Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V4HIX0

Protein Details
Accession A0A4V4HIX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-164IWDPPKKLSKKKEKQLAKRGIRIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-161PKKLSKKKEKQLAKRG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.5, cyto 6, plas 2, mito 1, pero 1, E.R. 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023251  Brr1  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0030532  C:small nuclear ribonucleoprotein complex  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MSNPMKRKHEELDDSDDEEPYFGKQILPVANLPADFDGVPTDGMEYLFTVRRDARLLPQITRVPNPYEEPLPPPRLSSIPHPSIPSEEWRSVLGMRFKNLKQNLTQPTIHVDISSSSNRKLMPDKQERALWWEFLAGKPQTIWDPPKKLSKKKEKQLAKRGIRISESFKMEAEGGTTVQEYQVEDESVIVANVSNEVPAESPVLAIYRHVKPTPSLLKHIDEKTALHLLMYFTHWINLHLSSSSDSDPPFPRLRQTHAQWIFALLTRIEEHVSADDMSLLRNLARACISLLGTLIQEKAPEASETEPETETDPWIDVCSCWMIVSLIVGFWGQRDLWMDAEEILRKTRLET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.52
3 0.46
4 0.36
5 0.28
6 0.23
7 0.15
8 0.14
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.17
13 0.2
14 0.22
15 0.22
16 0.23
17 0.24
18 0.23
19 0.23
20 0.18
21 0.16
22 0.13
23 0.13
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.09
31 0.08
32 0.08
33 0.1
34 0.14
35 0.14
36 0.17
37 0.18
38 0.19
39 0.22
40 0.23
41 0.27
42 0.32
43 0.35
44 0.34
45 0.4
46 0.44
47 0.45
48 0.47
49 0.43
50 0.38
51 0.38
52 0.39
53 0.35
54 0.33
55 0.31
56 0.33
57 0.37
58 0.39
59 0.36
60 0.34
61 0.33
62 0.31
63 0.32
64 0.34
65 0.36
66 0.36
67 0.38
68 0.38
69 0.36
70 0.38
71 0.38
72 0.37
73 0.33
74 0.29
75 0.28
76 0.27
77 0.27
78 0.24
79 0.27
80 0.28
81 0.25
82 0.27
83 0.32
84 0.33
85 0.4
86 0.43
87 0.41
88 0.37
89 0.44
90 0.47
91 0.46
92 0.45
93 0.37
94 0.37
95 0.36
96 0.33
97 0.24
98 0.18
99 0.14
100 0.18
101 0.22
102 0.19
103 0.18
104 0.2
105 0.21
106 0.22
107 0.27
108 0.3
109 0.35
110 0.43
111 0.46
112 0.48
113 0.5
114 0.48
115 0.49
116 0.43
117 0.33
118 0.23
119 0.22
120 0.2
121 0.17
122 0.22
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.15
127 0.14
128 0.17
129 0.23
130 0.23
131 0.28
132 0.31
133 0.41
134 0.47
135 0.54
136 0.6
137 0.66
138 0.69
139 0.73
140 0.8
141 0.79
142 0.83
143 0.85
144 0.86
145 0.81
146 0.78
147 0.73
148 0.65
149 0.58
150 0.5
151 0.45
152 0.39
153 0.35
154 0.28
155 0.25
156 0.24
157 0.21
158 0.19
159 0.14
160 0.09
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.11
194 0.13
195 0.16
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.25
200 0.33
201 0.32
202 0.34
203 0.34
204 0.37
205 0.42
206 0.43
207 0.37
208 0.29
209 0.27
210 0.25
211 0.25
212 0.21
213 0.15
214 0.15
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.12
219 0.09
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.12
228 0.11
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.17
234 0.19
235 0.23
236 0.26
237 0.24
238 0.3
239 0.32
240 0.38
241 0.42
242 0.44
243 0.5
244 0.49
245 0.5
246 0.43
247 0.42
248 0.37
249 0.29
250 0.27
251 0.16
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.12
260 0.1
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.07
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.14
275 0.15
276 0.12
277 0.13
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.16
291 0.18
292 0.2
293 0.19
294 0.18
295 0.2
296 0.19
297 0.19
298 0.16
299 0.15
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.12
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.12
312 0.1
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.09
319 0.07
320 0.09
321 0.13
322 0.14
323 0.16
324 0.17
325 0.17
326 0.17
327 0.21
328 0.23
329 0.2
330 0.22
331 0.22