Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z0YU40

Protein Details
Accession A0A4Z0YU40    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
384-403REKVRAEKRREEERKLRQSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-245MEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVLRSPPR
346-352AGASKRR
384-401REKVRAEKRREEERKLRQ
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MAASLAAALPRPRYTGEEEEVPVHAQHRGPRILGPGQIDESQIVLRRSAPPSYGQRAGWRPRGEEDFGDGGAFPEIPVAQYPLGMGKKGSDTSNALAIQVDAEGKVKYDAIASQGHAEGRIIHASFKDLIPLRQRADAGEISLARPSEDQVAETAEKTKAALASLVGSAVAAQKPKNLNTNAKREATYVRYTPANQMGDNSKKQDRIMKIVERQKDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVLRSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGFTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFSEALFMADRHAREEVRQRALMQQRLAEKEKAQKEDSLRMLAQKAREERAGASKRRSSRDSGDSRSRSRSYSYSDSGSESDGSEIREREKVRAEKRREEERKLRQSRMGTERRIQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTAQAESMYDSRLFNQSSGFDSGINEDNPYDKPLFAAQDAINSIYRPTQNMEDLDDEAAGDREMAKIQKTSRFGEALGRGTFKGTADAEAREGPVQFERDNAGNDPFQMDKFMAEVDQSSSSKRGFGLQDGESSEPKRVRIEEDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.37
4 0.39
5 0.39
6 0.39
7 0.38
8 0.36
9 0.29
10 0.24
11 0.23
12 0.21
13 0.25
14 0.3
15 0.32
16 0.32
17 0.34
18 0.39
19 0.39
20 0.4
21 0.38
22 0.33
23 0.33
24 0.33
25 0.31
26 0.25
27 0.22
28 0.21
29 0.22
30 0.2
31 0.17
32 0.19
33 0.24
34 0.27
35 0.28
36 0.28
37 0.31
38 0.38
39 0.44
40 0.46
41 0.42
42 0.47
43 0.54
44 0.6
45 0.61
46 0.57
47 0.53
48 0.54
49 0.58
50 0.52
51 0.45
52 0.42
53 0.35
54 0.31
55 0.29
56 0.23
57 0.18
58 0.15
59 0.14
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.15
70 0.17
71 0.16
72 0.16
73 0.15
74 0.19
75 0.21
76 0.22
77 0.2
78 0.22
79 0.23
80 0.28
81 0.26
82 0.23
83 0.21
84 0.19
85 0.16
86 0.13
87 0.12
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.11
98 0.13
99 0.14
100 0.15
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.13
106 0.12
107 0.15
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.15
112 0.17
113 0.16
114 0.2
115 0.18
116 0.23
117 0.28
118 0.33
119 0.32
120 0.34
121 0.35
122 0.29
123 0.32
124 0.28
125 0.22
126 0.21
127 0.19
128 0.16
129 0.18
130 0.17
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.16
139 0.16
140 0.17
141 0.18
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.14
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.14
161 0.18
162 0.21
163 0.28
164 0.31
165 0.4
166 0.46
167 0.55
168 0.56
169 0.55
170 0.53
171 0.48
172 0.47
173 0.42
174 0.39
175 0.3
176 0.27
177 0.27
178 0.27
179 0.29
180 0.32
181 0.28
182 0.24
183 0.25
184 0.29
185 0.33
186 0.35
187 0.35
188 0.32
189 0.32
190 0.34
191 0.39
192 0.35
193 0.36
194 0.4
195 0.42
196 0.47
197 0.52
198 0.56
199 0.52
200 0.51
201 0.46
202 0.44
203 0.41
204 0.43
205 0.44
206 0.42
207 0.42
208 0.51
209 0.56
210 0.53
211 0.6
212 0.6
213 0.63
214 0.69
215 0.77
216 0.75
217 0.77
218 0.79
219 0.78
220 0.76
221 0.72
222 0.66
223 0.58
224 0.53
225 0.49
226 0.51
227 0.52
228 0.53
229 0.52
230 0.55
231 0.56
232 0.53
233 0.51
234 0.5
235 0.49
236 0.46
237 0.42
238 0.37
239 0.35
240 0.34
241 0.32
242 0.28
243 0.21
244 0.16
245 0.18
246 0.19
247 0.28
248 0.3
249 0.38
250 0.42
251 0.48
252 0.52
253 0.49
254 0.49
255 0.42
256 0.41
257 0.35
258 0.39
259 0.34
260 0.35
261 0.37
262 0.34
263 0.3
264 0.3
265 0.29
266 0.19
267 0.18
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.15
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.13
281 0.11
282 0.12
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.08
291 0.1
292 0.1
293 0.09
294 0.11
295 0.11
296 0.13
297 0.22
298 0.26
299 0.28
300 0.29
301 0.28
302 0.34
303 0.4
304 0.41
305 0.34
306 0.31
307 0.31
308 0.35
309 0.37
310 0.31
311 0.28
312 0.33
313 0.37
314 0.38
315 0.35
316 0.35
317 0.35
318 0.4
319 0.39
320 0.34
321 0.29
322 0.27
323 0.28
324 0.26
325 0.26
326 0.24
327 0.25
328 0.24
329 0.24
330 0.24
331 0.23
332 0.31
333 0.35
334 0.34
335 0.37
336 0.41
337 0.46
338 0.5
339 0.51
340 0.46
341 0.45
342 0.5
343 0.51
344 0.52
345 0.56
346 0.56
347 0.57
348 0.59
349 0.54
350 0.46
351 0.42
352 0.39
353 0.35
354 0.37
355 0.36
356 0.32
357 0.31
358 0.32
359 0.29
360 0.27
361 0.21
362 0.15
363 0.13
364 0.12
365 0.13
366 0.14
367 0.14
368 0.15
369 0.19
370 0.2
371 0.22
372 0.3
373 0.36
374 0.43
375 0.52
376 0.58
377 0.62
378 0.68
379 0.76
380 0.74
381 0.75
382 0.75
383 0.76
384 0.8
385 0.77
386 0.75
387 0.69
388 0.67
389 0.66
390 0.66
391 0.64
392 0.57
393 0.57
394 0.58
395 0.55
396 0.52
397 0.44
398 0.38
399 0.39
400 0.43
401 0.42
402 0.41
403 0.38
404 0.42
405 0.44
406 0.42
407 0.33
408 0.27
409 0.23
410 0.19
411 0.19
412 0.16
413 0.14
414 0.12
415 0.13
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.09
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.14
425 0.14
426 0.16
427 0.17
428 0.16
429 0.18
430 0.22
431 0.21
432 0.16
433 0.17
434 0.16
435 0.19
436 0.21
437 0.2
438 0.16
439 0.15
440 0.18
441 0.2
442 0.19
443 0.16
444 0.13
445 0.15
446 0.15
447 0.18
448 0.17
449 0.13
450 0.14
451 0.16
452 0.18
453 0.16
454 0.2
455 0.17
456 0.19
457 0.2
458 0.21
459 0.19
460 0.17
461 0.17
462 0.18
463 0.19
464 0.17
465 0.19
466 0.21
467 0.24
468 0.25
469 0.27
470 0.24
471 0.25
472 0.24
473 0.2
474 0.16
475 0.13
476 0.12
477 0.09
478 0.07
479 0.06
480 0.06
481 0.09
482 0.11
483 0.12
484 0.17
485 0.21
486 0.28
487 0.32
488 0.35
489 0.37
490 0.37
491 0.35
492 0.39
493 0.39
494 0.37
495 0.35
496 0.34
497 0.29
498 0.29
499 0.3
500 0.22
501 0.22
502 0.17
503 0.19
504 0.19
505 0.2
506 0.21
507 0.22
508 0.23
509 0.2
510 0.19
511 0.18
512 0.19
513 0.21
514 0.19
515 0.19
516 0.21
517 0.23
518 0.25
519 0.26
520 0.25
521 0.23
522 0.24
523 0.25
524 0.23
525 0.2
526 0.2
527 0.17
528 0.14
529 0.14
530 0.14
531 0.11
532 0.11
533 0.12
534 0.12
535 0.17
536 0.17
537 0.19
538 0.22
539 0.22
540 0.23
541 0.22
542 0.26
543 0.23
544 0.28
545 0.31
546 0.29
547 0.33
548 0.35
549 0.37
550 0.34
551 0.33
552 0.35
553 0.32
554 0.33
555 0.34
556 0.33
557 0.36