Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V4HCW1

Protein Details
Accession A0A4V4HCW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-77SNKSDRTSGSSRRRSRRHKHKKSRKDNREKLKPVPPTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-72SSRRRSRRHKHKKSRKDNREKLK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MSKPVKHVDPNSYLGRAIFGSSKSSTPGSDDPDSSSSSDESNKSDRTSGSSRRRSRRHKHKKSRKDNREKLKPVPPTEYDGTPDARVLHRFCQESRDYLEAGKVKKYRQVFTISRFLKGTAWEFYLNTVARDVYSWDLEKFWVELLNYCFPTNYMAKLRKDLDRCYQNSRTVKTYVHELNELYDLVGQADVRTRVTRLWKGFRESIRSELYRAGLHPEISFWDEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.32
3 0.24
4 0.21
5 0.18
6 0.15
7 0.18
8 0.19
9 0.2
10 0.21
11 0.22
12 0.2
13 0.23
14 0.25
15 0.28
16 0.29
17 0.29
18 0.3
19 0.31
20 0.32
21 0.27
22 0.25
23 0.19
24 0.18
25 0.2
26 0.18
27 0.2
28 0.24
29 0.25
30 0.25
31 0.27
32 0.26
33 0.29
34 0.34
35 0.4
36 0.46
37 0.54
38 0.62
39 0.69
40 0.79
41 0.83
42 0.87
43 0.89
44 0.9
45 0.91
46 0.93
47 0.95
48 0.96
49 0.97
50 0.97
51 0.97
52 0.97
53 0.95
54 0.95
55 0.94
56 0.89
57 0.85
58 0.82
59 0.78
60 0.7
61 0.66
62 0.57
63 0.52
64 0.48
65 0.42
66 0.35
67 0.3
68 0.28
69 0.22
70 0.21
71 0.16
72 0.15
73 0.18
74 0.17
75 0.2
76 0.23
77 0.24
78 0.24
79 0.28
80 0.27
81 0.27
82 0.28
83 0.25
84 0.21
85 0.19
86 0.23
87 0.21
88 0.2
89 0.24
90 0.23
91 0.22
92 0.27
93 0.3
94 0.28
95 0.27
96 0.34
97 0.31
98 0.34
99 0.42
100 0.38
101 0.36
102 0.35
103 0.32
104 0.26
105 0.24
106 0.22
107 0.14
108 0.15
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.17
113 0.15
114 0.13
115 0.12
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.08
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.11
132 0.14
133 0.18
134 0.19
135 0.19
136 0.18
137 0.17
138 0.2
139 0.18
140 0.18
141 0.21
142 0.27
143 0.28
144 0.34
145 0.37
146 0.4
147 0.44
148 0.45
149 0.47
150 0.49
151 0.51
152 0.54
153 0.56
154 0.58
155 0.6
156 0.59
157 0.53
158 0.47
159 0.46
160 0.39
161 0.41
162 0.37
163 0.33
164 0.31
165 0.28
166 0.27
167 0.26
168 0.25
169 0.17
170 0.14
171 0.11
172 0.09
173 0.1
174 0.08
175 0.07
176 0.11
177 0.12
178 0.13
179 0.14
180 0.15
181 0.19
182 0.27
183 0.35
184 0.39
185 0.47
186 0.51
187 0.56
188 0.63
189 0.64
190 0.64
191 0.59
192 0.57
193 0.55
194 0.51
195 0.46
196 0.42
197 0.39
198 0.33
199 0.31
200 0.31
201 0.26
202 0.26
203 0.24
204 0.22
205 0.23