FuNGI

A0A4S8LWW4

Protein Details

Accession

A0A4S8LWW4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
270-291	APQHRIPIPRRKHPLNNRDRGM	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 16.5, cyto_nucl 12.5, nucl 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MHLYNLTLQPPTAITQAIVGNFSGARQQEIIASHGTRLELLRPDPQTGKISTVISTDVFGSIRSLAAFRLTGGTKDYAIVGSDSGRIIILDYDPKTTSFVKLHQETYGKSGARRIVPGQFLAVDPKGRSVMISAMEKAKLVYILNRDAAANLTISSPLEAHKNAAIIHHIVGLDVGFENPTFAALEVDYTESDQDPTGQAYENAEKMLTYYELDLGLNHVVRKWSEPTDRRANLLLQVPGGQLASSDKYDGPSGVLVCCEDHIIYRHMDAPQHRIPIPRRKHPLNNRDRGMLIVAAVMHKMKGAFFFLVQNEDGDLFKVTIEHEEEEVKALKIKYFDTVPVASSLCILKSGFLFVASEFSNHYLYQFQKLGDDDNEPEYSSTMYPSFGMSDPTRPLPAAFFRPRPLDNLAIADEIASLTPILDSKVLNVLPNSDTPQIFTACGRGTRSSLRILQHGLEVEESVSSDLPGIPNAVWTTKRTEEDPYDSYIILSFVNGTLVLSIGETIEEVQDTGFLSSAPTLAVQQIGADALLQVHPGGIRHVLANGHVTEWRSPTNKSIVAATTNKRQVVVALSSAELVYFELDLEGQLNEYQDRKAMGSTVLALSIGEVPEGRQRTPYLAVGCEDQTVRVVSLDPESTLETISLQALTAPPSSICIAEMMDFSITKVEPVMFVNIGLQNGVLLRTVLDPTSGQLVDTRTRFLGTRPIKLIRVQIQRQPAILALSSRSWLNYTHQNLMHFTPLIFDNFDYAWSFSAELSPEGLIGIAGSTLRIFQIPKLGTKLKEDSIPLSFTPRKFITHPSNHYFYLIEGDHRVIGDDAAAKKLAELRNQGKDIDDEVLELPQEVFGKPSGPAGTWGSAIRIIDPIEAKTVAYIPLDGNEAAFSLAVVPFSARNDDLHLVVGTAADTLVSPRSCSSGFLRTYQFTDDGAGLELLHKTETDDVPLALMAFQGRLAAGVGKALRIYDIGKKKLLRKVENKGFASAIISLHTQGSRIIVGDMQESVSYVVYKAPENRLLVFADDNQPRWVSAVTMVDYNTVAVGDRFGNILVNRLDPKVTDQVDDDPTGAGILHEKSILMGAPHKTKMIAHFHVGDLVTSIHKVAMVAGGREVLLYTCLHGTVGILVPFVSKEDVDFISTLEQHMRQENSSLVGRDHLAWRGYYTPVKAVIDGDLCEAFARLPTSKQSSIAVELDRTVGEVSKKLDQLRVTTSGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.15
3	0.18
4	0.18
5	0.17
6	0.15
7	0.15
8	0.14
9	0.14
10	0.16
11	0.14
12	0.15
13	0.15
14	0.15
15	0.18
16	0.19
17	0.21
18	0.21
19	0.21
20	0.2
21	0.21
22	0.21
23	0.19
24	0.18
25	0.21
26	0.22
27	0.24
28	0.31
29	0.31
30	0.36
31	0.37
32	0.4
33	0.4
34	0.36
35	0.37
36	0.33
37	0.32
38	0.28
39	0.27
40	0.24
41	0.2
42	0.19
43	0.16
44	0.14
45	0.13
46	0.12
47	0.12
48	0.11
49	0.11
50	0.11
51	0.11
52	0.1
53	0.12
54	0.12
55	0.11
56	0.16
57	0.16
58	0.16
59	0.19
60	0.2
61	0.18
62	0.19
63	0.19
64	0.14
65	0.14
66	0.14
67	0.11
68	0.11
69	0.12
70	0.12
71	0.11
72	0.1
73	0.09
74	0.09
75	0.1
76	0.11
77	0.16
78	0.17
79	0.2
80	0.21
81	0.21
82	0.24
83	0.24
84	0.27
85	0.24
86	0.29
87	0.35
88	0.39
89	0.4
90	0.43
91	0.45
92	0.41
93	0.43
94	0.44
95	0.36
96	0.33
97	0.37
98	0.37
99	0.37
100	0.39
101	0.38
102	0.38
103	0.39
104	0.39
105	0.35
106	0.29
107	0.27
108	0.28
109	0.26
110	0.23
111	0.21
112	0.22
113	0.22
114	0.2
115	0.2
116	0.17
117	0.18
118	0.19
119	0.22
120	0.22
121	0.24
122	0.24
123	0.24
124	0.23
125	0.2
126	0.17
127	0.15
128	0.18
129	0.2
130	0.24
131	0.25
132	0.26
133	0.25
134	0.23
135	0.24
136	0.19
137	0.15
138	0.11
139	0.1
140	0.1
141	0.1
142	0.1
143	0.09
144	0.09
145	0.13
146	0.13
147	0.15
148	0.16
149	0.17
150	0.17
151	0.18
152	0.2
153	0.17
154	0.17
155	0.17
156	0.15
157	0.13
158	0.13
159	0.11
160	0.09
161	0.08
162	0.08
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.06
167	0.07
168	0.06
169	0.06
170	0.07
171	0.06
172	0.07
173	0.08
174	0.09
175	0.09
176	0.09
177	0.1
178	0.1
179	0.1
180	0.1
181	0.1
182	0.1
183	0.11
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.15
188	0.18
189	0.18
190	0.17
191	0.16
192	0.14
193	0.14
194	0.15
195	0.12
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.11
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.12
204	0.13
205	0.12
206	0.13
207	0.14
208	0.15
209	0.19
210	0.21
211	0.26
212	0.34
213	0.39
214	0.46
215	0.54
216	0.55
217	0.54
218	0.52
219	0.47
220	0.42
221	0.41
222	0.35
223	0.25
224	0.25
225	0.22
226	0.2
227	0.18
228	0.13
229	0.08
230	0.1
231	0.11
232	0.1
233	0.12
234	0.12
235	0.13
236	0.15
237	0.14
238	0.13
239	0.13
240	0.13
241	0.12
242	0.12
243	0.11
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.08
248	0.09
249	0.12
250	0.13
251	0.14
252	0.15
253	0.18
254	0.18
255	0.23
256	0.23
257	0.28
258	0.31
259	0.34
260	0.35
261	0.39
262	0.45
263	0.51
264	0.57
265	0.59
266	0.63
267	0.67
268	0.76
269	0.79
270	0.83
271	0.83
272	0.85
273	0.78
274	0.72
275	0.64
276	0.54
277	0.45
278	0.34
279	0.23
280	0.15
281	0.12
282	0.09
283	0.1
284	0.09
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.1
291	0.1
292	0.11
293	0.14
294	0.15
295	0.17
296	0.17
297	0.16
298	0.14
299	0.14
300	0.13
301	0.1
302	0.1
303	0.08
304	0.07
305	0.08
306	0.07
307	0.09
308	0.11
309	0.11
310	0.12
311	0.13
312	0.13
313	0.15
314	0.16
315	0.13
316	0.16
317	0.15
318	0.16
319	0.17
320	0.17
321	0.18
322	0.18
323	0.19
324	0.19
325	0.19
326	0.18
327	0.18
328	0.18
329	0.15
330	0.15
331	0.14
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.08
336	0.08
337	0.1
338	0.09
339	0.08
340	0.09
341	0.07
342	0.1
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.11
347	0.12
348	0.11
349	0.12
350	0.13
351	0.15
352	0.19
353	0.2
354	0.19
355	0.19
356	0.2
357	0.22
358	0.2
359	0.21
360	0.18
361	0.18
362	0.19
363	0.17
364	0.16
365	0.14
366	0.14
367	0.11
368	0.11
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.11
374	0.1
375	0.14
376	0.13
377	0.16
378	0.18
379	0.19
380	0.2
381	0.18
382	0.18
383	0.16
384	0.19
385	0.24
386	0.28
387	0.29
388	0.32
389	0.36
390	0.36
391	0.37
392	0.37
393	0.31
394	0.27
395	0.26
396	0.23
397	0.2
398	0.19
399	0.15
400	0.11
401	0.08
402	0.07
403	0.05
404	0.04
405	0.03
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.1
413	0.11
414	0.12
415	0.12
416	0.13
417	0.13
418	0.15
419	0.17
420	0.16
421	0.16
422	0.16
423	0.18
424	0.16
425	0.15
426	0.14
427	0.14
428	0.13
429	0.15
430	0.16
431	0.15
432	0.17
433	0.19
434	0.22
435	0.23
436	0.26
437	0.26
438	0.26
439	0.26
440	0.24
441	0.23
442	0.21
443	0.17
444	0.13
445	0.11
446	0.09
447	0.08
448	0.07
449	0.06
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.06
457	0.05
458	0.07
459	0.07
460	0.09
461	0.1
462	0.11
463	0.16
464	0.18
465	0.2
466	0.2
467	0.24
468	0.25
469	0.29
470	0.3
471	0.28
472	0.26
473	0.24
474	0.23
475	0.19
476	0.16
477	0.1
478	0.09
479	0.06
480	0.04
481	0.05
482	0.04
483	0.04
484	0.03
485	0.04
486	0.04
487	0.03
488	0.03
489	0.03
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.04
523	0.04
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.06
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.09
532	0.08
533	0.09
534	0.1
535	0.1
536	0.11
537	0.12
538	0.15
539	0.15
540	0.16
541	0.17
542	0.2
543	0.21
544	0.2
545	0.2
546	0.17
547	0.2
548	0.23
549	0.23
550	0.26
551	0.28
552	0.28
553	0.26
554	0.25
555	0.22
556	0.2
557	0.19
558	0.13
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.1
563	0.09
564	0.06
565	0.05
566	0.04
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.04
573	0.03
574	0.04
575	0.04
576	0.05
577	0.05
578	0.06
579	0.07
580	0.07
581	0.08
582	0.08
583	0.07
584	0.08
585	0.07
586	0.07
587	0.08
588	0.07
589	0.06
590	0.06
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.04
596	0.04
597	0.04
598	0.08
599	0.1
600	0.1
601	0.1
602	0.11
603	0.13
604	0.15
605	0.17
606	0.15
607	0.14
608	0.15
609	0.15
610	0.15
611	0.13
612	0.11
613	0.09
614	0.08
615	0.08
616	0.07
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.07
621	0.07
622	0.07
623	0.07
624	0.08
625	0.08
626	0.07
627	0.07
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.05
632	0.04
633	0.04
634	0.05
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.05
639	0.07
640	0.08
641	0.07
642	0.07
643	0.06
644	0.06
645	0.07
646	0.07
647	0.06
648	0.06
649	0.06
650	0.05
651	0.06
652	0.06
653	0.05
654	0.06
655	0.05
656	0.06
657	0.06
658	0.08
659	0.07
660	0.07
661	0.08
662	0.09
663	0.09
664	0.08
665	0.07
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.04
670	0.03
671	0.04
672	0.05
673	0.06
674	0.05
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.09
679	0.09
680	0.08
681	0.09
682	0.12
683	0.15
684	0.16
685	0.16
686	0.14
687	0.15
688	0.15
689	0.14
690	0.22
691	0.21
692	0.26
693	0.28
694	0.31
695	0.32
696	0.33
697	0.38
698	0.36
699	0.42
700	0.4
701	0.41
702	0.45
703	0.44
704	0.42
705	0.37
706	0.29
707	0.21
708	0.19
709	0.15
710	0.1
711	0.09
712	0.1
713	0.09
714	0.09
715	0.09
716	0.09
717	0.12
718	0.19
719	0.21
720	0.26
721	0.28
722	0.29
723	0.3
724	0.3
725	0.29
726	0.21
727	0.17
728	0.13
729	0.13
730	0.12
731	0.11
732	0.09
733	0.09
734	0.09
735	0.1
736	0.09
737	0.09
738	0.08
739	0.08
740	0.09
741	0.07
742	0.09
743	0.08
744	0.08
745	0.08
746	0.07
747	0.07
748	0.06
749	0.06
750	0.04
751	0.04
752	0.03
753	0.03
754	0.03
755	0.03
756	0.03
757	0.03
758	0.04
759	0.05
760	0.05
761	0.06
762	0.13
763	0.14
764	0.16
765	0.21
766	0.25
767	0.26
768	0.3
769	0.33
770	0.27
771	0.29
772	0.28
773	0.26
774	0.24
775	0.25
776	0.2
777	0.24
778	0.26
779	0.24
780	0.28
781	0.27
782	0.27
783	0.28
784	0.35
785	0.38
786	0.43
787	0.5
788	0.5
789	0.53
790	0.5
791	0.49
792	0.41
793	0.31
794	0.27
795	0.2
796	0.16
797	0.13
798	0.13
799	0.13
800	0.12
801	0.13
802	0.08
803	0.08
804	0.07
805	0.1
806	0.1
807	0.11
808	0.11
809	0.11
810	0.11
811	0.17
812	0.19
813	0.19
814	0.26
815	0.31
816	0.37
817	0.39
818	0.38
819	0.34
820	0.32
821	0.29
822	0.24
823	0.18
824	0.12
825	0.11
826	0.11
827	0.1
828	0.09
829	0.08
830	0.07
831	0.08
832	0.07
833	0.07
834	0.07
835	0.09
836	0.09
837	0.11
838	0.11
839	0.1
840	0.13
841	0.14
842	0.15
843	0.15
844	0.15
845	0.14
846	0.14
847	0.14
848	0.12
849	0.11
850	0.11
851	0.11
852	0.12
853	0.12
854	0.12
855	0.13
856	0.12
857	0.11
858	0.11
859	0.1
860	0.09
861	0.1
862	0.08
863	0.09
864	0.11
865	0.1
866	0.09
867	0.08
868	0.08
869	0.07
870	0.07
871	0.05
872	0.05
873	0.05
874	0.05
875	0.05
876	0.05
877	0.06
878	0.07
879	0.1
880	0.09
881	0.1
882	0.13
883	0.15
884	0.14
885	0.15
886	0.14
887	0.12
888	0.11
889	0.11
890	0.07
891	0.06
892	0.05
893	0.04
894	0.04
895	0.04
896	0.08
897	0.08
898	0.09
899	0.1
900	0.13
901	0.13
902	0.16
903	0.19
904	0.23
905	0.25
906	0.28
907	0.31
908	0.3
909	0.32
910	0.32
911	0.29
912	0.21
913	0.21
914	0.17
915	0.14
916	0.13
917	0.11
918	0.09
919	0.09
920	0.09
921	0.08
922	0.08
923	0.07
924	0.07
925	0.11
926	0.12
927	0.13
928	0.14
929	0.13
930	0.13
931	0.14
932	0.13
933	0.08
934	0.09
935	0.06
936	0.05
937	0.05
938	0.05
939	0.05
940	0.05
941	0.05
942	0.06
943	0.06
944	0.08
945	0.09
946	0.09
947	0.09
948	0.09
949	0.09
950	0.09
951	0.11
952	0.17
953	0.25
954	0.28
955	0.34
956	0.39
957	0.45
958	0.51
959	0.58
960	0.59
961	0.6
962	0.68
963	0.72
964	0.77
965	0.71
966	0.67
967	0.58
968	0.49
969	0.41
970	0.32
971	0.22
972	0.14
973	0.13
974	0.11
975	0.13
976	0.12
977	0.11
978	0.1
979	0.11
980	0.1
981	0.1
982	0.1
983	0.09
984	0.1
985	0.11
986	0.1
987	0.1
988	0.09
989	0.09
990	0.09
991	0.08
992	0.08
993	0.07
994	0.09
995	0.1
996	0.13
997	0.17
998	0.22
999	0.27
1000	0.29
1001	0.3
1002	0.3
1003	0.29
1004	0.28
1005	0.25
1006	0.23
1007	0.26
1008	0.26
1009	0.27
1010	0.27
1011	0.26
1012	0.25
1013	0.24
1014	0.22
1015	0.14
1016	0.15
1017	0.17
1018	0.16
1019	0.17
1020	0.18
1021	0.17
1022	0.17
1023	0.16
1024	0.12
1025	0.08
1026	0.08
1027	0.06
1028	0.07
1029	0.07
1030	0.07
1031	0.08
1032	0.08
1033	0.12
1034	0.11
1035	0.16
1036	0.16
1037	0.19
1038	0.2
1039	0.21
1040	0.22
1041	0.19
1042	0.23
1043	0.27
1044	0.27
1045	0.25
1046	0.25
1047	0.29
1048	0.31
1049	0.32
1050	0.27
1051	0.19
1052	0.18
1053	0.16
1054	0.14
1055	0.09
1056	0.09
1057	0.09
1058	0.09
1059	0.09
1060	0.09
1061	0.09
1062	0.1
1063	0.11
1064	0.09
1065	0.13
1066	0.18
1067	0.23
1068	0.25
1069	0.25
1070	0.26
1071	0.27
1072	0.33
1073	0.37
1074	0.35
1075	0.34
1076	0.35
1077	0.35
1078	0.38
1079	0.35
1080	0.28
1081	0.2
1082	0.18
1083	0.14
1084	0.12
1085	0.12
1086	0.09
1087	0.09
1088	0.09
1089	0.08
1090	0.12
1091	0.13
1092	0.13
1093	0.13
1094	0.14
1095	0.13
1096	0.13
1097	0.13
1098	0.08
1099	0.08
1100	0.08
1101	0.09
1102	0.09
1103	0.09
1104	0.09
1105	0.09
1106	0.09
1107	0.1
1108	0.13
1109	0.12
1110	0.11
1111	0.11
1112	0.12
1113	0.12
1114	0.13
1115	0.11
1116	0.08
1117	0.09
1118	0.12
1119	0.13
1120	0.15
1121	0.15
1122	0.14
1123	0.16
1124	0.17
1125	0.18
1126	0.18
1127	0.19
1128	0.2
1129	0.26
1130	0.27
1131	0.24
1132	0.27
1133	0.27
1134	0.27
1135	0.29
1136	0.28
1137	0.23
1138	0.22
1139	0.23
1140	0.23
1141	0.25
1142	0.26
1143	0.24
1144	0.22
1145	0.24
1146	0.25
1147	0.28
1148	0.29
1149	0.28
1150	0.27
1151	0.31
1152	0.31
1153	0.29
1154	0.28
1155	0.27
1156	0.25
1157	0.23
1158	0.22
1159	0.17
1160	0.16
1161	0.15
1162	0.15
1163	0.11
1164	0.11
1165	0.14
1166	0.13
1167	0.16
1168	0.22
1169	0.3
1170	0.31
1171	0.33
1172	0.34
1173	0.34
1174	0.37
1175	0.39
1176	0.34
1177	0.28
1178	0.27
1179	0.26
1180	0.22
1181	0.2
1182	0.16
1183	0.15
1184	0.15
1185	0.17
1186	0.2
1187	0.26
1188	0.3
1189	0.32
1190	0.37
1191	0.36
1192	0.39
1193	0.41

A0A4S8LWW4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer