FuNGI

A0A4Z0A119

Protein Details

Accession

A0A4Z0A119

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-56	SSGSVSPKRPRPVGRPRPPKPEAEKE	Basic
162-189	GSESQKKGPATKKKFQKKTRQVFKIPEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
37-51	PKRPRPVGRPRPPKP
167-181	KKGPATKKKFQKKTR

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 9.5, cyto_mito 7, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MAPAPPGSAILFHPKAKKKQLGTAESRETSSSGSVSPKRPRPVGRPRPPKPEAEKEDAAPALPEGPYTEFNLVSSALNGWKYDVMKFDSRKPVDILRWQAPVKLNRKELRRPETTATDEDLQAKAVGPMLGPDGKPVIGMDGRMVMVDAEGKPIHPRDSTPGSESQKKGPATKKKFQKKTRQVFKIPEATRQLRKEERYPWVMEDATGGEIWQGKMEEVVKAETHAFFMPASNNTFKFVPAHRWYKFHKRPNYHIPDLEEAESLMAMRQKNKDPERWLLHKRNGQGPSAATSALFKAESGGEPVLGGGPSSQRSLGPGGRRLRTVVNGSDSLFGDEDEGEGPRRRKREYGAEADFDEVPYQEEFADDEEKMVQEDEEDEVAKEMEERLQREYMSANKQRDSHVDEDVDEEESQLTGAGKAIKKLMSKLEKNEAYEDDEEENPYASSEEEEEEEEIVSNEPAVQSYLTPSQTSRAASPSQPSQPAAPPRPEGASSPSSRATSPVPNHGGHFVVAKRATSPKAPKPKAMGVNGSRATSPLAQQDGPSGRATSPPSAAKPPSAVTPNGT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.55
3	0.63
4	0.7
5	0.65
6	0.71
7	0.76
8	0.76
9	0.76
10	0.75
11	0.74
12	0.67
13	0.63
14	0.55
15	0.45
16	0.37
17	0.3
18	0.23
19	0.17
20	0.23
21	0.28
22	0.36
23	0.45
24	0.51
25	0.57
26	0.63
27	0.69
28	0.71
29	0.76
30	0.79
31	0.81
32	0.84
33	0.85
34	0.87
35	0.83
36	0.83
37	0.8
38	0.8
39	0.76
40	0.73
41	0.69
42	0.6
43	0.61
44	0.51
45	0.42
46	0.32
47	0.25
48	0.18
49	0.15
50	0.13
51	0.1
52	0.13
53	0.14
54	0.17
55	0.18
56	0.16
57	0.17
58	0.18
59	0.17
60	0.14
61	0.13
62	0.12
63	0.13
64	0.14
65	0.14
66	0.14
67	0.16
68	0.17
69	0.18
70	0.21
71	0.23
72	0.3
73	0.33
74	0.4
75	0.47
76	0.47
77	0.49
78	0.48
79	0.49
80	0.48
81	0.53
82	0.51
83	0.46
84	0.5
85	0.47
86	0.49
87	0.5
88	0.52
89	0.53
90	0.53
91	0.57
92	0.57
93	0.65
94	0.69
95	0.72
96	0.72
97	0.69
98	0.67
99	0.64
100	0.64
101	0.61
102	0.54
103	0.48
104	0.42
105	0.38
106	0.34
107	0.29
108	0.23
109	0.18
110	0.16
111	0.12
112	0.11
113	0.1
114	0.08
115	0.08
116	0.1
117	0.13
118	0.12
119	0.13
120	0.12
121	0.12
122	0.12
123	0.11
124	0.12
125	0.1
126	0.1
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.06
133	0.06
134	0.08
135	0.08
136	0.09
137	0.09
138	0.1
139	0.13
140	0.15
141	0.18
142	0.16
143	0.17
144	0.21
145	0.27
146	0.29
147	0.29
148	0.36
149	0.39
150	0.45
151	0.46
152	0.44
153	0.45
154	0.45
155	0.49
156	0.5
157	0.55
158	0.57
159	0.64
160	0.69
161	0.73
162	0.81
163	0.84
164	0.86
165	0.86
166	0.89
167	0.91
168	0.89
169	0.86
170	0.82
171	0.79
172	0.78
173	0.68
174	0.64
175	0.61
176	0.57
177	0.57
178	0.53
179	0.53
180	0.5
181	0.53
182	0.51
183	0.51
184	0.52
185	0.49
186	0.48
187	0.43
188	0.39
189	0.35
190	0.29
191	0.23
192	0.17
193	0.13
194	0.11
195	0.09
196	0.07
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.07
201	0.06
202	0.08
203	0.09
204	0.09
205	0.09
206	0.1
207	0.09
208	0.1
209	0.11
210	0.1
211	0.11
212	0.1
213	0.09
214	0.08
215	0.09
216	0.1
217	0.11
218	0.14
219	0.14
220	0.15
221	0.16
222	0.16
223	0.16
224	0.17
225	0.17
226	0.23
227	0.27
228	0.34
229	0.34
230	0.38
231	0.44
232	0.52
233	0.6
234	0.61
235	0.63
236	0.62
237	0.68
238	0.75
239	0.78
240	0.7
241	0.63
242	0.56
243	0.51
244	0.46
245	0.39
246	0.27
247	0.19
248	0.15
249	0.12
250	0.09
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.11
255	0.14
256	0.19
257	0.27
258	0.31
259	0.36
260	0.38
261	0.45
262	0.48
263	0.53
264	0.57
265	0.56
266	0.59
267	0.57
268	0.56
269	0.55
270	0.51
271	0.44
272	0.37
273	0.3
274	0.26
275	0.23
276	0.2
277	0.12
278	0.11
279	0.1
280	0.09
281	0.08
282	0.05
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.05
293	0.05
294	0.04
295	0.05
296	0.06
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.11
302	0.15
303	0.17
304	0.24
305	0.28
306	0.3
307	0.3
308	0.31
309	0.29
310	0.29
311	0.29
312	0.24
313	0.22
314	0.21
315	0.21
316	0.22
317	0.2
318	0.18
319	0.14
320	0.12
321	0.09
322	0.08
323	0.08
324	0.06
325	0.07
326	0.08
327	0.12
328	0.15
329	0.19
330	0.23
331	0.25
332	0.28
333	0.32
334	0.41
335	0.44
336	0.5
337	0.49
338	0.48
339	0.46
340	0.44
341	0.39
342	0.29
343	0.22
344	0.13
345	0.1
346	0.08
347	0.08
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.08
352	0.1
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.09
358	0.09
359	0.07
360	0.05
361	0.06
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.1
372	0.13
373	0.14
374	0.17
375	0.19
376	0.19
377	0.19
378	0.21
379	0.23
380	0.29
381	0.35
382	0.35
383	0.37
384	0.39
385	0.4
386	0.42
387	0.42
388	0.35
389	0.32
390	0.29
391	0.26
392	0.27
393	0.25
394	0.23
395	0.17
396	0.14
397	0.1
398	0.09
399	0.09
400	0.07
401	0.07
402	0.05
403	0.07
404	0.12
405	0.13
406	0.14
407	0.17
408	0.2
409	0.21
410	0.24
411	0.32
412	0.36
413	0.4
414	0.44
415	0.51
416	0.51
417	0.52
418	0.52
419	0.45
420	0.4
421	0.36
422	0.33
423	0.26
424	0.23
425	0.22
426	0.19
427	0.18
428	0.13
429	0.13
430	0.11
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.09
435	0.09
436	0.1
437	0.11
438	0.11
439	0.11
440	0.1
441	0.09
442	0.09
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.06
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.07
451	0.11
452	0.15
453	0.16
454	0.17
455	0.17
456	0.19
457	0.22
458	0.24
459	0.22
460	0.21
461	0.23
462	0.25
463	0.29
464	0.33
465	0.36
466	0.37
467	0.37
468	0.36
469	0.4
470	0.47
471	0.49
472	0.47
473	0.44
474	0.43
475	0.45
476	0.43
477	0.38
478	0.34
479	0.36
480	0.33
481	0.35
482	0.36
483	0.34
484	0.33
485	0.33
486	0.31
487	0.33
488	0.34
489	0.39
490	0.4
491	0.4
492	0.42
493	0.42
494	0.38
495	0.3
496	0.31
497	0.22
498	0.25
499	0.25
500	0.24
501	0.25
502	0.29
503	0.32
504	0.36
505	0.44
506	0.47
507	0.57
508	0.61
509	0.64
510	0.66
511	0.72
512	0.72
513	0.69
514	0.68
515	0.61
516	0.67
517	0.63
518	0.56
519	0.47
520	0.39
521	0.37
522	0.29
523	0.28
524	0.24
525	0.26
526	0.25
527	0.26
528	0.33
529	0.33
530	0.33
531	0.32
532	0.27
533	0.24
534	0.28
535	0.32
536	0.28
537	0.3
538	0.34
539	0.36
540	0.42
541	0.44
542	0.42
543	0.41
544	0.39
545	0.41
546	0.4

A0A4Z0A119

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer