Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V4HIN7

Protein Details
Accession A0A4V4HIN7    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-99YTSQRPSKSFSSKPRRQRPEQARKRKRTAKRKEDIDLNDHydrophilic
115-140EAALKGSKKSSRPKKRKNDDQVLDSFHydrophilic
362-382QDVERRRKNAERLRSLTRKVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-92SSKPRRQRPEQARKRKRTAKRK
119-131KGSKKSSRPKKRK
368-369RK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDKGKLARDIFGGSDSELSDDDILDDDNNANNDSQHRQNLSADRDSNPDDDDDDSDDDEYTSQRPSKSFSSKPRRQRPEQARKRKRTAKRKEDIDLNDLPPEQASKHRIDLAIEAALKGSKKSSRPKKRKNDDQVLDSFADDQVARLRESMINAAEEDIRSNQEKLPATAKLRALPDAMDTLRKVSLAQSIIDNNLLEAVRKWLEPLPDRSLPTLNIQRELFTTLRKMEFIDSSVIKESGLGPLVLFYTKCKRVTPDVARIANELVSTWSRPIIKRSASFRDRHIPIASTLNADDDGQNPGGMAPRPEKLNAILARAKEEDKNRVRKNAVMIPQASLGTYTVAPSMNAGVLRNQGRTSVDQDVERRRKNAERLRSLTRKVKGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.16
4 0.15
5 0.13
6 0.13
7 0.11
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.09
12 0.08
13 0.09
14 0.09
15 0.12
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.14
20 0.18
21 0.22
22 0.27
23 0.31
24 0.32
25 0.33
26 0.39
27 0.45
28 0.47
29 0.49
30 0.46
31 0.42
32 0.43
33 0.44
34 0.39
35 0.33
36 0.28
37 0.22
38 0.21
39 0.2
40 0.19
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.1
49 0.13
50 0.16
51 0.17
52 0.18
53 0.23
54 0.3
55 0.38
56 0.45
57 0.52
58 0.6
59 0.67
60 0.77
61 0.84
62 0.85
63 0.84
64 0.87
65 0.87
66 0.87
67 0.9
68 0.9
69 0.9
70 0.91
71 0.93
72 0.93
73 0.92
74 0.91
75 0.91
76 0.91
77 0.9
78 0.87
79 0.83
80 0.81
81 0.75
82 0.7
83 0.64
84 0.54
85 0.46
86 0.39
87 0.33
88 0.24
89 0.2
90 0.16
91 0.17
92 0.2
93 0.2
94 0.23
95 0.26
96 0.26
97 0.26
98 0.26
99 0.22
100 0.21
101 0.19
102 0.16
103 0.13
104 0.14
105 0.13
106 0.12
107 0.13
108 0.15
109 0.21
110 0.32
111 0.43
112 0.53
113 0.64
114 0.75
115 0.83
116 0.89
117 0.93
118 0.93
119 0.93
120 0.87
121 0.81
122 0.73
123 0.65
124 0.55
125 0.44
126 0.34
127 0.23
128 0.18
129 0.12
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.13
137 0.14
138 0.16
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.08
147 0.1
148 0.1
149 0.12
150 0.12
151 0.17
152 0.18
153 0.18
154 0.21
155 0.23
156 0.24
157 0.27
158 0.27
159 0.26
160 0.26
161 0.25
162 0.22
163 0.19
164 0.17
165 0.15
166 0.14
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.08
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.1
191 0.11
192 0.15
193 0.18
194 0.23
195 0.26
196 0.29
197 0.3
198 0.3
199 0.29
200 0.27
201 0.29
202 0.3
203 0.25
204 0.25
205 0.25
206 0.24
207 0.23
208 0.26
209 0.21
210 0.15
211 0.17
212 0.16
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.16
220 0.14
221 0.15
222 0.16
223 0.15
224 0.13
225 0.13
226 0.11
227 0.09
228 0.1
229 0.08
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.09
236 0.15
237 0.21
238 0.23
239 0.24
240 0.27
241 0.33
242 0.43
243 0.48
244 0.51
245 0.54
246 0.54
247 0.54
248 0.51
249 0.45
250 0.35
251 0.28
252 0.18
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.13
258 0.16
259 0.17
260 0.21
261 0.26
262 0.29
263 0.34
264 0.4
265 0.47
266 0.5
267 0.52
268 0.53
269 0.56
270 0.53
271 0.51
272 0.47
273 0.39
274 0.35
275 0.37
276 0.32
277 0.25
278 0.22
279 0.19
280 0.18
281 0.17
282 0.15
283 0.11
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.13
290 0.13
291 0.15
292 0.15
293 0.17
294 0.2
295 0.21
296 0.22
297 0.21
298 0.28
299 0.27
300 0.3
301 0.31
302 0.29
303 0.32
304 0.33
305 0.33
306 0.31
307 0.34
308 0.39
309 0.45
310 0.55
311 0.56
312 0.62
313 0.63
314 0.61
315 0.64
316 0.62
317 0.6
318 0.56
319 0.52
320 0.45
321 0.45
322 0.4
323 0.33
324 0.25
325 0.18
326 0.13
327 0.12
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.2
339 0.23
340 0.24
341 0.23
342 0.24
343 0.26
344 0.29
345 0.32
346 0.32
347 0.32
348 0.34
349 0.41
350 0.5
351 0.57
352 0.59
353 0.56
354 0.56
355 0.61
356 0.67
357 0.7
358 0.7
359 0.71
360 0.71
361 0.79
362 0.81
363 0.81
364 0.8