Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z0YWL4

Protein Details
Accession A0A4Z0YWL4    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-75VTPDTMAKKEKKSQKPSKSSKPSKQQSDAVVHydrophilic
450-478LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-66KKEKKSQKPSKSSKP
113-128RKHRATKAWKGHGAGK
264-265KK
456-469KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10.833, mito 6.5, cyto_mito 5.666, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSKSSKPLSNTVTSSASSASSASPGPPAWLFSNNSSSTPSAQVAVTPDTMAKKEKKSQKPSKSSKPSKQQSDAVVKRSTSPASTAQNPPPQLMDLVESFLSDQGFDDAHREFRKHRATKAWKGHGAGKGGNKEHHSLVSVFQTWETLPSATAPITKISSSDDRSSSSDSDSSSSDESSDDDDVAMADAPAAQSSSSESSSSDSSSESESDSDSDEEEATASKPPASAVIPTTKSLKRKANSDSESSSSDSDSDTTGSNSKEDKKKPEAKKLKTDDSSDASSSSNSSSDSDSDSEDEEAKPKITKIVESDSDSSSESDSDDSSSSSESESDSEDEVKVAAKIALPESDADSSSESESESEKAKQKIKIEGKTGISAGSESSATLEKASPEYAPLPPDPITFKANNRGNGSALKKTQNQPFSRISKDVQVDPRLSSNAYVTHGYGEQAHRDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYKGGPLDVHTSRSFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.31
3 0.25
4 0.19
5 0.17
6 0.13
7 0.12
8 0.13
9 0.12
10 0.14
11 0.13
12 0.16
13 0.16
14 0.19
15 0.19
16 0.24
17 0.26
18 0.28
19 0.35
20 0.33
21 0.34
22 0.34
23 0.33
24 0.3
25 0.3
26 0.27
27 0.21
28 0.19
29 0.2
30 0.2
31 0.21
32 0.19
33 0.16
34 0.18
35 0.19
36 0.21
37 0.26
38 0.29
39 0.34
40 0.43
41 0.53
42 0.61
43 0.69
44 0.78
45 0.83
46 0.87
47 0.9
48 0.92
49 0.93
50 0.93
51 0.92
52 0.92
53 0.91
54 0.89
55 0.86
56 0.81
57 0.78
58 0.78
59 0.74
60 0.68
61 0.63
62 0.53
63 0.49
64 0.48
65 0.41
66 0.31
67 0.29
68 0.3
69 0.31
70 0.36
71 0.4
72 0.43
73 0.48
74 0.48
75 0.45
76 0.4
77 0.35
78 0.3
79 0.25
80 0.2
81 0.14
82 0.15
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.12
87 0.11
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.08
93 0.1
94 0.1
95 0.16
96 0.18
97 0.2
98 0.21
99 0.31
100 0.41
101 0.43
102 0.48
103 0.53
104 0.61
105 0.69
106 0.77
107 0.76
108 0.7
109 0.68
110 0.69
111 0.63
112 0.57
113 0.51
114 0.46
115 0.44
116 0.42
117 0.43
118 0.38
119 0.36
120 0.34
121 0.31
122 0.27
123 0.21
124 0.21
125 0.21
126 0.2
127 0.18
128 0.16
129 0.16
130 0.14
131 0.15
132 0.14
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.12
144 0.15
145 0.19
146 0.22
147 0.24
148 0.24
149 0.25
150 0.27
151 0.3
152 0.26
153 0.23
154 0.21
155 0.18
156 0.18
157 0.17
158 0.16
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.05
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.15
216 0.16
217 0.17
218 0.22
219 0.23
220 0.27
221 0.32
222 0.37
223 0.34
224 0.38
225 0.43
226 0.48
227 0.47
228 0.47
229 0.43
230 0.38
231 0.38
232 0.33
233 0.28
234 0.19
235 0.16
236 0.13
237 0.11
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.13
246 0.19
247 0.26
248 0.29
249 0.36
250 0.42
251 0.52
252 0.58
253 0.67
254 0.7
255 0.69
256 0.76
257 0.75
258 0.74
259 0.68
260 0.64
261 0.57
262 0.5
263 0.46
264 0.36
265 0.31
266 0.23
267 0.19
268 0.16
269 0.13
270 0.1
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.11
288 0.15
289 0.14
290 0.16
291 0.17
292 0.22
293 0.24
294 0.27
295 0.3
296 0.26
297 0.26
298 0.25
299 0.22
300 0.17
301 0.14
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.11
344 0.12
345 0.16
346 0.22
347 0.28
348 0.33
349 0.37
350 0.4
351 0.49
352 0.56
353 0.57
354 0.56
355 0.57
356 0.54
357 0.51
358 0.47
359 0.37
360 0.28
361 0.22
362 0.17
363 0.12
364 0.09
365 0.07
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.12
373 0.13
374 0.12
375 0.13
376 0.15
377 0.16
378 0.18
379 0.18
380 0.19
381 0.19
382 0.21
383 0.22
384 0.23
385 0.26
386 0.27
387 0.3
388 0.37
389 0.42
390 0.47
391 0.47
392 0.46
393 0.43
394 0.47
395 0.47
396 0.44
397 0.43
398 0.43
399 0.46
400 0.51
401 0.58
402 0.6
403 0.58
404 0.57
405 0.61
406 0.61
407 0.59
408 0.56
409 0.5
410 0.49
411 0.49
412 0.5
413 0.5
414 0.49
415 0.46
416 0.44
417 0.45
418 0.39
419 0.36
420 0.3
421 0.24
422 0.22
423 0.22
424 0.22
425 0.19
426 0.19
427 0.19
428 0.19
429 0.21
430 0.21
431 0.22
432 0.22
433 0.21
434 0.19
435 0.19
436 0.2
437 0.21
438 0.26
439 0.24
440 0.25
441 0.3
442 0.33
443 0.4
444 0.43
445 0.48
446 0.51
447 0.61
448 0.69
449 0.75
450 0.82
451 0.84
452 0.9
453 0.91
454 0.9
455 0.9
456 0.89
457 0.89
458 0.89
459 0.86
460 0.76
461 0.68
462 0.66
463 0.57
464 0.53
465 0.45
466 0.39
467 0.33