FuNGI

A0A4S8M1X0

Protein Details

Accession

A0A4S8M1X0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
286-309	IKRQRSFYKSKTLRQNQRRNESTF	Hydrophilic
978-999	APEMKRMREEARKTRVRKPKAQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
979-999	PEMKRMREEARKTRVRKPKAQ

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 10.5, cyto 6, pero 3, mito 2, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MPNPFVDIEAQIDDDDDCSPESLDGDNAWVTGDGLEDVHDNVGDGLENWKDEDLLDIAQHQGLSWPIFADYLLERYAKRPTSPPLIGDDALPNTALKIALITNDIAQDTFWRVKCKPGHEADLLMDIMRREMQEIPNTTSNLTSSFQSAEPTRSVQAQAFDHLCSTCVDPNASIPAIEAELKNILGSHYTAQWDHALSLGSPQDPDEDPSAAMDRLMTIWEQLVPHPSSASGPSVSHQPTLPSSSPLRSAFVVPIVIGFIYLEADLGLRPQETDIAEYLRGHKAVIKRQRSFYKSKTLRQNQRRNESTFAAKPWLVKSQVWMERISCEEVATLLSTPTPTIKTYSWVRILRGEYRGDVGLVISRQTSEVGCRLIVLLVPRLYQEPVDETTQEIEETASAKRKRGPELPQTLFNIDDYPGGVTKSNEGENHFIYKGKKIWHDLLCKSLDYSSVSQVDVDMDDATRRLFRASKHPIIQSICLPASRSWTFFYRDRVEVLCFGPLTEAQKQNPDLPRKTTIKYAVVIEVEAERCKVQFDEYAELDEDDTAEWVSKVNLRKRIYEGDGVEVVAGESNGRHGIVAASIDGLLEVRESLANEGDTFWVEANVCRVTEARDNNGVPWLGHLVTIFKGQYCGYQGVVLDVHPPRPYFTSLEVRISRLLLTVSVNHDDVYDSCSHQWLRLAAPLGPQQKHFHQATWDAEYAPNLKFNVYDYHEKRYLVAEDLVFRQPSQPWVGKEVRVVSKEWKALGTVKQVERTGKCASGIRLQVELRIMTAVHGLPVYWFDYAQVYDPKQPTPIPEWRRPTRAQTPPLSSNEFVDPFTSSEPSAGPSTDPQAPPTHWLLDPRLIGAKFYARWVPLYDLPMEKQLVEPTEQGIVKVYSGAEVFIARPEEIYDCAVRIRPSTNKKPIVAVRGEHTGKYMRQIHYKYDVNGKEIVTAAVYVNWGLSNEEYAEQVEVRPEELAETSNDWRHDPNEKRFAPEMKRMREEARKTRVRKPKAQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.12
3	0.1
4	0.1
5	0.1
6	0.1
7	0.1
8	0.11
9	0.11
10	0.11
11	0.1
12	0.12
13	0.12
14	0.11
15	0.11
16	0.1
17	0.1
18	0.08
19	0.09
20	0.07
21	0.07
22	0.08
23	0.08
24	0.08
25	0.09
26	0.08
27	0.08
28	0.08
29	0.08
30	0.07
31	0.07
32	0.1
33	0.1
34	0.11
35	0.12
36	0.12
37	0.12
38	0.11
39	0.13
40	0.12
41	0.12
42	0.12
43	0.12
44	0.13
45	0.14
46	0.13
47	0.11
48	0.11
49	0.12
50	0.13
51	0.12
52	0.12
53	0.11
54	0.12
55	0.11
56	0.12
57	0.11
58	0.12
59	0.14
60	0.15
61	0.16
62	0.18
63	0.26
64	0.27
65	0.29
66	0.32
67	0.37
68	0.45
69	0.47
70	0.47
71	0.44
72	0.46
73	0.43
74	0.39
75	0.36
76	0.28
77	0.26
78	0.24
79	0.18
80	0.13
81	0.14
82	0.12
83	0.08
84	0.08
85	0.08
86	0.09
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.13
91	0.13
92	0.12
93	0.11
94	0.12
95	0.15
96	0.21
97	0.23
98	0.28
99	0.28
100	0.37
101	0.43
102	0.47
103	0.51
104	0.51
105	0.55
106	0.51
107	0.53
108	0.46
109	0.43
110	0.37
111	0.28
112	0.23
113	0.16
114	0.15
115	0.14
116	0.13
117	0.12
118	0.16
119	0.2
120	0.26
121	0.3
122	0.35
123	0.38
124	0.39
125	0.37
126	0.34
127	0.3
128	0.25
129	0.23
130	0.18
131	0.15
132	0.16
133	0.16
134	0.19
135	0.2
136	0.2
137	0.21
138	0.23
139	0.23
140	0.22
141	0.24
142	0.22
143	0.25
144	0.23
145	0.26
146	0.25
147	0.24
148	0.23
149	0.21
150	0.2
151	0.16
152	0.17
153	0.16
154	0.16
155	0.17
156	0.16
157	0.17
158	0.21
159	0.19
160	0.17
161	0.14
162	0.13
163	0.13
164	0.15
165	0.13
166	0.1
167	0.12
168	0.12
169	0.11
170	0.1
171	0.09
172	0.09
173	0.1
174	0.1
175	0.12
176	0.14
177	0.14
178	0.15
179	0.17
180	0.16
181	0.15
182	0.15
183	0.13
184	0.11
185	0.14
186	0.14
187	0.13
188	0.13
189	0.13
190	0.15
191	0.15
192	0.17
193	0.16
194	0.15
195	0.14
196	0.16
197	0.17
198	0.14
199	0.13
200	0.11
201	0.09
202	0.08
203	0.09
204	0.08
205	0.06
206	0.07
207	0.08
208	0.09
209	0.1
210	0.15
211	0.15
212	0.16
213	0.15
214	0.15
215	0.15
216	0.16
217	0.18
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.2
222	0.21
223	0.21
224	0.2
225	0.2
226	0.2
227	0.26
228	0.26
229	0.23
230	0.24
231	0.25
232	0.3
233	0.29
234	0.28
235	0.23
236	0.24
237	0.21
238	0.2
239	0.18
240	0.13
241	0.12
242	0.1
243	0.08
244	0.07
245	0.06
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.08
259	0.08
260	0.1
261	0.11
262	0.12
263	0.13
264	0.14
265	0.17
266	0.17
267	0.17
268	0.15
269	0.18
270	0.22
271	0.3
272	0.39
273	0.45
274	0.48
275	0.56
276	0.64
277	0.66
278	0.68
279	0.64
280	0.66
281	0.64
282	0.67
283	0.71
284	0.72
285	0.77
286	0.8
287	0.85
288	0.84
289	0.86
290	0.84
291	0.77
292	0.71
293	0.64
294	0.59
295	0.52
296	0.44
297	0.38
298	0.33
299	0.31
300	0.28
301	0.3
302	0.27
303	0.24
304	0.25
305	0.3
306	0.35
307	0.34
308	0.33
309	0.29
310	0.28
311	0.3
312	0.29
313	0.2
314	0.14
315	0.13
316	0.12
317	0.11
318	0.1
319	0.08
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.12
328	0.12
329	0.17
330	0.21
331	0.26
332	0.32
333	0.33
334	0.34
335	0.36
336	0.38
337	0.38
338	0.37
339	0.33
340	0.26
341	0.26
342	0.24
343	0.19
344	0.16
345	0.11
346	0.1
347	0.09
348	0.09
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.09
361	0.1
362	0.09
363	0.11
364	0.1
365	0.11
366	0.11
367	0.12
368	0.12
369	0.12
370	0.11
371	0.1
372	0.12
373	0.13
374	0.13
375	0.12
376	0.13
377	0.13
378	0.12
379	0.09
380	0.07
381	0.06
382	0.07
383	0.08
384	0.15
385	0.16
386	0.18
387	0.23
388	0.27
389	0.31
390	0.37
391	0.43
392	0.45
393	0.54
394	0.55
395	0.54
396	0.52
397	0.48
398	0.41
399	0.33
400	0.25
401	0.16
402	0.13
403	0.09
404	0.08
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.09
410	0.1
411	0.12
412	0.13
413	0.15
414	0.17
415	0.17
416	0.2
417	0.18
418	0.19
419	0.18
420	0.21
421	0.22
422	0.24
423	0.26
424	0.27
425	0.35
426	0.38
427	0.44
428	0.41
429	0.43
430	0.4
431	0.36
432	0.33
433	0.26
434	0.2
435	0.17
436	0.17
437	0.15
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.13
442	0.12
443	0.09
444	0.09
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.06
452	0.07
453	0.09
454	0.11
455	0.21
456	0.28
457	0.34
458	0.38
459	0.38
460	0.41
461	0.41
462	0.4
463	0.32
464	0.27
465	0.21
466	0.18
467	0.18
468	0.14
469	0.19
470	0.18
471	0.18
472	0.17
473	0.19
474	0.22
475	0.24
476	0.29
477	0.27
478	0.27
479	0.27
480	0.26
481	0.25
482	0.23
483	0.2
484	0.16
485	0.12
486	0.11
487	0.1
488	0.09
489	0.11
490	0.14
491	0.16
492	0.16
493	0.2
494	0.21
495	0.26
496	0.31
497	0.34
498	0.32
499	0.33
500	0.39
501	0.39
502	0.39
503	0.39
504	0.36
505	0.32
506	0.32
507	0.29
508	0.24
509	0.21
510	0.19
511	0.15
512	0.13
513	0.11
514	0.09
515	0.09
516	0.07
517	0.07
518	0.08
519	0.07
520	0.07
521	0.09
522	0.12
523	0.15
524	0.15
525	0.17
526	0.16
527	0.16
528	0.15
529	0.12
530	0.09
531	0.05
532	0.05
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.05
538	0.08
539	0.15
540	0.2
541	0.29
542	0.3
543	0.33
544	0.36
545	0.41
546	0.4
547	0.38
548	0.34
549	0.28
550	0.27
551	0.24
552	0.2
553	0.15
554	0.12
555	0.07
556	0.06
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.05
566	0.05
567	0.04
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.04
578	0.04
579	0.05
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.09
592	0.09
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.11
597	0.17
598	0.19
599	0.2
600	0.24
601	0.24
602	0.24
603	0.26
604	0.24
605	0.18
606	0.16
607	0.15
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.08
612	0.09
613	0.11
614	0.1
615	0.08
616	0.09
617	0.09
618	0.11
619	0.12
620	0.12
621	0.11
622	0.12
623	0.12
624	0.12
625	0.12
626	0.1
627	0.13
628	0.12
629	0.14
630	0.14
631	0.15
632	0.15
633	0.17
634	0.2
635	0.17
636	0.21
637	0.28
638	0.28
639	0.35
640	0.34
641	0.34
642	0.32
643	0.3
644	0.25
645	0.18
646	0.16
647	0.1
648	0.1
649	0.11
650	0.13
651	0.14
652	0.14
653	0.13
654	0.13
655	0.13
656	0.12
657	0.13
658	0.12
659	0.11
660	0.11
661	0.14
662	0.14
663	0.15
664	0.17
665	0.15
666	0.15
667	0.18
668	0.19
669	0.16
670	0.2
671	0.25
672	0.29
673	0.29
674	0.3
675	0.31
676	0.32
677	0.38
678	0.35
679	0.3
680	0.27
681	0.32
682	0.33
683	0.33
684	0.31
685	0.26
686	0.25
687	0.25
688	0.24
689	0.19
690	0.18
691	0.14
692	0.13
693	0.13
694	0.14
695	0.18
696	0.2
697	0.3
698	0.29
699	0.36
700	0.39
701	0.39
702	0.38
703	0.35
704	0.33
705	0.26
706	0.26
707	0.19
708	0.19
709	0.22
710	0.23
711	0.2
712	0.19
713	0.18
714	0.17
715	0.19
716	0.22
717	0.24
718	0.23
719	0.3
720	0.33
721	0.32
722	0.34
723	0.37
724	0.37
725	0.34
726	0.34
727	0.33
728	0.36
729	0.37
730	0.34
731	0.29
732	0.25
733	0.28
734	0.3
735	0.33
736	0.34
737	0.34
738	0.38
739	0.4
740	0.45
741	0.42
742	0.42
743	0.37
744	0.31
745	0.3
746	0.29
747	0.3
748	0.31
749	0.33
750	0.3
751	0.31
752	0.3
753	0.3
754	0.28
755	0.25
756	0.18
757	0.15
758	0.14
759	0.1
760	0.12
761	0.1
762	0.08
763	0.08
764	0.08
765	0.07
766	0.09
767	0.1
768	0.08
769	0.08
770	0.08
771	0.1
772	0.1
773	0.14
774	0.17
775	0.18
776	0.25
777	0.27
778	0.27
779	0.28
780	0.29
781	0.29
782	0.31
783	0.39
784	0.4
785	0.47
786	0.56
787	0.59
788	0.66
789	0.65
790	0.67
791	0.67
792	0.69
793	0.67
794	0.66
795	0.66
796	0.66
797	0.67
798	0.63
799	0.54
800	0.47
801	0.44
802	0.37
803	0.3
804	0.25
805	0.21
806	0.18
807	0.19
808	0.18
809	0.13
810	0.13
811	0.13
812	0.15
813	0.15
814	0.14
815	0.13
816	0.14
817	0.18
818	0.23
819	0.23
820	0.23
821	0.26
822	0.27
823	0.29
824	0.31
825	0.3
826	0.25
827	0.29
828	0.3
829	0.32
830	0.32
831	0.29
832	0.32
833	0.28
834	0.28
835	0.26
836	0.27
837	0.22
838	0.25
839	0.27
840	0.21
841	0.23
842	0.25
843	0.28
844	0.27
845	0.29
846	0.29
847	0.27
848	0.28
849	0.31
850	0.29
851	0.24
852	0.22
853	0.22
854	0.21
855	0.21
856	0.2
857	0.17
858	0.22
859	0.22
860	0.2
861	0.2
862	0.18
863	0.16
864	0.16
865	0.15
866	0.11
867	0.11
868	0.11
869	0.09
870	0.09
871	0.09
872	0.11
873	0.13
874	0.11
875	0.12
876	0.13
877	0.14
878	0.15
879	0.17
880	0.15
881	0.14
882	0.16
883	0.19
884	0.19
885	0.2
886	0.24
887	0.31
888	0.4
889	0.5
890	0.58
891	0.62
892	0.62
893	0.68
894	0.69
895	0.67
896	0.62
897	0.55
898	0.48
899	0.5
900	0.5
901	0.42
902	0.39
903	0.36
904	0.32
905	0.38
906	0.42
907	0.38
908	0.45
909	0.48
910	0.52
911	0.55
912	0.58
913	0.53
914	0.55
915	0.53
916	0.47
917	0.48
918	0.41
919	0.35
920	0.31
921	0.28
922	0.18
923	0.17
924	0.14
925	0.11
926	0.11
927	0.09
928	0.09
929	0.09
930	0.09
931	0.09
932	0.09
933	0.1
934	0.11
935	0.12
936	0.12
937	0.13
938	0.14
939	0.13
940	0.13
941	0.16
942	0.14
943	0.15
944	0.14
945	0.13
946	0.14
947	0.14
948	0.15
949	0.13
950	0.17
951	0.2
952	0.25
953	0.26
954	0.26
955	0.28
956	0.3
957	0.38
958	0.44
959	0.49
960	0.55
961	0.55
962	0.6
963	0.64
964	0.68
965	0.66
966	0.67
967	0.66
968	0.65
969	0.69
970	0.66
971	0.68
972	0.7
973	0.73
974	0.72
975	0.73
976	0.74
977	0.75
978	0.81
979	0.83

A0A4S8M1X0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer