Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y9ZRQ1

Protein Details
Accession A0A4Y9ZRQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-341LPAVAQPKPKARSRKREEDVEDDHydrophilic
343-365EDEQTSRKRKAPAKKAAASKRKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-333KPKARSRK
349-365RKRKAPAKKAAASKRKK
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 11.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009091  RCC1/BLIP-II  
IPR028641  RCC2  
IPR000408  Reg_chr_condens  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PF13540  RCC1_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00626  RCC1_2  
PS50012  RCC1_3  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
Amino Acid Sequences PGTSEQEHVVKAAAGITFSLFLTNTGKVLVKGLQDKKITHISCGQQHSIAIDEQGIIYVWGYNGYCRLGLGNQQDVLTPKVVPQFAGPQDMLMGAMIAAGPSNSVVVDRQGMYWMAGKWKNTGDGSGGQPYSNFRYMQDIMSVACFLSFMTQAEVLLRACKMKFVACGGVTHWALAPDEEDSGVMTVCWGQNAANGELGLGPDEVKSSTKPMRNVPLIGIDVFAIAPGQNTTFFLVHPNEKYSDLPRHPAELDAPDLCVVCNAEHGEDDAPLECEKCDRPYHLGCLSPPLTAVPDGEWFCPECTHNPGAPVGHDEPAPLPAVAQPKPKARSRKREEDVEDDEEDEQTSRKRKAPAKKAAASKRKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.08
8 0.1
9 0.12
10 0.13
11 0.12
12 0.14
13 0.15
14 0.14
15 0.17
16 0.19
17 0.21
18 0.3
19 0.35
20 0.4
21 0.44
22 0.44
23 0.47
24 0.53
25 0.48
26 0.43
27 0.44
28 0.43
29 0.47
30 0.52
31 0.48
32 0.39
33 0.39
34 0.36
35 0.31
36 0.25
37 0.18
38 0.13
39 0.11
40 0.1
41 0.1
42 0.09
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.05
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.12
55 0.11
56 0.17
57 0.21
58 0.23
59 0.23
60 0.23
61 0.25
62 0.25
63 0.25
64 0.2
65 0.16
66 0.15
67 0.19
68 0.19
69 0.18
70 0.18
71 0.23
72 0.24
73 0.28
74 0.25
75 0.2
76 0.2
77 0.19
78 0.17
79 0.09
80 0.08
81 0.03
82 0.04
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.02
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.13
101 0.13
102 0.18
103 0.2
104 0.21
105 0.22
106 0.23
107 0.26
108 0.23
109 0.23
110 0.19
111 0.2
112 0.21
113 0.23
114 0.22
115 0.18
116 0.18
117 0.2
118 0.21
119 0.21
120 0.19
121 0.15
122 0.21
123 0.22
124 0.22
125 0.21
126 0.17
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.08
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.15
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.18
157 0.17
158 0.15
159 0.14
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.06
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.07
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.11
195 0.16
196 0.21
197 0.24
198 0.28
199 0.34
200 0.36
201 0.36
202 0.33
203 0.3
204 0.27
205 0.24
206 0.2
207 0.12
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.05
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.12
222 0.14
223 0.17
224 0.18
225 0.2
226 0.19
227 0.21
228 0.23
229 0.24
230 0.3
231 0.29
232 0.33
233 0.32
234 0.33
235 0.32
236 0.31
237 0.28
238 0.22
239 0.22
240 0.17
241 0.16
242 0.14
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.07
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.1
262 0.12
263 0.16
264 0.18
265 0.2
266 0.27
267 0.3
268 0.36
269 0.37
270 0.37
271 0.33
272 0.38
273 0.35
274 0.29
275 0.26
276 0.2
277 0.19
278 0.17
279 0.17
280 0.11
281 0.15
282 0.17
283 0.17
284 0.17
285 0.17
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.17
290 0.22
291 0.26
292 0.26
293 0.26
294 0.28
295 0.27
296 0.26
297 0.29
298 0.25
299 0.22
300 0.21
301 0.2
302 0.18
303 0.19
304 0.19
305 0.13
306 0.11
307 0.13
308 0.19
309 0.22
310 0.29
311 0.33
312 0.4
313 0.46
314 0.54
315 0.62
316 0.66
317 0.74
318 0.76
319 0.81
320 0.8
321 0.84
322 0.82
323 0.79
324 0.75
325 0.69
326 0.61
327 0.51
328 0.45
329 0.35
330 0.3
331 0.22
332 0.17
333 0.18
334 0.24
335 0.27
336 0.32
337 0.41
338 0.49
339 0.59
340 0.68
341 0.73
342 0.77
343 0.8
344 0.85
345 0.87