FuNGI

A0A4Z0YXU0

Protein Details

Accession

A0A4Z0YXU0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
980-999	DAWIQNQKEKPAKRTKKRVL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
989-997	KPAKRTKKR

Subcellular Location(s)

cyto 12, cyto_nucl 12, nucl 10, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR035698 RNAP_III_Rpc1_C IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0043229 C:intracellular organelle GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02736 RNAP_III_Rpc1_C

Amino Acid Sequences

MMDGVTHLDLPPPAILAPKRLWTGKQVFSMLMRPNKSTQVKVNLDAKCREYVDPPPAPPGHRKRAPDMCPNDGWLVVRNSEVMCGRMDKSTVGSGKKDSIFYVILRDYGPDEAVTAMNRLAKLCARMLTNRGFSIGIGDVFPTAALTAAKNKLVEDAYIESDNFITQFNENKLQKATGCSMEETLEAKISGVLSKVRQNAGELCISSLSRNNAPLVMASSGSKGSNINVAQMIAAVGQQIIAGSRVADGFQDRTLPHFHKNTRHALAKGFVRNSFYTGLVPTEFLFHAISGREGLVDTAVKTAETGYMSRRLMKSLEDLSTKYDDTVRTSGDGVVQFQFGADKLDPVDMEGKAVPVNFERTFSHAENLTWNNADRALLPFEILALCDSMLKKERDRYRRRGLLHGEPLMYNDTTDYGVDEHESGRNFLETIYNHVRSLAERFTNLRVAAGLDGMLSTPDTHPFPLTSNEREVLATLIFDVEQARVKQLARLNAADGHRRTRKSARTKPEVNKFMYEDLLNLKPVLEELDFQRPPKAKTIIEKREFAKLLELNARLDKLELDYLARLACKIESQECGQVSKIASERAAKVSEKTLKYFIGLCLEKYSKAHVEPGHAVGAVGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVAGMSITQGVPRIKEIINASKSISTPVISCPLQNPRSLEAAKIVRARIEKTYVEDVLRYVDDEWQPHRSFITLHINTETLESMHLGIKLDDIVNAIAKQKKLKIQKGDMQVFEQDASIEITVRALDIDPSTKRTTRTKTVAEAMADLSVRISQLRRVLPAVPISGYPEATRAIIQQSDKDSTNTVLVEGYGLRQCINTEGVVGTKVTSNSVMECRDVLGIEAARTTIAKEISDVMGDMGIDPRHMQLLADVMTYKGEILGITRFGLSKMRDSVLQLASFEKTADHLFDAASGMKTDPIEGVSEKIIMGETMSIGTGAFQVVRRLNLLDEHFATMPTVFEDAWIQNQKEKPAKRTKKRVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.18
3	0.22
4	0.25
5	0.29
6	0.34
7	0.36
8	0.38
9	0.41
10	0.48
11	0.49
12	0.51
13	0.47
14	0.44
15	0.44
16	0.49
17	0.48
18	0.47
19	0.44
20	0.42
21	0.43
22	0.51
23	0.53
24	0.52
25	0.52
26	0.54
27	0.56
28	0.59
29	0.64
30	0.6
31	0.61
32	0.6
33	0.55
34	0.5
35	0.48
36	0.43
37	0.39
38	0.41
39	0.44
40	0.45
41	0.44
42	0.46
43	0.47
44	0.48
45	0.55
46	0.57
47	0.58
48	0.6
49	0.63
50	0.65
51	0.72
52	0.75
53	0.75
54	0.72
55	0.68
56	0.62
57	0.61
58	0.53
59	0.44
60	0.38
61	0.33
62	0.29
63	0.23
64	0.22
65	0.2
66	0.19
67	0.21
68	0.21
69	0.17
70	0.16
71	0.18
72	0.19
73	0.2
74	0.21
75	0.18
76	0.19
77	0.25
78	0.29
79	0.29
80	0.31
81	0.32
82	0.37
83	0.39
84	0.37
85	0.31
86	0.3
87	0.28
88	0.26
89	0.29
90	0.23
91	0.22
92	0.21
93	0.21
94	0.19
95	0.18
96	0.18
97	0.11
98	0.11
99	0.11
100	0.12
101	0.12
102	0.11
103	0.12
104	0.14
105	0.14
106	0.15
107	0.16
108	0.18
109	0.2
110	0.22
111	0.23
112	0.24
113	0.28
114	0.33
115	0.37
116	0.38
117	0.35
118	0.34
119	0.31
120	0.27
121	0.26
122	0.22
123	0.16
124	0.12
125	0.12
126	0.1
127	0.1
128	0.1
129	0.07
130	0.05
131	0.05
132	0.06
133	0.07
134	0.13
135	0.16
136	0.18
137	0.19
138	0.19
139	0.22
140	0.22
141	0.21
142	0.18
143	0.18
144	0.19
145	0.2
146	0.2
147	0.17
148	0.16
149	0.16
150	0.13
151	0.11
152	0.09
153	0.09
154	0.15
155	0.18
156	0.27
157	0.28
158	0.31
159	0.32
160	0.33
161	0.33
162	0.32
163	0.32
164	0.28
165	0.29
166	0.28
167	0.27
168	0.25
169	0.25
170	0.22
171	0.18
172	0.14
173	0.12
174	0.11
175	0.11
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.12
180	0.14
181	0.2
182	0.24
183	0.25
184	0.25
185	0.27
186	0.28
187	0.29
188	0.29
189	0.23
190	0.2
191	0.2
192	0.19
193	0.18
194	0.19
195	0.19
196	0.19
197	0.2
198	0.2
199	0.19
200	0.19
201	0.18
202	0.17
203	0.14
204	0.12
205	0.11
206	0.12
207	0.12
208	0.12
209	0.12
210	0.1
211	0.1
212	0.16
213	0.15
214	0.16
215	0.15
216	0.15
217	0.14
218	0.14
219	0.13
220	0.07
221	0.07
222	0.05
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.05
229	0.05
230	0.04
231	0.05
232	0.06
233	0.06
234	0.07
235	0.08
236	0.09
237	0.09
238	0.12
239	0.12
240	0.14
241	0.2
242	0.22
243	0.26
244	0.32
245	0.37
246	0.43
247	0.5
248	0.55
249	0.56
250	0.59
251	0.54
252	0.49
253	0.5
254	0.47
255	0.47
256	0.42
257	0.37
258	0.36
259	0.35
260	0.34
261	0.31
262	0.25
263	0.2
264	0.17
265	0.17
266	0.14
267	0.14
268	0.11
269	0.12
270	0.11
271	0.11
272	0.1
273	0.09
274	0.1
275	0.1
276	0.1
277	0.08
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.11
294	0.17
295	0.18
296	0.23
297	0.23
298	0.23
299	0.22
300	0.23
301	0.25
302	0.23
303	0.26
304	0.23
305	0.23
306	0.24
307	0.26
308	0.24
309	0.2
310	0.19
311	0.17
312	0.19
313	0.2
314	0.18
315	0.17
316	0.17
317	0.17
318	0.17
319	0.17
320	0.14
321	0.13
322	0.13
323	0.11
324	0.1
325	0.1
326	0.07
327	0.1
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.09
333	0.1
334	0.13
335	0.09
336	0.11
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.08
343	0.14
344	0.13
345	0.15
346	0.15
347	0.18
348	0.23
349	0.23
350	0.24
351	0.2
352	0.2
353	0.23
354	0.24
355	0.22
356	0.18
357	0.17
358	0.15
359	0.14
360	0.14
361	0.1
362	0.11
363	0.12
364	0.11
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.09
369	0.09
370	0.07
371	0.04
372	0.05
373	0.06
374	0.07
375	0.09
376	0.14
377	0.16
378	0.18
379	0.26
380	0.35
381	0.44
382	0.53
383	0.6
384	0.65
385	0.7
386	0.7
387	0.7
388	0.67
389	0.65
390	0.62
391	0.55
392	0.46
393	0.39
394	0.37
395	0.31
396	0.25
397	0.16
398	0.1
399	0.09
400	0.08
401	0.08
402	0.07
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.07
408	0.09
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.09
413	0.09
414	0.09
415	0.12
416	0.09
417	0.16
418	0.21
419	0.22
420	0.22
421	0.22
422	0.22
423	0.19
424	0.22
425	0.19
426	0.14
427	0.14
428	0.16
429	0.17
430	0.19
431	0.18
432	0.15
433	0.12
434	0.12
435	0.11
436	0.09
437	0.07
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.03
443	0.04
444	0.04
445	0.06
446	0.07
447	0.07
448	0.08
449	0.08
450	0.1
451	0.14
452	0.18
453	0.18
454	0.2
455	0.2
456	0.2
457	0.19
458	0.18
459	0.13
460	0.1
461	0.07
462	0.05
463	0.05
464	0.04
465	0.04
466	0.05
467	0.05
468	0.07
469	0.07
470	0.08
471	0.1
472	0.1
473	0.14
474	0.16
475	0.2
476	0.2
477	0.2
478	0.2
479	0.23
480	0.25
481	0.26
482	0.25
483	0.27
484	0.3
485	0.3
486	0.33
487	0.36
488	0.44
489	0.49
490	0.57
491	0.59
492	0.63
493	0.71
494	0.75
495	0.77
496	0.74
497	0.65
498	0.58
499	0.51
500	0.43
501	0.35
502	0.27
503	0.18
504	0.16
505	0.15
506	0.12
507	0.11
508	0.1
509	0.09
510	0.09
511	0.09
512	0.06
513	0.06
514	0.09
515	0.17
516	0.18
517	0.18
518	0.23
519	0.24
520	0.25
521	0.3
522	0.32
523	0.25
524	0.33
525	0.44
526	0.49
527	0.5
528	0.53
529	0.48
530	0.51
531	0.5
532	0.41
533	0.36
534	0.27
535	0.26
536	0.27
537	0.27
538	0.21
539	0.22
540	0.22
541	0.16
542	0.15
543	0.13
544	0.09
545	0.08
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.06
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.08
557	0.09
558	0.11
559	0.13
560	0.17
561	0.17
562	0.17
563	0.17
564	0.18
565	0.16
566	0.17
567	0.16
568	0.13
569	0.14
570	0.15
571	0.17
572	0.17
573	0.19
574	0.17
575	0.17
576	0.22
577	0.28
578	0.28
579	0.28
580	0.28
581	0.26
582	0.26
583	0.27
584	0.21
585	0.21
586	0.2
587	0.18
588	0.2
589	0.21
590	0.21
591	0.2
592	0.22
593	0.17
594	0.18
595	0.22
596	0.19
597	0.22
598	0.23
599	0.24
600	0.22
601	0.19
602	0.18
603	0.13
604	0.12
605	0.08
606	0.06
607	0.04
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.03
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.06
619	0.09
620	0.09
621	0.11
622	0.11
623	0.1
624	0.1
625	0.1
626	0.1
627	0.07
628	0.07
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.04
634	0.04
635	0.07
636	0.08
637	0.08
638	0.09
639	0.13
640	0.13
641	0.17
642	0.2
643	0.26
644	0.27
645	0.27
646	0.28
647	0.27
648	0.27
649	0.25
650	0.22
651	0.14
652	0.13
653	0.14
654	0.18
655	0.16
656	0.16
657	0.18
658	0.26
659	0.27
660	0.29
661	0.3
662	0.27
663	0.33
664	0.33
665	0.29
666	0.26
667	0.27
668	0.29
669	0.29
670	0.27
671	0.25
672	0.27
673	0.28
674	0.25
675	0.27
676	0.24
677	0.25
678	0.29
679	0.27
680	0.26
681	0.24
682	0.21
683	0.19
684	0.18
685	0.14
686	0.11
687	0.14
688	0.15
689	0.17
690	0.2
691	0.24
692	0.25
693	0.25
694	0.24
695	0.2
696	0.19
697	0.23
698	0.31
699	0.25
700	0.26
701	0.27
702	0.27
703	0.27
704	0.27
705	0.21
706	0.1
707	0.09
708	0.08
709	0.08
710	0.1
711	0.1
712	0.1
713	0.09
714	0.1
715	0.1
716	0.1
717	0.09
718	0.08
719	0.08
720	0.09
721	0.09
722	0.13
723	0.16
724	0.17
725	0.21
726	0.25
727	0.32
728	0.41
729	0.48
730	0.53
731	0.57
732	0.64
733	0.7
734	0.71
735	0.65
736	0.57
737	0.5
738	0.42
739	0.34
740	0.26
741	0.16
742	0.11
743	0.11
744	0.09
745	0.08
746	0.07
747	0.07
748	0.07
749	0.06
750	0.06
751	0.05
752	0.06
753	0.07
754	0.11
755	0.12
756	0.17
757	0.22
758	0.24
759	0.27
760	0.35
761	0.41
762	0.45
763	0.51
764	0.51
765	0.52
766	0.55
767	0.55
768	0.48
769	0.42
770	0.34
771	0.28
772	0.23
773	0.18
774	0.12
775	0.09
776	0.08
777	0.09
778	0.09
779	0.11
780	0.18
781	0.2
782	0.22
783	0.24
784	0.25
785	0.27
786	0.29
787	0.27
788	0.21
789	0.2
790	0.22
791	0.21
792	0.2
793	0.17
794	0.15
795	0.14
796	0.14
797	0.14
798	0.12
799	0.13
800	0.17
801	0.17
802	0.2
803	0.23
804	0.26
805	0.27
806	0.27
807	0.26
808	0.23
809	0.24
810	0.21
811	0.17
812	0.13
813	0.12
814	0.12
815	0.1
816	0.11
817	0.11
818	0.11
819	0.11
820	0.11
821	0.12
822	0.13
823	0.14
824	0.12
825	0.11
826	0.11
827	0.12
828	0.12
829	0.12
830	0.1
831	0.11
832	0.11
833	0.12
834	0.12
835	0.12
836	0.14
837	0.18
838	0.19
839	0.17
840	0.17
841	0.17
842	0.16
843	0.16
844	0.14
845	0.13
846	0.13
847	0.12
848	0.12
849	0.11
850	0.11
851	0.11
852	0.11
853	0.11
854	0.11
855	0.11
856	0.12
857	0.14
858	0.15
859	0.15
860	0.14
861	0.11
862	0.1
863	0.1
864	0.09
865	0.1
866	0.09
867	0.09
868	0.1
869	0.1
870	0.11
871	0.11
872	0.11
873	0.09
874	0.13
875	0.13
876	0.13
877	0.13
878	0.12
879	0.12
880	0.12
881	0.11
882	0.07
883	0.07
884	0.06
885	0.07
886	0.09
887	0.1
888	0.11
889	0.12
890	0.12
891	0.13
892	0.19
893	0.19
894	0.22
895	0.25
896	0.26
897	0.27
898	0.29
899	0.36
900	0.34
901	0.33
902	0.28
903	0.26
904	0.26
905	0.25
906	0.22
907	0.15
908	0.13
909	0.13
910	0.14
911	0.14
912	0.13
913	0.12
914	0.13
915	0.14
916	0.14
917	0.13
918	0.12
919	0.11
920	0.13
921	0.13
922	0.13
923	0.13
924	0.12
925	0.14
926	0.13
927	0.15
928	0.14
929	0.14
930	0.13
931	0.13
932	0.12
933	0.09
934	0.09
935	0.08
936	0.07
937	0.07
938	0.07
939	0.07
940	0.06
941	0.07
942	0.07
943	0.06
944	0.08
945	0.09
946	0.15
947	0.17
948	0.19
949	0.2
950	0.21
951	0.22
952	0.26
953	0.28
954	0.28
955	0.27
956	0.3
957	0.28
958	0.27
959	0.27
960	0.21
961	0.18
962	0.14
963	0.13
964	0.09
965	0.1
966	0.13
967	0.14
968	0.22
969	0.28
970	0.28
971	0.33
972	0.37
973	0.45
974	0.51
975	0.57
976	0.59
977	0.63
978	0.73
979	0.78

A0A4Z0YXU0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer