FuNGI

A0A4V6T4V9

Protein Details

Accession

A0A4V6T4V9

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
294-317	FKYQRPFYKSKTLRHNQRRNESSF	Hydrophilic
427-450	SDDTRDSNWRKRKRGREAFPQTLF	Hydrophilic
1047-1068	GEMKKMRDEARQKRVRKPKGKD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
436-441	RKRKRG
1048-1068	EMKKMRDEARQKRVRKPKGKD

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 13.5, cyto 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MSNPFVDLQAQVDDEEDWIDGEPMFLPGSDDEDYLWGAGDDEERGERGEKGTDNEEDHWENEDLLEVRREEDYPPTFVDYLMERYTNRPSTPPPPLNGDDALSNVVLRAALLSADKAKDTFWRIKCKPGYELELVFDIMRREQERTTSSTTSSKAPAFVEVESIQARAFDLLCQSCADPNVTIPAVEADLKKILGTAYTSPWNQALSASSPLDPDEDPSVALNRLSAMKQLLVPDKSSTSISYGQLTTQPPSPDVLSAFCVPTVTGSVYIEADLGLRPQDTEFADYLRTHKTVFKYQRPFYKSKTLRHNQRRNESSFASRPWLAKSQVWLERVPCEEVATLLETPTSTIKPFSWVKITRGEYQGDTGLVLSRQKSSIQRRLRVLLVPRLPPKSPMPRPPTPEPKETHPLVLQEGATGRDDMVGRRGSDDTRDSNWRKRKRGREAFPQTLFDPDDYPDDTKKFANEDNLFSYMGRTFSFDLLLKSLDYRSVTQVDVNMDETTRRFFRTSRHPIFQSVRLPVSKDWVFFHHDKVEVFCTEPLSDVQSRNLDLPRRTMTRNAIVTEVQGDHCNVSFDDYGTFETGEWVSKINLRKRIYEGDGVEVAEGENKGRKGIVIFSLDGLLQVQERESNTNTDFWIDANTCRVTNIRDGSGVPWIGRLVTVFKGTYRNYRGVVQDVHPPRSHFTTLDVKIPRLLTTITVSHDDVYDSESYKWLRVAVPLAPHQIHFNQATWHADYAPNLEFCVYDYHERRYLQSKDMVIRQPPQPWIGKEVRVVGKEWKSLGFVKQVERTGKSESGLRFLVELKILTAVYGLPERWFDYTEVFDPRTGNSLDLAYPLIGHQKRYWQPLVSPKHIKPDADLQPKWISPFRIPLRVQTPPWNSGDFVDPFATTETSAGPSTVPQIPTHWVLDPRLVGKKFYARWAPLNDNPMEKQVIEPGDHGTIKVYSGAEVFIAHSDEIYDCNVRILPKTNKRPMVAIRGEHTGKNLRQIHYKYDDDGKEVIIAAVYRNWALSNEEYVEQVEVRPEDLAEAPNDWRLDPNEKRFAGEMKKMRDEARQKRVRKPKGKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.12
3	0.1
4	0.08
5	0.08
6	0.09
7	0.08
8	0.08
9	0.08
10	0.08
11	0.09
12	0.08
13	0.09
14	0.09
15	0.13
16	0.14
17	0.13
18	0.13
19	0.14
20	0.14
21	0.13
22	0.12
23	0.08
24	0.07
25	0.08
26	0.09
27	0.08
28	0.09
29	0.11
30	0.11
31	0.13
32	0.14
33	0.14
34	0.15
35	0.2
36	0.21
37	0.24
38	0.28
39	0.3
40	0.32
41	0.34
42	0.37
43	0.35
44	0.33
45	0.33
46	0.29
47	0.25
48	0.21
49	0.23
50	0.18
51	0.18
52	0.21
53	0.17
54	0.18
55	0.19
56	0.2
57	0.18
58	0.25
59	0.26
60	0.25
61	0.27
62	0.29
63	0.28
64	0.27
65	0.28
66	0.22
67	0.24
68	0.24
69	0.24
70	0.21
71	0.24
72	0.32
73	0.35
74	0.34
75	0.33
76	0.37
77	0.43
78	0.53
79	0.55
80	0.5
81	0.53
82	0.54
83	0.53
84	0.49
85	0.41
86	0.31
87	0.27
88	0.25
89	0.18
90	0.15
91	0.11
92	0.1
93	0.08
94	0.07
95	0.06
96	0.05
97	0.06
98	0.06
99	0.08
100	0.12
101	0.13
102	0.14
103	0.13
104	0.14
105	0.19
106	0.25
107	0.33
108	0.36
109	0.46
110	0.48
111	0.57
112	0.63
113	0.62
114	0.61
115	0.58
116	0.58
117	0.52
118	0.52
119	0.44
120	0.39
121	0.35
122	0.29
123	0.24
124	0.19
125	0.15
126	0.18
127	0.18
128	0.2
129	0.21
130	0.26
131	0.28
132	0.32
133	0.37
134	0.34
135	0.36
136	0.38
137	0.38
138	0.36
139	0.36
140	0.32
141	0.29
142	0.27
143	0.28
144	0.25
145	0.23
146	0.24
147	0.2
148	0.21
149	0.19
150	0.19
151	0.15
152	0.13
153	0.13
154	0.1
155	0.1
156	0.08
157	0.13
158	0.14
159	0.15
160	0.16
161	0.16
162	0.16
163	0.18
164	0.18
165	0.14
166	0.13
167	0.17
168	0.16
169	0.15
170	0.14
171	0.13
172	0.13
173	0.15
174	0.14
175	0.12
176	0.14
177	0.14
178	0.13
179	0.13
180	0.11
181	0.1
182	0.12
183	0.12
184	0.15
185	0.2
186	0.21
187	0.21
188	0.23
189	0.22
190	0.19
191	0.18
192	0.16
193	0.14
194	0.18
195	0.18
196	0.17
197	0.17
198	0.17
199	0.18
200	0.16
201	0.16
202	0.14
203	0.13
204	0.13
205	0.14
206	0.15
207	0.14
208	0.14
209	0.11
210	0.1
211	0.12
212	0.12
213	0.13
214	0.13
215	0.13
216	0.15
217	0.19
218	0.25
219	0.24
220	0.25
221	0.25
222	0.25
223	0.25
224	0.24
225	0.21
226	0.18
227	0.21
228	0.2
229	0.21
230	0.2
231	0.2
232	0.24
233	0.25
234	0.23
235	0.23
236	0.23
237	0.21
238	0.22
239	0.22
240	0.18
241	0.18
242	0.17
243	0.16
244	0.16
245	0.16
246	0.14
247	0.13
248	0.12
249	0.11
250	0.11
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.07
259	0.07
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.1
267	0.1
268	0.13
269	0.13
270	0.13
271	0.16
272	0.16
273	0.18
274	0.19
275	0.18
276	0.17
277	0.21
278	0.24
279	0.32
280	0.41
281	0.48
282	0.54
283	0.59
284	0.67
285	0.69
286	0.69
287	0.64
288	0.67
289	0.64
290	0.63
291	0.69
292	0.69
293	0.73
294	0.8
295	0.85
296	0.83
297	0.86
298	0.85
299	0.78
300	0.74
301	0.66
302	0.62
303	0.56
304	0.49
305	0.43
306	0.38
307	0.35
308	0.33
309	0.35
310	0.31
311	0.28
312	0.3
313	0.33
314	0.36
315	0.37
316	0.35
317	0.31
318	0.32
319	0.32
320	0.3
321	0.22
322	0.18
323	0.16
324	0.15
325	0.14
326	0.13
327	0.11
328	0.09
329	0.09
330	0.07
331	0.08
332	0.1
333	0.1
334	0.08
335	0.1
336	0.1
337	0.16
338	0.18
339	0.19
340	0.26
341	0.28
342	0.3
343	0.37
344	0.41
345	0.4
346	0.41
347	0.41
348	0.33
349	0.31
350	0.3
351	0.21
352	0.17
353	0.12
354	0.1
355	0.09
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.11
360	0.14
361	0.22
362	0.3
363	0.39
364	0.46
365	0.51
366	0.53
367	0.56
368	0.55
369	0.51
370	0.48
371	0.46
372	0.43
373	0.42
374	0.43
375	0.43
376	0.41
377	0.4
378	0.42
379	0.44
380	0.46
381	0.5
382	0.53
383	0.56
384	0.62
385	0.67
386	0.72
387	0.66
388	0.66
389	0.59
390	0.58
391	0.58
392	0.52
393	0.47
394	0.37
395	0.34
396	0.28
397	0.27
398	0.2
399	0.15
400	0.14
401	0.13
402	0.11
403	0.1
404	0.09
405	0.09
406	0.1
407	0.09
408	0.13
409	0.14
410	0.13
411	0.15
412	0.16
413	0.14
414	0.17
415	0.2
416	0.19
417	0.21
418	0.29
419	0.32
420	0.4
421	0.49
422	0.54
423	0.61
424	0.67
425	0.74
426	0.76
427	0.83
428	0.82
429	0.83
430	0.84
431	0.83
432	0.76
433	0.68
434	0.57
435	0.48
436	0.41
437	0.3
438	0.22
439	0.15
440	0.14
441	0.13
442	0.15
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.15
447	0.15
448	0.15
449	0.15
450	0.21
451	0.22
452	0.23
453	0.24
454	0.25
455	0.25
456	0.22
457	0.22
458	0.15
459	0.13
460	0.11
461	0.1
462	0.09
463	0.1
464	0.11
465	0.11
466	0.11
467	0.11
468	0.11
469	0.1
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.1
474	0.1
475	0.12
476	0.13
477	0.13
478	0.13
479	0.15
480	0.14
481	0.13
482	0.13
483	0.11
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.11
488	0.11
489	0.12
490	0.11
491	0.12
492	0.18
493	0.29
494	0.39
495	0.42
496	0.46
497	0.46
498	0.5
499	0.52
500	0.52
501	0.45
502	0.37
503	0.34
504	0.29
505	0.3
506	0.24
507	0.27
508	0.22
509	0.19
510	0.18
511	0.18
512	0.23
513	0.22
514	0.24
515	0.21
516	0.21
517	0.2
518	0.2
519	0.2
520	0.15
521	0.16
522	0.13
523	0.12
524	0.1
525	0.11
526	0.1
527	0.11
528	0.13
529	0.12
530	0.14
531	0.14
532	0.15
533	0.16
534	0.19
535	0.19
536	0.18
537	0.21
538	0.23
539	0.25
540	0.26
541	0.28
542	0.29
543	0.31
544	0.32
545	0.29
546	0.26
547	0.24
548	0.23
549	0.2
550	0.17
551	0.12
552	0.1
553	0.09
554	0.08
555	0.08
556	0.09
557	0.07
558	0.09
559	0.09
560	0.08
561	0.09
562	0.09
563	0.09
564	0.09
565	0.09
566	0.07
567	0.07
568	0.07
569	0.07
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.11
574	0.17
575	0.22
576	0.3
577	0.31
578	0.33
579	0.36
580	0.41
581	0.4
582	0.38
583	0.33
584	0.28
585	0.27
586	0.24
587	0.2
588	0.16
589	0.12
590	0.09
591	0.08
592	0.06
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.09
598	0.08
599	0.1
600	0.13
601	0.13
602	0.13
603	0.13
604	0.14
605	0.13
606	0.13
607	0.11
608	0.07
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.06
613	0.07
614	0.09
615	0.1
616	0.13
617	0.14
618	0.15
619	0.15
620	0.14
621	0.13
622	0.11
623	0.13
624	0.11
625	0.1
626	0.13
627	0.13
628	0.12
629	0.13
630	0.14
631	0.13
632	0.17
633	0.18
634	0.16
635	0.16
636	0.16
637	0.17
638	0.19
639	0.18
640	0.13
641	0.11
642	0.1
643	0.09
644	0.09
645	0.08
646	0.07
647	0.08
648	0.1
649	0.09
650	0.11
651	0.16
652	0.18
653	0.25
654	0.26
655	0.28
656	0.28
657	0.31
658	0.32
659	0.3
660	0.31
661	0.25
662	0.3
663	0.31
664	0.34
665	0.32
666	0.31
667	0.3
668	0.31
669	0.31
670	0.23
671	0.23
672	0.29
673	0.29
674	0.35
675	0.34
676	0.31
677	0.32
678	0.32
679	0.28
680	0.2
681	0.19
682	0.13
683	0.14
684	0.15
685	0.14
686	0.16
687	0.16
688	0.15
689	0.15
690	0.14
691	0.11
692	0.12
693	0.11
694	0.1
695	0.1
696	0.13
697	0.13
698	0.14
699	0.14
700	0.13
701	0.13
702	0.13
703	0.15
704	0.15
705	0.18
706	0.2
707	0.23
708	0.22
709	0.22
710	0.23
711	0.21
712	0.22
713	0.2
714	0.18
715	0.16
716	0.18
717	0.2
718	0.19
719	0.19
720	0.16
721	0.16
722	0.16
723	0.17
724	0.17
725	0.15
726	0.13
727	0.13
728	0.11
729	0.11
730	0.15
731	0.14
732	0.18
733	0.21
734	0.25
735	0.3
736	0.31
737	0.32
738	0.37
739	0.38
740	0.35
741	0.38
742	0.38
743	0.37
744	0.43
745	0.45
746	0.4
747	0.41
748	0.41
749	0.4
750	0.38
751	0.38
752	0.37
753	0.33
754	0.37
755	0.37
756	0.36
757	0.33
758	0.38
759	0.38
760	0.35
761	0.35
762	0.36
763	0.36
764	0.35
765	0.34
766	0.28
767	0.26
768	0.27
769	0.29
770	0.28
771	0.27
772	0.29
773	0.33
774	0.37
775	0.39
776	0.39
777	0.39
778	0.37
779	0.36
780	0.32
781	0.33
782	0.28
783	0.28
784	0.26
785	0.24
786	0.19
787	0.19
788	0.2
789	0.15
790	0.14
791	0.1
792	0.11
793	0.11
794	0.1
795	0.09
796	0.07
797	0.08
798	0.09
799	0.09
800	0.08
801	0.1
802	0.11
803	0.12
804	0.14
805	0.13
806	0.14
807	0.17
808	0.19
809	0.22
810	0.21
811	0.22
812	0.21
813	0.21
814	0.22
815	0.2
816	0.17
817	0.14
818	0.15
819	0.13
820	0.14
821	0.13
822	0.09
823	0.09
824	0.09
825	0.17
826	0.17
827	0.19
828	0.2
829	0.29
830	0.34
831	0.41
832	0.44
833	0.38
834	0.42
835	0.5
836	0.56
837	0.55
838	0.58
839	0.54
840	0.6
841	0.6
842	0.55
843	0.49
844	0.5
845	0.52
846	0.53
847	0.51
848	0.46
849	0.48
850	0.48
851	0.49
852	0.43
853	0.36
854	0.29
855	0.39
856	0.39
857	0.44
858	0.44
859	0.47
860	0.49
861	0.51
862	0.52
863	0.52
864	0.52
865	0.47
866	0.49
867	0.44
868	0.38
869	0.34
870	0.36
871	0.28
872	0.25
873	0.21
874	0.19
875	0.18
876	0.19
877	0.18
878	0.12
879	0.12
880	0.11
881	0.12
882	0.12
883	0.12
884	0.1
885	0.1
886	0.14
887	0.18
888	0.18
889	0.16
890	0.18
891	0.22
892	0.25
893	0.26
894	0.26
895	0.25
896	0.25
897	0.28
898	0.28
899	0.29
900	0.34
901	0.33
902	0.31
903	0.32
904	0.39
905	0.38
906	0.43
907	0.46
908	0.42
909	0.48
910	0.54
911	0.57
912	0.54
913	0.58
914	0.52
915	0.48
916	0.45
917	0.42
918	0.36
919	0.29
920	0.25
921	0.24
922	0.25
923	0.22
924	0.21
925	0.21
926	0.24
927	0.24
928	0.23
929	0.19
930	0.17
931	0.16
932	0.18
933	0.15
934	0.11
935	0.12
936	0.12
937	0.1
938	0.1
939	0.1
940	0.09
941	0.1
942	0.09
943	0.09
944	0.09
945	0.09
946	0.1
947	0.12
948	0.12
949	0.11
950	0.13
951	0.15
952	0.15
953	0.18
954	0.26
955	0.34
956	0.43
957	0.54
958	0.62
959	0.66
960	0.67
961	0.71
962	0.69
963	0.69
964	0.65
965	0.59
966	0.52
967	0.53
968	0.53
969	0.47
970	0.45
971	0.44
972	0.39
973	0.44
974	0.48
975	0.44
976	0.51
977	0.53
978	0.56
979	0.55
980	0.55
981	0.49
982	0.52
983	0.5
984	0.44
985	0.42
986	0.34
987	0.28
988	0.26
989	0.22
990	0.14
991	0.13
992	0.11
993	0.12
994	0.12
995	0.11
996	0.12
997	0.12
998	0.12
999	0.16
1000	0.17
1001	0.19
1002	0.21
1003	0.21
1004	0.21
1005	0.22
1006	0.22
1007	0.18
1008	0.17
1009	0.17
1010	0.14
1011	0.15
1012	0.14
1013	0.13
1014	0.14
1015	0.16
1016	0.17
1017	0.14
1018	0.16
1019	0.17
1020	0.21
1021	0.22
1022	0.2
1023	0.22
1024	0.24
1025	0.33
1026	0.39
1027	0.46
1028	0.51
1029	0.51
1030	0.53
1031	0.52
1032	0.55
1033	0.54
1034	0.55
1035	0.54
1036	0.53
1037	0.59
1038	0.6
1039	0.6
1040	0.63
1041	0.65
1042	0.66
1043	0.69
1044	0.71
1045	0.7
1046	0.78
1047	0.86
1048	0.87

A0A4V6T4V9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer