Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z0Z8M9

Protein Details
Accession A0A4Z0Z8M9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
267-290VDQDRRSNSSQSRSRRRRSRSDSRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-153RRKLRRRGRAG
279-287RSRRRRSRS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MPSDTHRADERRFLDERGSGASLAPNGLNPATIMEKAVRERIIDSYFWKEQCFGVNEADIVDRVVDHVSFIAGTYGDNQKPSPFLCLAFKLLQLGPGDAVLREYLSYGGDRFKYLRALAVFYVRLTRKAEHVFKTLEPFLEDRRKLRRRGRAGAKVTFVDDFVDELLTKDRVCATSLWQMPKREILEDLDLLEPRVSPLGDIEDLLDEDLDDVNGGDAENGDVDVDVDGEEGEIEDERRDRSSSPDYSEKSRPSSRGRSSSRDRMSVDQDRRSNSSQSRSRRRRSRSDSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.38
3 0.36
4 0.32
5 0.3
6 0.24
7 0.22
8 0.23
9 0.19
10 0.17
11 0.16
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.09
17 0.11
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.17
23 0.19
24 0.24
25 0.23
26 0.21
27 0.23
28 0.26
29 0.27
30 0.24
31 0.25
32 0.28
33 0.32
34 0.32
35 0.31
36 0.27
37 0.26
38 0.3
39 0.3
40 0.25
41 0.22
42 0.22
43 0.21
44 0.21
45 0.2
46 0.14
47 0.11
48 0.09
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.08
62 0.14
63 0.14
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.18
68 0.19
69 0.2
70 0.15
71 0.16
72 0.18
73 0.2
74 0.23
75 0.22
76 0.22
77 0.2
78 0.19
79 0.2
80 0.18
81 0.16
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.09
86 0.09
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.05
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.15
101 0.14
102 0.17
103 0.15
104 0.16
105 0.16
106 0.17
107 0.16
108 0.14
109 0.2
110 0.16
111 0.18
112 0.19
113 0.19
114 0.21
115 0.27
116 0.32
117 0.3
118 0.33
119 0.32
120 0.31
121 0.34
122 0.3
123 0.24
124 0.2
125 0.18
126 0.2
127 0.25
128 0.26
129 0.25
130 0.35
131 0.4
132 0.47
133 0.54
134 0.58
135 0.58
136 0.67
137 0.73
138 0.72
139 0.72
140 0.67
141 0.61
142 0.52
143 0.45
144 0.36
145 0.26
146 0.17
147 0.12
148 0.08
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.12
162 0.2
163 0.24
164 0.3
165 0.33
166 0.34
167 0.34
168 0.38
169 0.35
170 0.29
171 0.26
172 0.22
173 0.2
174 0.2
175 0.2
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.13
180 0.11
181 0.08
182 0.09
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.07
223 0.08
224 0.1
225 0.12
226 0.13
227 0.14
228 0.2
229 0.27
230 0.3
231 0.35
232 0.42
233 0.43
234 0.48
235 0.55
236 0.53
237 0.52
238 0.54
239 0.54
240 0.55
241 0.62
242 0.64
243 0.67
244 0.69
245 0.71
246 0.74
247 0.78
248 0.75
249 0.71
250 0.66
251 0.62
252 0.64
253 0.65
254 0.64
255 0.62
256 0.61
257 0.6
258 0.62
259 0.6
260 0.59
261 0.55
262 0.58
263 0.58
264 0.64
265 0.7
266 0.75
267 0.82
268 0.84
269 0.87
270 0.88