527	0.13
528	0.15
529	0.16
530	0.17
531	0.25
532	0.29
533	0.33
534	0.35
535	0.37
536	0.39
537	0.47
538	0.47
539	0.41
540	0.36
541	0.35
542	0.33
543	0.31
544	0.26
545	0.17
546	0.15
547	0.14
548	0.14
549	0.12
550	0.11
551	0.08
552	0.13
553	0.19
554	0.23
555	0.3
556	0.3
557	0.32
558	0.35
559	0.4
560	0.36
561	0.33
562	0.3
563	0.26
564	0.31
565	0.29
566	0.26
567	0.2
568	0.21
569	0.19
570	0.17
571	0.14
572	0.1
573	0.13
574	0.12
575	0.13
576	0.13
577	0.12
578	0.14
579	0.13
580	0.16
581	0.15
582	0.15
583	0.14
584	0.13
585	0.18
586	0.17
587	0.17
588	0.15
589	0.16
590	0.18
591	0.19
592	0.21
593	0.16
594	0.16
595	0.16
596	0.14
597	0.13
598	0.11
599	0.1
600	0.07
601	0.07
602	0.06
603	0.06
604	0.07
605	0.07
606	0.08
607	0.08
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.13
612	0.13
613	0.14
614	0.14
615	0.15
616	0.15
617	0.19
618	0.2
619	0.2
620	0.2
621	0.19
622	0.2
623	0.23
624	0.21
625	0.26
626	0.35
627	0.41
628	0.5
629	0.55
630	0.56
631	0.59
632	0.67
633	0.6
634	0.54
635	0.55
636	0.5
637	0.53
638	0.53
639	0.47
640	0.45
641	0.5
642	0.51
643	0.43
644	0.42
645	0.37
646	0.34
647	0.33
648	0.31
649	0.25
650	0.25
651	0.25
652	0.25
653	0.23
654	0.29
655	0.28
656	0.25
657	0.24
658	0.2
659	0.19
660	0.16
661	0.15
662	0.08
663	0.07
664	0.08
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.07
673	0.07
674	0.07
675	0.14
676	0.14
677	0.14
678	0.15
679	0.15
680	0.15
681	0.17
682	0.17
683	0.1
684	0.1
685	0.1
686	0.09
687	0.09
688	0.08
689	0.08
690	0.08
691	0.08
692	0.1
693	0.1
694	0.11
695	0.11
696	0.11
697	0.09
698	0.09
699	0.1
700	0.07
701	0.07
702	0.07
703	0.07
704	0.07
705	0.08
706	0.07
707	0.07
708	0.06
709	0.07
710	0.06
711	0.06
712	0.05
713	0.05
714	0.05
715	0.05
716	0.05
717	0.04
718	0.09
719	0.1
720	0.11
721	0.13
722	0.12
723	0.17
724	0.18
725	0.19
726	0.17
727	0.17
728	0.18
729	0.21
730	0.27
731	0.27
732	0.34
733	0.34
734	0.32
735	0.36
736	0.35
737	0.33
738	0.29
739	0.25
740	0.2
741	0.25
742	0.26
743	0.25
744	0.25
745	0.27
746	0.27
747	0.32
748	0.31
749	0.27
750	0.3
751	0.26
752	0.29
753	0.26
754	0.25
755	0.22
756	0.21
757	0.22
758	0.19
759	0.21
760	0.2
761	0.21
762	0.21
763	0.19
764	0.21
765	0.24
766	0.24
767	0.24
768	0.22
769	0.22
770	0.22
771	0.23
772	0.22
773	0.17
774	0.16
775	0.13
776	0.11
777	0.1
778	0.08
779	0.07
780	0.04
781	0.04
782	0.04
783	0.03
784	0.03
785	0.03
786	0.03
787	0.03
788	0.03
789	0.03
790	0.03
791	0.03
792	0.03
793	0.04
794	0.04
795	0.05
796	0.05
797	0.06
798	0.07
799	0.09
800	0.1
801	0.11
802	0.12
803	0.16
804	0.17
805	0.17
806	0.17
807	0.17
808	0.19
809	0.18
810	0.18
811	0.15
812	0.14
813	0.13
814	0.11
815	0.11
816	0.07
