FuNGI

A0A4Z0Z5Q0

Protein Details

Accession

A0A4Z0Z5Q0

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
393-415	GDYSMHGKKRVKKGKWGNGVEQF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
303-308	RRKKRK
400-407	KKRVKKGK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRGKWIDKKTAQHFTLVHRPQNDPLIHDTEAPSMILNPTDNRNASKGKKLNDLASELGVDDVAHMRANEGEAATHGVYFDDTEYDYMQHLRDLGSSGGGDAVFVEAKTEQNKGKGKHKQTLEDAIRQLDLEDQERKKHELFDDSFLPNKNLQHVTYQAQQNIPDVIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDEDDIFQELAKDGRELDDIEFENEFDDEGWETDDTAKPRKEYNADAEVPDLVPVDGAAGEETDVVKNDNWLEDFQKFKKNQKTGGRAVAGIAPSQSDMQSSLMTTTTNGGRRKKRKGALTSQSGYSMTSSSLVRTEQLSLLDARFDILEQKQYNPDHDDYDLDGDEDDDAKSTAMSMMSTASSVTGPLRSDFDSILDDFLGDYSMHGKKRVKKGKWGNGVEQFDEFRRELGPAKVPAKYGVKQRTAATATAGGASTSSSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.6
3	0.63
4	0.6
5	0.57
6	0.51
7	0.53
8	0.51
9	0.57
10	0.51
11	0.43
12	0.42
13	0.41
14	0.38
15	0.37
16	0.34
17	0.28
18	0.27
19	0.24
20	0.18
21	0.14
22	0.14
23	0.14
24	0.14
25	0.14
26	0.18
27	0.24
28	0.26
29	0.27
30	0.31
31	0.38
32	0.4
33	0.48
34	0.5
35	0.49
36	0.56
37	0.57
38	0.59
39	0.55
40	0.54
41	0.46
42	0.4
43	0.36
44	0.26
45	0.22
46	0.16
47	0.11
48	0.08
49	0.08
50	0.08
51	0.08
52	0.08
53	0.09
54	0.09
55	0.11
56	0.11
57	0.09
58	0.09
59	0.09
60	0.12
61	0.12
62	0.11
63	0.1
64	0.09
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.07
69	0.07
70	0.08
71	0.09
72	0.1
73	0.11
74	0.12
75	0.11
76	0.11
77	0.11
78	0.1
79	0.1
80	0.12
81	0.11
82	0.11
83	0.1
84	0.09
85	0.1
86	0.09
87	0.08
88	0.06
89	0.07
90	0.06
91	0.06
92	0.07
93	0.06
94	0.09
95	0.11
96	0.15
97	0.16
98	0.23
99	0.3
100	0.34
101	0.43
102	0.5
103	0.56
104	0.6
105	0.63
106	0.63
107	0.61
108	0.67
109	0.62
110	0.59
111	0.53
112	0.47
113	0.41
114	0.34
115	0.29
116	0.22
117	0.19
118	0.16
119	0.22
120	0.22
121	0.27
122	0.3
123	0.33
124	0.31
125	0.34
126	0.33
127	0.34
128	0.35
129	0.35
130	0.37
131	0.35
132	0.37
133	0.34
134	0.33
135	0.27
136	0.25
137	0.26
138	0.23
139	0.23
140	0.23
141	0.25
142	0.26
143	0.3
144	0.33
145	0.3
146	0.29
147	0.29
148	0.27
149	0.24
150	0.21
151	0.14
152	0.11
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.08
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.13
165	0.13
166	0.13
167	0.13
168	0.12
169	0.12
170	0.12
171	0.11
172	0.07
173	0.07
174	0.07
175	0.07
176	0.06
177	0.05
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.05
192	0.06
193	0.07
194	0.08
195	0.08
196	0.11
197	0.11
198	0.12
199	0.12
200	0.11
201	0.1
202	0.09
203	0.08
204	0.05
205	0.05
206	0.04
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.07
212	0.09
213	0.1
214	0.15
215	0.16
216	0.17
217	0.19
218	0.22
219	0.23
220	0.24
221	0.28
222	0.29
223	0.29
224	0.28
225	0.27
226	0.24
227	0.21
228	0.18
229	0.12
230	0.06
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.09
250	0.11
251	0.13
252	0.17
253	0.19
254	0.26
255	0.28
256	0.36
257	0.44
258	0.46
259	0.52
260	0.57
261	0.63
262	0.6
263	0.64
264	0.57
265	0.48
266	0.44
267	0.38
268	0.29
269	0.21
270	0.16
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.08
275	0.06
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.09
285	0.12
286	0.18
287	0.24
288	0.31
289	0.41
290	0.5
291	0.59
292	0.66
293	0.69
294	0.72
295	0.75
296	0.78
297	0.77
298	0.77
299	0.7
300	0.61
301	0.56
302	0.47
303	0.38
304	0.28
305	0.2
306	0.11
307	0.11
308	0.1
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.11
313	0.11
314	0.13
315	0.12
316	0.13
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.13
321	0.11
322	0.1
323	0.08
324	0.08
325	0.1
326	0.11
327	0.18
328	0.18
329	0.21
330	0.27
331	0.28
332	0.32
333	0.33
334	0.33
335	0.29
336	0.28
337	0.28
338	0.22
339	0.24
340	0.2
341	0.15
342	0.14
343	0.11
344	0.11
345	0.1
346	0.09
347	0.06
348	0.07
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.06
362	0.07
363	0.08
364	0.09
365	0.11
366	0.12
367	0.15
368	0.15
369	0.17
370	0.17
371	0.17
372	0.18
373	0.17
374	0.17
375	0.14
376	0.12
377	0.11
378	0.1
379	0.1
380	0.07
381	0.07
382	0.11
383	0.16
384	0.18
385	0.24
386	0.31
387	0.39
388	0.5
389	0.61
390	0.62
391	0.68
392	0.77
393	0.82
394	0.85
395	0.83
396	0.81
397	0.8
398	0.78
399	0.69
400	0.6
401	0.52
402	0.43
403	0.41
404	0.32
405	0.24
406	0.21
407	0.21
408	0.22
409	0.25
410	0.3
411	0.33
412	0.36
413	0.38
414	0.39
415	0.43
416	0.46
417	0.46
418	0.49
419	0.51
420	0.53
421	0.54
422	0.55
423	0.57
424	0.53
425	0.49
426	0.42
427	0.36
428	0.3
429	0.28
430	0.26
431	0.17
432	0.14

A0A4Z0Z5Q0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer