FuNGI

A0A4Y9ZQC9

Protein Details

Accession

A0A4Y9ZQC9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1160-1179	VNHALRRKSAFDRRLRQRLP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 10, nucl 5, pero 5, mito 4, cysk 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17917 RT_RNaseH PF00665 rve PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MPATNEPTEYEGREATASAWIEEVEASEDEKSAGAATASATSDASNDEYGPRKDPYAEEDSKLDRDAKHPGQTNKEQCSTAANTQAKANTEMRRESKGDSGSPSRGVSPSSLRKSLNTDTNLAYDRANVPNTEASQTTMRGASVEEIEDEEHVRLRRKREYARGSGFTLPAREVPPHMSPQAVPFDIDTDPGIEVWAVDTVDPKAHLYTRLTDLHKPARVEEMLRRIQIGDDLTTDERAQVLALLTEFADCFALSVGEVKPADDAVHKLNIPEGATFSTKPRQRPLTPPQREYLSKKVEEMLAAGIIEAVHPSRVKAVSPTTLAQKAHEGAGLTLDELQLRINDECVAAGLPPMFDLPARSPTAERVTAVEPPLKWRICQNFNEVNKVTTVAPMPQGDIRMKQQALCGHRYISVFDFASGFYALTMHIDSRPYTAFYVEGRGYFWYLRMPFGMTGAPASFAYVTGIHMHDLLTRQIMELFVDDGGAAANSFGEMMDKLRVVFVRVRERNLSLSADKSSFFMSEAVFAGARVGLQGVLPDLSKLTAVVDWMQPKDALNLVSFLGLTGHFRDLVRDYARIEAPLRDLLRKVDMPAQSSKGTYRRIMEGYKLTDHWSAIHTEAFLRLKAALTAEPVLRGPQWDGTPFTVTSDGCQNGFAAVLTQKFQYQLPNGKVVCKSHPIAFASKRTSTSEEKYKPFLLEFAALKFALDKFSDIIWGFPVIVVTDCQALRDVLLSDGLNATHARWRDGILAYQIIDVKHLPGKLNVVADGLSRKSEGLPHVAGDGSDWTVNEDWEASRGLVNDVMALTVERDPQYQDLFMRFQAEPLFTDVLEALTKQYTNSTKLRDKRRAQHRSSEYFLDDGKLWRLRGGSAARSRPRVECVSKVEAQALAYQQHITGGHWGRDSIKVALMERICSPRLDASIMAAIKACAQCKNYGAPHLHALFEPVTRRHPFELLVGDYLSMPKAKGKYHNVGLFLDTFSQHIWAFKFTVSGSAKTTMGCLHHIFQNFVPPETFMSDNGSHFKNAEVRDFCTKWNVKHHVVATYSPWVNGLVEGTNKLLIHVLARLAAPGLGEDDYVAITPEDLPTRWPDHLDEAVRILNNRLLPALKFTPKELLLGMVINTPPSTIAEAASVLRSGDVETQIAYVAQQRLDGYEAIVNHALRRKSAFDRRLRQRLPGEVLFHTGQLVQIYQNQLAFTVSSNSKLQAKWTPPHRIASRMCNAYEIVTLEGEPAKGTPISARRLRAFTPRLGSVLETEQRAFEEALRVEREQVAAARALEEVQKPGSDAGVDDLEVGFLGLGGDGGVAMFEGGTME

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.16
3	0.2
4	0.18
5	0.16
6	0.15
7	0.14
8	0.14
9	0.13
10	0.13
11	0.1
12	0.1
13	0.11
14	0.11
15	0.11
16	0.11
17	0.11
18	0.1
19	0.08
20	0.08
21	0.07
22	0.07
23	0.08
24	0.1
25	0.11
26	0.11
27	0.11
28	0.1
29	0.11
30	0.12
31	0.13
32	0.11
33	0.11
34	0.15
35	0.22
36	0.24
37	0.28
38	0.28
39	0.28
40	0.3
41	0.31
42	0.34
43	0.36
44	0.38
45	0.36
46	0.39
47	0.41
48	0.4
49	0.41
50	0.38
51	0.31
52	0.3
53	0.38
54	0.39
55	0.43
56	0.49
57	0.54
58	0.59
59	0.67
60	0.73
61	0.71
62	0.69
63	0.61
64	0.54
65	0.53
66	0.5
67	0.44
68	0.45
69	0.4
70	0.37
71	0.41
72	0.43
73	0.39
74	0.39
75	0.4
76	0.37
77	0.4
78	0.46
79	0.46
80	0.49
81	0.49
82	0.46
83	0.47
84	0.45
85	0.43
86	0.42
87	0.44
88	0.42
89	0.43
90	0.41
91	0.36
92	0.32
93	0.3
94	0.27
95	0.31
96	0.37
97	0.41
98	0.45
99	0.43
100	0.45
101	0.51
102	0.54
103	0.53
104	0.47
105	0.44
106	0.4
107	0.44
108	0.43
109	0.37
110	0.3
111	0.25
112	0.26
113	0.27
114	0.26
115	0.22
116	0.23
117	0.27
118	0.29
119	0.28
120	0.24
121	0.23
122	0.24
123	0.25
124	0.24
125	0.19
126	0.17
127	0.15
128	0.16
129	0.15
130	0.13
131	0.13
132	0.11
133	0.12
134	0.12
135	0.12
136	0.13
137	0.12
138	0.14
139	0.17
140	0.25
141	0.29
142	0.35
143	0.43
144	0.51
145	0.59
146	0.66
147	0.72
148	0.74
149	0.77
150	0.75
151	0.7
152	0.64
153	0.58
154	0.49
155	0.42
156	0.33
157	0.28
158	0.26
159	0.24
160	0.22
161	0.24
162	0.26
163	0.29
164	0.28
165	0.27
166	0.25
167	0.28
168	0.32
169	0.28
170	0.24
171	0.2
172	0.22
173	0.2
174	0.2
175	0.16
176	0.11
177	0.11
178	0.1
179	0.1
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.07
185	0.06
186	0.08
187	0.09
188	0.11
189	0.12
190	0.12
191	0.13
192	0.14
193	0.18
194	0.19
195	0.23
196	0.27
197	0.33
198	0.36
199	0.38
200	0.44
201	0.48
202	0.5
203	0.47
204	0.43
205	0.42
206	0.4
207	0.39
208	0.39
209	0.4
210	0.4
211	0.39
212	0.38
213	0.32
214	0.31
215	0.31
216	0.25
217	0.17
218	0.14
219	0.17
220	0.17
221	0.18
222	0.17
223	0.15
224	0.13
225	0.12
226	0.11
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.08
243	0.08
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.12
248	0.12
249	0.13
250	0.12
251	0.14
252	0.13
253	0.17
254	0.17
255	0.17
256	0.19
257	0.2
258	0.19
259	0.17
260	0.16
261	0.14
262	0.16
263	0.17
264	0.19
265	0.26
266	0.3
267	0.33
268	0.4
269	0.45
270	0.48
271	0.57
272	0.64
273	0.67
274	0.71
275	0.7
276	0.66
277	0.64
278	0.65
279	0.62
280	0.61
281	0.57
282	0.5
283	0.47
284	0.46
285	0.4
286	0.35
287	0.3
288	0.21
289	0.13
290	0.12
291	0.1
292	0.08
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.05
297	0.06
298	0.07
299	0.07
300	0.11
301	0.12
302	0.12
303	0.16
304	0.19
305	0.21
306	0.23
307	0.25
308	0.27
309	0.31
310	0.3
311	0.28
312	0.28
313	0.25
314	0.23
315	0.22
316	0.18
317	0.13
318	0.14
319	0.13
320	0.1
321	0.09
322	0.09
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.06
327	0.09
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.06
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.05
343	0.08
344	0.1
345	0.14
346	0.16
347	0.17
348	0.17
349	0.21
350	0.26
351	0.25
352	0.23
353	0.21
354	0.21
355	0.23
356	0.25
357	0.24
358	0.19
359	0.23
360	0.3
361	0.28
362	0.26
363	0.31
364	0.38
365	0.41
366	0.44
367	0.48
368	0.49
369	0.51
370	0.58
371	0.51
372	0.43
373	0.36
374	0.35
375	0.27
376	0.19
377	0.18
378	0.13
379	0.15
380	0.14
381	0.15
382	0.15
383	0.17
384	0.17
385	0.19
386	0.2
387	0.24
388	0.24
389	0.24
390	0.26
391	0.29
392	0.32
393	0.33
394	0.31
395	0.26
396	0.29
397	0.28
398	0.27
399	0.22
400	0.21
401	0.18
402	0.17
403	0.16
404	0.13
405	0.13
406	0.11
407	0.1
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.07
413	0.06
414	0.07
415	0.08
416	0.09
417	0.11
418	0.12
419	0.12
420	0.12
421	0.12
422	0.12
423	0.12
424	0.16
425	0.14
426	0.14
427	0.13
428	0.13
429	0.14
430	0.13