817	0.08
818	0.08
819	0.07
820	0.1
821	0.11
822	0.12
823	0.13
824	0.14
825	0.16
826	0.17
827	0.17
828	0.17
829	0.23
830	0.3
831	0.39
832	0.41
833	0.39
834	0.41
835	0.43
836	0.43
837	0.37
838	0.32
839	0.27
840	0.26
841	0.26
842	0.23
843	0.21
844	0.19
845	0.19
846	0.15
847	0.11
848	0.14
849	0.13
850	0.13
851	0.14
852	0.14
853	0.15
854	0.15
855	0.15
856	0.11
857	0.16
858	0.16
859	0.17
860	0.17
861	0.16
862	0.16
863	0.16
864	0.15
865	0.1
866	0.12
867	0.11
868	0.1
869	0.1
870	0.1
871	0.1
872	0.1
873	0.1
874	0.08
875	0.08
876	0.07
877	0.06
878	0.06
879	0.06
880	0.05
881	0.05
882	0.04
883	0.04
884	0.04
885	0.04
886	0.04
887	0.05
888	0.05
889	0.05
890	0.07
891	0.07
892	0.08
893	0.09
894	0.1
895	0.09
896	0.09
897	0.1
898	0.09
899	0.09
900	0.09
901	0.1
902	0.13
903	0.13
904	0.15
905	0.15
906	0.14
907	0.17
908	0.22
909	0.32
910	0.3
911	0.32
912	0.34
913	0.37
914	0.38
915	0.4
916	0.39
917	0.3
918	0.34
919	0.34
920	0.34
921	0.35
922	0.36
923	0.34
924	0.34
925	0.35
926	0.31
927	0.36
928	0.32
929	0.27
930	0.26
931	0.25
932	0.2
933	0.19
934	0.23
935	0.17
936	0.22
937	0.23
938	0.23
939	0.25
940	0.25
941	0.27
942	0.29
943	0.3
944	0.24
945	0.24
946	0.23
947	0.2
948	0.19
949	0.15
950	0.08
951	0.09
952	0.11
953	0.13
954	0.18
955	0.18
956	0.19
957	0.21
958	0.22
959	0.2
960	0.24
961	0.23
962	0.19
963	0.18
964	0.17
965	0.15
966	0.13
967	0.11
968	0.05
969	0.05
970	0.05
971	0.05
972	0.07
973	0.09
974	0.15
975	0.19
976	0.21
977	0.24
978	0.33
979	0.36
980	0.42
981	0.43
982	0.41
983	0.41
984	0.4
985	0.38
986	0.31
987	0.27
988	0.19
989	0.15
990	0.13
991	0.09
992	0.09
993	0.08
994	0.07
995	0.08
996	0.08
997	0.08
998	0.13
999	0.15
1000	0.18
1001	0.19
1002	0.2
1003	0.19
1004	0.21
1005	0.21
1006	0.19
1007	0.23
1008	0.23
1009	0.26
1010	0.31
1011	0.32
1012	0.31
1013	0.31
1014	0.3
1015	0.25
1016	0.24
1017	0.22
1018	0.23
1019	0.23
1020	0.26
1021	0.29
1022	0.26
1023	0.25
1024	0.22
1025	0.19
1026	0.13
1027	0.11
1028	0.1
1029	0.09
1030	0.12
1031	0.14
1032	0.15
1033	0.17
1034	0.23
1035	0.26
1036	0.29
1037	0.34
1038	0.38
1039	0.43
1040	0.5
1041	0.56
1042	0.56
1043	0.61
1044	0.59
1045	0.62
1046	0.61
1047	0.61
1048	0.57
1049	0.52
1050	0.5
1051	0.45
1052	0.43
1053	0.37
1054	0.34
1055	0.27
1056	0.28
1057	0.31
1058	0.27
1059	0.25
1060	0.23
1061	0.2
1062	0.17
1063	0.17
1064	0.15
1065	0.1
1066	0.11
1067	0.09
1068	0.1
1069	0.1
1070	0.11
1071	0.11
1072	0.1
1073	0.09
1074	0.09
1075	0.09
1076	0.1
1077	0.15
1078	0.16
1079	0.21
1080	0.32
1081	0.38
1082	0.46
1083	0.48
1084	0.5
1085	0.47
1086	0.49
1087	0.53
1088	0.45
1089	0.4

A0A4Y9ZY34

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer