Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4S8MJ29

Protein Details
Accession A0A4S8MJ29    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-68ENEERMKQGKRPRKGQKREDLPKPTDBasic
176-199KEAALRDEKKAKKKAEKEKALAEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-34AKKRD
38-38K
40-40R
44-61NEERMKQGKRPRKGQKRE
174-194KAKEAALRDEKKAKKKAEKEK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MADKGGAYGTKAADTDFRKKWDKEEYAERAKKRDLEEKERMQENEERMKQGKRPRKGQKREDLPKPTDFMKQREGALELDKNLNKTMVVQNPGGRGAGQPGFYCETCNRTYKDTVGYLDHINSRAHLRALGQTTKLERSTLEQVRARIALLRERTKEASAAKAFDFDKRLAEVKAKEAALRDEKKAKKKAEKEKALAEELANNPENDEMAKMMGFGGFGSSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.32
3 0.34
4 0.4
5 0.46
6 0.47
7 0.53
8 0.56
9 0.57
10 0.56
11 0.6
12 0.63
13 0.66
14 0.72
15 0.69
16 0.64
17 0.62
18 0.61
19 0.56
20 0.56
21 0.54
22 0.56
23 0.62
24 0.66
25 0.68
26 0.68
27 0.63
28 0.58
29 0.55
30 0.52
31 0.52
32 0.46
33 0.44
34 0.42
35 0.45
36 0.47
37 0.52
38 0.55
39 0.54
40 0.62
41 0.69
42 0.76
43 0.83
44 0.87
45 0.87
46 0.89
47 0.89
48 0.89
49 0.86
50 0.8
51 0.72
52 0.64
53 0.56
54 0.53
55 0.48
56 0.42
57 0.39
58 0.37
59 0.35
60 0.34
61 0.34
62 0.27
63 0.26
64 0.23
65 0.19
66 0.22
67 0.22
68 0.21
69 0.2
70 0.18
71 0.15
72 0.16
73 0.2
74 0.19
75 0.21
76 0.22
77 0.23
78 0.24
79 0.25
80 0.22
81 0.16
82 0.12
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.1
87 0.12
88 0.14
89 0.14
90 0.16
91 0.13
92 0.16
93 0.17
94 0.2
95 0.2
96 0.2
97 0.22
98 0.21
99 0.23
100 0.21
101 0.2
102 0.18
103 0.19
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.15
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.14
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.2
121 0.23
122 0.22
123 0.18
124 0.15
125 0.17
126 0.25
127 0.26
128 0.31
129 0.3
130 0.31
131 0.32
132 0.32
133 0.28
134 0.23
135 0.21
136 0.21
137 0.25
138 0.3
139 0.3
140 0.34
141 0.36
142 0.33
143 0.35
144 0.31
145 0.32
146 0.28
147 0.28
148 0.24
149 0.26
150 0.26
151 0.26
152 0.27
153 0.2
154 0.2
155 0.2
156 0.22
157 0.2
158 0.25
159 0.23
160 0.24
161 0.29
162 0.27
163 0.26
164 0.26
165 0.31
166 0.34
167 0.36
168 0.38
169 0.42
170 0.49
171 0.57
172 0.64
173 0.67
174 0.68
175 0.75
176 0.81
177 0.83
178 0.85
179 0.81
180 0.82
181 0.78
182 0.7
183 0.62
184 0.51
185 0.47
186 0.39
187 0.39
188 0.31
189 0.26
190 0.23
191 0.22
192 0.21
193 0.15
194 0.14
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.09