431	0.13
432	0.14
433	0.14
434	0.14
435	0.14
436	0.15
437	0.13
438	0.14
439	0.14
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.07
445	0.08
446	0.07
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.08
452	0.09
453	0.08
454	0.08
455	0.09
456	0.09
457	0.1
458	0.1
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.06
468	0.06
469	0.05
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.03
474	0.02
475	0.02
476	0.02
477	0.03
478	0.02
479	0.03
480	0.03
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.08
486	0.08
487	0.1
488	0.13
489	0.18
490	0.28
491	0.3
492	0.33
493	0.34
494	0.35
495	0.35
496	0.34
497	0.31
498	0.22
499	0.22
500	0.21
501	0.19
502	0.18
503	0.16
504	0.15
505	0.12
506	0.11
507	0.1
508	0.08
509	0.09
510	0.09
511	0.09
512	0.08
513	0.08
514	0.07
515	0.06
516	0.06
517	0.04
518	0.04
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.05
531	0.04
532	0.05
533	0.07
534	0.09
535	0.11
536	0.12
537	0.12
538	0.12
539	0.12
540	0.13
541	0.13
542	0.11
543	0.09
544	0.1
545	0.09
546	0.09
547	0.08
548	0.07
549	0.06
550	0.05
551	0.06
552	0.06
553	0.07
554	0.08
555	0.08
556	0.09
557	0.1
558	0.15
559	0.15
560	0.15
561	0.15
562	0.18
563	0.18
564	0.18
565	0.17
566	0.14
567	0.14
568	0.17
569	0.17
570	0.15
571	0.16
572	0.16
573	0.18
574	0.17
575	0.17
576	0.19
577	0.19
578	0.21
579	0.23
580	0.25
581	0.22
582	0.22
583	0.24
584	0.23
585	0.25
586	0.24
587	0.23
588	0.24
589	0.25
590	0.26
591	0.26
592	0.25
593	0.24
594	0.24
595	0.22
596	0.22
597	0.2
598	0.19
599	0.17
600	0.14
601	0.12
602	0.12
603	0.11
604	0.09
605	0.08
606	0.11
607	0.11
608	0.1
609	0.09
610	0.09
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.07
615	0.07
616	0.09
617	0.08
618	0.09
619	0.09
620	0.09
621	0.08
622	0.08
623	0.08
624	0.09
625	0.09
626	0.1
627	0.12
628	0.12
629	0.14
630	0.13
631	0.13
632	0.13
633	0.12
634	0.11
635	0.13
636	0.13
637	0.11
638	0.11
639	0.1
640	0.09
641	0.09
642	0.08
643	0.05
644	0.06
645	0.06
646	0.07
647	0.07
648	0.08
649	0.08
650	0.09
651	0.11
652	0.14
653	0.2
654	0.21
655	0.27
656	0.27
657	0.29
658	0.3
659	0.29
660	0.28
661	0.26
662	0.25
663	0.22
664	0.26
665	0.24
666	0.27
667	0.28
668	0.31
669	0.31
670	0.31
671	0.3
672	0.28
673	0.31
674	0.3
675	0.31
676	0.36
677	0.38
678	0.38
679	0.4
680	0.39
681	0.35
682	0.31
683	0.27
684	0.19
685	0.17
686	0.15
687	0.13
688	0.13
689	0.12
690	0.12
691	0.11
692	0.1
693	0.09
694	0.08
695	0.08
696	0.07
697	0.07
698	0.1
699	0.09
700	0.09
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.07
705	0.07
706	0.05
707	0.05
708	0.05
709	0.05
710	0.07
711	0.07
712	0.07
713	0.08
714	0.07
715	0.07
716	0.08
717	0.08
718	0.06
719	0.07
720	0.07
721	0.06
722	0.07
723	0.06
724	0.07
725	0.06
726	0.07
727	0.08
728	0.09
729	0.1
730	0.1
731	0.12
732	0.14
733	0.15
734	0.15
735	0.14
736	0.14
737	0.13
738	0.14
739	0.14
740	0.11
741	0.11
742	0.1
743	0.1
744	0.11
745	0.12
746	0.12
747	0.11
748	0.14
749	0.15
750	0.15
751	0.14
752	0.12
753	0.11
754	0.11
755	0.12
756	0.1
757	0.08
758	0.08
759	0.08
760	0.08
761	0.11
762	0.11
763	0.13
764	0.13
765	0.13
766	0.14
767	0.13
768	0.13
769	0.1
770	0.1
771	0.07
772	0.06
773	0.06
774	0.07
775	0.07
776	0.07
777	0.07
778	0.07
779	0.06
780	0.07
781	0.08
782	0.07
783	0.07
784	0.08
785	0.08
786	0.08
787	0.08
788	0.07
789	0.07
790	0.06
791	0.05
792	0.05
793	0.05
794	0.06
795	0.08
796	0.08
797	0.08
798	0.09
799	0.11
800	0.12
801	0.12
802	0.12
803	0.13
804	0.14
805	0.14
806	0.17
807	0.15
808	0.16
809	0.16
810	0.16
811	0.14
812	0.16
813	0.16
814	0.11
815	0.12
816	0.11
817	0.1
818	0.09
819	0.08
820	0.06
821	0.06
822	0.07
823	0.06
824	0.11
825	0.13
826	0.18
827	0.22
828	0.27
829	0.35
830	0.42
831	0.52
832	0.58
833	0.63
834	0.69
835	0.76
836	0.8
837	0.76
838	0.79
839	0.77
840	0.72
841	0.68
842	0.61
843	0.5
844	0.41
845	0.37
846	0.28
847	0.21
848	0.17
849	0.18
850	0.18
851	0.17
852	0.17
853	0.18
854	0.16
855	0.21
856	0.23
857	0.26
858	0.3
859	0.38
860	0.4
861	0.44
862	0.46
863	0.42
864	0.44
865	0.43
866	0.4
867	0.37
868	0.39
869	0.41
870	0.41
871	0.4
872	0.36
873	0.3
874	0.27
875	0.24
876	0.19
877	0.14
878	0.13
879	0.12
880	0.11
881	0.12
882	0.12
883	0.1
884	0.16
885	0.17
886	0.19
887	0.19
888	0.19
889	0.19
890	0.22
891	0.24
892	0.17
893	0.18
894	0.17
895	0.18
896	0.22
897	0.21
898	0.19
899	0.2
900	0.22
901	0.2
902	0.19
903	0.19
904	0.16
905	0.17
906	0.17
907	0.14
908	0.13
909	0.17
910	0.17
911	0.15
912	0.13
913	0.12
914	0.14
915	0.16
916	0.16
917	0.14
918	0.16
919	0.18
920	0.2
921	0.26
922	0.24
923	0.28
924	0.3
925	0.29
926	0.33
927	0.32
928	0.3
929	0.25
930	0.25
931	0.2
932	0.19
933	0.21
934	0.17
935	0.22
936	0.24
937	0.27
938	0.26
939	0.26
940	0.25
941	0.25
942	0.27
943	0.23
944	0.22
945	0.19
946	0.17
947	0.16
948	0.15
949	0.13
950	0.09
951	0.08
952	0.11
953	0.14
954	0.17
955	0.25
956	0.32
957	0.39
958	0.46
959	0.5
960	0.48
961	0.46
962	0.43
963	0.36
964	0.3
965	0.23
966	0.16
967	0.13
968	0.11
969	0.12
970	0.1
971	0.11
972	0.12
973	0.12
974	0.13
975	0.13
976	0.14
977	0.12
978	0.21
979	0.21
980	0.21
981	0.22
982	0.24
983	0.24
984	0.22
985	0.23
986	0.17
987	0.16
988	0.18
989	0.17
990	0.17
991	0.21
992	0.22
993	0.24
994	0.22
995	0.29
996	0.27
997	0.26
998	0.24
999	0.2
1000	0.21
1001	0.22
1002	0.22
1003	0.14
1004	0.19
1005	0.19
1006	0.2
1007	0.23
1008	0.23
1009	0.2
1010	0.19
1011	0.21
1012	0.21
1013	0.21
1014	0.28
1015	0.27
1016	0.29
1017	0.36
1018	0.37
1019	0.36
1020	0.4
1021	0.42
1022	0.39
1023	0.47
1024	0.51
1025	0.47
1026	0.52
1027	0.53
1028	0.49
1029	0.46
1030	0.43
1031	0.36
1032	0.36
1033	0.33
1034	0.27
1035	0.25
1036	0.2
1037	0.18
1038	0.17
1039	0.15
1040	0.1
1041	0.1
1042	0.11
1043	0.11
1044	0.13
1045	0.12
1046	0.12
1047	0.12
1048	0.1
1049	0.1
1050	0.11
1051	0.1
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.1
1055	0.09
1056	0.09
1057	0.08
1058	0.07
1059	0.08
1060	0.06
1061	0.06
1062	0.06
1063	0.06
1064	0.06
1065	0.06
1066	0.07
1067	0.05
1068	0.05
1069	0.06
1070	0.08
1071	0.09
1072	0.09
1073	0.11
1074	0.15
1075	0.19
1076	0.2
1077	0.21
1078	0.21
1079	0.25
1080	0.3
1081	0.31
1082	0.27
1083	0.26
1084	0.28
1085	0.27
1086	0.25
1087	0.22
1088	0.2
1089	0.19
1090	0.18
1091	0.17
1092	0.16
1093	0.16
1094	0.22
1095	0.26
1096	0.28
1097	0.29
1098	0.3
1099	0.34
1100	0.33
1101	0.34
1102	0.28
1103	0.23
1104	0.19
1105	0.18
1106	0.17
1107	0.14
1108	0.13
1109	0.13
1110	0.12
1111	0.1
1112	0.1
1113	0.1
1114	0.12
1115	0.09
1116	0.1
1117	0.1
1118	0.11
1119	0.12
1120	0.12
1121	0.11
1122	0.09
1123	0.08
1124	0.08
1125	0.09
1126	0.11
1127	0.11
1128	0.11
1129	0.11
1130	0.11
1131	0.11
1132	0.11
1133	0.1
1134	0.13
1135	0.14
1136	0.14
1137	0.15
1138	0.15
1139	0.16
1140	0.18
1141	0.18
1142	0.13
1143	0.14
1144	0.14
1145	0.16
1146	0.19
1147	0.18
1148	0.19
1149	0.25
1150	0.25
1151	0.24
1152	0.27
1153	0.29
1154	0.35
1155	0.46
1156	0.51
1157	0.56
1158	0.66
1159	0.74
1160	0.82
1161	0.79
1162	0.78
1163	0.73
1164	0.72
1165	0.69
1166	0.64
1167	0.57
1168	0.48
1169	0.51
1170	0.43
1171	0.37
1172	0.29
1173	0.22
1174	0.18
1175	0.15
1176	0.14
1177	0.11
1178	0.14
1179	0.17
1180	0.18
1181	0.19
1182	0.18
1183	0.18
1184	0.17
1185	0.16
1186	0.13
1187	0.16
1188	0.16
1189	0.18
1190	0.19
1191	0.21
1192	0.25
1193	0.25
1194	0.29
1195	0.32
1196	0.38
1197	0.43
1198	0.5
1199	0.58
1200	0.57
1201	0.66
1202	0.64
1203	0.65
1204	0.63
1205	0.65
1206	0.65
1207	0.59
1208	0.56
1209	0.49
1210	0.46
1211	0.38
1212	0.35
1213	0.27
1214	0.19
1215	0.15
1216	0.15
1217	0.14
1218	0.15
1219	0.13
1220	0.12
1221	0.1
1222	0.11
1223	0.11
1224	0.11
1225	0.16
1226	0.21
1227	0.3
1228	0.35
1229	0.41
1230	0.44
1231	0.48
1232	0.51
1233	0.55
1234	0.54
1235	0.52
1236	0.53
1237	0.48
1238	0.45
1239	0.41
1240	0.39
1241	0.32
1242	0.35
1243	0.32
1244	0.28
1245	0.26
1246	0.25
1247	0.25
1248	0.26
1249	0.24
1250	0.18
1251	0.21
1252	0.21
1253	0.26
1254	0.29
1255	0.29
1256	0.29
1257	0.3
1258	0.29
1259	0.24
1260	0.24
1261	0.21
1262	0.2
1263	0.19
1264	0.18
1265	0.16
1266	0.16
1267	0.18
1268	0.18
1269	0.19
1270	0.18
1271	0.18
1272	0.18
1273	0.18
1274	0.18
1275	0.14
1276	0.13
1277	0.14
1278	0.13
1279	0.13
1280	0.12
1281	0.12
1282	0.11
1283	0.1
1284	0.09
1285	0.06
1286	0.04
1287	0.04
1288	0.03
1289	0.03
1290	0.03
1291	0.03
1292	0.03
1293	0.03
1294	0.03
1295	0.03
1296	0.03
1297	0.02

A0A4Y9ZQC9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer