Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZMH4

Protein Details
Accession A0A4Y9ZMH4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-59KSKSSASSGTRKKHARKAGNGQPEPIPKEKKPKGKDKGKKKEPRKKVYIPPTKPAPVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-48GTRKKHARKAGNGQPEPIPKEKKPKGKDKGKKKEPRKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039795  LTN1/Rkr1  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:1990112  C:RQC complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
GO:0072344  P:rescue of stalled ribosome  
GO:1990116  P:ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Amino Acid Sequences MAKSKSSASSGTRKKHARKAGNGQPEPIPKEKKPKGKDKGKKKEPRKKVYIPPTKPAPVQQDPLDSLGLAHQLPPELLVVLRRFNKKDAVTKTKALEELQAHWVNRVRSDEVLDALALMVPVWLHHLPALFLHRSRRIRMLTGELHASLLKIPHLRDQVLFFLRESASEDQVESILGSWAMAAREADRQLSLPVRESWDRTISLLPSASDQKLALQGSALAALLSFVQRAVLDPAGLYTYLNPVQTSVTQPVSRRVHGRLVPISQIKKDDDASEASQKAEADEENESDRNARFRVGGLGVLHWLLAEAEPIVKLLSTAILRSAFVEPDAQVRTVMWQPLLMFLKSFPRAWELDAAFTPEKDEENESDSEEEDEANHVVETSAPEKQSQAYQEFLRFLQLGASGSPTEGYPTVLIIVSTIPSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.78
3 0.82
4 0.81
5 0.82
6 0.85
7 0.86
8 0.87
9 0.8
10 0.74
11 0.7
12 0.68
13 0.63
14 0.61
15 0.58
16 0.53
17 0.62
18 0.67
19 0.7
20 0.72
21 0.78
22 0.8
23 0.84
24 0.89
25 0.89
26 0.92
27 0.92
28 0.94
29 0.94
30 0.94
31 0.94
32 0.94
33 0.93
34 0.91
35 0.91
36 0.91
37 0.91
38 0.86
39 0.83
40 0.81
41 0.76
42 0.69
43 0.65
44 0.63
45 0.57
46 0.56
47 0.51
48 0.48
49 0.44
50 0.44
51 0.37
52 0.28
53 0.22
54 0.18
55 0.17
56 0.12
57 0.11
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.08
64 0.09
65 0.12
66 0.13
67 0.19
68 0.26
69 0.31
70 0.33
71 0.35
72 0.43
73 0.43
74 0.5
75 0.54
76 0.57
77 0.56
78 0.59
79 0.58
80 0.55
81 0.52
82 0.44
83 0.4
84 0.33
85 0.31
86 0.34
87 0.36
88 0.32
89 0.33
90 0.36
91 0.31
92 0.32
93 0.32
94 0.26
95 0.22
96 0.25
97 0.23
98 0.2
99 0.19
100 0.16
101 0.13
102 0.11
103 0.1
104 0.06
105 0.05
106 0.04
107 0.03
108 0.03
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.11
116 0.16
117 0.14
118 0.16
119 0.21
120 0.29
121 0.32
122 0.35
123 0.4
124 0.38
125 0.39
126 0.4
127 0.41
128 0.35
129 0.34
130 0.33
131 0.26
132 0.24
133 0.21
134 0.18
135 0.12
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.17
141 0.2
142 0.21
143 0.21
144 0.22
145 0.25
146 0.25
147 0.24
148 0.19
149 0.19
150 0.17
151 0.17
152 0.19
153 0.15
154 0.15
155 0.15
156 0.15
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.08
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.17
182 0.18
183 0.19
184 0.2
185 0.2
186 0.19
187 0.18
188 0.19
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.11
193 0.11
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.13
200 0.13
201 0.11
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.04
226 0.07
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.13
234 0.13
235 0.15
236 0.17
237 0.18
238 0.27
239 0.29
240 0.3
241 0.31
242 0.31
243 0.35
244 0.35
245 0.4
246 0.34
247 0.33
248 0.36
249 0.38
250 0.37
251 0.32
252 0.32
253 0.28
254 0.26
255 0.26
256 0.22
257 0.18
258 0.2
259 0.21
260 0.23
261 0.22
262 0.21
263 0.21
264 0.2
265 0.18
266 0.16
267 0.13
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.14
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.12
280 0.13
281 0.16
282 0.15
283 0.17
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.13
289 0.09
290 0.08
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.13
309 0.14
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.11
314 0.15
315 0.17
316 0.15
317 0.14
318 0.14
319 0.16
320 0.18
321 0.19
322 0.15
323 0.15
324 0.15
325 0.21
326 0.24
327 0.21
328 0.18
329 0.17
330 0.25
331 0.26
332 0.27
333 0.21
334 0.23
335 0.24
336 0.25
337 0.31
338 0.25
339 0.26
340 0.25
341 0.3
342 0.26
343 0.25
344 0.25
345 0.19
346 0.19
347 0.18
348 0.2
349 0.16
350 0.2
351 0.21
352 0.2
353 0.2
354 0.2
355 0.19
356 0.16
357 0.14
358 0.11
359 0.12
360 0.11
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.12
367 0.12
368 0.16
369 0.16
370 0.17
371 0.19
372 0.21
373 0.25
374 0.27
375 0.27
376 0.27
377 0.3
378 0.33
379 0.35
380 0.33
381 0.32
382 0.26
383 0.24
384 0.21
385 0.2
386 0.17
387 0.15
388 0.18
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.12
393 0.13
394 0.12
395 0.14
396 0.11
397 0.12
398 0.13
399 0.12
400 0.12
401 0.1
402 0.1