Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S8LTE1

Protein Details
Accession A0A4S8LTE1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-42FDGPLRPGKKRSKRVGAAAHWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-35PGKKRSKR
Subcellular Location(s) plas 20, extr 4, mito 1, pero 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences LANVFYKLSFFLSLPLVLVFVFDGPLRPGKKRSKRVGAAAHWMTQPFKELVLAFGYHTHQAPGEAEAELARMSTTGFIDAVLTDDSDALLFGARLVIRRWVYFPHIRRDPDSIATYYTDNFAQDPDKPIMHGGMLLFAILQGGDYSKGLHRCGQDTAYRLTHTELGSELLLAADEDNETLSTFLPAWRAKLRHYLADDPYGLIGQKNKKLAAGVPNDFPSMEIVKLYTNPLVSESSWTSNASWHVFQLPNLANLSILVERLFLWRSTGLAENKLQSKVFGAFCIKYLLMVWLCSVVYWPVY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.13
4 0.1
5 0.11
6 0.08
7 0.06
8 0.07
9 0.06
10 0.07
11 0.09
12 0.17
13 0.2
14 0.23
15 0.32
16 0.42
17 0.53
18 0.62
19 0.7
20 0.74
21 0.78
22 0.84
23 0.84
24 0.78
25 0.78
26 0.7
27 0.63
28 0.54
29 0.48
30 0.4
31 0.31
32 0.29
33 0.2
34 0.17
35 0.16
36 0.14
37 0.14
38 0.15
39 0.16
40 0.13
41 0.15
42 0.16
43 0.16
44 0.16
45 0.15
46 0.13
47 0.13
48 0.14
49 0.13
50 0.12
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.1
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.04
59 0.04
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.03
78 0.03
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.08
83 0.14
84 0.15
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.24
89 0.31
90 0.35
91 0.38
92 0.43
93 0.45
94 0.46
95 0.48
96 0.45
97 0.41
98 0.39
99 0.3
100 0.25
101 0.24
102 0.22
103 0.18
104 0.16
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.13
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.02
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.07
134 0.09
135 0.1
136 0.14
137 0.15
138 0.16
139 0.17
140 0.19
141 0.19
142 0.2
143 0.22
144 0.2
145 0.19
146 0.18
147 0.18
148 0.19
149 0.16
150 0.14
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.08
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.1
172 0.1
173 0.13
174 0.18
175 0.2
176 0.21
177 0.3
178 0.31
179 0.32
180 0.36
181 0.38
182 0.36
183 0.38
184 0.36
185 0.27
186 0.25
187 0.2
188 0.17
189 0.12
190 0.15
191 0.17
192 0.21
193 0.24
194 0.24
195 0.24
196 0.25
197 0.28
198 0.31
199 0.32
200 0.31
201 0.31
202 0.32
203 0.31
204 0.3
205 0.27
206 0.21
207 0.15
208 0.13
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.12
213 0.13
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.17
221 0.17
222 0.19
223 0.2
224 0.21
225 0.19
226 0.2
227 0.23
228 0.22
229 0.2
230 0.18
231 0.22
232 0.22
233 0.22
234 0.27
235 0.25
236 0.24
237 0.25
238 0.24
239 0.18
240 0.18
241 0.2
242 0.12
243 0.11
244 0.09
245 0.08
246 0.09
247 0.11
248 0.13
249 0.11
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.22
255 0.22
256 0.25
257 0.28
258 0.3
259 0.34
260 0.36
261 0.34
262 0.28
263 0.28
264 0.29
265 0.27
266 0.26
267 0.27
268 0.25
269 0.26
270 0.3
271 0.26
272 0.21
273 0.21
274 0.23
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.16
279 0.16
280 0.15
281 0.16