Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V4HHM4

Protein Details
Accession A0A4V4HHM4    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-131VEIAKQPDQKDKEKKARKPKRRFGRRGSKAVPGEBasic
148-175ATPAEGADKKKKKKKARKSKKAADAAAGBasic
187-213ATEAAPKKKTPRQRKPRTPRPAGEDPVHydrophilic
246-267VTTARIVRRKWPSRRRSYGPESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-126KDKEKKARKPKRRFGRRGSK
155-207DKKKKKKKARKSKKAADAAAGGAEKPAEGEAEATEAAPKKKTPRQRKPRTPRP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025239  DUF4187  
IPR039249  GPATCH11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13821  DUF4187  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAPAAAQVTENGAPVTQVQEEPGHKVFAGNLAYSTTDEGLKAFFEPVSSDIITAQVILRGTRSAGYGFVALSSAEAAQKAVDLLDKKELDGRPVIVEIAKQPDQKDKEKKARKPKRRFGRRGSKAVPGEVSEAEANGATTQAEDGATPAEGADKKKKKKKARKSKKAADAAAGGAEKPAEGEAEATEAAPKKKTPRQRKPRTPRPAGEDPVGEPSKTMLFVANLGFNIDDAGLAALFTEAGITVTTARIVRRKWPSRRRSYGPESEEQKQAIRRSKGYGFVDVGSEEQQKTAIELLNGKDVGGRPIAVKIAVNTPEEESSAEAAPTTEAAEANERNKTRSRRDREVEAREEGLSKSLFARAQEEKEKLGSDGGTGSSSGTGNKALSIMMKMGFKPGQSLGRVDNGGDNNDDQGDSSSSSTPALPLPSTLELSKNKDPNNRNEAGTSSTGASISMEISSVNKGFSHRTEPLPLTEWEGKKGIGTSKKRGPSPTSAERVAKMAKMAEETSKEDFRDRTRREYQERRAEGRLGPAQRTCQNLDEDAGKKFNVLWLNPGNPETLPPGLIDALSLHTTLDFSSLNHGYRGDREDKDVVATRLRQQIKSDALQSLDDDDDELQYDDDNDGKQNKDTAIESFSDEMLEEVTQFLRLQAQDRLSLVLSYLRDNYAYCFWCGTQYDDQEEMVNQCPGDDEELH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.15
5 0.13
6 0.12
7 0.14
8 0.19
9 0.21
10 0.27
11 0.28
12 0.26
13 0.24
14 0.25
15 0.23
16 0.24
17 0.24
18 0.19
19 0.18
20 0.17
21 0.18
22 0.18
23 0.19
24 0.14
25 0.12
26 0.12
27 0.12
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.11
35 0.12
36 0.16
37 0.15
38 0.15
39 0.13
40 0.14
41 0.14
42 0.13
43 0.12
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.11
53 0.12
54 0.13
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.11
71 0.12
72 0.14
73 0.22
74 0.22
75 0.22
76 0.29
77 0.3
78 0.29
79 0.3
80 0.29
81 0.23
82 0.23
83 0.24
84 0.17
85 0.18
86 0.18
87 0.22
88 0.25
89 0.26
90 0.27
91 0.36
92 0.41
93 0.49
94 0.57
95 0.6
96 0.66
97 0.74
98 0.82
99 0.84
100 0.9
101 0.91
102 0.92
103 0.92
104 0.93
105 0.94
106 0.94
107 0.94
108 0.94
109 0.92
110 0.91
111 0.84
112 0.82
113 0.74
114 0.66
115 0.57
116 0.47
117 0.41
118 0.31
119 0.29
120 0.19
121 0.17
122 0.14
123 0.12
124 0.1
125 0.07
126 0.07
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.09
139 0.12
140 0.16
141 0.26
142 0.35
143 0.45
144 0.54
145 0.64
146 0.71
147 0.8
148 0.87
149 0.88
150 0.91
151 0.92
152 0.95
153 0.95
154 0.94
155 0.92
156 0.83
157 0.75
158 0.65
159 0.54
160 0.46
161 0.35
162 0.25
163 0.16
164 0.13
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.09
176 0.12
177 0.13
178 0.15
179 0.17
180 0.23
181 0.3
182 0.41
183 0.5
184 0.58
185 0.68
186 0.78
187 0.87
188 0.91
189 0.95
190 0.95
191 0.93
192 0.87
193 0.85
194 0.82
195 0.74
196 0.66
197 0.56
198 0.46
199 0.45
200 0.4
201 0.31
202 0.22
203 0.19
204 0.17
205 0.16
206 0.15
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.02
228 0.02
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.06
235 0.07
236 0.09
237 0.13
238 0.14
239 0.22
240 0.33
241 0.42
242 0.52
243 0.62
244 0.7
245 0.77
246 0.84
247 0.82
248 0.81
249 0.79
250 0.78
251 0.72
252 0.69
253 0.63
254 0.58
255 0.54
256 0.45
257 0.4
258 0.36
259 0.37
260 0.38
261 0.37
262 0.35
263 0.37
264 0.39
265 0.43
266 0.4
267 0.37
268 0.3
269 0.27
270 0.26
271 0.21
272 0.2
273 0.14
274 0.14
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.11
284 0.11
285 0.14
286 0.14
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.13
291 0.11
292 0.11
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.11
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.14
304 0.14
305 0.14
306 0.13
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.08
320 0.09
321 0.11
322 0.15
323 0.15
324 0.17
325 0.23
326 0.28
327 0.35
328 0.45
329 0.51
330 0.56
331 0.59
332 0.66
333 0.68
334 0.7
335 0.64
336 0.55
337 0.48
338 0.39
339 0.37
340 0.27
341 0.21
342 0.13
343 0.1
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.1
348 0.14
349 0.15
350 0.19
351 0.23
352 0.24
353 0.22
354 0.22
355 0.22
356 0.18
357 0.17
358 0.13
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.13
384 0.14
385 0.17
386 0.17
387 0.18
388 0.17
389 0.19
390 0.19
391 0.17
392 0.19
393 0.16
394 0.16
395 0.15
396 0.13
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.1
412 0.08
413 0.08
414 0.11
415 0.11
416 0.13
417 0.12
418 0.16
419 0.18
420 0.25
421 0.3
422 0.33
423 0.36
424 0.43
425 0.47
426 0.52
427 0.56
428 0.52
429 0.47
430 0.43
431 0.41
432 0.36
433 0.32
434 0.24
435 0.17
436 0.14
437 0.13
438 0.12
439 0.11
440 0.07
441 0.07
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.09
451 0.12
452 0.14
453 0.2
454 0.21
455 0.24
456 0.28
457 0.29
458 0.3
459 0.3
460 0.28
461 0.28
462 0.32
463 0.3
464 0.28
465 0.27
466 0.25
467 0.22
468 0.24
469 0.24
470 0.27
471 0.32
472 0.37
473 0.44
474 0.5
475 0.52
476 0.55
477 0.54
478 0.53
479 0.55
480 0.56
481 0.54
482 0.52
483 0.51
484 0.47
485 0.45
486 0.38
487 0.31
488 0.24
489 0.2
490 0.17
491 0.17
492 0.18
493 0.18
494 0.19
495 0.22
496 0.25
497 0.26
498 0.26
499 0.26
500 0.28
501 0.33
502 0.4
503 0.41
504 0.45
505 0.52
506 0.59
507 0.66
508 0.73
509 0.76
510 0.76
511 0.78
512 0.75
513 0.69
514 0.64
515 0.55
516 0.53
517 0.49
518 0.42
519 0.39
520 0.36
521 0.38
522 0.38
523 0.41
524 0.36
525 0.33
526 0.32
527 0.3
528 0.29
529 0.3
530 0.28
531 0.27
532 0.26
533 0.22
534 0.2
535 0.19
536 0.22
537 0.21
538 0.19
539 0.23
540 0.26
541 0.29
542 0.3
543 0.31
544 0.28
545 0.23
546 0.24
547 0.21
548 0.16
549 0.14
550 0.12
551 0.13
552 0.12
553 0.12
554 0.11
555 0.08
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.08
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.1
564 0.08
565 0.07
566 0.14
567 0.17
568 0.18
569 0.18
570 0.2
571 0.19
572 0.23
573 0.28
574 0.29
575 0.27
576 0.31
577 0.33
578 0.32
579 0.35
580 0.36
581 0.33
582 0.32
583 0.33
584 0.35
585 0.41
586 0.45
587 0.43
588 0.41
589 0.46
590 0.47
591 0.47
592 0.45
593 0.38
594 0.36
595 0.34
596 0.31
597 0.27
598 0.21
599 0.17
600 0.14
601 0.12
602 0.11
603 0.11
604 0.11
605 0.08
606 0.08
607 0.09
608 0.09
609 0.1
610 0.11
611 0.13
612 0.17
613 0.19
614 0.2
615 0.23
616 0.23
617 0.24
618 0.25
619 0.23
620 0.23
621 0.22
622 0.23
623 0.21
624 0.2
625 0.17
626 0.16
627 0.13
628 0.11
629 0.1
630 0.08
631 0.07
632 0.08
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.13
637 0.14
638 0.17
639 0.22
640 0.24
641 0.26
642 0.27
643 0.29
644 0.25
645 0.23
646 0.21
647 0.2
648 0.18
649 0.18
650 0.2
651 0.18
652 0.18
653 0.19
654 0.22
655 0.25
656 0.26
657 0.24
658 0.24
659 0.23
660 0.28
661 0.29
662 0.31
663 0.32
664 0.34
665 0.38
666 0.37
667 0.37
668 0.33
669 0.34
670 0.3
671 0.26
672 0.24
673 0.18
674 0.17
675 0.18
676 0.17