FuNGI

A0A4S8LYU6

Protein Details

Accession

A0A4S8LYU6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1072-1093	REEARKPQAGCKTKKKAYKPRR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1075-1093	ARKPQAGCKTKKKAYKPRR

Subcellular Location(s)

mito_nucl 9, nucl 8.5, mito 8.5, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MHSVIKRALDKPKLDYVIPSPFFSNLHVDALSLPPLSQDVQFTSIAFSMPNPFIDDRAHEDAEDFYDDEDEEYEQEQDDRQWIDLDDDRQELSDFQHHAGFYQQRIEDIERRYCPGTGTTELETSNEQGPAPPTPTRSEICDFDENKLKSVLMSAESPPFWRVKCKVGRETDLVLDIMNSVILEPANTPTTLPPSNTTIGQVTLTHSSSPAALALRSIRQYALTQIGEPKDMADKIGQLLGPGFTVEWNRLIDAAGLEPGLEDVLAATQDALETINKKAAMFLPRSILAEAEALASLPDDSTSSSVTPSAPTPISHPGGCHSCTLLSAFTVPTVQGCVYLEGRCDEKVHEWLGNHAAVVKRQSRVWMEHMDCREIAVLLDTQPLSLQPCSWVRVTRGLYRGDVGLVVSRQMLADQHPFEVLLVPRIPPPQRETPPTPPPKETHPLLQHSEPDPSLSSPTTLEPTDEKKRRRGSERFSQRLFHEVSFQGQCEKMAENVYRWNNDEYRHGLVVKYYDSRSLSQTDVIMDRNTRRLFGLSQAPSVMTVSFPVIGDWVFFAEEKVEAVVLGPLNQQQKLDPTLPRSTYLKGGIIFNDYDECDNDDTSVQVSNINLRKRVYIGDSVAVEAGEMRGREGMVTSMTSNTLEVLELGGELTTFRVEVNSCRVTALRSTGFVPWVDKHVTIVLGDYKGYSGFVIDTHPPKPQYTTLQVKIPSLGVTVQLRHDHIVDTISKQYLRFAAPLNQHQQQFAQLDWDAYRSPNLTRPPVDPFSGRWIQAEDILNRQPQQPWLNVPISVIRGQHKGTGTVKQVERSHHTSSKLRVLVEHDFVSAEHGAAPQYWSDYEDIRDPRTGLPLHIVYPLHGRQRYWEPRTRVKAVSVPNPYLRPNHGLRTEIPSTVTPPGSPGPFIDPFAGPSESSSGTEAAHWAADPRLGGKTFYARWHPQSGSDVAKILATPITRSRMVQVKEASGMGGVLVPPDEIYDVQVPIKPTTNRQPLLVVRGEHTGKYLRQIWCRYRDKDDEHPVITAAVFEDWGTTTETMADPYYIEVKAEDCAEAADDLNKEKFKQTMKELREEARKPQAGCKTKKKAYKPRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.5
3	0.46
4	0.49
5	0.47
6	0.43
7	0.35
8	0.34
9	0.34
10	0.32
11	0.32
12	0.23
13	0.24
14	0.22
15	0.21
16	0.2
17	0.22
18	0.21
19	0.16
20	0.14
21	0.11
22	0.13
23	0.14
24	0.14
25	0.14
26	0.15
27	0.18
28	0.19
29	0.18
30	0.19
31	0.18
32	0.17
33	0.15
34	0.13
35	0.16
36	0.17
37	0.18
38	0.2
39	0.2
40	0.21
41	0.24
42	0.26
43	0.27
44	0.32
45	0.32
46	0.27
47	0.28
48	0.27
49	0.27
50	0.26
51	0.19
52	0.13
53	0.13
54	0.13
55	0.13
56	0.12
57	0.1
58	0.09
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.11
63	0.11
64	0.12
65	0.16
66	0.16
67	0.16
68	0.17
69	0.17
70	0.21
71	0.24
72	0.26
73	0.24
74	0.24
75	0.24
76	0.23
77	0.23
78	0.19
79	0.18
80	0.21
81	0.2
82	0.2
83	0.24
84	0.23
85	0.22
86	0.29
87	0.29
88	0.25
89	0.3
90	0.29
91	0.27
92	0.31
93	0.36
94	0.35
95	0.37
96	0.44
97	0.39
98	0.43
99	0.43
100	0.4
101	0.36
102	0.33
103	0.33
104	0.28
105	0.3
106	0.28
107	0.28
108	0.28
109	0.28
110	0.25
111	0.22
112	0.21
113	0.18
114	0.16
115	0.16
116	0.18
117	0.2
118	0.22
119	0.23
120	0.23
121	0.26
122	0.31
123	0.3
124	0.33
125	0.35
126	0.34
127	0.37
128	0.43
129	0.4
130	0.41
131	0.49
132	0.44
133	0.41
134	0.39
135	0.33
136	0.24
137	0.25
138	0.23
139	0.15
140	0.17
141	0.18
142	0.21
143	0.21
144	0.23
145	0.22
146	0.24
147	0.22
148	0.27
149	0.28
150	0.34
151	0.42
152	0.5
153	0.56
154	0.61
155	0.65
156	0.62
157	0.62
158	0.54
159	0.47
160	0.38
161	0.29
162	0.22
163	0.16
164	0.11
165	0.08
166	0.06
167	0.04
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.09
173	0.1
174	0.1
175	0.11
176	0.12
177	0.18
178	0.2
179	0.2
180	0.21
181	0.24
182	0.26
183	0.26
184	0.26
185	0.22
186	0.2
187	0.2
188	0.18
189	0.16
190	0.18
191	0.18
192	0.16
193	0.15
194	0.15
195	0.14
196	0.13
197	0.12
198	0.1
199	0.09
200	0.1
201	0.12
202	0.16
203	0.17
204	0.17
205	0.16
206	0.17
207	0.18
208	0.19
209	0.23
210	0.2
211	0.2
212	0.25
213	0.26
214	0.25
215	0.24
216	0.21
217	0.19
218	0.18
219	0.18
220	0.14
221	0.14
222	0.14
223	0.16
224	0.15
225	0.11
226	0.12
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.08
231	0.07
232	0.09
233	0.09
234	0.11
235	0.11
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.11
240	0.11
241	0.1
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.06
246	0.06
247	0.05
248	0.04
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.04
258	0.05
259	0.06
260	0.07
261	0.09
262	0.12
263	0.13
264	0.13
265	0.14
266	0.18
267	0.22
268	0.23
269	0.24
270	0.24
271	0.25
272	0.27
273	0.25
274	0.21
275	0.16
276	0.14
277	0.12
278	0.09
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.05
288	0.06
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.09
293	0.09
294	0.1
295	0.1
296	0.13
297	0.13
298	0.13
299	0.15
300	0.21
301	0.23
302	0.22
303	0.22
304	0.22
305	0.25
306	0.26
307	0.24
308	0.18
309	0.16
310	0.16
311	0.17
312	0.13
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.06
320	0.08
321	0.07
322	0.07
323	0.08
324	0.1
325	0.11
326	0.12
327	0.13
328	0.12
329	0.14
330	0.14
331	0.14
332	0.13
333	0.14
334	0.17
335	0.18
336	0.19
337	0.18
338	0.2
339	0.22
340	0.2
341	0.17
342	0.16
343	0.16
344	0.15
345	0.2
346	0.21
347	0.19
348	0.2
349	0.25
350	0.26
351	0.28
352	0.31
353	0.34
354	0.34
355	0.38
356	0.39
357	0.37
358	0.33
359	0.3
360	0.25
361	0.17
362	0.14
363	0.1
364	0.08
365	0.07
366	0.09
367	0.09
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.11
375	0.13
376	0.15
377	0.17
378	0.19
379	0.18
380	0.26
381	0.29
382	0.31
383	0.33
384	0.33
385	0.32
386	0.3
387	0.28
388	0.21
389	0.18
390	0.12
391	0.1
392	0.08
393	0.08
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.07
399	0.08
400	0.12
401	0.13
402	0.13
403	0.13
404	0.13
405	0.13
406	0.15
407	0.13
408	0.11
409	0.11
410	0.11
411	0.13
412	0.18
413	0.19
414	0.18
415	0.24
416	0.3
417	0.33
418	0.39
419	0.44
420	0.48
421	0.57
422	0.63
423	0.61
424	0.55
425	0.53
426	0.52
427	0.51
428	0.45
429	0.43
430	0.4
431	0.42
432	0.42
433	0.42
434	0.4
435	0.35
436	0.36
437	0.27
438	0.23
439	0.19
440	0.16
441	0.16
442	0.12
443	0.12
444	0.1
445	0.11
446	0.12
447	0.11
448	0.12
449	0.12
450	0.18
451	0.27
452	0.34
453	0.36
454	0.42
455	0.5
456	0.56
457	0.62
458	0.64
459	0.62
460	0.66
461	0.73
462	0.72
463	0.66
464	0.62
465	0.54
466	0.51
467	0.46
468	0.35
469	0.28
470	0.22
471	0.23
472	0.21
473	0.21
474	0.17
475	0.15
476	0.15
477	0.12
478	0.12
479	0.1
480	0.12
481	0.13
482	0.12
483	0.19
484	0.21
485	0.21
486	0.23
487	0.24
488	0.23
489	0.23
490	0.25
491	0.22
492	0.23
493	0.22
494	0.2
495	0.18
496	0.16
497	0.16
498	0.15
499	0.14
500	0.12
501	0.14
502	0.15
503	0.16
504	0.17
505	0.18
506	0.17
507	0.16
508	0.16
509	0.14
510	0.13
511	0.13
512	0.12
513	0.12
514	0.12
515	0.18
516	0.18
517	0.17
518	0.16
519	0.17
520	0.16
521	0.18
522	0.25
523	0.19
524	0.2
525	0.19
526	0.19
527	0.17
528	0.17
529	0.14
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.03
550	0.04
551	0.05
552	0.04
553	0.05
554	0.05
555	0.09
556	0.11
557	0.11
558	0.11
559	0.11
560	0.13
561	0.15
562	0.18
563	0.17
564	0.2
565	0.24
566	0.24
567	0.26
568	0.26
569	0.24
570	0.24
571	0.23
572	0.21
573	0.18
574	0.17
575	0.16
576	0.16
577	0.14
578	0.12
579	0.11
580	0.1
581	0.09
582	0.09
583	0.1
584	0.09
585	0.08
586	0.09
587	0.08
588	0.07
589	0.07
590	0.08
591	0.06
592	0.06
593	0.06
594	0.12
595	0.17
596	0.19
597	0.21
598	0.21
599	0.21
600	0.22
601	0.23
602	0.2
603	0.18
604	0.18
605	0.18
606	0.17
607	0.17
608	0.16
609	0.14
610	0.1
611	0.07
612	0.06
613	0.05
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.05
619	0.06
620	0.06
621	0.05
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.07
626	0.07
627	0.07
628	0.06
629	0.06
630	0.05
631	0.05
632	0.04
633	0.04
634	0.04
635	0.04
636	0.03
637	0.03
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.03
643	0.04
644	0.05
645	0.07
646	0.13
647	0.14
648	0.14
649	0.15
650	0.15
651	0.16
652	0.17
653	0.19
654	0.14
655	0.13
656	0.15
657	0.15
658	0.16
659	0.15
660	0.16
661	0.13
662	0.16
663	0.16
664	0.15
665	0.14
666	0.14
667	0.14
668	0.11
669	0.12
670	0.11
671	0.09
672	0.09
673	0.09
674	0.08
675	0.08
676	0.08
677	0.06
678	0.05
679	0.04
680	0.05
681	0.07
682	0.11
683	0.13
684	0.15
685	0.18
686	0.19
687	0.2
688	0.23
689	0.24
690	0.26
691	0.31
692	0.37
693	0.37
694	0.4
695	0.41
696	0.38
697	0.36
698	0.31
699	0.23
700	0.16
701	0.14
702	0.11
703	0.12
704	0.12
705	0.14
706	0.15
707	0.16
708	0.16
709	0.16
710	0.14
711	0.13
712	0.14
713	0.13
714	0.13
715	0.15
716	0.15
717	0.16
718	0.15
719	0.16
720	0.17
721	0.17
722	0.16
723	0.17
724	0.22
725	0.26
726	0.32
727	0.35
728	0.38
729	0.37
730	0.36
731	0.34
732	0.31
733	0.28
734	0.22
735	0.2
736	0.15
737	0.16
738	0.15
739	0.16
740	0.12
741	0.12
742	0.13
743	0.11
744	0.12
745	0.17
746	0.22
747	0.25
748	0.27
749	0.29
750	0.34
751	0.36
752	0.36
753	0.32
754	0.29
755	0.32
756	0.33
757	0.31
758	0.25
759	0.24
760	0.23
761	0.26
762	0.28
763	0.22
764	0.23
765	0.26
766	0.27
767	0.26
768	0.28
769	0.24
770	0.26
771	0.28
772	0.26
773	0.28
774	0.31
775	0.31
776	0.29
777	0.28
778	0.25
779	0.24
780	0.24
781	0.22
782	0.2
783	0.21
784	0.22
785	0.26
786	0.24
787	0.27
788	0.27
789	0.3
790	0.31
791	0.36
792	0.37
793	0.39
794	0.42
795	0.41
796	0.46
797	0.45
798	0.48
799	0.45
800	0.48
801	0.47
802	0.48
803	0.52
804	0.48
805	0.43
806	0.38
807	0.38
808	0.38
809	0.36
810	0.31
811	0.23
812	0.21
813	0.2
814	0.21
815	0.16
816	0.12
817	0.09
818	0.09
819	0.09
820	0.09
821	0.1
822	0.07
823	0.08
824	0.08
825	0.09
826	0.1
827	0.11
828	0.13
829	0.19
830	0.21
831	0.22
832	0.23
833	0.24
834	0.24
835	0.28
836	0.27
837	0.21
838	0.24
839	0.23
840	0.22
841	0.25
842	0.24
843	0.19
844	0.25
845	0.28
846	0.31
847	0.31
848	0.3
849	0.31
850	0.42
851	0.51
852	0.52
853	0.56
854	0.56
855	0.64
856	0.72
857	0.72
858	0.63
859	0.58
860	0.57
861	0.54
862	0.56
863	0.52
864	0.49
865	0.48
866	0.48
867	0.47
868	0.44
869	0.41
870	0.38
871	0.36
872	0.39
873	0.38
874	0.38
875	0.37
876	0.41
877	0.4
878	0.34
879	0.33
880	0.26
881	0.26
882	0.28
883	0.26
884	0.18
885	0.19
886	0.22
887	0.2
888	0.2
889	0.18
890	0.2
891	0.21
892	0.23
893	0.22
894	0.19
895	0.2
896	0.23
897	0.23
898	0.16
899	0.16
900	0.18
901	0.16
902	0.17
903	0.17
904	0.14
905	0.13
906	0.13
907	0.13
908	0.11
909	0.1
910	0.09
911	0.09
912	0.09
913	0.1
914	0.1
915	0.11
916	0.14
917	0.15
918	0.15
919	0.16
920	0.22
921	0.24
922	0.29
923	0.36
924	0.38
925	0.42
926	0.48
927	0.47
928	0.44
929	0.45
930	0.44
931	0.4
932	0.36
933	0.32
934	0.25
935	0.25
936	0.21
937	0.18
938	0.16
939	0.12
940	0.14
941	0.18
942	0.22
943	0.23
944	0.24
945	0.28
946	0.34
947	0.35
948	0.39
949	0.38
950	0.36
951	0.37
952	0.36
953	0.31
954	0.22
955	0.2
956	0.13
957	0.11
958	0.08
959	0.06
960	0.06
961	0.06
962	0.06
963	0.06
964	0.07
965	0.06
966	0.1
967	0.12
968	0.13
969	0.14
970	0.17
971	0.19
972	0.2
973	0.27
974	0.26
975	0.31
976	0.4
977	0.49
978	0.48
979	0.47
980	0.51
981	0.48
982	0.52
983	0.5
984	0.41
985	0.33
986	0.39
987	0.39
988	0.32
989	0.31
990	0.3
991	0.26
992	0.31
993	0.37
994	0.37
995	0.44
996	0.53
997	0.59
998	0.64
999	0.72
1000	0.7
1001	0.71
1002	0.73
1003	0.72
1004	0.73
1005	0.74
1006	0.71
1007	0.63
1008	0.59
1009	0.51
1010	0.43
1011	0.36
1012	0.26
1013	0.17
1014	0.1
1015	0.09
1016	0.07
1017	0.08
1018	0.08
1019	0.09
1020	0.12
1021	0.11
1022	0.11
1023	0.13
1024	0.13
1025	0.14
1026	0.14
1027	0.13
1028	0.1
1029	0.12
1030	0.15
1031	0.13
1032	0.13
1033	0.12
1034	0.12
1035	0.14
1036	0.14
1037	0.13
1038	0.1
1039	0.1
1040	0.11
1041	0.11
1042	0.11
1043	0.13
1044	0.13
1045	0.16
1046	0.21
1047	0.23
1048	0.23
1049	0.26
1050	0.31
1051	0.34
1052	0.4
1053	0.47
1054	0.52
1055	0.56
1056	0.64
1057	0.66
1058	0.68
1059	0.71
1060	0.67
1061	0.65
1062	0.66
1063	0.66
1064	0.59
1065	0.62
1066	0.65
1067	0.65
1068	0.71
1069	0.74
1070	0.74
1071	0.76
1072	0.84
1073	0.86

A0A4S8LYU6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer