FuNGI

A0A4S8MHA2

Protein Details

Accession

A0A4S8MHA2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
437-462	AKYKQNDAQMKKRKRQQERPSQALFH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MSNPFVDIEAQVEDDDDILDDEPLFLPSSDDEDGNSNPQGAGVEFADEGKEEEDEEPYYDLGDPWQNEDLLEQEQQDTTDATFTDYLLERYVQRATISPLREHHDDTLSNAALRTALLSSQVGKDSFWRVKCTPGCETELVIDLMLREQEKTSNVSSPVITPTPVSETTTNNSSTRSETGPSTCTTESAEEKAFDILCHFAVDPNGSIPGTHAELQLVLGSKYTSVWDQALNAATISDPEEDPLDALKRVTDMKPHLVPCIPTANLTTPSGNILASVSDSSSSTPTLTLTQNSNAPNDSELHPADLGLRPQDSDLMDYLRGHKLVIKRQEPFHQLKPVRQTRGRAQAAFTSTPWLAKAQVWLEKVSGEEIAVLLDTRAPSIKLYSWIKITRGTYKDDVGVVVCRETSAAQRRLAVLLVPRLTSTTISSHRRSPTSDAKYKQNDAQMKKRKRQQERPSQALFHTTDLSLDEVSTLQDHHFVYKGQEYEYGLLKKYVDYNSVTPIEVAIDDNTRRLFRASGHPILQSVAFPVPTNWTFFYQEKVHVLCHEKLTQSQIDNPDLPRKSEPRKLSSYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.09
3	0.08
4	0.08
5	0.07
6	0.08
7	0.07
8	0.08
9	0.08
10	0.09
11	0.1
12	0.09
13	0.1
14	0.1
15	0.15
16	0.15
17	0.15
18	0.15
19	0.17
20	0.19
21	0.21
22	0.21
23	0.17
24	0.16
25	0.16
26	0.16
27	0.12
28	0.13
29	0.1
30	0.11
31	0.1
32	0.11
33	0.11
34	0.1
35	0.11
36	0.09
37	0.09
38	0.09
39	0.1
40	0.12
41	0.12
42	0.14
43	0.14
44	0.13
45	0.14
46	0.12
47	0.12
48	0.13
49	0.17
50	0.16
51	0.19
52	0.21
53	0.2
54	0.2
55	0.2
56	0.19
57	0.17
58	0.17
59	0.14
60	0.14
61	0.14
62	0.14
63	0.15
64	0.13
65	0.11
66	0.11
67	0.1
68	0.12
69	0.11
70	0.11
71	0.14
72	0.14
73	0.14
74	0.14
75	0.16
76	0.14
77	0.16
78	0.18
79	0.15
80	0.15
81	0.17
82	0.21
83	0.26
84	0.29
85	0.3
86	0.32
87	0.37
88	0.39
89	0.39
90	0.37
91	0.35
92	0.32
93	0.31
94	0.33
95	0.28
96	0.26
97	0.23
98	0.2
99	0.15
100	0.14
101	0.13
102	0.07
103	0.07
104	0.08
105	0.09
106	0.1
107	0.12
108	0.15
109	0.14
110	0.14
111	0.17
112	0.22
113	0.28
114	0.29
115	0.34
116	0.32
117	0.41
118	0.44
119	0.47
120	0.44
121	0.42
122	0.44
123	0.38
124	0.38
125	0.3
126	0.28
127	0.23
128	0.18
129	0.14
130	0.1
131	0.09
132	0.1
133	0.09
134	0.08
135	0.08
136	0.1
137	0.12
138	0.15
139	0.16
140	0.19
141	0.2
142	0.21
143	0.21
144	0.2
145	0.22
146	0.19
147	0.18
148	0.14
149	0.14
150	0.17
151	0.17
152	0.19
153	0.17
154	0.19
155	0.21
156	0.24
157	0.25
158	0.21
159	0.22
160	0.21
161	0.22
162	0.22
163	0.2
164	0.19
165	0.19
166	0.2
167	0.21
168	0.21
169	0.22
170	0.2
171	0.19
172	0.18
173	0.19
174	0.19
175	0.19
176	0.2
177	0.16
178	0.16
179	0.17
180	0.16
181	0.13
182	0.12
183	0.1
184	0.09
185	0.09
186	0.09
187	0.08
188	0.09
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.11
200	0.1
201	0.1
202	0.1
203	0.11
204	0.09
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.06
212	0.07
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.1
217	0.11
218	0.1
219	0.09
220	0.08
221	0.07
222	0.07
223	0.08
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.08
231	0.08
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.1
237	0.11
238	0.15
239	0.16
240	0.21
241	0.26
242	0.26
243	0.27
244	0.26
245	0.26
246	0.22
247	0.24
248	0.19
249	0.15
250	0.16
251	0.16
252	0.17
253	0.17
254	0.16
255	0.12
256	0.13
257	0.12
258	0.11
259	0.08
260	0.06
261	0.05
262	0.06
263	0.05
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.09
274	0.1
275	0.11
276	0.11
277	0.13
278	0.16
279	0.17
280	0.17
281	0.15
282	0.15
283	0.14
284	0.14
285	0.15
286	0.14
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.12
291	0.13
292	0.12
293	0.11
294	0.09
295	0.09
296	0.08
297	0.08
298	0.1
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.1
304	0.1
305	0.13
306	0.12
307	0.12
308	0.11
309	0.14
310	0.17
311	0.24
312	0.32
313	0.34
314	0.36
315	0.39
316	0.45
317	0.49
318	0.49
319	0.48
320	0.49
321	0.46
322	0.47
323	0.54
324	0.55
325	0.55
326	0.54
327	0.53
328	0.51
329	0.6
330	0.59
331	0.5
332	0.44
333	0.41
334	0.41
335	0.38
336	0.3
337	0.23
338	0.19
339	0.19
340	0.18
341	0.14
342	0.12
343	0.11
344	0.15
345	0.15
346	0.19
347	0.2
348	0.2
349	0.2
350	0.19
351	0.18
352	0.15
353	0.12
354	0.07
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.03
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.09
368	0.1
369	0.16
370	0.19
371	0.21
372	0.26
373	0.27
374	0.29
375	0.32
376	0.33
377	0.34
378	0.34
379	0.37
380	0.34
381	0.33
382	0.33
383	0.28
384	0.26
385	0.19
386	0.19
387	0.14
388	0.12
389	0.1
390	0.09
391	0.09
392	0.09
393	0.15
394	0.22
395	0.26
396	0.27
397	0.29
398	0.3
399	0.3
400	0.3
401	0.25
402	0.19
403	0.2
404	0.19
405	0.18
406	0.17
407	0.17
408	0.18
409	0.17
410	0.16
411	0.16
412	0.22
413	0.28
414	0.3
415	0.36
416	0.4
417	0.41
418	0.43
419	0.44
420	0.48
421	0.51
422	0.57
423	0.54
424	0.59
425	0.63
426	0.64
427	0.61
428	0.59
429	0.58
430	0.57
431	0.64
432	0.65
433	0.69
434	0.74
435	0.77
436	0.79
437	0.82
438	0.86
439	0.86
440	0.87
441	0.87
442	0.86
443	0.83
444	0.75
445	0.65
446	0.61
447	0.51
448	0.42
449	0.34
450	0.25
451	0.21
452	0.19
453	0.19
454	0.13
455	0.11
456	0.09
457	0.07
458	0.08
459	0.08
460	0.08
461	0.07
462	0.11
463	0.11
464	0.13
465	0.14
466	0.14
467	0.17
468	0.22
469	0.23
470	0.2
471	0.23
472	0.23
473	0.24
474	0.3
475	0.29
476	0.25
477	0.25
478	0.24
479	0.23
480	0.27
481	0.27
482	0.24
483	0.25
484	0.26
485	0.31
486	0.32
487	0.3
488	0.25
489	0.22
490	0.2
491	0.16
492	0.16
493	0.11
494	0.14
495	0.14
496	0.17
497	0.2
498	0.19
499	0.2
500	0.2
501	0.2
502	0.2
503	0.3
504	0.35
505	0.39
506	0.41
507	0.41
508	0.4
509	0.4
510	0.36
511	0.26
512	0.21
513	0.17
514	0.15
515	0.14
516	0.14
517	0.2
518	0.2
519	0.24
520	0.23
521	0.25
522	0.29
523	0.3
524	0.35
525	0.31
526	0.35
527	0.37
528	0.36
529	0.34
530	0.35
531	0.4
532	0.38
533	0.41
534	0.41
535	0.37
536	0.39
537	0.42
538	0.42
539	0.39
540	0.42
541	0.42
542	0.43
543	0.44
544	0.45
545	0.48
546	0.45
547	0.46
548	0.47
549	0.51
550	0.54
551	0.59
552	0.64
553	0.63

A0A4S8MHA2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer