Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZZR5

Protein Details
Accession A0A4Y9ZZR5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
665-687KADSSYRGGKKNRKPWEPPRVKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
324-361TRGKGSRGRGGRGRDRGGRGGRGGRGGRGGGGRNERPS
673-679GKKNRKP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001656  PsdUridine_synth_TruD  
IPR020119  PsdUridine_synth_TruD_CS  
IPR011760  PsdUridine_synth_TruD_insert  
IPR042214  TruD_catalytic  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01142  TruD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50984  TRUD  
PS01268  UPF0024  
CDD cd02576  PseudoU_synth_ScPUS7  
Amino Acid Sequences MQFQAKVEVRVDEVDSDEHKALRIINNITKRWGPGFPARRDKISMSDKRDLEDAIEEPSTKRQKLDEPAGPVASAIAKESAAEPAPSASEGAQPTVVEDVAEEKEENPPSLLPPSHALLGTSPPLRTEDGAMVRIMETDVGISEYIAKDVPKIEGIIKQRFTDFLVYEVDLDSNVIHIKSLDMPESAPKKDKAAEDTPAASEPQTPAVSVAEVASGSTAEPTAEPEIPAPSEPTQPTTSEAAPVTDGAAVSKDAASEPWPEAFTTRLAPFLPEERIAQVKQMYLEGPEPPFVSDAGWGGRAPSKAAGEGDQAKEEPEKPEEEETRGKGSRGRGGRGRDRGGRGGRGGRGGRGGGGRNERPSRGSYPPYIHFTLQKTNRDTQDALAYLSRTLHVSTKDLSTAGTKDKRGVTVQRVALRRGAKTVEDVWKLANGVPSKRSAAEAVSERGDRGIRIADLNYRKAGLELGMLKGNAFVITLRNVQVDSLETVDKAMNSMKEHGFINYYGTLCMQRFGTASIPTHSIGLALLRSQWQLAVSLILRTRPGEHPDVMAAREAWLKDGDLDRALELMPRRVVAERCILESYKKQNGETRNAYGALSTIPRNLRLMYVHAYQSYVWNAIVSERIKTYGAVKPVPGDLVLESDSEKVGEDEMEVDEPEGEDKADKADSSYRGGKKNRKPWEPPRVKTLTAEDVDKYSIFDVVMPLPGKDVAFPGGALGERYREYLRTDGLDPDNFDRKHKEYSLSGSYRKILHLPKELSWSVLRYTDPDVPLAQADEDKLLGYDAPADTPDGRFMALQIRLTVGTAAYATMALREVTKTETSSHFQTGLTQASADQQFKGGAEAPAIMDGEAVEDAAPDAADEAVLVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.23
4 0.23
5 0.21
6 0.2
7 0.21
8 0.23
9 0.25
10 0.3
11 0.32
12 0.39
13 0.47
14 0.48
15 0.51
16 0.5
17 0.48
18 0.45
19 0.41
20 0.39
21 0.42
22 0.5
23 0.54
24 0.63
25 0.63
26 0.63
27 0.64
28 0.61
29 0.6
30 0.61
31 0.6
32 0.58
33 0.63
34 0.59
35 0.57
36 0.56
37 0.47
38 0.38
39 0.33
40 0.25
41 0.2
42 0.2
43 0.19
44 0.19
45 0.28
46 0.33
47 0.31
48 0.32
49 0.33
50 0.4
51 0.48
52 0.56
53 0.53
54 0.53
55 0.56
56 0.54
57 0.5
58 0.41
59 0.33
60 0.25
61 0.19
62 0.13
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.1
76 0.14
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.15
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.18
92 0.2
93 0.2
94 0.18
95 0.18
96 0.19
97 0.24
98 0.24
99 0.2
100 0.21
101 0.22
102 0.23
103 0.23
104 0.21
105 0.17
106 0.2
107 0.22
108 0.21
109 0.19
110 0.18
111 0.2
112 0.21
113 0.21
114 0.2
115 0.21
116 0.22
117 0.24
118 0.23
119 0.21
120 0.2
121 0.19
122 0.17
123 0.1
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.12
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.15
141 0.2
142 0.27
143 0.33
144 0.34
145 0.34
146 0.34
147 0.33
148 0.33
149 0.32
150 0.25
151 0.2
152 0.2
153 0.19
154 0.18
155 0.18
156 0.16
157 0.11
158 0.1
159 0.08
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.08
166 0.11
167 0.13
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.22
172 0.26
173 0.27
174 0.29
175 0.28
176 0.3
177 0.34
178 0.37
179 0.36
180 0.36
181 0.37
182 0.36
183 0.36
184 0.34
185 0.31
186 0.28
187 0.21
188 0.18
189 0.15
190 0.16
191 0.15
192 0.14
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.07
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.11
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.15
217 0.14
218 0.18
219 0.19
220 0.22
221 0.22
222 0.22
223 0.25
224 0.25
225 0.23
226 0.21
227 0.21
228 0.17
229 0.16
230 0.15
231 0.12
232 0.1
233 0.1
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.1
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.13
255 0.14
256 0.15
257 0.17
258 0.18
259 0.16
260 0.16
261 0.17
262 0.2
263 0.19
264 0.2
265 0.18
266 0.17
267 0.16
268 0.16
269 0.14
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.11
279 0.1
280 0.08
281 0.09
282 0.08
283 0.09
284 0.08
285 0.09
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.18
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.16
300 0.18
301 0.18
302 0.17
303 0.15
304 0.15
305 0.16
306 0.21
307 0.22
308 0.25
309 0.28
310 0.27
311 0.31
312 0.31
313 0.29
314 0.28
315 0.29
316 0.32
317 0.31
318 0.34
319 0.33
320 0.4
321 0.47
322 0.5
323 0.52
324 0.51
325 0.5
326 0.52
327 0.5
328 0.45
329 0.4
330 0.38
331 0.34
332 0.34
333 0.32
334 0.25
335 0.24
336 0.21
337 0.2
338 0.18
339 0.19
340 0.17
341 0.22
342 0.23
343 0.28
344 0.3
345 0.29
346 0.29
347 0.31
348 0.31
349 0.31
350 0.32
351 0.3
352 0.33
353 0.35
354 0.38
355 0.37
356 0.32
357 0.31
358 0.31
359 0.35
360 0.37
361 0.4
362 0.39
363 0.42
364 0.43
365 0.42
366 0.4
367 0.32
368 0.3
369 0.24
370 0.21
371 0.17
372 0.16
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.08
377 0.08
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.12
382 0.13
383 0.13
384 0.12
385 0.12
386 0.11
387 0.12
388 0.16
389 0.19
390 0.19
391 0.22
392 0.23
393 0.24
394 0.25
395 0.28
396 0.27
397 0.3
398 0.33
399 0.36
400 0.36
401 0.36
402 0.38
403 0.35
404 0.31
405 0.26
406 0.23
407 0.18
408 0.18
409 0.21
410 0.22
411 0.21
412 0.21
413 0.19
414 0.19
415 0.19
416 0.18
417 0.18
418 0.13
419 0.13
420 0.14
421 0.16
422 0.16
423 0.16
424 0.16
425 0.12
426 0.11
427 0.13
428 0.14
429 0.14
430 0.15
431 0.14
432 0.13
433 0.14
434 0.13
435 0.1
436 0.09
437 0.08
438 0.07
439 0.08
440 0.09
441 0.14
442 0.17
443 0.18
444 0.18
445 0.17
446 0.16
447 0.16
448 0.15
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.07
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.07
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.14
482 0.13
483 0.14
484 0.15
485 0.15
486 0.15
487 0.13
488 0.14
489 0.13
490 0.12
491 0.11
492 0.11
493 0.13
494 0.11
495 0.12
496 0.1
497 0.09
498 0.09
499 0.1
500 0.12
501 0.12
502 0.13
503 0.14
504 0.15
505 0.15
506 0.14
507 0.13
508 0.11
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.05
513 0.06
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.15
529 0.16
530 0.2
531 0.21
532 0.21
533 0.21
534 0.23
535 0.23
536 0.2
537 0.18
538 0.14
539 0.11
540 0.13
541 0.12
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.11
546 0.13
547 0.13
548 0.11
549 0.12
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.11
554 0.1
555 0.12
556 0.12
557 0.12
558 0.13
559 0.16
560 0.17
561 0.17
562 0.23
563 0.21
564 0.23
565 0.24
566 0.24
567 0.24
568 0.28
569 0.32
570 0.32
571 0.33
572 0.33
573 0.37
574 0.42
575 0.48
576 0.47
577 0.44
578 0.39
579 0.38
580 0.36
581 0.3
582 0.25
583 0.18
584 0.15
585 0.12
586 0.14
587 0.14
588 0.15
589 0.17
590 0.17
591 0.17
592 0.16
593 0.19
594 0.19
595 0.21
596 0.21
597 0.2
598 0.2
599 0.19
600 0.2
601 0.18
602 0.15
603 0.12
604 0.11
605 0.1
606 0.1
607 0.15
608 0.13
609 0.13
610 0.13
611 0.14
612 0.15
613 0.15
614 0.19
615 0.18
616 0.22
617 0.22
618 0.22
619 0.22
620 0.22
621 0.22
622 0.18
623 0.14
624 0.1
625 0.11
626 0.11
627 0.09
628 0.1
629 0.09
630 0.09
631 0.09
632 0.09
633 0.07
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.07
639 0.08
640 0.08
641 0.08
642 0.07
643 0.07
644 0.08
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.06
649 0.07
650 0.08
651 0.08
652 0.1
653 0.15
654 0.17
655 0.22
656 0.3
657 0.34
658 0.41
659 0.5
660 0.58
661 0.62
662 0.7
663 0.75
664 0.76
665 0.8
666 0.83
667 0.86
668 0.87
669 0.8
670 0.79
671 0.74
672 0.67
673 0.6
674 0.55
675 0.51
676 0.42
677 0.41
678 0.33
679 0.29
680 0.29
681 0.26
682 0.21
683 0.13
684 0.12
685 0.1
686 0.1
687 0.1
688 0.1
689 0.14
690 0.14
691 0.13
692 0.14
693 0.15
694 0.14
695 0.13
696 0.13
697 0.11
698 0.1
699 0.1
700 0.09
701 0.09
702 0.1
703 0.1
704 0.1
705 0.1
706 0.11
707 0.14
708 0.15
709 0.15
710 0.18
711 0.2
712 0.22
713 0.23
714 0.24
715 0.27
716 0.3
717 0.31
718 0.3
719 0.32
720 0.39
721 0.36
722 0.38
723 0.38
724 0.38
725 0.43
726 0.43
727 0.43
728 0.38
729 0.45
730 0.51
731 0.51
732 0.5
733 0.46
734 0.46
735 0.43
736 0.41
737 0.41
738 0.38
739 0.39
740 0.45
741 0.46
742 0.46
743 0.51
744 0.5
745 0.46
746 0.41
747 0.36
748 0.29
749 0.28
750 0.25
751 0.21
752 0.25
753 0.28
754 0.27
755 0.26
756 0.25
757 0.23
758 0.23
759 0.22
760 0.18
761 0.13
762 0.13
763 0.12
764 0.11
765 0.1
766 0.1
767 0.09
768 0.08
769 0.07
770 0.1
771 0.09
772 0.1
773 0.1
774 0.12
775 0.13
776 0.14
777 0.16
778 0.13
779 0.13
780 0.13
781 0.13
782 0.18
783 0.21
784 0.21
785 0.19
786 0.21
787 0.2
788 0.21
789 0.2
790 0.13
791 0.1
792 0.09
793 0.08
794 0.07
795 0.07
796 0.06
797 0.06
798 0.07
799 0.07
800 0.08
801 0.09
802 0.1
803 0.14
804 0.16
805 0.17
806 0.2
807 0.25
808 0.28
809 0.32
810 0.33
811 0.31
812 0.29
813 0.31
814 0.31
815 0.3
816 0.26
817 0.22
818 0.19
819 0.25
820 0.3
821 0.27
822 0.23
823 0.21
824 0.22
825 0.21
826 0.24
827 0.2
828 0.15
829 0.15
830 0.16
831 0.15
832 0.15
833 0.15
834 0.13
835 0.09
836 0.08
837 0.09
838 0.08
839 0.07
840 0.06
841 0.05
842 0.06
843 0.06
844 0.06
845 0.04
846 0.05
847 0.05
848 0.05