Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z0YXV1

Protein Details
Accession A0A4Z0YXV1    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
378-409VMSQRKTKGKGTKQPPKTKRKKKAGTEANPILHydrophilic
663-688RPTTSDNPSPKRPRGRPKKSETASIAHydrophilic
691-715GSSTSISSPKRPRGRPRKSSATSIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
318-327KSKAPAPRKK
382-401RKTKGKGTKQPPKTKRKKKA
672-681PKRPRGRPKK
699-708PKRPRGRPRK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MSSPDAFMSSPPRPRTFDPTSISSSSPYLPSLDEIFLKKSPRKPSLRAGNHAATLPANARTTFTSAANVLRETPEIDIDTETVTRSPSHRVKTTTTSRRRVASKSDTLANDRGLNPLAVVMESLSPKDKPWQKFESKPSVQSGDESLISKSLKALGSRKRLGKTIEKVSRHFTTREEDLHLENSTDQEKEKVGTEEPVGAALASTELEPAIPRRGDWTPPRVNKPIVLDSDSDARELFSSVGKEPVSKDVFQTLYSQYGRQDVDLTPELFPQTQADFLRKRKRIEMISTGQERGSEQPMEKSPLKESQRPKEQQNQAKSKAPAPRKKTRTITELATAPFAVPLASDIEIAGPATGESMLDYFDSDGAVKALVEHQTAVMSQRKTKGKGTKQPPKTKRKKKAGTEANPILLSPSSALKQSSNQDFVFGTSSQLVREESPTTLRDLEAAIRASNSLKSDPFDDDLGQRLWHAGARDEEGELIGMGVIDLQHSPAIMTEPNVAATPGGRSFVDIDDILDSPKPASSPPNAPSGSLRTNSHFFQSQNMNQNSSDKSLKSGGSATATNVDPRPNYELFTDAQLGKQITSYGFKTVKKRTAMIALLDQCWTSKHQGASAGSIQPLSTSTRSPVLVQQESAGGVPNKASAKPHGRDRPTKDDDTMTSVTRPTTSDNPSPKRPRGRPKKSETASIATAGSSTSISSPKRPRGRPRKSSATSIEIPDSETGTPSPVSSPDPVFSSPPPLDLTTSDEGDMSLTLSPTDQQAELFRHITKAVTSAPRSQNPSNPSWYEKMLLYDPIILEDLASWLNGGELTRLGYDGEVSPFDVKKWCESKSVICLWRQNIKGKERKRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.59
3 0.59
4 0.61
5 0.58
6 0.57
7 0.58
8 0.56
9 0.52
10 0.45
11 0.39
12 0.33
13 0.29
14 0.24
15 0.19
16 0.18
17 0.19
18 0.2
19 0.2
20 0.22
21 0.22
22 0.26
23 0.28
24 0.34
25 0.38
26 0.43
27 0.51
28 0.57
29 0.63
30 0.65
31 0.72
32 0.77
33 0.79
34 0.78
35 0.76
36 0.71
37 0.64
38 0.58
39 0.49
40 0.38
41 0.32
42 0.27
43 0.23
44 0.2
45 0.19
46 0.2
47 0.21
48 0.24
49 0.24
50 0.22
51 0.21
52 0.21
53 0.24
54 0.25
55 0.23
56 0.21
57 0.2
58 0.21
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.14
73 0.23
74 0.29
75 0.35
76 0.41
77 0.45
78 0.5
79 0.57
80 0.66
81 0.68
82 0.7
83 0.72
84 0.7
85 0.73
86 0.72
87 0.67
88 0.66
89 0.64
90 0.62
91 0.58
92 0.6
93 0.56
94 0.56
95 0.54
96 0.48
97 0.43
98 0.35
99 0.33
100 0.28
101 0.24
102 0.19
103 0.17
104 0.15
105 0.1
106 0.1
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.24
115 0.31
116 0.34
117 0.41
118 0.49
119 0.55
120 0.64
121 0.71
122 0.73
123 0.69
124 0.69
125 0.66
126 0.61
127 0.53
128 0.46
129 0.4
130 0.32
131 0.29
132 0.25
133 0.2
134 0.19
135 0.19
136 0.17
137 0.15
138 0.17
139 0.18
140 0.21
141 0.29
142 0.34
143 0.43
144 0.5
145 0.56
146 0.54
147 0.57
148 0.58
149 0.6
150 0.59
151 0.6
152 0.62
153 0.6
154 0.6
155 0.62
156 0.61
157 0.55
158 0.49
159 0.41
160 0.38
161 0.38
162 0.38
163 0.36
164 0.32
165 0.31
166 0.32
167 0.3
168 0.25
169 0.2
170 0.2
171 0.17
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.17
184 0.16
185 0.14
186 0.11
187 0.1
188 0.07
189 0.06
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.07
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.17
201 0.19
202 0.26
203 0.32
204 0.39
205 0.44
206 0.51
207 0.58
208 0.58
209 0.58
210 0.54
211 0.54
212 0.5
213 0.44
214 0.39
215 0.33
216 0.3
217 0.34
218 0.31
219 0.25
220 0.19
221 0.16
222 0.14
223 0.14
224 0.13
225 0.09
226 0.11
227 0.11
228 0.15
229 0.14
230 0.15
231 0.16
232 0.23
233 0.24
234 0.22
235 0.23
236 0.24
237 0.25
238 0.24
239 0.26
240 0.2
241 0.23
242 0.23
243 0.23
244 0.19
245 0.23
246 0.22
247 0.2
248 0.21
249 0.15
250 0.2
251 0.22
252 0.22
253 0.18
254 0.19
255 0.19
256 0.17
257 0.17
258 0.13
259 0.11
260 0.13
261 0.14
262 0.19
263 0.23
264 0.32
265 0.42
266 0.45
267 0.48
268 0.49
269 0.55
270 0.55
271 0.56
272 0.56
273 0.51
274 0.53
275 0.53
276 0.48
277 0.41
278 0.36
279 0.3
280 0.24
281 0.22
282 0.17
283 0.15
284 0.18
285 0.2
286 0.26
287 0.27
288 0.26
289 0.26
290 0.33
291 0.37
292 0.4
293 0.46
294 0.5
295 0.58
296 0.6
297 0.63
298 0.65
299 0.69
300 0.7
301 0.72
302 0.71
303 0.65
304 0.68
305 0.64
306 0.59
307 0.58
308 0.6
309 0.58
310 0.58
311 0.64
312 0.62
313 0.69
314 0.71
315 0.68
316 0.64
317 0.59
318 0.54
319 0.47
320 0.45
321 0.36
322 0.29
323 0.24
324 0.18
325 0.15
326 0.12
327 0.08
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.1
365 0.14
366 0.14
367 0.16
368 0.23
369 0.27
370 0.3
371 0.37
372 0.44
373 0.47
374 0.56
375 0.64
376 0.67
377 0.73
378 0.81
379 0.84
380 0.85
381 0.87
382 0.89
383 0.89
384 0.9
385 0.9
386 0.87
387 0.88
388 0.88
389 0.84
390 0.82
391 0.74
392 0.65
393 0.55
394 0.46
395 0.36
396 0.25
397 0.18
398 0.09
399 0.08
400 0.06
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.12
405 0.16
406 0.19
407 0.21
408 0.21
409 0.21
410 0.2
411 0.2
412 0.19
413 0.15
414 0.12
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.1
419 0.1
420 0.08
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.12
425 0.12
426 0.13
427 0.13
428 0.12
429 0.11
430 0.1
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.09
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.11
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.12
444 0.13
445 0.14
446 0.13
447 0.13
448 0.12
449 0.14
450 0.14
451 0.12
452 0.11
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.09
464 0.09
465 0.06
466 0.05
467 0.03
468 0.03
469 0.02
470 0.02
471 0.02
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.05
480 0.05
481 0.06
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.07
488 0.07
489 0.08
490 0.06
491 0.08
492 0.07
493 0.07
494 0.09
495 0.09
496 0.11
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.1
502 0.08
503 0.08
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.1
509 0.13
510 0.19
511 0.21
512 0.28
513 0.28
514 0.28
515 0.29
516 0.31
517 0.31
518 0.28
519 0.27
520 0.24
521 0.26
522 0.26
523 0.27
524 0.25
525 0.21
526 0.24
527 0.29
528 0.31
529 0.38
530 0.39
531 0.38
532 0.35
533 0.38
534 0.35
535 0.32
536 0.28
537 0.19
538 0.21
539 0.22
540 0.21
541 0.19
542 0.19
543 0.17
544 0.17
545 0.17
546 0.15
547 0.15
548 0.15
549 0.16
550 0.16
551 0.17
552 0.14
553 0.16
554 0.21
555 0.18
556 0.19
557 0.18
558 0.18
559 0.17
560 0.19
561 0.2
562 0.15
563 0.14
564 0.16
565 0.16
566 0.14
567 0.14
568 0.12
569 0.11
570 0.14
571 0.14
572 0.17
573 0.22
574 0.26
575 0.33
576 0.4
577 0.46
578 0.45
579 0.46
580 0.43
581 0.45
582 0.43
583 0.38
584 0.37
585 0.32
586 0.3
587 0.29
588 0.26
589 0.19
590 0.18
591 0.18
592 0.15
593 0.17
594 0.17
595 0.19
596 0.24
597 0.25
598 0.28
599 0.29
600 0.27
601 0.23
602 0.22
603 0.2
604 0.15
605 0.15
606 0.14
607 0.12
608 0.12
609 0.13
610 0.16
611 0.17
612 0.19
613 0.22
614 0.26
615 0.26
616 0.25
617 0.24
618 0.22
619 0.22
620 0.2
621 0.19
622 0.12
623 0.11
624 0.11
625 0.14
626 0.15
627 0.15
628 0.17
629 0.21
630 0.3
631 0.34
632 0.44
633 0.5
634 0.56
635 0.64
636 0.7
637 0.73
638 0.71
639 0.69
640 0.62
641 0.56
642 0.5
643 0.48
644 0.42
645 0.33
646 0.27
647 0.25
648 0.23
649 0.2
650 0.2
651 0.18
652 0.22
653 0.27
654 0.34
655 0.42
656 0.48
657 0.57
658 0.65
659 0.69
660 0.73
661 0.77
662 0.8
663 0.82
664 0.86
665 0.87
666 0.87
667 0.9
668 0.82
669 0.82
670 0.76
671 0.7
672 0.6
673 0.51
674 0.42
675 0.31
676 0.28
677 0.19
678 0.14
679 0.09
680 0.07
681 0.08
682 0.13
683 0.15
684 0.23
685 0.31
686 0.41
687 0.5
688 0.59
689 0.68
690 0.74
691 0.84
692 0.86
693 0.87
694 0.88
695 0.83
696 0.83
697 0.77
698 0.73
699 0.66
700 0.58
701 0.52
702 0.41
703 0.38
704 0.3
705 0.27
706 0.19
707 0.17
708 0.14
709 0.13
710 0.13
711 0.12
712 0.12
713 0.12
714 0.15
715 0.17
716 0.19
717 0.19
718 0.22
719 0.23
720 0.24
721 0.24
722 0.28
723 0.25
724 0.25
725 0.26
726 0.24
727 0.24
728 0.22
729 0.28
730 0.23
731 0.24
732 0.22
733 0.19
734 0.18
735 0.17
736 0.16
737 0.1
738 0.08
739 0.07
740 0.07
741 0.08
742 0.08
743 0.09
744 0.11
745 0.11
746 0.11
747 0.15
748 0.2
749 0.23
750 0.25
751 0.24
752 0.24
753 0.24
754 0.24
755 0.2
756 0.19
757 0.22
758 0.28
759 0.31
760 0.38
761 0.46
762 0.51
763 0.57
764 0.58
765 0.59
766 0.57
767 0.58
768 0.56
769 0.52
770 0.51
771 0.48
772 0.46
773 0.41
774 0.37
775 0.36
776 0.31
777 0.3
778 0.25
779 0.25
780 0.23
781 0.22
782 0.21
783 0.17
784 0.14
785 0.12
786 0.12
787 0.09
788 0.09
789 0.07
790 0.06
791 0.06
792 0.07
793 0.07
794 0.07
795 0.07
796 0.09
797 0.09
798 0.1
799 0.1
800 0.09
801 0.11
802 0.12
803 0.14
804 0.13
805 0.14
806 0.18
807 0.18
808 0.2
809 0.24
810 0.24
811 0.3
812 0.35
813 0.36
814 0.38
815 0.42
816 0.47
817 0.5
818 0.57
819 0.53
820 0.54
821 0.59
822 0.58
823 0.63
824 0.62
825 0.63
826 0.62
827 0.67
828 0.71