FuNGI

A0A4V4HDU8

Protein Details

Accession

A0A4V4HDU8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1044-1064	RKAARKTESGKTKRLYKPKPR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1042-1064	KLRKAARKTESGKTKRLYKPKPR

Subcellular Location(s)

mito 13, cyto 7.5, cyto_nucl 6.5, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II

Amino Acid Sequences

MACRPGLARVFQRLLTPSLFPSYFQRVRRLGGALPLVDPVDMCKLLVNYVSYSSMSRNPFVDHEAYEDDDEEYGFGGEGGGEGDNEEDEDLPSWVDRSGVNWDDEDMIDTSTRLDIEEFADHLAQRYTAPTIGETSRISAHAQEVEPALRKALMTEETTQSFWRVKCKPGTETDLVFDIMQHQIEVSPAIPTLPHSYPSTIPPASEAVQLIQTFAQSATAAVDEISDTVARVLGIKSLPELWRKAIDATILDPDEAQENPLRGLERFNDLVPELLLSCASSGNDGVCHPSGPLTNVTRLPEQNNSDLKQQWRCEDTSQVFSAFSVADNPGSIYLEAFLTRFPQPQSWVRVTKGMYSGDVGLVLRREITTSMRRLVLLLVPRLPAPPSRATPPPRPPHPNHPLSWEADPSFDPLPLSPPQTPSPVALGKRKHTDKKFEQRLFIIGEFPHFTQTGHKRYQHRTVLYEHGLRVCCLGYSSVTQVDVVMDHCTRLLFRASGHPALNHVPLPVCDDWVFFVEEKVEVIHSAPLTIHQVLNPGVPDQTYLKNATVVNVNVDTCTVHLDDYEAFREEDTSFEVKKVNIRKILKTGDSVIVEVGDMKGRYGFVLSSWGDEVEVGETGDRVGQSFFVHPNVCRLSNARDDTVVPWLNRHITIIRGQYRGYTGIVLDTFPPRPLYTMLEVKILNLLLAVRIRHDDVHDTCANRPLQEAFPLRLHQRHFMQATWGLSFAPNVDTSQVDPHTGREIVPQDLLIRQPDQPWLEVPVIVVKGSLKHRGTVKRVERNHRVSSGLKVDVELNYASAEFGVSPRFTFDYSWVRDPTTGLPLHIRYPLHGRQKYWEPLSRVKAVLVPNPKFSTAPARALAPSLPTPTWNGGDFVDPFQTSEATASDASSSSPASPVHWAVDPRLDGKEFFVRWQPDEGLGMAKVAAKPDCTLGRVLLSDGGENWFVPPHEIFDLMLSVKPTTNKAALVVVRGEHIGKSLRQIFCKYVDGVEEPVITAAVYDKWGTSAEKQIEPYVEVRAEDCAFATSEPNKSLFKEEIDKLRKAARKTESGKTKRLYKPKPR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.36
3	0.33
4	0.27
5	0.3
6	0.29
7	0.27
8	0.3
9	0.36
10	0.41
11	0.43
12	0.49
13	0.46
14	0.49
15	0.52
16	0.49
17	0.41
18	0.41
19	0.41
20	0.34
21	0.31
22	0.29
23	0.25
24	0.22
25	0.19
26	0.15
27	0.15
28	0.14
29	0.13
30	0.15
31	0.15
32	0.16
33	0.19
34	0.19
35	0.16
36	0.18
37	0.19
38	0.18
39	0.19
40	0.21
41	0.25
42	0.26
43	0.27
44	0.27
45	0.28
46	0.29
47	0.32
48	0.32
49	0.26
50	0.27
51	0.27
52	0.28
53	0.26
54	0.24
55	0.2
56	0.17
57	0.16
58	0.12
59	0.1
60	0.08
61	0.07
62	0.06
63	0.05
64	0.04
65	0.05
66	0.05
67	0.05
68	0.05
69	0.05
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.07
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.08
82	0.09
83	0.08
84	0.1
85	0.17
86	0.2
87	0.21
88	0.2
89	0.21
90	0.22
91	0.22
92	0.22
93	0.15
94	0.13
95	0.12
96	0.12
97	0.12
98	0.11
99	0.11
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.11
104	0.13
105	0.13
106	0.13
107	0.15
108	0.14
109	0.15
110	0.15
111	0.13
112	0.12
113	0.13
114	0.13
115	0.13
116	0.14
117	0.14
118	0.17
119	0.17
120	0.2
121	0.19
122	0.19
123	0.19
124	0.19
125	0.2
126	0.17
127	0.19
128	0.2
129	0.2
130	0.2
131	0.2
132	0.22
133	0.24
134	0.23
135	0.21
136	0.17
137	0.16
138	0.15
139	0.17
140	0.17
141	0.17
142	0.21
143	0.24
144	0.25
145	0.27
146	0.27
147	0.25
148	0.27
149	0.26
150	0.31
151	0.31
152	0.36
153	0.43
154	0.48
155	0.5
156	0.51
157	0.58
158	0.53
159	0.51
160	0.46
161	0.4
162	0.35
163	0.3
164	0.23
165	0.17
166	0.15
167	0.13
168	0.11
169	0.09
170	0.08
171	0.09
172	0.1
173	0.08
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.09
179	0.14
180	0.15
181	0.17
182	0.19
183	0.21
184	0.23
185	0.26
186	0.31
187	0.25
188	0.24
189	0.23
190	0.24
191	0.23
192	0.23
193	0.2
194	0.15
195	0.18
196	0.18
197	0.17
198	0.14
199	0.12
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.06
217	0.06
218	0.07
219	0.07
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.14
225	0.18
226	0.21
227	0.23
228	0.23
229	0.25
230	0.26
231	0.26
232	0.23
233	0.21
234	0.18
235	0.17
236	0.19
237	0.17
238	0.16
239	0.14
240	0.14
241	0.14
242	0.12
243	0.13
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.13
248	0.14
249	0.12
250	0.15
251	0.16
252	0.18
253	0.19
254	0.18
255	0.19
256	0.18
257	0.18
258	0.15
259	0.14
260	0.09
261	0.08
262	0.08
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.07
271	0.08
272	0.11
273	0.1
274	0.1
275	0.1
276	0.11
277	0.12
278	0.13
279	0.18
280	0.17
281	0.2
282	0.23
283	0.25
284	0.28
285	0.29
286	0.3
287	0.31
288	0.32
289	0.36
290	0.38
291	0.37
292	0.37
293	0.4
294	0.42
295	0.43
296	0.42
297	0.4
298	0.38
299	0.38
300	0.36
301	0.4
302	0.38
303	0.35
304	0.33
305	0.29
306	0.26
307	0.24
308	0.22
309	0.14
310	0.11
311	0.09
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.06
325	0.08
326	0.1
327	0.13
328	0.13
329	0.15
330	0.2
331	0.25
332	0.32
333	0.35
334	0.37
335	0.36
336	0.39
337	0.38
338	0.37
339	0.35
340	0.29
341	0.23
342	0.21
343	0.2
344	0.15
345	0.15
346	0.11
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.06
352	0.07
353	0.08
354	0.12
355	0.17
356	0.2
357	0.23
358	0.23
359	0.23
360	0.22
361	0.22
362	0.21
363	0.19
364	0.18
365	0.17
366	0.17
367	0.17
368	0.18
369	0.18
370	0.16
371	0.17
372	0.19
373	0.2
374	0.23
375	0.31
376	0.36
377	0.44
378	0.51
379	0.55
380	0.59
381	0.64
382	0.65
383	0.69
384	0.72
385	0.69
386	0.6
387	0.57
388	0.53
389	0.47
390	0.44
391	0.36
392	0.27
393	0.22
394	0.21
395	0.19
396	0.16
397	0.13
398	0.12
399	0.1
400	0.13
401	0.13
402	0.17
403	0.15
404	0.18
405	0.2
406	0.22
407	0.23
408	0.2
409	0.22
410	0.23
411	0.25
412	0.28
413	0.3
414	0.32
415	0.4
416	0.46
417	0.51
418	0.52
419	0.59
420	0.63
421	0.7
422	0.76
423	0.71
424	0.67
425	0.59
426	0.56
427	0.49
428	0.39
429	0.3
430	0.2
431	0.18
432	0.16
433	0.15
434	0.14
435	0.12
436	0.11
437	0.17
438	0.24
439	0.29
440	0.33
441	0.39
442	0.44
443	0.5
444	0.59
445	0.58
446	0.54
447	0.5
448	0.48
449	0.48
450	0.44
451	0.41
452	0.32
453	0.29
454	0.27
455	0.24
456	0.21
457	0.15
458	0.12
459	0.1
460	0.1
461	0.07
462	0.07
463	0.09
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.08
468	0.08
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.08
478	0.09
479	0.07
480	0.08
481	0.14
482	0.17
483	0.21
484	0.21
485	0.2
486	0.2
487	0.22
488	0.22
489	0.16
490	0.13
491	0.1
492	0.1
493	0.15
494	0.12
495	0.12
496	0.11
497	0.1
498	0.11
499	0.12
500	0.12
501	0.08
502	0.08
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.06
507	0.05
508	0.04
509	0.05
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.08
519	0.1
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.08
524	0.07
525	0.07
526	0.08
527	0.08
528	0.1
529	0.11
530	0.12
531	0.12
532	0.15
533	0.15
534	0.15
535	0.15
536	0.14
537	0.13
538	0.12
539	0.12
540	0.09
541	0.09
542	0.08
543	0.06
544	0.07
545	0.06
546	0.05
547	0.05
548	0.06
549	0.07
550	0.08
551	0.09
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.1
556	0.09
557	0.09
558	0.11
559	0.12
560	0.11
561	0.12
562	0.13
563	0.12
564	0.18
565	0.23
566	0.25
567	0.31
568	0.34
569	0.36
570	0.4
571	0.44
572	0.4
573	0.35
574	0.33
575	0.28
576	0.26
577	0.23
578	0.17
579	0.13
580	0.12
581	0.1
582	0.08
583	0.06
584	0.05
585	0.05
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.04
592	0.1
593	0.1
594	0.1
595	0.1
596	0.1
597	0.1
598	0.1
599	0.1
600	0.05
601	0.05
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.05
607	0.05
608	0.04
609	0.04
610	0.05
611	0.06
612	0.08
613	0.09
614	0.11
615	0.13
616	0.12
617	0.17
618	0.19
619	0.19
620	0.18
621	0.19
622	0.21
623	0.27
624	0.29
625	0.25
626	0.23
627	0.23
628	0.23
629	0.27
630	0.26
631	0.19
632	0.18
633	0.19
634	0.19
635	0.18
636	0.19
637	0.14
638	0.12
639	0.17
640	0.23
641	0.26
642	0.26
643	0.26
644	0.25
645	0.26
646	0.25
647	0.21
648	0.15
649	0.1
650	0.1
651	0.1
652	0.1
653	0.09
654	0.1
655	0.11
656	0.11
657	0.12
658	0.11
659	0.12
660	0.13
661	0.16
662	0.18
663	0.22
664	0.22
665	0.24
666	0.23
667	0.22
668	0.22
669	0.18
670	0.14
671	0.09
672	0.08
673	0.06
674	0.08
675	0.08
676	0.08
677	0.09
678	0.1
679	0.11
680	0.12
681	0.17
682	0.16
683	0.23
684	0.24
685	0.25
686	0.25
687	0.3
688	0.3
689	0.24
690	0.24
691	0.2
692	0.19
693	0.24
694	0.26
695	0.22
696	0.24
697	0.27
698	0.29
699	0.3
700	0.31
701	0.3
702	0.3
703	0.34
704	0.33
705	0.3
706	0.31
707	0.3
708	0.3
709	0.25
710	0.22
711	0.16
712	0.15
713	0.14
714	0.11
715	0.09
716	0.08
717	0.08
718	0.08
719	0.09
720	0.09
721	0.14
722	0.13
723	0.14
724	0.14
725	0.15
726	0.17
727	0.17
728	0.16
729	0.18
730	0.19
731	0.19
732	0.19
733	0.18
734	0.16
735	0.17
736	0.18
737	0.15
738	0.14
739	0.14
740	0.15
741	0.2
742	0.2
743	0.19
744	0.19
745	0.2
746	0.19
747	0.18
748	0.17
749	0.15
750	0.14
751	0.13
752	0.12
753	0.09
754	0.13
755	0.17
756	0.25
757	0.22
758	0.25
759	0.33
760	0.4
761	0.45
762	0.51
763	0.57
764	0.59
765	0.66
766	0.72
767	0.75
768	0.74
769	0.74
770	0.66
771	0.61
772	0.53
773	0.5
774	0.46
775	0.39
776	0.31
777	0.27
778	0.26
779	0.22
780	0.23
781	0.17
782	0.12
783	0.09
784	0.09
785	0.08
786	0.07
787	0.06
788	0.05
789	0.05
790	0.08
791	0.08
792	0.08
793	0.1
794	0.11
795	0.12
796	0.13
797	0.17
798	0.23
799	0.28
800	0.32
801	0.32
802	0.32
803	0.31
804	0.32
805	0.3
806	0.28
807	0.24
808	0.2
809	0.23
810	0.24
811	0.25
812	0.28
813	0.25
814	0.21
815	0.28
816	0.35
817	0.41
818	0.43
819	0.42
820	0.45
821	0.53
822	0.59
823	0.58
824	0.56
825	0.52
826	0.57
827	0.61
828	0.58
829	0.5
830	0.43
831	0.41
832	0.38
833	0.39
834	0.41
835	0.38
836	0.39
837	0.41
838	0.41
839	0.36
840	0.35
841	0.38
842	0.32
843	0.35
844	0.3
845	0.3
846	0.29
847	0.3
848	0.29
849	0.23
850	0.21
851	0.2
852	0.19
853	0.18
854	0.21
855	0.22
856	0.24
857	0.21
858	0.2
859	0.17
860	0.2
861	0.2
862	0.19
863	0.19
864	0.17
865	0.16
866	0.16
867	0.15
868	0.12
869	0.12
870	0.11
871	0.1
872	0.1
873	0.1
874	0.1
875	0.1
876	0.1
877	0.1
878	0.1
879	0.08
880	0.11
881	0.11
882	0.12
883	0.15
884	0.16
885	0.17
886	0.2
887	0.21
888	0.21
889	0.26
890	0.26
891	0.24
892	0.26
893	0.25
894	0.22
895	0.25
896	0.3
897	0.25
898	0.27
899	0.32
900	0.33
901	0.34
902	0.37
903	0.35
904	0.28
905	0.29
906	0.27
907	0.22
908	0.18
909	0.16
910	0.13
911	0.14
912	0.13
913	0.15
914	0.15
915	0.14
916	0.15
917	0.2
918	0.22
919	0.21
920	0.21
921	0.19
922	0.21
923	0.2
924	0.2
925	0.18
926	0.16
927	0.15
928	0.15
929	0.16
930	0.14
931	0.13
932	0.13
933	0.12
934	0.12
935	0.14
936	0.13
937	0.14
938	0.15
939	0.16
940	0.15
941	0.14
942	0.16
943	0.15
944	0.16
945	0.14
946	0.14
947	0.16
948	0.17
949	0.19
950	0.21
951	0.23
952	0.22
953	0.22
954	0.27
955	0.26
956	0.27
957	0.26
958	0.22
959	0.21
960	0.21
961	0.21
962	0.14
963	0.16
964	0.17
965	0.16
966	0.23
967	0.3
968	0.33
969	0.37
970	0.41
971	0.41
972	0.42
973	0.45
974	0.39
975	0.32
976	0.31
977	0.29
978	0.28
979	0.27
980	0.23
981	0.19
982	0.17
983	0.16
984	0.12
985	0.1
986	0.09
987	0.07
988	0.09
989	0.09
990	0.09
991	0.1
992	0.12
993	0.15
994	0.17
995	0.25
996	0.28
997	0.32
998	0.34
999	0.36
1000	0.36
1001	0.35
1002	0.33
1003	0.3
1004	0.26
1005	0.23
1006	0.21
1007	0.22
1008	0.21
1009	0.19
1010	0.19
1011	0.15
1012	0.14
1013	0.14
1014	0.19
1015	0.18
1016	0.22
1017	0.24
1018	0.26
1019	0.27
1020	0.28
1021	0.33
1022	0.3
1023	0.32
1024	0.35
1025	0.39
1026	0.47
1027	0.51
1028	0.51
1029	0.49
1030	0.55
1031	0.56
1032	0.52
1033	0.56
1034	0.53
1035	0.57
1036	0.61
1037	0.68
1038	0.7
1039	0.71
1040	0.76
1041	0.74
1042	0.77
1043	0.76
1044	0.81

A0A4V4HDU8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer