Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V4HC06

Protein Details
Accession A0A4V4HC06    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
264-298HIKRFCPDKDDEKKKKKKKKDGKEKEKEKSKEKDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-248KKKKK
275-305EKKKKKKKKDGKEKEKEKSKEKDEDKSKAES
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSSPFTPFDEINPWSDAISSGSFREAKPEIKDASVTIDEVAETRAGVLNDSFIHPSYPLSSYSIQQKGDYFREVPKLDADGTNWADFKENWMYATYAAEIGHLVESKFEPPEFPELGTGRGANAAYDADLRSYNAYKLLENQCRVFLVQKLPSDVRRDVMDGTSCCRDIWFNLVKRFQVKVENDTADLKAPMPTQVIYDELRREYNSRNPKLPEWAKSKDKAAQSSSNSSSSKPQHALQAEEEKKKKKKDFSDYDCYGCGEKGHIKRFCPDKDDEKKKKKKKKDGKEKEKEKSKEKDEDKSKAESESKSSEGSEKGKGKESQANAVEEIEYAYSTDDAEDEVEYAYMAETLFEDSEDDVPDLQDLSDSDDEDWDDDSDDEEDFLPSRRFLNPPCCDEPTSGGTQDLYILTDDLVFDENAITFRQTSNYSILHRSLAHPDALVPPTKVSSKHLPKGMHQYPCPKET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.2
4 0.17
5 0.18
6 0.16
7 0.15
8 0.19
9 0.21
10 0.21
11 0.26
12 0.27
13 0.3
14 0.33
15 0.38
16 0.36
17 0.36
18 0.37
19 0.31
20 0.34
21 0.29
22 0.25
23 0.19
24 0.17
25 0.15
26 0.14
27 0.15
28 0.09
29 0.07
30 0.08
31 0.11
32 0.1
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.13
37 0.15
38 0.16
39 0.13
40 0.14
41 0.13
42 0.15
43 0.16
44 0.16
45 0.15
46 0.18
47 0.19
48 0.22
49 0.3
50 0.34
51 0.33
52 0.32
53 0.35
54 0.37
55 0.39
56 0.4
57 0.34
58 0.33
59 0.4
60 0.39
61 0.37
62 0.33
63 0.32
64 0.3
65 0.28
66 0.25
67 0.23
68 0.25
69 0.26
70 0.24
71 0.21
72 0.22
73 0.2
74 0.24
75 0.23
76 0.21
77 0.2
78 0.21
79 0.21
80 0.19
81 0.21
82 0.17
83 0.11
84 0.11
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.19
99 0.18
100 0.18
101 0.21
102 0.2
103 0.21
104 0.22
105 0.19
106 0.14
107 0.15
108 0.14
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.14
122 0.15
123 0.14
124 0.22
125 0.31
126 0.35
127 0.36
128 0.37
129 0.34
130 0.34
131 0.34
132 0.28
133 0.23
134 0.22
135 0.25
136 0.25
137 0.29
138 0.3
139 0.33
140 0.37
141 0.34
142 0.29
143 0.25
144 0.25
145 0.22
146 0.22
147 0.23
148 0.18
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.18
153 0.17
154 0.16
155 0.12
156 0.19
157 0.24
158 0.27
159 0.32
160 0.35
161 0.36
162 0.38
163 0.39
164 0.34
165 0.34
166 0.31
167 0.3
168 0.33
169 0.32
170 0.3
171 0.3
172 0.29
173 0.22
174 0.2
175 0.15
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.12
184 0.11
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.15
190 0.17
191 0.19
192 0.26
193 0.34
194 0.36
195 0.4
196 0.41
197 0.42
198 0.49
199 0.49
200 0.48
201 0.45
202 0.48
203 0.47
204 0.47
205 0.48
206 0.44
207 0.44
208 0.4
209 0.38
210 0.38
211 0.36
212 0.39
213 0.38
214 0.37
215 0.34
216 0.31
217 0.33
218 0.29
219 0.31
220 0.27
221 0.26
222 0.28
223 0.28
224 0.29
225 0.26
226 0.33
227 0.34
228 0.39
229 0.42
230 0.44
231 0.49
232 0.54
233 0.58
234 0.56
235 0.6
236 0.64
237 0.7
238 0.71
239 0.74
240 0.69
241 0.65
242 0.57
243 0.49
244 0.38
245 0.28
246 0.2
247 0.13
248 0.17
249 0.22
250 0.3
251 0.32
252 0.32
253 0.38
254 0.45
255 0.45
256 0.43
257 0.41
258 0.43
259 0.51
260 0.61
261 0.66
262 0.7
263 0.78
264 0.83
265 0.9
266 0.9
267 0.91
268 0.91
269 0.91
270 0.92
271 0.93
272 0.94
273 0.95
274 0.94
275 0.93
276 0.92
277 0.86
278 0.84
279 0.81
280 0.76
281 0.74
282 0.69
283 0.69
284 0.66
285 0.67
286 0.62
287 0.58
288 0.52
289 0.47
290 0.46
291 0.38
292 0.35
293 0.32
294 0.3
295 0.26
296 0.26
297 0.24
298 0.23
299 0.25
300 0.28
301 0.29
302 0.3
303 0.35
304 0.37
305 0.38
306 0.42
307 0.41
308 0.41
309 0.39
310 0.39
311 0.33
312 0.31
313 0.27
314 0.2
315 0.19
316 0.11
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.11
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.14
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.08
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.14
374 0.17
375 0.2
376 0.26
377 0.36
378 0.4
379 0.46
380 0.51
381 0.53
382 0.52
383 0.5
384 0.48
385 0.43
386 0.4
387 0.33
388 0.28
389 0.24
390 0.22
391 0.21
392 0.17
393 0.13
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.11
410 0.14
411 0.15
412 0.18
413 0.22
414 0.25
415 0.28
416 0.31
417 0.32
418 0.32
419 0.32
420 0.32
421 0.33
422 0.32
423 0.29
424 0.25
425 0.25
426 0.28
427 0.29
428 0.29
429 0.23
430 0.22
431 0.25
432 0.28
433 0.28
434 0.29
435 0.37
436 0.44
437 0.51
438 0.56
439 0.57
440 0.61
441 0.7
442 0.71
443 0.69
444 0.65
445 0.68